Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00530350

Standard Name

PRP12 (pre-mRNA processing factor 12)

Aliases

PreTt04698 | 67.m00213 | 3684.m00083

Description

CPSF A subunit region family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• nucleus (IEA) | GO:0005634

Molecular Function

• nucleic acid binding (IEA) | GO:0003676

Domains

• ( PF03178 ) CPSF A subunit region

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 31.6%

TetraMine Data

TTHERM_00530350

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Stentor Coeruleus	SteCoe_1863	0
WormBase	WBGene00019323	9.997093137033517e-262	locus:teg-4 status:Partially _confirmed UniProt:O44985 protein_id:CCD68627.1
Tetrahymena borealis	EI9_13616.1	9.997093137033517e-262	CPSF A subunit region family p rotein (1198 aa)
DictyBase	DDB_G0282569	9.997093137033517e-262	sf3b3 on chromosome: 3 positio n 5947254 to 5951124
Oxytricha	Contig1943.0.g12	9.997093137033517e-262	CPSF A subunit region
SGD	YML049C	1.0003292389192957e-45	RSE1 Protein involved in pre-m RNA splicing; component of the pre-spliceosome; associates w ith U2 snRNA; involved in ER t o Golgi transport

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00530350(coding)
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>TTHERM_00530350(protein)
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HVMFRSFYGPVKSVIDGDLCEQFIKLSSGKQKVLADEMDRHPHEVHKKLDEIRNKIL

>TTHERM_00530350(gene)
ATGATGAACTTATACAGTTTAACGCTGTTATAACCAACAGCTATTTTAAAAGCAGTATAC
GGTAATTTTTCAGGACCTAAAGCTTAGGAAATTGCTGTAGCTAAAGGAAAAGTTTTAGAA
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