Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00424700

Standard Name

POL1 (DNA polymerase alpha-primase complex catalytic subunit POL1)

Aliases

PreTt14004 | 47.m00199

Description

POL1 DNA polymerase II; DNA polymerase catalytic subunit

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00136 ) DNA polymerase family B
  • ( TIGR00592 ) DNA polymerase (pol2)
  • ( TIGR01396 ) flagellar basal-body rod protein FlgB
  • ( PF03104 ) DNA polymerase family B, exonuclease

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.3%

TetraMine Data

TTHERM_00424700

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_00216.19.997093137033517e-262DNA polymerase catalytic subun
it (3569 aa)
OxytrichaContig22794.0.g894.998437866964194e-166DNA polymerase family B
WormBaseWBGene000129365.0014192254601655e-126DNA polymerase status:Partia
lly_confirmed UniProt:Q9NAH1
protein_id:CAB97239.2
SGDYNL102W9.997962730346853e-122POL1 Catalytic subunit of the
DNA polymerase I alpha-primase
complex, required for the ini
tiation of DNA replication dur
ing mitotic DNA synthesis and
premeiotic DNA synthesis
DictyBaseDDB_G02821918.002072745601587e-114polA1 on chromosome: 3 positio
n 5500018 to 5504728
Stentor CoeruleusSteCoe_304284.248354255291589e-18

