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Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00424700Standard Name
POL1 (DNA polymerase alpha-primase complex catalytic subunit POL1)Aliases
PreTt14004 | 47.m00199Description
POL1 DNA polymerase II; DNA polymerase catalytic subunitGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- nucleotide binding (IEA) | GO:0000166
- DNA-directed DNA polymerase activity (IEA) | GO:0003887
- DNA binding (IEA) | GO:0003677
Biological Process
- DNA replication (IEA) | GO:0006260
Domains
Gene Expression Profile
- Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.3%
TetraMine Data
TTHERM_00424700
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_00216.1 9.997093137033517e-262 DNA polymerase catalytic subun
it (3569 aa)
Oxytricha Contig22794.0.g89 4.998437866964194e-166 DNA polymerase family B
WormBase WBGene00012936 5.0014192254601655e-126 DNA polymerase status:Partia
lly_confirmed UniProt:Q9NAH1
protein_id:CAB97239.2
SGD YNL102W 9.997962730346853e-122 POL1 Catalytic subunit of the
DNA polymerase I alpha-primase
complex, required for the ini
tiation of DNA replication dur
ing mitotic DNA synthesis and
premeiotic DNA synthesis
DictyBase DDB_G0282191 8.002072745601587e-114 polA1 on chromosome: 3 positio
n 5500018 to 5504728
Stentor Coeruleus SteCoe_30428 4.248354255291589e-18
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00424700(coding)
ATGAGTGACAAATTAACAAGATTAGAGAGACTCAATAAAGAAGTCAAAAAGCAAAACAAG
CTCAAATAGCACTCAAAGAACAATCGCTTTGATGATGACATGGATATTGAGGCATATGAG
GATGATGAATAGATAGAAGAAGATGATTTTATAGATGACACATAAGATAAAAAGAAATAT
AGAGAAATAGAAGATGAGTTCGACCAAGAGATTGAAGAGGAAGAGGAGTTAAATAAAAAG
AAGAAGACTAAGAATACAATTTTAAATTATACAAACACCACAGCTGTTACCAATAATAAG
AAAAAGGCAATTAGCAAGTAGATTCCAGATATTGATATTGAAGAAATTATGAAGCTAACT
GAGAGGAAAAAAAAAATAGAGTAAGAAGAAGCTCAGCTACTTTAGGAAGAACAAGAACTC
TTAGAATAAGAAAAAAGGGAGGAAGAGGAAAAGAAGCGTATTAGTTAAGAAGCAAAAAGT
ATTTTAAGAGAAGATTGTGCCTCTTCAAAGACAGCAAATAGCAGCAAAGGGAAAGTAGAT
TAGAATATTTTAAATGCAATCAACAGAGACTTTTCTGATGACAGTAATACAGTAGACAGC
ATTTCTGAATTTTAGAAATTAAAAAGTTTAGCACAAAAAGCTAATTTGGCAAACGAGAGC
CTAAAATAAAGCAAAGTCAGCAATACAGAAATTAATTTGACTAACCTCTCTATTTCTTAA
GTGAAAAAGATCAATGACTATAAGAATGAAGATGGTTCTGTTGATGCTTATTTGTATGAT
TACTTTTATGATGCCTAAGTTAAACCTGATAAAATATATGCATTTGCCAAAGTTTAAAAC
AAGCAAACAAATGCTTTTGATACTTGTGTTATTCAAATTGATACTATTATCAGAAATCTC
TTCTTCTATCCTTCTTCTGACACAGTTACTGAGCAGCAAATTAAAAATGAAATTGCAGAA
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AAGAACTACGCTTTTGAATTGCCTATACCAAGAGGTAAAAGTAGATGGTATTAAGTTGTA
ATGTCTTATGAATATGAAGTGATTAGTCCAGATACAAAGGGATAATATTTTTCTTATTGT
GTTGGTTCTACTTACAGTGCTTTAGAGACATTCCTCATTACAAAGAAAATTACTGGACCA
AGTTGGGTACGCTTTTAAAATGTGAAGGATACTACTTCATGCATAACAAATAGAAAATTA
