Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00378980
Standard Name
POT2 (protection of telomeres 2)
Aliases
PreTt10352 | 40.m00237 | KM406494
Description
hypothetical protein
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 13%
TetraMine Data
TTHERM_00378980
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_00078.1 7.002629310501235e-115 hypothetical protein (482 aa)
Oxytricha Contig22209.0.g66 0.000005998506718272351 Telomeric single stranded DNA
binding POT1/CDC13
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:25303953 : Cranert S, Heyse S, Linger BR, Lescasse R, Price C (2014) Tetrahymena Pot2 is a developmentally regulated paralog of Pot1 that localizes to chromosome breakage sites but not to telomeres. Eukaryotic cell 13(12):1519-29Ref:24297442 : Premkumar VL, Cranert S, Linger BR, Morin GB, Minium S, Price C (2014) The 3' overhangs at Tetrahymena thermophila telomeres are packaged by four proteins, Pot1a, Tpt1, Pat1, and Pat2. Eukaryotic cell 13(2):240-5
Sequences
>TTHERM_00378980(coding)ATG AAG CAA ACC AGC TAA CTT AAG ACA TTA TCA GAG ATT ACC AAG GCT AAG AGT TTA AAA TAA AGC ATC ATC ATA GCT TTG ATA CTG GAC TAT ACT AAT AAT TAC TTG ACT AGT CAA GGA CCA CTT GTA AGA ATA AAA ATA ATA GAT GAC ACA TTT ACA TTT GAA AAA AAA TAA AGC TCA AAA GTG TAT TTT CAG GTG CAC AAT CTG ACT GAT AAA AAA TAT ATG ATG AAA ATA GGC GAT ATC GTG TAT GTA AAA GAA TTC TAA TCA TTT AAA TAG GAT AAG CCT GAA ATT TAT GAA ATA GAA ACT AGT TCT CAT ATA CAT GTA TTT GAA CAA AAC AAA TCT AAT CTT TGG TGC ACC AAC TGC TAA AAG AAT ATC TTG CTT TGT GAG CAG TCT CAA AAA AGA ATA TAA GAT CTT CGA GAC TAC AGC TTT AAA AAA TTC TCT CAA ATT AAA TTA AAA GAT TTA TAT TGG AAA GGC TTT ACT AAT TCT GAT TAA GTT ATT AAA TAA AAC TTT GAC TTG TTG TTG AAA GTA GAT TAA ATA GAA TTA GTT AAT CTT TAA GAC ATA CCA AAG TAT TAC AAT ATT AGA TTG GTA GAT TCT GAT CTT AAT TAA TAC TAT TTA AAG GAG TAA AAT AAT GAT TTA GAA GTA GGA GAG ATT GTT AAA ATT AGA TCT GTG CAT TAC TTT GTT TAA TTA CTA AGA GAC AAA GAA AAT CAA ATT ATA AAA AGT GAC TAC ACA AAT GTG CAA AGA CTT TAT AGA TTT TTT TAT GAT GTA GTG AAT TTC GAT AAA TTT AAG TAT GAA ATA GTT AGA TAT GCA AAA GAA AAT TAT GAT TTT GAA GAG TAT TAT CAT GAT TTA TAA GAT GAA AAT AGA AAA TTT TCT ATC ATA AAA AGG ATT CAT TAA AAT AAT TAT AAC ATT ACT TCT TTA CAA TTT CTA TTG AAC AAG CAG CAA TCT AAT GAT TAC TAT TCT ATC AAG CAT ATG AAA TAC AGG ATA CAG TGC TAC GTT ATA GAT ATT CAG CCA TCT TAT TTA TTA GAT GCT GTT AGA AGG ATA TCA TAC TTT GAT AAA AAA ATT AAC TAT CCT TTA AAG GAT TCA AAT TTC AAA AAT ATG AAT TAG CTA AAA AGA ATT TTA GAA GTT TAA ATT TTA GTC AAG GAC ACT TCA ATC GAC TTG AAC AAG GAT GTA GTT AAT ATT ATA CTT ATT TAA GAG GAG CTT CAA AAT GAT CAC GAT TTT TTT AAA GGA GTT GAA TTA CTC AAA ATC GAA GAA GAA AAT GTA TAA GAG TAT CAA AAA GTT TAC TAT AAT ATA TTA AAT AGA CTA TTT ACA GAA ACA AGC TCA TCT AAA ATG GTG GAT ATT ATA GTT AAA CCA TTC TTA TTT CAA TAA AAA ATT TTA TAT AAA ATT ATT GAC ACT CAA TTT CTC CCC TGA >TTHERM_00378980(protein)M K Q T S Q L K T L S E I T K A K S L K Q S I I I A L I L D Y T N N Y L T S Q G P L V R I K I I D D T F T F E K K Q S S K V Y F Q V H N L T D K K Y M M K I G D I V Y V K E F Q S F K Q D K P E I Y E I E T S S H I H V F E Q N K