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00424700(coding)
ATGAGTGACAAATTAACAAGATTAGAGAGACTCAATAAAGAAGTCAAAAAGCAAAACAAG
CTCAAATAGCACTCAAAGAACAATCGCTTTGATGATGACATGGATATTGAGGCATATGAG
GATGATGAATAGATAGAAGAAGATGATTTTATAGATGACACATAAGATAAAAAGAAATAT
AGAGAAATAGAAGATGAGTTCGACCAAGAGATTGAAGAGGAAGAGGAGTTAAATAAAAAG
AAGAAGACTAAGAATACAATTTTAAATTATACAAACACCACAGCTGTTACCAATAATAAG
AAAAAGGCAATTAGCAAGTAGATTCCAGATATTGATATTGAAGAAATTATGAAGCTAACT
GAGAGGAAAAAAAAAATAGAGTAAGAAGAAGCTCAGCTACTTTAGGAAGAACAAGAACTC
TTAGAATAAGAAAAAAGGGAGGAAGAGGAAAAGAAGCGTATTAGTTAAGAAGCAAAAAGT
ATTTTAAGAGAAGATTGTGCCTCTTCAAAGACAGCAAATAGCAGCAAAGGGAAAGTAGAT
TAGAATATTTTAAATGCAATCAACAGAGACTTTTCTGATGACAGTAATACAGTAGACAGC
ATTTCTGAATTTTAGAAATTAAAAAGTTTAGCACAAAAAGCTAATTTGGCAAACGAGAGC
CTAAAATAAAGCAAAGTCAGCAATACAGAAATTAATTTGACTAACCTCTCTATTTCTTAA
GTGAAAAAGATCAATGACTATAAGAATGAAGATGGTTCTGTTGATGCTTATTTGTATGAT
TACTTTTATGATGCCTAAGTTAAACCTGATAAAATATATGCATTTGCCAAAGTTTAAAAC
AAGCAAACAAATGCTTTTGATACTTGTGTTATTCAAATTGATACTATTATCAGAAATCTC
TTCTTCTATCCTTCTTCTGACACAGTTACTGAGCAGCAAATTAAAAATGAAATTGCAGAA
CTTTTAAAGAAGGAGCAAACATCACGTAAAAATGTAGAATTTTTAGGTGCTTTTGTTGAT
AAGAACTACGCTTTTGAATTGCCTATACCAAGAGGTAAAAGTAGATGGTATTAAGTTGTA
ATGTCTTATGAATATGAAGTGATTAGTCCAGATACAAAGGGATAATATTTTTCTTATTGT
GTTGGTTCTACTTACAGTGCTTTAGAGACATTCCTCATTACAAAGAAAATTACTGGACCA
AGTTGGGTACGCTTTTAAAATGTGAAGGATACTACTTCATGCATAACAAATAGAAAATTA
GAATTTAGAGTAGATTATACTAATTAATCAAATATATAAGTATTACAAAAATAATTGCCA
ACTCCTCCCTTGAGCGTTGTTTGTATCTCACTTAAAACTAGCTAGCAAATTGTACTCAGT
TAAAAGAAAAAGGAATATAAAAAGGAAATCTTTAATCTAAACATGAAATACCACGAAGGT
ATAAATATTGATAATTCAAACAAAGATGAACTCAACTAGTTTAAGAGTATTTCCTTCATA
ACTCACATAGATCCCACTAAAAAGTAAGATAGTATCACTAAAAAGGGTACTCTTCCTGAA
ACAACTAAGTTTTGCTTAAATGAACTGAACCTATTAGAGTAGTTTTTAGTTCATTTTAAT
GAGATTGATCCTGATATTGTTGTGGCACATGATCTATACTCTACTGTTTTTGAAATTATT
CTCACAAGAATCCGTGAAAAGGGAATCAGAAAATGGAATCTTCTTTCCAAGCTTATAAAT
ATTGGCTCGTCTGACATTCCAAAATATGGTTCTTCTACTTTTAAAACTAAAATGGCAATG
AAAGGTCGTCTTTTAGTAGACACTTTATTGAGTTCTCAAGAATTCGTTAACTGTGTTGAG
TACACTCTTGAAGCCTTGGCTTAAAAGCTCTTTAAAATAGAAATTCCCAGAATAGATGCA
AAGGCTTATTAATAGAAATTCGCTACTTATAAATTGCTTAACAGTTTGGTAGATGACACA
TATTAGGATATTGATTATGCACTTAGGATCATGTACCATTTACAAATTGTTCCTCTTACT
