Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00113340

Standard Name

PRP31 (Pre-mRNA Processing factor 31)

Aliases

PreTt27148 | 8.m00408 | 3812.m02442

Description

PRP31 snoRNA-binding domain protein putative; SnoRNA binding domain containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

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Gene Ontology Annotations

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Domains

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Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.6%

TetraMine Data

TTHERM_00113340

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_03897.19.997093137033517e-262SnoRNA binding domain-containi
ng protein (538 aa)
OxytrichaContig11690.0.g123.999413844471248e-84Putative snoRNA binding domain
WormBaseWBGene000224589.997863464222902e-69locus:prp-31 status:Confirme
d UniProt:Q9N592 protein_i
d:CCD66198.1
DictyBaseDDB_G02895951.0000310450948521e-65prpf31 on chromosome: 5 positi
on 2984110 to 2985612
SGDYGR091W3.0001084582952455e-37PRP31 Splicing factor, compone
nt of the U4/U6-U5 snRNP compl
ex
Stentor CoeruleusSteCoe_374632.8625185805493937e-20

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00113340(coding)
ATGTTATTAAATTATTTGAGCTGCTAATGCTTAAAAGTTATTAACTTGGTTAGGAGGAAT
AACTCCTTATAATTAGTTTTGCTGATTTTCAATATCTCCTCCTTAAGGGTTTTATTATTG
CCCTACTTAGTTAGCAGGTGGATTTATCTAAGCGTGCATAACGGGATTTCCTATAAACTC
TAAACTACCTAAAATTTCATCATCTCTAACTAGTCTTCCTCTATAAATGAATCTAATAGA
ATAGCCTTCGGCAACTTGCTAAGGAAAAGCTCGCTATTTGAGAGCGTTAATATTAATTTA
TTTAAGTTCATCTGTATAAGGGATGCAAATAGGCTCACCATTAAGTTTTTTTATAGTCAA
AACAGGTGGCTAGTTGTTTTCTTACTACTTTTTTTCTAAATCCTAATCTCCCTATTAATT
TTATTGTCCAGCTTTATTTTCTTAAGAAATTTGATTTAATTCTATATTAGTTGCCTGCGA
AGACCTGCTCTCTACATCAGTTTCAATTTCTTCAATTAATTTTTCGTGCTTAGGCAAGCC
TTGTGTGTCCATCTAATTAGCAGTGACTTTTTTTAATTCAATACTAAATGGATAATTAAT
TGTATAAACCAATACAACTCTTTAATTTTGGTCATCTGCATTTTAAATATCCTATATTCA
TCTTTTTAGAATCAAGACTTTTTGAAAGATTTAGATGATTTGGATGATGATGAGGAAATA
GTTGTAGATGATGGGTATGGCGATGATGATAACAATGAAGAAGATGAAATGAATGATGAA
GATTTGTAGAATCTTGAAGGTTTTGATGATGAGGATTTGGAGGGTGATAATCTAGAAGAA
TAAATTGTTAAAAAAGTAAAAACACAAAATAGAGAAAATGAAAAGGAAAATGCTATTTAA
GAGTTTAAGACAGCTTTTTAAAAAGTTTAATCCAAGCCTATTTCAAATTTACTAAATGAT
GCTGAGTTCAAAAAGCTCTATCAAAAAATCCAAGAGTATAAAGGAAAATAAAATGTTTCT
AACTTGACAGCTCAAGATGATGAATATCATGTTATAATAAGATCAAATGAATATGCTGCT
ATTATTGAAAGAGAAATCTAAGCTGTGCATAAATTTGCAAAGGACATCTTCTTAAAGAGA
TTAGCTGAATTGCAAGATATTGTTATCAATCCTATTGATTATGCAAAATGTGTCAAGTTA
ATTAAAAATGAATCGGATATCATGAAATTAGATTTTTCTAGCATTCCTACATTAACTATG
CAGTAAATTACTTCTATTTCTGTTGCAGCTTCGCAAGAAGAAGGAAAGTATTTAAATGCT
AGCGAATACAAATAAGTCATAGCTGCTTGTGACAATATTTTAGAACTTCACGAGATGTCA
TTATAAATATAAGCTTACATAGAGAGTCGTATGAAATTTATTGCTCCAAATTTAAGTGCT
CTCGTAGGAAGTACTTGTGCTTCTCGTTTGGTTACAGCAGCTGGTGGTGTGGAAGCTCTC
TAAAGAATGCCTGCTTGCAATATCTAAGTTATGGGTTCCTAGAAAAAATCACTGTTAGGT
ATGTCTAAAGAAGGATAAGGAAATAACAGAGGTTATTTCGCATAATTAGAAATGGTCTAA
AAAGCTCCTCCCTAGTTTTAGACAAAACTAGTCAGAATGCTTTCTACTAATGTTGCAAAA
GCTGTTCGTATTGATTTCTTGAAGACATGTCCTAGTGGATCTGCTGGAAAAAGATTGTAT
GATTTAATGATTTAAAGATTCTCAAAAGTCTAAGAACCTCCTCCAGCCAAGATGAACAAA
CCTTTAGCTAAACCTGATGACAAGCCCAGCAGAAAAAGAGGTGGTGAGAAATATAGAAAG
ATTAAAGAGCGTTTAGGATTAACTAATTTGAGAGCTTTATCACAAAGAATGATGTTTGGT
GATTAAGCAGAAGAAGAATTTAGAGACACAGGAAAGGGCTTTGGTCTATTGGGAGTTTAA
GCTGGTACTATTAAGGTCAATGTAAGCAAGAGGAAGATTAAATTAAGTAATGTTATTAAA
TTTTATTTATATATTCTAAATTTAATATAAAAATAGCTCAAAAGCAATAAAAGCAGCAAG
CTAAATAAGAATAAAGATAGGTTCCACTTAAAATAGCTGGCGGAGATATGCAAGATGGTC
TTGCATCTAGCTTATAATTTACTTCAAATTAGGGAATAGAACTTATAAATCCTTACCTTC
TCAAGCAAGATGGTATCAAGACAGAAAATTATTTTAACAAAGATGTTGGTTTCAGAACTG
TTGTAGAAACAAAAAACAATGTAGGCTTACTCCCAGGTCAATTTAAGGCTCCTAATTGAG
TTTACTACTTAATCTATCTTAAAATTTAAATGTTGGTTGTGTTTGTTTTTAAACTTGTTT
TTCATAAAAATTATCTTTAAATTTGCAATAAAAGTTGTTTAAAATTTTTAAAAAAATAAT
TAGGGTGTTTTTTTTGTTTTAAACAGTAAAAATTAGTAAAAAAATTAATTTTTGCTAAAA
TTTACTCAAAAAAATTTAGTTTGA


