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Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00113340Standard Name
PRP31 (Pre-mRNA Processing factor 31)Aliases
PreTt27148 | 8.m00408 | 3812.m02442Description
PRP31 snoRNA-binding domain protein putative; SnoRNA binding domain containing proteinGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
No Data fetched for Domains
Gene Expression Profile
- Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.6%
TetraMine Data
TTHERM_00113340
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_03897.1 9.997093137033517e-262 SnoRNA binding domain-containi
ng protein (538 aa)
Oxytricha Contig11690.0.g12 3.999413844471248e-84 Putative snoRNA binding domain
WormBase WBGene00022458 9.997863464222902e-69 locus:prp-31 status:Confirme
d UniProt:Q9N592 protein_i
d:CCD66198.1
DictyBase DDB_G0289595 1.0000310450948521e-65 prpf31 on chromosome: 5 positi
on 2984110 to 2985612
SGD YGR091W 3.0001084582952455e-37 PRP31 Splicing factor, compone
nt of the U4/U6-U5 snRNP compl
ex
Stentor Coeruleus SteCoe_37463 2.8625185805493937e-20
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00113340(coding)
ATGTTATTAAATTATTTGAGCTGCTAATGCTTAAAAGTTATTAACTTGGTTAGGAGGAAT
AACTCCTTATAATTAGTTTTGCTGATTTTCAATATCTCCTCCTTAAGGGTTTTATTATTG
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AACAGGTGGCTAGTTGTTTTCTTACTACTTTTTTTCTAAATCCTAATCTCCCTATTAATT
TTATTGTCCAGCTTTATTTTCTTAAGAAATTTGATTTAATTCTATATTAGTTGCCTGCGA
AGACCTGCTCTCTACATCAGTTTCAATTTCTTCAATTAATTTTTCGTGCTTAGGCAAGCC
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TGTATAAACCAATACAACTCTTTAATTTTGGTCATCTGCATTTTAAATATCCTATATTCA
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TAGGGTGTTTTTTTTGTTTTAAACAGTAAAAATTAGTAAAAAAATTAATTTTTGCTAAAA
TTTACTCAAAAAAATTTAGTTTGA>TTHERM_00113340(protein)
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LHLAYNLLQIREQNLQILTFSSKMVSRQKIILTKMLVSELLQKQKTMQAYSQVNLRLLIE
FTTQSILKFKCWLCLFLNLFFIKIIFKFAIKVVQNFQKNNQGVFFVLNSKNQQKNQFLLK
FTQKNLV>TTHERM_00113340(gene)
ATGTTATTAAATTATTTGAGCTGCTAATGCTTAAAAGTTATTAACTTGGTTAGGAGGAAT
AACTCCTTATAATTAGTTTTGCTGATTTTCAATATCTCCTCCTTAAGGGTTTTATTATTG
CCCTACTTAGTTAGCAGGTGGATTTATCTAAGCGTGCATAACGGGATTTCCTATAAACTC
TAAACTACCTAAAATTTCATCATCTCTAACTAGTCTTCCTCTATAAATGAATCTAATAGA
ATAGCCTTCGGCAACTTGCTAAGGAAAAGCTCGCTATTTGAGAGCGTTAATATTAATTTA
TTTAAGTTCATCTGTATAAGGGATGCAAATAGGCTCACCATTAAGTTTTTTTATAGTCAA
AACAGGTGGCTAGTTGTTTTCTTACTACTTTTTTTCTAAATCCTAATCTCCCTATTAATT
TTATTGTCCAGCTTTATTTTCTTAAGAAATTTGATTTAATTCTATATTAGTTGCCTGCGA
AGACCTGCTCTCTACATCAGTTTCAATTTCTTCAATTAATTTTTCGTGCTTAGGCAAGCC
TTGTGTGTCCATCTAATTAGCAGTGACTTTTTTTAATTCAATGTATATATTTGAACTTTA
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TAATAATAATTTCAGAATTTTTATGTAAATAAATAAATAAATTTTTTTGATAAAATTCAT
TATTTTTAAATTTGATTAAAATTTTATTTGCTTGTCCTAGAATTTTTGTTATAGACTAAA
TGGATAATTAATTGTAATTGCAAAAAGTAAACATTCTATTTTAAAATCAATTATATATAT
TATAGGTATAAACCAATACAACTCTTTAATTTTGGTCATCTGCATTTTAAATATCCTATA
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TAATAATCATTTTGAAGTTAAAGTGTCGTTAAAATAAGTTAGGATGAGATAGTTTCAAGG
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AAAGAAAATATAATATAAAAGATGAATAAATTATTCCAATTAGCGATAAGAATAAACTTC
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ATTCTAAATTTAATATAAAAATAGCTCAAAAGCAATAAAAGCAGCAAGCTAAATAAGAAT
AAAGATAGGTTCCACTTAAAATAGCTGGCGGAGATATGCAAGATGGTCTTGCATCTAGCT
TATAATTTACTTCAAATTAGGGAATAGAACTTATAAGTAAATAATAACTTTTTAAGATAA
ATCTCTATTTAAATTTATTTGTAAAAATAAAGATCCTTACCTTCTCAAGCAAGATGGTAT
CAAGACAGAAAATTATTTTAACAAAGATGTTGGTTTCAGAACTGTTGTAGAAACAAAAAA
CAATGTAGGCTTACTCCCAGGTCAATTTAAGGCTCCTAATTGAGTTTACTACTTAATCTA
TCTTAAAATTTAAATGTTGGTTGTGTTTGTTTTTAAACTTGTTTTTCATAAAAATTATCT
TTAAATTTGCAATAAAAGTTGTTTAAAATTTTTAAAAAAATAATTAGGGTGTTTTTTTTG
TTTTAAACAGTAAAAATTAGTAAAAAAATTAATTTTTGCTAAAATTTACTCAAAAAAATT
TAGTTTGA