AAGTAACTTACTTCAATTTGTGGTAACATTTGGATGGGTTCCCTATAAAACTAAAGAGCA
GAAAGAAACGAAATGCTTCTCCTTCATAAGTTTAATTAACTGAATTACGTTTATCCTGAT
AATTTTAAAAATCTACCAGAATCATATAAAAAGAAACACAAAAATGCTTAGATTAGAAAG
TAATATGAAGAAGATGAGGATTAAGCTCAAGGAAATAAAAATCCTAAAAAGAAAGAAAAT
AAATACAAGGGTGGTTAAGTATTTGAACCTGAAAAAGGTTTGTATAATGAGTACATCGTA
CTGTTGGATTTCAACTCTCTTTATCCTTCAATTATATAGGAATTCAATGTTTGCTTTACT
ACTTGCGTGAGAGATCCTATACCTCTTGAAATGCAAATGGCTCCCTTCTTGGGAAATAAA
AAGGCTGCTATTTAATACTCTAAAAATTAAAATACTAAAGAGAATAAAATGTAAGATGAA
GACGAGGAAGACAATGAAAATGAATAAATTGTTCAAACTCATGATGTTCTTCCTACCATA
GAAGTTATTAAAGGAATTGCTCCTCTTCCATCAATTTTATAATATTTGGTAGAACAAAGA
AAAGTTGTAAAGAATCAAATCAAAGGCTAAAAAGATCCATAAGTTATCGAAACTTTAGAT
ATTAAATAGAAAGCTTTCAAGCTTGTTGCTAATTCTATGTATGGTTGCTTGGGTTTCAGC
TCTTCTCGTTTCTATGCTATGCCACTTGCATCCTTCATTACAGCTAAAGGTAGACATATT
CTATTTGATTCAAAGAAAATTGTAGAAGACATGGGCTATTCTGTAATCTATGGTGACACA
GATTCTTTGATGATAAAACCTGGCACAAATGAGTTCCTTGAAGCAGTAAAAACAGGCTTA
AGCATAAAAATAAAAGTCAACAGCAAATATAAGAAACTTTAATTAGACATTGATGGTGTG
TTCAAAAATATGCTTTTACTCAAAAAGAAAAAATATGCTACTTTGAAGGTTGCAAACTGG
GAAGAGGTAAAAAATACAAATGCTCCTGAAAAGTTAGAAAAAGAAATTAAAGGTATTGAC
GTTGTTCGTAGAGATTGGTGTTAATTATCCAGAGATGCTGGTAATAAAATCCTAGAAATT
ATATTAGAGAGCAAAAGCAGTGAAAATATGTTAGATGATATCAAGAAATATTTGATTTAG
CTGAATGATGACATAAATTAAAAGAACATTAAAAACAGCAACTATTATATCACTAAGCGT
TTGACTAAAAGAGTAGATTAATATGGTGAAAAGAACCTTCCTCACGTAGCTGTTGCTCAA
AGATCCATTTAAGAAAAAGGTATTGACCCTTAAACATACGTCAATCAAATTATCAGTTAT
ATCATCTGCAAAAATGAATAATCTAGCAGATTAGTAGATAAGGCTTATAGTCCTTAAGAA
TTTATCACTTAAAGTAAAAGTTTGGAAATAGACTTATAATACTATAAGAGATTTTAACTT
TTTGAACCAATAAAGAGAATGTTAGAAGTAATCGAGGGTATTAATCTTTAAGAAATTGCA
AGTATTCTTGAAGTTCACTACTCTGTCTAGCATGTTAGTTAAAATAATGAACTAAATGCT
GAAAATGTACTTAACTTGAAGAGTAAAAGAAATCAATTTTTAACATCTATTCCTCGTGTA
TTGGTAGATTGTAAGAAGTGTGATCAAACTTTCTTGTTTTTAGGTATTCTTGAAGAAAAT
GCAGATGCTGCTTCGATTCTAAAATGCAAGTGTGGAAACGATATTTATATTTAACTTAAA
AATAAAATAGCTCTTGTTGTTAAAGAGTTAATTAGAAATTTTGAAGAAAATGCAATTCAA
ATTGATAATGAAGAATTTGAATATACTCACTAAATTTCTTTAGTAGGAAAAGCCAAATAA
TAAAAAATGAGTAGCTTCACTTTGAACTAAAAGCTTCTTTCTATTCAAGCTATGTTTGAT
ATCACAAAAGAGGAATAAGAAAATACTCAAAAGGTCACTATAGAAAAAATAAAAACAATT
AAAAAAACACTTGATGATTTATTGTCAAAATCTTAATACAATAATTTAAATTTAAGCAAT
ATTTTTACAAGTTTCGGGTTATTAAAATGA