GAATTTAGAGTAGATTATACTAATTAATCAAATATATAAGTATTACAAAAATAATTGCCA
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TAAAAGAAAAAGGAATATAAAAAGGAAATCTTTAATCTAAACATGAAATACCACGAAGGT
ATAAATATTGATAATTCAAACAAAGATGAACTCAACTAGTTTAAGAGTATTTCCTTCATA
ACTCACATAGATCCCACTAAAAAGTAAGATAGTATCACTAAAAAGGGTACTCTTCCTGAA
ACAACTAAGTTTTGCTTAAATGAACTGAACCTATTAGAGTAGTTTTTAGTTCATTTTAAT
GAGATTGATCCTGATATTGTTGTGGCACATGATCTATACTCTACTGTTTTTGAAATTATT
CTCACAAGAATCCGTGAAAAGGGAATCAGAAAATGGAATCTTCTTTCCAAGCTTATAAAT
ATTGGCTCGTCTGACATTCCAAAATATGGTTCTTCTACTTTTAAAACTAAAATGGCAATG
AAAGGTCGTCTTTTAGTAGACACTTTATTGAGTTCTCAAGAATTCGTTAACTGTGTTGAG
TACACTCTTGAAGCCTTGGCTTAAAAGCTCTTTAAAATAGAAATTCCCAGAATAGATGCA
AAGGCTTATTAATAGAAATTCGCTACTTATAAATTGCTTAACAGTTTGGTAGATGACACA
TATTAGGATATTGATTATGCACTTAGGATCATGTACCATTTACAAATTGTTCCTCTTACT
AAGTAACTTACTTCAATTTGTGGTAACATTTGGATGGGTTCCCTATAAAACTAAAGAGCA
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AATTTTAAAAATCTACCAGAATCATATAAAAAGAAACACAAAAATGCTTAGATTAGAAAG
TAATATGAAGAAGATGAGGATTAAGCTCAAGGAAATAAAAATCCTAAAAAGAAAGAAAAT
AAATACAAGGGTGGTTAAGTATTTGAACCTGAAAAAGGTTTGTATAATGAGTACATCGTA
CTGTTGGATTTCAACTCTCTTTATCCTTCAATTATATAGGAATTCAATGTTTGCTTTACT
ACTTGCGTGAGAGATCCTATACCTCTTGAAATGCAAATGGCTCCCTTCTTGGGAAATAAA
AAGGCTGCTATTTAATACTCTAAAAATTAAAATACTAAAGAGAATAAAATGTAAGATGAA
GACGAGGAAGACAATGAAAATGAATAAATTGTTCAAACTCATGATGTTCTTCCTACCATA
GAAGTTATTAAAGGAATTGCTCCTCTTCCATCAATTTTATAATATTTGGTAGAACAAAGA
AAAGTTGTAAAGAATCAAATCAAAGGCTAAAAAGATCCATAAGTTATCGAAACTTTAGAT
ATTAAATAGAAAGCTTTCAAGCTTGTTGCTAATTCTATGTATGGTTGCTTGGGTTTCAGC
TCTTCTCGTTTCTATGCTATGCCACTTGCATCCTTCATTACAGCTAAAGGTAGACATATT
CTATTTGATTCAAAGAAAATTGTAGAAGACATGGGCTATTCTGTAATCTATGGTGACACA
GATTCTTTGATGATAAAACCTGGCACAAATGAGTTCCTTGAAGCAGTAAAAACAGGCTTA
AGCATAAAAATAAAAGTCAACAGCAAATATAAGAAACTTTAATTAGACATTGATGGTGTG
TTCAAAAATATGCTTTTACTCAAAAAGAAAAAATATGCTACTTTGAAGGTTGCAAACTGG
GAAGAGGTAAAAAATACAAATGCTCCTGAAAAGTTAGAAAAAGAAATTAAAGGTATTGAC
GTTGTTCGTAGAGATTGGTGTTAATTATCCAGAGATGCTGGTAATAAAATCCTAGAAATT
ATATTAGAGAGCAAAAGCAGTGAAAATATGTTAGATGATATCAAGAAATATTTGATTTAG
CTGAATGATGACATAAATTAAAAGAACATTAAAAACAGCAACTATTATATCACTAAGCGT
TTGACTAAAAGAGTAGATTAATATGGTGAAAAGAACCTTCCTCACGTAGCTGTTGCTCAA
AGATCCATTTAAGAAAAAGGTATTGACCCTTAAACATACGTCAATCAAATTATCAGTTAT
ATCATCTGCAAAAATGAATAATCTAGCAGATTAGTAGATAAGGCTTATAGTCCTTAAGAA
TTTATCACTTAAAGTAAAAGTTTGGAAATAGACTTATAATACTATAAGAGATTTTAACTT
TTTGAACCAATAAAGAGAATGTTAGAAGTAATCGAGGGTATTAATCTTTAAGAAATTGCA
AGTATTCTTGAAGTTCACTACTCTGTCTAGCATGTTAGTTAAAATAATGAACTAAATGCT
GAAAATGTACTTAACTTGAAGAGTAAAAGAAATCAATTTTTAACATCTATTCCTCGTGTA
TTGGTAGATTGTAAGAAGTGTGATCAAACTTTCTTGTTTTTAGGTATTCTTGAAGAAAAT
GCAGATGCTGCTTCGATTCTAAAATGCAAGTGTGGAAACGATATTTATATTTAACTTAAA
AATAAAATAGCTCTTGTTGTTAAAGAGTTAATTAGAAATTTTGAAGAAAATGCAATTCAA