>TTHERM_00113340(protein)
MLLNYLSCQCLKVINLVRRNNSLQLVLLIFNISSLRVLLLPYLVSRWIYLSVHNGISYKL
QTTQNFIISNQSSSINESNRIAFGNLLRKSSLFESVNINLFKFICIRDANRLTIKFFYSQ
NRWLVVFLLLFFQILISLLILLSSFIFLRNLIQFYISCLRRPALYISFNFFNQFFVLRQA
LCVHLISSDFFQFNTKWIINCINQYNSLILVICILNILYSSFQNQDFLKDLDDLDDDEEI
VVDDGYGDDDNNEEDEMNDEDLQNLEGFDDEDLEGDNLEEQIVKKVKTQNRENEKENAIQ
EFKTAFQKVQSKPISNLLNDAEFKKLYQKIQEYKGKQNVSNLTAQDDEYHVIIRSNEYAA
IIEREIQAVHKFAKDIFLKRLAELQDIVINPIDYAKCVKLIKNESDIMKLDFSSIPTLTM
QQITSISVAASQEEGKYLNASEYKQVIAACDNILELHEMSLQIQAYIESRMKFIAPNLSA
LVGSTCASRLVTAAGGVEALQRMPACNIQVMGSQKKSLLGMSKEGQGNNRGYFAQLEMVQ
KAPPQFQTKLVRMLSTNVAKAVRIDFLKTCPSGSAGKRLYDLMIQRFSKVQEPPPAKMNK
PLAKPDDKPSRKRGGEKYRKIKERLGLTNLRALSQRMMFGDQAEEEFRDTGKGFGLLGVQ
AGTIKVNVSKRKIKLSNVIKFYLYILNLIQKQLKSNKSSKLNKNKDRFHLKQLAEICKMV
LHLAYNLLQIREQNLQILTFSSKMVSRQKIILTKMLVSELLQKQKTMQAYSQVNLRLLIE
FTTQSILKFKCWLCLFLNLFFIKIIFKFAIKVVQNFQKNNQGVFFVLNSKNQQKNQFLLK
FTQKNLV