>TTHERM_00424700(protein)
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REIEDEFDQEIEEEEELNKKKKTKNTILNYTNTTAVTNNKKKAISKQIPDIDIEEIMKLT
ERKKKIEQEEAQLLQEEQELLEQEKREEEEKKRISQEAKSILREDCASSKTANSSKGKVD
QNILNAINRDFSDDSNTVDSISEFQKLKSLAQKANLANESLKQSKVSNTEINLTNLSISQ
VKKINDYKNEDGSVDAYLYDYFYDAQVKPDKIYAFAKVQNKQTNAFDTCVIQIDTIIRNL
FFYPSSDTVTEQQIKNEIAELLKKEQTSRKNVEFLGAFVDKNYAFELPIPRGKSRWYQVV
MSYEYEVISPDTKGQYFSYCVGSTYSALETFLITKKITGPSWVRFQNVKDTTSCITNRKL
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IKQKAFKLVANSMYGCLGFSSSRFYAMPLASFITAKGRHILFDSKKIVEDMGYSVIYGDT
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EEVKNTNAPEKLEKEIKGIDVVRRDWCQLSRDAGNKILEIILESKSSENMLDDIKKYLIQ
LNDDINQKNIKNSNYYITKRLTKRVDQYGEKNLPHVAVAQRSIQEKGIDPQTYVNQIISY
IICKNEQSSRLVDKAYSPQEFITQSKSLEIDLQYYKRFQLFEPIKRMLEVIEGINLQEIA
SILEVHYSVQHVSQNNELNAENVLNLKSKRNQFLTSIPRVLVDCKKCDQTFLFLGILEEN
ADAASILKCKCGNDIYIQLKNKIALVVKELIRNFEENAIQIDNEEFEYTHQISLVGKAKQ
QKMSSFTLNQKLLSIQAMFDITKEEQENTQKVTIEKIKTIKKTLDDLLSKSQYNNLNLSN
IFTSFGLLK


