Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00636920

Standard Name

POLD1 (DNA polymerase delta)

Aliases

PreTt19695 | 91.m00110

Description

DNA polymerase family B containing protein; homolog to human POLD1

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• DNA binding (IEA) | GO:0003677
• nucleotide binding (IEA) | GO:0000166
• DNA-directed DNA polymerase activity (IEA) | GO:0003887

Biological Process

• DNA replication (IEA) | GO:0006260

Domains

• ( PF00136 ) DNA polymerase family B
• ( TIGR00592 ) DNA polymerase (pol2)
• ( PF03104 ) DNA polymerase family B, exonuclease

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.3%

TetraMine Data

TTHERM_00636920

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Stentor Coeruleus	SteCoe_30428	0
WormBase	WBGene00008645	9.997093137033517e-262	DNA polymerase delta catalytic subunit status:Confirmed UniProt:P90829 protein_id:CA B04077.1
Tetrahymena borealis	EI9_03520.1	9.997093137033517e-262	DNA polymerase family B contai ning protein (1117 aa)
DictyBase	DDB_G0285381	9.997093137033517e-262	polD1 on chromosome: 4 positio n 3206066 to 3209653
Oxytricha	Contig17557.0.g86	9.997093137033517e-262	DNA polymerase family B
SGD	YDL102W	9.997093137033517e-262	POL3 Catalytic subunit of DNA polymerase delta; required for chromosomal DNA replication d uring mitosis and meiosis, int ragenic recombination, repair of double strand DNA breaks, a nd DNA replication during nucl eotide excision repair (NER)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00636920(coding)
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TTTGATGAATGGTGA

>TTHERM_00636920(protein)
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GKFIVKKESCLQCKCQVNGKQPVCDNCLEKNPQRLIDIYTEKIIQHQSIEYQYNQLWTQC
QRCQGSLHEQVICSNRDCPIYYKRTKLQTDLSRSQQLLSRFDEW

>TTHERM_00636920(gene)
ATGAACGACGATAATAGTGACTATTCATAAGAGCCAGAAGACTTTGGAGATGAACTTATT
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TTTAATTTAAAATAAAATGAAAAATAAATAATATTTTAAAATAAATAAATTAGATTGGAG
ATAGAATTCCTTATGTTATAGTAGCAGGAGCAAAATCAGCTAAAAATTATGAAAAAGTAG
AAGATCCAATTTATGTGTTAGAAAACGATATCCCTTTAGATTACGATTATTACATTGAAA
AGCAAATTAAAAATCCTATTACTCGTATTTATTCCCACATCATAGATAATGTTGATTCGT
TATTCTATGGAGAGCATACTAAAAATAGATATCAACCTAAAGTTAATAGTGGACATGGTT
TAGGAAAATTCATTGTAAAAAAAGAAAGTTGCTTACAATGTAAATGCTAAGTAAATGGTA
AATAGCCTGTTTGTGATAATTGTCTTGAAAAAAATCCTCAGAGATTGATTGATATATACA
CTGAAAAAATTATTTAGCATCAATCTATCGAGTATTAATATAACTAACTTTGGACTTAGT
GCCAAAGATGCCAAGGAAGTTTGCACGAATAAGTAATTTGCTCAAATAGAGACTGCCCTA
TTTATTACAAGAGAACTAAATTATAAACTGATTTATCTAGATCATAATAATTATTATCAC
GTTTTGATGAATGGTGA