>TTHERM_00113340(gene)
ATGTTATTAAATTATTTGAGCTGCTAATGCTTAAAAGTTATTAACTTGGTTAGGAGGAAT
AACTCCTTATAATTAGTTTTGCTGATTTTCAATATCTCCTCCTTAAGGGTTTTATTATTG
CCCTACTTAGTTAGCAGGTGGATTTATCTAAGCGTGCATAACGGGATTTCCTATAAACTC
TAAACTACCTAAAATTTCATCATCTCTAACTAGTCTTCCTCTATAAATGAATCTAATAGA
ATAGCCTTCGGCAACTTGCTAAGGAAAAGCTCGCTATTTGAGAGCGTTAATATTAATTTA
TTTAAGTTCATCTGTATAAGGGATGCAAATAGGCTCACCATTAAGTTTTTTTATAGTCAA
AACAGGTGGCTAGTTGTTTTCTTACTACTTTTTTTCTAAATCCTAATCTCCCTATTAATT
TTATTGTCCAGCTTTATTTTCTTAAGAAATTTGATTTAATTCTATATTAGTTGCCTGCGA
AGACCTGCTCTCTACATCAGTTTCAATTTCTTCAATTAATTTTTCGTGCTTAGGCAAGCC
TTGTGTGTCCATCTAATTAGCAGTGACTTTTTTTAATTCAATGTATATATTTGAACTTTA
TGATAAATTAGTTTTAATTATATTCTATCAATAGCAATCAATAACAATAATGATAATAAA
TAATAATAATTTCAGAATTTTTATGTAAATAAATAAATAAATTTTTTTGATAAAATTCAT
TATTTTTAAATTTGATTAAAATTTTATTTGCTTGTCCTAGAATTTTTGTTATAGACTAAA
TGGATAATTAATTGTAATTGCAAAAAGTAAACATTCTATTTTAAAATCAATTATATATAT
TATAGGTATAAACCAATACAACTCTTTAATTTTGGTCATCTGCATTTTAAATATCCTATA
TTCATCTTTTTAGGTATGTGTTTTCTTCTACAACATTAAATGATAATAAAGAGTTTCTTG
AAATTGATATAACAAAATATAAAAATTAAACATTATCATACAAGTTTTAATAGTTAATTA
ATATTTCAATCATTCTAATTTTTTATAAATTATTCTATATTGAATAAGAATTTATTTACT
CTTATTAAAAGTTAGTTTTAAATATTTAAAAAATAATTAATATTAATTAAATATTTTAAA
AATTTTAATATCAATAAGTTAATTAAATGTTTGATAATTATGGTTGAATGATAAGCTAGA
ATCAGAACTGGATGTGCATTTATCAAAGATTATATAAGAGTAAAGCGTTATTTAAATCTC
ATACAACTACTTTTCCAGTGTTTTATAATAAGAAAACATCATATTCATTTTTACATCATA
ATTTATATCAAATAGATTCATCTTTTTTTTGTTTTTTTAGAATTTCAGTTGATATCCAAA
TATAATTATTTGTCTTTTTTTGATTTTTTAGATTTTTTAGATTTTTTAACCAACAAATAT
AAATGAATACTTTGTTAAAAAAACATAAATCTCTATAAAATTTATTTGTTTAAGTATCAG
GTTTTAGTGAAGAAGTTTTATTTTATTATCAATAAAATTTTTATTAAAATTTTTAAAATT
AATGAATTTATTTTTCATTTTTTTGAGATAGATAAAATTAAAATTATTTTTTATTATCTA
ATTTATAATTTGAAGATTTTAATTTTAAATAGAACGTCTAGATAGATAATTTGACTCTTT
GGTTGATTTAGTGATTCTATTATTTAATAAAGTTCTTTAGGTTTTTTATTAACTTGAAGC
TAGAGAGCTTGTTTGATGAATAAATATCATATCAATTGAATTTTAATTAAAAGTTAGAAT
TAGCAAAATATAGTCATCAAAAAGAAATACATAAAATATTCACGTTAAATAGAAATGGTA
AAAATAGCATCTTACTTTTGAAAAATTTCACAGTCTTTTATGGTTAAAATATAGGAATTT
TAATAATCATTTTGAAGTTAAAGTGTCGTTAAAATAAGTTAGGATGAGATAGTTTCAAGG
CTAATCTATTTATTGATTAGAAACAAATATTCCTAAATGAATCAACAATTTCCAACAAAT
TTGCAATAAAAAATCTACTTCTATGAATTTTGTTTGAATCCTTAAATAGGATTAATAATG
AAAGAAAATATAATATAAAAGATGAATAAATTATTCCAATTAGCGATAAGAATAAACTTC
CTAAATTCATTTATAAATTATTATGATTTTGGTTGAAAATAAAAATATTTGTTTGCCAGC
CAAACGAAGCTTATATTTAATGATAATAAAGTTCTATATATTTATAACCATAGAGACTGA