S N L W C T N C Q K N I L L C E Q S Q K R I Q D L R D Y S F K K F S Q I K L K D L Y W K G F T N S D Q V I K Q N F D L L L K V D Q I E L V N L Q D I P K Y Y N I R L V D S D L N Q Y Y L K E Q N N D L E V G E I V K I R S V H Y F V Q L L R D K E N Q I I K S D Y T N V Q R L Y R F F Y D V V N F D K F K Y E I V R Y A K E N Y D F E E Y Y H D L Q D E N R K F S I I K R I H Q N N Y N I T S L Q F L L N K Q Q S N D Y Y S I K H M K Y R I Q C Y V I D I Q P S Y L L D A V R R I S Y F D K K I N Y P L K D S N F K N M N Q L K R I L E V Q I L V K D T S I D L N K D V V N I I L I Q E E L Q N D H D F F K G V E L L K I E E E N V Q E Y Q K V Y Y N I L N R L F T E T S S S K M V D I I V K P F L F Q Q K I L Y K I I D T Q F L P >TTHERM_00378980(gene)ATG AAG CAA ACC AGC TAA GTA AAC CAT AAT ATA AAG TTT ATT AAC TTC TAT TTA AAC ATT TTA AAA ATT ATT ATC AGC TTA AGA CAT TAT CAG AGA TTA CCA AGG CTA AGA GTT TAA AAT AAA GCA TCA TCA TAG CTT TGA TAC TGG ACT ATA CTA ATA ATT ACT TGA CTA GTC AAG GAC CAC TTG TAA GAA TAA AAA TAA TAG ATG ACA CAT TTA CAT TTG AAA AAA AAT AAA GCT CAA AAG TGT ATT TTC AGG TGC ACA ATC TGA CTG ATA AAA AAT ATA TGA TGA AAA TAG GCG ATA TCG TGT ATG TAA AAG AAT TCT AAT CAT TTA AAT AGG ATA AGG TAA TAA CTA TTT AGG ATA ACT TAA ATT AAT ATA TTT TTT GTT TAA TTA AGC CTG AAA TTT ATG AAA TAG AAA CTA GTT CTC ATA TAC ATG TAT TTG AAC AAA ACA AAT CTA ATC TTT GGT GCA CCA ACT GCT AAA AGA ATA TCT TGC TTT GTG AGC AGT CTC AAA AAA GAA TAT AAG ATC TTC GAG ACT ACA GCT TTA AAA AAT TCT CTC AAA TTA AAT GTA TGC TTA AAT TTT TAT TCT TTT TAT TTA TTT ATT GAA AAA ATT GTA TTT TGA AAA GTA AAA GAT TTA TAT TGG AAA GGC TTT ACT AAT TCT GAT TAA GTT ATT AAA TAA AAC TTT GAC TTG TTG TTG AAA GTA GAT TAA ATA GAA TTA GTT AAT CTT TAA GAC ATA CCA AAG TAT TAC AAT ATT AGA TTG GTA GAT TCT GAT CTT AAT TAA TAC TAT TTA AAG GAG TAA AAT AAT GAT TTA GAA GTA GGA GAG ATT GTT AAA ATT AGA TCT GTG CAT TAC TTG TAA GTA ATT TTG TTT AGA ATT TTA GTA ATT TAA AAG TTA ATT TAT AGT GTT TAA TTA CTA AGA GAC AAA GAA AAT CAA ATT ATA AAA AGT GAC TAC ACA AAT GTG CAA AGA CTT TAT AGA TTT TTT TAT GAT GTA GTG AAT TTC GAT AAA TTT AAG TAT GAA ATA GTT AGA TAT GCA AAA GAA AAT TAT GAT TTT GAA GAG TAT TAT CAT GAT TTA TAA GAT GAA AAT AGA AAA TGT ATT TTA TTT AAT TTA ATT TAA ATT TAC AAA TTT TTT ATT TAA GGA TTA AAA TTT TAA TTA AAT TTA TAA ATA AAT AAA TAG TTT CTA TCA TAA AAA GGA TTC ATT AAA ATA ATT ATA ACA TTA CTT CTT TAC AAT TTC TAT TGA ACA AGC AGC AAT CTA ATG ATT ACT ATT CTA TCA AGC ATA TGA AAT ACA GGA TAC AGT GCT ACG TTA TAG ATA TTC AGC CAT CTT ATT TAT TAG ATG CTG TTA GAA GGA TAT CAT ACT TTG ATA AAA AAA TTA AGT AAT TTT TAA ATA CAA ATA TTT TAT GAT TTT TCA TTT AAA ATT TTT TTT TTC TAG CTA TCC TTT AAA GGA TTC AAA TTT CAA AAA TAT GAA TTA GCT AAA AAG AAT TTT AGA AGT TTA AAT TTT AGT CAA GGA CAC TTC AAT CGA CTT GAA CAA GGA TGT AGT TAA TAT TAT ACT TAT TTA AGA GGA GCT TCA AAA TGA TCA CGT ATA TAC ATA TAT ATA ATT TAA AAT AGC TTA TTA ATT TCT GAA AAT AAT TAA ATT TTA TTA GGA TTT TTT TAA AGG AGT TGA ATT ACT CAA AAT CGA AGA AGA AAA TGT ATA AGA GTA TCA AAA AGT TTA CTA TAA TAT ATT AAA TAG ACT ATT TAC AGA AAC AAG CTC ATC TAA AAT GGT GGA TAT TAT AGT TAA ACC ATT CTT ATT TCA ATA AAA AAT TTT ATA TAA AAT TAT TGA CAC TCA ATT TCT CCC CTG A