Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00312730

Standard Name

POM121

Aliases

PreTt03460 | 30.m00269 | 3810.m01882

Description

hypothetical protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: Yes
Presense Probability: 80%

TetraMine Data

TTHERM_00312730

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_03287.19.997093137033517e-262hypothetical protein (1181 aa)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:28386019: Iwamoto M, Osakada H, Mori C, Fukuda Y, Nagao K, Obuse C, Hiraoka Y, Haraguchi T (2017) Compositionally distinct nuclear pore complexes of functionally distinct dimorphic nuclei in the ciliate Tetrahymena. Journal of cell science 130(10):1822-1834

Sequences

>TTHERM_00312730(coding)
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ATGCAAACTAATACAGGATTATAAATACCCTCTATTCAAGCAAGTATAGGAATAGCTTAA
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GAAAATAAGTTCGGTGGTGAAGGTGGTTTATTTGGAAATTTAGGTAAAAATTAGATTTCT
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TAAAATTCTTTATTCTAATTGAAAGAATAACCTAAAGTATCCACTTCTTAATTGTAAAGT
AGTTCGTAAGGAGGTTTATTTGGAAGTTAAAATTAATCATTAAGTCAATAAACCAATTAA
TCAGAACCTAACAAAAATACATCCTTATTTGGTAATTTATAAAGTTAAAATAAAGGGGGC
TTATTTGGCTCTAATGGAACAGGACTTTTTGCAAATTAATCTAGCAATTCTAATTAGTAA
AATGGTTTATTTGGAAATACTAGCCTATTTTCAAAACCAGCAGAGAGTGCTACATAATGA


>TTHERM_00312730(protein)
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>TTHERM_00312730(gene)
ATGGAAAATTAGCAAGTACTTTCTCTTTTGCTTTTCTTCCTTTAGATAATTATTGCCTTG
AAGACTTTGCATGCGTATTAATTAATTTTTAATTCAACCGTTATAAGTGGCTTCAGCCCT
TAAAATTTTCTATTGCTTAGTTAACTGTTCTTAGATATAAAATTTGAATTTAACTATCAA
ATTATTTAGCTCAATGCAGATTAATTAATATTTGTTTTTTCGTAAATGGATAGGTTGAAT
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AAGGATAAGGAATAAACAGTAGATCAAACAACTAAAAATTAGCATTAAATTGCATCGTAG
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TAGACAAGCAGTGGACCATCATTTAGCAATTTCGATATAGATGTCTCAACTACATAGAGA
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TAAACTCCTAACTTTAATACTAAAAATAATATTGTAGGCTAAAATAAGAGCAGAAAGAAC
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AATTTATAAACAAATAGTTATTAGAATCCAAAAAAGATAGCATCTAGTAACAACCAAGAT
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