Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00487020

Standard Name

PRS1 (Prolyl-tRNA synthetase 1)

Aliases

PreTt19633 | 59.m00271 | 3680.m00128

Description

PRS1 prolyl-tRNA synthetase protein putative; prolyl-tRNA synthetase family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• cytoplasm (IEA) | GO:0005737

Molecular Function

• nucleotide binding (IEA) | GO:0000166
• ATP binding (IEA) | GO:0005524
• proline-tRNA ligase activity (IEA) | GO:0004827
• aminoacyl-tRNA ligase activity (IEA) | GO:0004812

Biological Process

• translation (IEA) | GO:0006412
• prolyl-tRNA aminoacylation (IEA) | GO:0006433
• tRNA aminoacylation for protein translation (IEA) | GO:0006418

Domains

• ( TIGR00414 ) seryl-tRNA synthetase
• ( PF03129 ) Anticodon binding domain
• ( TIGR00408 ) prolyl-tRNA synthetase
• ( TIGR00409 ) prolyl-tRNA synthetase
• ( TIGR00418 ) threonyl-tRNA synthetase
• ( PF09180 ) Prolyl-tRNA synthetase, C-terminal
• ( PF05727 ) Uncharacterised protein family (UPF0228)
• ( PF04073 ) YbaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain
• ( PF00587 ) tRNA synthetase class II core

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%

TetraMine Data

TTHERM_00487020

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Stentor Coeruleus	SteCoe_37784	0
WormBase	WBGene00004189	9.997093137033517e-262	locus:pars-1 status:Confirme d UniProt:Q22620 protein_i d:CCD73349.1
Tetrahymena borealis	EI9_12209.1	9.997093137033517e-262	prolyl-tRNA synthetase (734 aa )
DictyBase	DDB_G0284197	9.997093137033517e-262	proS on chromosome: 4 position 1680128 to 1681774
Oxytricha	Contig15844.0.g111	9.997093137033517e-262	Anticodon binding domain
SGD	YHR020W	9.997093137033517e-262	YHR020W Protein of unknown fun ction that may interact with r ibosomes, based on co-purifica tion experiments; has similari ty to proline-tRNA ligase; YHR 020W is an essential gene

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00487020(coding)
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AATATTAATAACAATTAAAATTTCTATAGCATTCATTAAAAATATCTTAATCACTTTTCA
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TCAGCTCTTGAATCTAAGGGAACAGAAAATGAATCTGGTTTATCTGGATCTGCAAAGACT
TTGTGCATTCCTAATGAATAAGAACCTATCGCTGAAGGCACTAAGTGTTTCTCTTGCGGA
AAGCCTGCTCTTAAGAGAGTTTATTGGGGAAGATCTTATTGA

>TTHERM_00487020(protein)
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ERVLNKAHELKAELKKAGIRVQVDDRDNYTSGWKFNHWEVKGIPLRFEIGQMDMDKNQIT
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CIVYTPWCNEISCEKAVKERSALESKGTENESGLSGSAKTLCIPNEQEPIAEGTKCFSCG
KPALKRVYWGRSY

>TTHERM_00487020(gene)
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AATATTAATAACAATTAAAATTTCTATAGCATTCATTAAAAATATCTTAATCACTTTTCA
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AAGGGTAACTATTATTTAGTTGTAGCTAAGCATGATACTAAAGTTGAAAAAACTTTATGG
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TAAAAGTTTATCGATGCTATTGGCAGAACTTTTGTTCACGTGAGACTCGACTTATCTGAA
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TTATTTTTTTGTTAAATTTAAATTTCAATTAAAAATAATAATAATAGAGATTCTTTGATG
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TGGATATGGATAAGAATTAAATTACAGCAGTTTGGAGAGTCAACTCTCACAAGGAAGCTA
TTCCTAACGAAAGTATTATTGAAACTACTAAGTTAAGATTGAAAGAAATACAAGATTTAA
TGTTAACTAACTCCAAGAAAAAGTTTAACGATAAGATTAAGCCTGCTAGTACCTGGGCTG
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CAATAAATACAGTTTTCATTTCATATCGATTTATGAAAACTGATAATTAAATTTGAATAT
TTATTGAATTTTTCTTTTTTAATAAAAGGTGCAATGAAATTTCATGTGAAAAGGCTGTTA
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CAAAGACTTTGTGCATTCCTAATGAATAAGAACCTATCGCTGAAGGCACTAAGTGTTTCT
CTTGCGGAAAGCCTGCTCTTAAGAGAGTTTATTGGGGAAGATCTTATTGA