Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00487020Standard Name
PRS1 (Prolyl-tRNA synthetase 1)Aliases
PreTt19633 | 59.m00271 | 3680.m00128Description
PRS1 prolyl-tRNA synthetase protein putative; prolyl-tRNA synthetase family proteinGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
Cellular Component
- cytoplasm (IEA) | GO:0005737
Molecular Function
- ATP binding (IEA) | GO:0005524
- proline-tRNA ligase activity (IEA) | GO:0004827
- aminoacyl-tRNA ligase activity (IEA) | GO:0004812
- nucleotide binding (IEA) | GO:0000166
Biological Process
- prolyl-tRNA aminoacylation (IEA) | GO:0006433
- tRNA aminoacylation for protein translation (IEA) | GO:0006418
- translation (IEA) | GO:0006412
Domains
- ( TIGR00414 ) seryl-tRNA synthetase
- ( PF03129 ) Anticodon binding domain
- ( TIGR00408 ) prolyl-tRNA synthetase
- ( TIGR00409 ) prolyl-tRNA synthetase
- ( TIGR00418 ) threonyl-tRNA synthetase
- ( PF09180 ) Prolyl-tRNA synthetase, C-terminal
- ( PF05727 ) Uncharacterised protein family (UPF0228)
- ( PF04073 ) YbaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain
- ( PF00587 ) tRNA synthetase class II core
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%
TetraMine Data
TTHERM_00487020
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Stentor Coeruleus SteCoe_37784 0 WormBase WBGene00004189 9.997093137033517e-262 locus:pars-1 status:Confirme
d UniProt:Q22620 protein_i
d:CCD73349.1
Tetrahymena borealis EI9_12209.1 9.997093137033517e-262 prolyl-tRNA synthetase (734 aa
)
DictyBase DDB_G0284197 9.997093137033517e-262 proS on chromosome: 4 position
1680128 to 1681774
Oxytricha Contig15844.0.g111 9.997093137033517e-262 Anticodon binding domain
SGD YHR020W 9.997093137033517e-262 YHR020W Protein of unknown fun
ction that may interact with r
ibosomes, based on co-purifica
tion experiments; has similari
ty to proline-tRNA ligase; YHR
020W is an essential gene
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00487020(coding)
ATGATAAAAATATTAAACAGATTCGTAAGGATTCAAAAATTTAATAATAATTATTTAAAA
AATATTAATAACAATTAAAATTTCTATAGCATTCATTAAAAATATCTTAATCACTTTTCA
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AAGCCTGCTCTTAAGAGAGTTTATTGGGGAAGATCTTATTGA>TTHERM_00487020(protein)
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KPALKRVYWGRSY>TTHERM_00487020(gene)
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GAAAATAGTGTTAATAAAATCACATTGTGAATACGTAATTTAGCATAAGACTTATGAAAA
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TATTGGGCTTTCCATCCTATGGATAATTCTGCTTGCGTTGAATTCAAGCAAACTGAATTC
TAAAAGTTTATCGATGCTATTGGCAGAACTTTTGTTCACGTGAGACTCGACTTATCTGAA
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TGTTAACTAACTCCAAGAAAAAGTTTAACGATAAGATTAAGCCTGCTAGTACCTGGGCTG
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CTTGCGGAAAGCCTGCTCTTAAGAGAGTTTATTGGGGAAGATCTTATTGA