AAATATATAAGTGAAATAACTTCTAACATTTTTAAAAAATAAATTAGAATCAAGACTTTT
TGAAAGATTTAGATGATTTGGATGATGGTAATTAAATTTTATTTCAATTTTAATATTTAT
TTATTAAAAAATTATTTGTTTAAATTAACAAAGATGAGGAAATAGTTGTAGATGATGGGT
ATGGCGATGATGATAACAATGAAGAAGATGAAATGAATGATGAAGATTTGTAGAATCTTG
AAGGTTTTGATGATGAGGATTTGGAGGGTGATAATCTAGAAGAATAAATTGTTAAAAAAG
TAAAAACACAAAATAGAGAAAATGAAAAGGAAAATGCTATTTAAGAGTTTAAGACAGCTT
TTTAAAAAGTTTAATCCAAGCCTATTTCAAATTTACTAAATGATGCTGAGTTCAAAAAGC
TCTATCAAGTAAAATTAATTTCAAGATTTTTCATCTTATTTATCTTCTTAATTTGTAGAA
AATCCAAGAGTATAAAGGAAAATAAAATGTTTCTAACTTGACAGCTCAAGATGATGAATA
TCATGTTATAATAAGATCAAATGAATATGCTGCTATTATTGAAAGAGAGTAAATAAATAT
ACTTTGTATTTATTATTCCTTATTAAAGTTTCTTTTTTAATTTAATTTATTTTAGAATCT
AAGCTGTGCATAAATTTGCAAAGGACATCTTCTTAAAGAGATTAGCTGAATTGCAAGATA
TTGTTATCAATCCTATTGATTATGCAAAATGTGTCAAGTTAATTAAAAATGAATCGGATA
TCATGAAATTAGATTTTTCTAGCATTCCTACATTAACTATGCAGTAAATTACTTCTATTT
CTGTTGCAGCTTCGCAAGAAGAAGGAAAGTATTTAAATGCTAGCGAATACAAATAAGTCA
TAGCTGCTTGTGACAATATTTTAGAACTTCACGAGATGTCATTATAAGTAATTAATTTTT
CATATTTATTATATATTTTATTTATCATAAAAATATATTTTAATTAGATATAAGCTTACA
TAGAGAGTCGTATGAAATTTATTGCTCCAAATTTAAGTGCTCTCGTAGGAAGTACTTGTG
CTTCTCGTTTGGTTACAGCAGCTGGTGGTGTGGAAGCTCTCTAAAGAATGCCTGCTTGCA
ATATCTAAGTTATGGGTTCCTAGAAAAAATCACTGTTAGGTATGTCTAAAGAAGGATAAG
GAAATAACAGAGGTTATTTCGCATAATTAGAAATGGTCTAAAAAGCTCCTCCCTAGTTTT
AGACAAAACTAGTCAGAATGCTTTCTACTAATGTTGCAAAAGCTGTTCGTATTGATTTCT
TGAAGACATGTCCTAGTGGATCTGCTGGAAAAAGATTGTATGATTTAATGATTTAAAGAT
TCTCAAAAGTCTAAGAACCTCCTCCAGCCAAGATGAACAAACCTTTAGCTAAACCTGATG
ACAAGCCCAGCAGAAAAAGAGGTGGTGAGAAATATAGAAAGATTAAAGAGCGTTTAGGAT
TAACTAATTTGAGAGCTTTATCACAAAGAATGATGTTTGGTGATTAAGTAATTTTGAAAA
AATTGATAAAAACTTAAATATTCTAAATAATTTATTAATTAAATTAAATAAAAGGCAGAA
GAAGAATTTAGAGACACAGGAAAGGGCTTTGGTCTATTGGGAGTTTAAGCTGGTACTATT
AAGGTCAATGTAAGCAAGAGGAAGATTAAATTAAGTAATGTTATTAAATTTTATTTATAT
ATTCTAAATTTAATATAAAAATAGCTCAAAAGCAATAAAAGCAGCAAGCTAAATAAGAAT
AAAGATAGGTTCCACTTAAAATAGCTGGCGGAGATATGCAAGATGGTCTTGCATCTAGCT
TATAATTTACTTCAAATTAGGGAATAGAACTTATAAGTAAATAATAACTTTTTAAGATAA
ATCTCTATTTAAATTTATTTGTAAAAATAAAGATCCTTACCTTCTCAAGCAAGATGGTAT
CAAGACAGAAAATTATTTTAACAAAGATGTTGGTTTCAGAACTGTTGTAGAAACAAAAAA
CAATGTAGGCTTACTCCCAGGTCAATTTAAGGCTCCTAATTGAGTTTACTACTTAATCTA
TCTTAAAATTTAAATGTTGGTTGTGTTTGTTTTTAAACTTGTTTTTCATAAAAATTATCT
TTAAATTTGCAATAAAAGTTGTTTAAAATTTTTAAAAAAATAATTAGGGTGTTTTTTTTG
TTTTAAACAGTAAAAATTAGTAAAAAAATTAATTTTTGCTAAAATTTACTCAAAAAAATT
TAGTTTGA