>TTHERM_00424700(gene)
ATGAGTGACAAATTAACAAGATTAGAGAGACTCAATAAAGAAGTCAAAAAGCAAAACAAG
CTCGTAATTAATCGAGTTCTTTTTTAGGATATCAATCAATTTTTTTATCAAATGTAATTA
GAAATAGCACTCAAAGAACAATCGCTTTGATGATGACATGGATATTGAGGCATATGAGGA
TGATGAATAGATAGAAGAAGATGATTTTATAGATGACACATAAGGTTAATTAATTAATTA
AACAAATGATATATCTTATCTATTTTTTATTATTAATAGAGGATAAAAAATGTAATAATT
TTAATGACAGAAATCTTAGATTTCAGAGAAAGCAAACAAGAGCAATTTATTTTACAATTT
AAATATTTAGATAAAAAGAAATATAGAGAAATAGAAGATGAGTTCGACCAAGAGATTGAA
GAGGAAGAGGAGTTAAATAAAAAGAAGAAGACTAAGAATACAATTTTAAATTATACAAAC
ACCACAGCTGTTACCAATAATAAGAAAAAGGCAATTAGCAAGTAGATTCCAGATATTGAT
ATTGAAGAAATTATGAAGCTAACTGAGAGGAAAAAAAAAATAGAGTAAGAAGAAGCTCAG
CTACTTTAGGAAGAACAAGAACTCTTAGGTAGAATTTTGTTAAATAGATTTTTTAGTAAT
TAACTTAACTAGAATAAGAAAAAAGGGAGGAAGAGGAAAAGAAGCGTATTAGTTAAGAAG
CAAAAAGTATTTTAAGAGAAGATTGTGCCTCTTCAAAGACAGCAAATAGCAGCAAAGGGA
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TAGACAGCATTTCTGAATTTTAGAAATTAAAAAGTTTAGCACAAAAAGCTAATTTGGCAA
ACGAGAGCCTAAAATAAAGCAAAGTCAGCAATACAGAAATTAATTTGACTAACCTCTCTA
TTTCTTAAGTGAAAAAGATCAATGACTATAAGAATGAAGATGGTAAATTTGGAATTAATT
TTGTTTTATAATAGATTTATATGTTGTAAATTAATTTTAAAAATAAATAGGTTCTGTTGA
TGCTTATTTGTATGATTACTTTTATGATGCCTAAGTTAAACCTGATAAAATATATGCATT
TGCCAAAGTTTAAAACAAGCAAACAAATGCTTTTGATACTTGTGTTATTCAAATTGATAC
TATTATCAGAAATCTCTTCTTCTATCCTTCTTCTGACACAGTTACTGAGCAGGTATCAAT
TAAAAATTCATTCATTATTTTAAACCTATAAACTAAACAAATAATTAGAAATGATTTTTA
ATCTTTCCTTATTTATTTATTAATGTAGTCTAATTTCTTTATTGTGATAGAAATTTTTTA
ATTTTAAAAGTATTCCTTAGAATTAAATTGTAAAAATAAATAAAAGGGATAAATAAAATA
ATAAAATTTAAAGTCATATGAAAAATTTAATAAAGGTTCAATATAAATGTTGGTCAAATA
GCAATTAATTTAGCAAATAAATAGAGTCTATTTCATAGATAATAATTATTCAATTAAATA
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AGAATTTAGAGTAGATTATACTAATTAATCAAATATATAAGTATTACAAAAATAATTGCC
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AACTCACATAGATCCCACTAAAAAGTAAGATAGTATCACTAAAAAGGGTACTCTTCCTGA
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GTTCCCTATAAAACTAAAGAGCAGAAAGAAACGAAATGCTTCTCCTTCATAAGTTTAATT
AAGTAATTATTGAACTAACTAAAAATTACATTATTAATAATTTATTAAATATAATTAATT
AAAGCTGAATTACGTTTATCCTGATAATTTTAAAAATCTACCAGAATCATATAAAAAGAA
ACACAAAAATGCTTAGATTAGAAAGTAATATGAAGAAGATGAGGATTAAGCTCAAGGAAA
TAAAAATCCTAAAAAGAAAGAAAATAAATACAAGGGTGGTTAAGTATTTGAACCTGAAAA
AGGTTTGTATAATGAGTACATCGTACTGTTGGATTTCAACTCTCTTTATCCTTCAATTAT
ATAGGAATTCAATGTTTGCTTTACTACTTGCGTGAGAGATCCTATACCTCTTGAAATGCA
AATGGCTCCCTTCTTGGGAAATAAAAAGGCTGCTATTTAATACTCTAAAAATTAAAATAC
TAAAGAGAATAAAATGTAAGATGAAGACGAGGAAGACAATGAAAATGAATAAATTGTTCA
AACTCATGATGTTCTTCCTACCATAGAAGTTATTAAAGGAATTGCTCCTCTTCCATCAAT
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TCCATAAGTTATCGAAACTTTAGATATTAAATAGAAAGCTTTCAAGCTTGTTGCTAATTC
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TATTATAGGTAGACATATTCTATTTGATTCAAAGAAAATTGTAGAAGACATGGGCTATTC
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TATAATTAGGTATTGACGTTGTTCGTAGAGATTGGTGTTAATTATCCAGAGATGCTGGTA
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AGAAATATTTGATTTAGCTGAGTAATTTAATAAAAATTTTGAAATTTATTCTATTTATTA
TAATTAATCTTTAAATTAATAAATAGATGATGACATAAATTAAAAGAACATTAAAAACAG
CAACTATTATATCACTAAGCGTTTGACTAAAAGAGTAGATTAATATGGTGAAAAGAACCT
TCCTCACGTAGCTGTTGCTCAAAGATCCATTTAAGAAAAAGGTATTGACCCTTAAACATA
CGTCAATCAAATTATCAGTTATATCATCTGCAAAAATGAATAATCTGTAAGCTTTCTTAG
TTAATTTTAATTCAAAAAATAAAATAAATAATATTTTTGGTCTCTAAGATTGTTAAATCT
AAATGAAGATTAGATATAAAAAATAAGTATCCTTTATAGAGTTTTTCTCTATAATAAATA
TATTTTTTAGAAATTATTTTTCGTTGATTCATGCATGGTTAATATTTAAAGAGAAAAGTG
GTGGTTATTGTAAATGCAAGAGAGGACAATTTATTACTAAATTCAAATAAAACATTTAGA
TAATATTTTATTAAAAATTATTATTTTGCTATTCTTGAAAAAAATAAAAATAAATAAAGC
TTTTTATTTAAATTTAACATTAAAAACACAATAAAATTGAACATTTTTATGATGCTAATT
TTAAAAATATTTCTTCAAAAAAAGCTAAAATTATAATGGAAAAATTTTTTATAACAATAA
ATAAACCTTTAAGAAGAAATTTTGTTTAAAAAATTGCTTAGAGACTAAAAGATATTTTTA
TTTTTATGAAATACTTTATTAATTTATTATTTAATTTAACAGAGCAGATTAGTAGATAAG
GCTTATAGTCCTTAAGAATTTATCACTTAAAGTAAAAGTTTGGAAATAGACTTATAATAC
TATAAGAGATTTTAACTTTTTGAACCAATAAAGAGAATGTTAGAAGTAATCGAGGGTATT
AATCTTTAAGAAATTGCAAGTATTCTTGAAGTTCACTACTCTGTCTAGCATGTTAGTTAG
TAAAAAAAACAAGATTAATTTATTATAATATTAACTTTTAATCTAAAATTAATTTAGAAA
TAATGAACTAAATGCTGAAAATGTACTTAACTTGAAGAGTAAAAGAAATCAATTTTTAAC
ATCTATTCCTCGTGTATTGGTAGATTGTAAGAAGTGTGATCAAACTTTCTTGTTTTTAGG
TATTCTTGAAGAAAATGCAGATGCTGCTTCGATTCTAAAATGCAAGTGTGGAAACGATAT
TTATATTTAACTTAAAAATAAAATAGCTCTTGTTGTTAAAGAGTTAATTAGAAATTTTGA
AGAAAATGCAATTCAAATTGATAATGAAGAATTTGAATATACTCACTAAATTTCTTTAGT
AGGAAAAGCCAAATAATAAAAAATGAGTAGCTTCACTTTGAACTAAAAGCTTCTTTCTAT
TCAAGCTATGTTTGATATCACAAAAGAGTAAATTTGAAAATAATTAGAAATAAGTAAATA
AATATATCATGAATTTTAATTTTATTTAATCAGGGAATAAGAAAATACTCAAAAGGTCAC
TATAGAAAAAATAAAAACAATTAAAGTAATTTATTTATTCAATATATTTTATTCATTAAT
TAATCTATTTTTATTTTAAAAGAAAACACTTGATGATTTATTGTCAAAATCTTAATACAA
TAATTTAAATTTAAGCAATATTTTTACAAGTTTCGGGTTATTAAAATGA