Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00113340

Standard Name

PRP31 (Pre-mRNA Processing factor 31)

Aliases

PreTt27148 | 8.m00408 | 3812.m02442

Description

SnoRNA binding domain containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.6%

TetraMine Data

TTHERM_00113340

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_03897.1	9.997093137033517e-262	SnoRNA binding domain-containi ng protein (538 aa)
Oxytricha	Contig11690.0.g12	3.999413844471248e-84	Putative snoRNA binding domain
WormBase	WBGene00022458	9.997863464222902e-69	locus:prp-31 status:Confirme d UniProt:Q9N592 protein_i d:CCD66198.1
DictyBase	DDB_G0289595	1.0000310450948521e-65	prpf31 on chromosome: 5 positi on 2984110 to 2985612
SGD	YGR091W	3.0001084582952455e-37	PRP31 Splicing factor, compone nt of the U4/U6-U5 snRNP compl ex
Stentor Coeruleus	SteCoe_37463	2.8625185805493937e-20

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00113340(coding)
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GATGATGGGTATGGCGATGATGATAACAATGAAGAAGATGAAATGAATGATGAAGATTTG
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AATGAATCGGATATCATGAAATTAGATTTTTCTAGCATTCCTACATTAACTATGCAGTAA
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TACAAATAAGTCATAGCTGCTTGTGACAATATTTTAGAACTTCACGAGATGTCATTATAA
ATATAAGCTTACATAGAGAGTCGTATGAAATTTATTGCTCCAAATTTAAGTGCTCTCGTA
GGAAGTACTTGTGCTTCTCGTTTGGTTACAGCAGCTGGTGGTGTGGAAGCTCTCTAAAGA
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GTTTTTTTTGTTTTAAACAGTAAAAATTAGTAAAAAAATTAATTTTTGCTAAAATTTACT
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>TTHERM_00113340(protein)
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KEGQGNNRGYFAQLEMVQKAPPQFQTKLVRMLSTNVAKAVRIDFLKTCPSGSAGKRLYDL
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KNKDRFHLKQLAEICKMVLHLAYNLLQIREQNLQILTFSSKMVSRQKIILTKMLVSELLQ
KQKTMQAYSQVNLRLLIEFTTQSILKFKCWLCLFLNLFFIKIIFKFAIKVVQNFQKNNQG
VFFVLNSKNQQKNQFLLKFTQKNLV

>TTHERM_00113340(gene)
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TTTTTGTTTTAAACAGTAAAAATTAGTAAAAAAATTAATTTTTGCTAAAATTTACTCAAA
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