Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00222280

Standard Name

POP1 (Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1)

Aliases

PreTt12435 | 19.m00227

Description

POP1 ribonuclease P/MRP protein subunit POP1; Ribonucleases P/MRP protein subunit

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• ribonuclease P activity (IEA) | GO:0004526

Biological Process

• tRNA 5'-leader removal (IEA) | GO:0001682

Domains

• ( PF08170 ) POPLD (NUC188) domain
• ( TIGR01784 ) conserved hypothetical protein
• ( PF06978 ) Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%

TetraMine Data

TTHERM_00222280

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_05553.1	9.997093137033517e-262	ribonuclease P/MRP protein sub unit POP1 containing protein ( 757 aa)
DictyBase	DDB_G0291320	6.002971818577897e-50	pop1 on chromosome: 6 position 120925 to 123655
Oxytricha	Contig1019.1.g97	2.0003218023735366e-33	Ribonucleases P/MRP protein su bunit POP1
Stentor Coeruleus	SteCoe_8648	3.221340285992516e-27
WormBase	WBGene00015486	2.0002795641672355e-21	Uncharacterized protein C05D11 .9 status:Confirmed UniPro t:Q11188 protein_id:CCD63199 .1
SGD	YNL221C	0.00000030014504373857585	POP1 Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P; RNase MR P cleaves pre-rRNA, while nucl ear RNase P cleaves tRNA precu rsors to generate mature 5 end s and facilitates turnover of nuclear RNAs; binds to the RPR 1 RNA subunit in RNase P

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00222280(coding)
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>TTHERM_00222280(protein)
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KSQGNNMEIEDKQKNKKQNEIFCLIRNPTSRKYYLANLYLI

>TTHERM_00222280(gene)
ATGCAAGATAATTAAGCAAATAGTGATATTGTAATTGAAGATCGTCATATAAATGTGAGC
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AAATTTTTTCTATTTTTATGGAATTTTGATTCAAGAAATTCGTTGATTTTCTAATCTTTT
TAATTAAATCTTTATTGTAAAAGGGTTTTTATCATTTGGAGATTTTTCATTTAAATCTGG
AGTTGGAAAGGGAAGAGGCTAAATCATAAAGTATTATTTGGATGCTTTAAAAGCTAAAAG
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CTGCTTAATCCGTAATCCTACTTCAAGAAAGTACTATTTGGCAAACCTTTATTTAATTTG
A