ATTGATAATGAAGAATTTGAATATACTCACTAAATTTCTTTAGTAGGAAAAGCCAAATAA
TAAAAAATGAGTAGCTTCACTTTGAACTAAAAGCTTCTTTCTATTCAAGCTATGTTTGAT
ATCACAAAAGAGGAATAAGAAAATACTCAAAAGGTCACTATAGAAAAAATAAAAACAATT
AAAAAAACACTTGATGATTTATTGTCAAAATCTTAATACAATAATTTAAATTTAAGCAAT
ATTTTTACAAGTTTCGGGTTATTAAAATGA>TTHERM_00424700(protein)
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EEVKNTNAPEKLEKEIKGIDVVRRDWCQLSRDAGNKILEIILESKSSENMLDDIKKYLIQ
LNDDINQKNIKNSNYYITKRLTKRVDQYGEKNLPHVAVAQRSIQEKGIDPQTYVNQIISY
IICKNEQSSRLVDKAYSPQEFITQSKSLEIDLQYYKRFQLFEPIKRMLEVIEGINLQEIA
SILEVHYSVQHVSQNNELNAENVLNLKSKRNQFLTSIPRVLVDCKKCDQTFLFLGILEEN
ADAASILKCKCGNDIYIQLKNKIALVVKELIRNFEENAIQIDNEEFEYTHQISLVGKAKQ
QKMSSFTLNQKLLSIQAMFDITKEEQENTQKVTIEKIKTIKKTLDDLLSKSQYNNLNLSN
IFTSFGLLK>TTHERM_00424700(gene)
ATGAGTGACAAATTAACAAGATTAGAGAGACTCAATAAAGAAGTCAAAAAGCAAAACAAG
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GAAATAGCACTCAAAGAACAATCGCTTTGATGATGACATGGATATTGAGGCATATGAGGA
TGATGAATAGATAGAAGAAGATGATTTTATAGATGACACATAAGGTTAATTAATTAATTA
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AAATATTTAGATAAAAAGAAATATAGAGAAATAGAAGATGAGTTCGACCAAGAGATTGAA
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ACCACAGCTGTTACCAATAATAAGAAAAAGGCAATTAGCAAGTAGATTCCAGATATTGAT
ATTGAAGAAATTATGAAGCTAACTGAGAGGAAAAAAAAAATAGAGTAAGAAGAAGCTCAG
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TAGACAGCATTTCTGAATTTTAGAAATTAAAAAGTTTAGCACAAAAAGCTAATTTGGCAA
ACGAGAGCCTAAAATAAAGCAAAGTCAGCAATACAGAAATTAATTTGACTAACCTCTCTA
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TGCTTATTTGTATGATTACTTTTATGATGCCTAAGTTAAACCTGATAAAATATATGCATT
TGCCAAAGTTTAAAACAAGCAAACAAATGCTTTTGATACTTGTGTTATTCAAATTGATAC
TATTATCAGAAATCTCTTCTTCTATCCTTCTTCTGACACAGTTACTGAGCAGGTATCAAT
TAAAAATTCATTCATTATTTTAAACCTATAAACTAAACAAATAATTAGAAATGATTTTTA
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ATTTTAAAAGTATTCCTTAGAATTAAATTGTAAAAATAAATAAAAGGGATAAATAAAATA
ATAAAATTTAAAGTCATATGAAAAATTTAATAAAGGTTCAATATAAATGTTGGTCAAATA
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GTTCCCTATAAAACTAAAGAGCAGAAAGAAACGAAATGCTTCTCCTTCATAAGTTTAATT
AAGTAATTATTGAACTAACTAAAAATTACATTATTAATAATTTATTAAATATAATTAATT
AAAGCTGAATTACGTTTATCCTGATAATTTTAAAAATCTACCAGAATCATATAAAAAGAA
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TAAAAATCCTAAAAAGAAAGAAAATAAATACAAGGGTGGTTAAGTATTTGAACCTGAAAA
AGGTTTGTATAATGAGTACATCGTACTGTTGGATTTCAACTCTCTTTATCCTTCAATTAT
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AATGGCTCCCTTCTTGGGAAATAAAAAGGCTGCTATTTAATACTCTAAAAATTAAAATAC
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AACTCATGATGTTCTTCCTACCATAGAAGTTATTAAAGGAATTGCTCCTCTTCCATCAAT
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CGTCAATCAAATTATCAGTTATATCATCTGCAAAAATGAATAATCTGTAAGCTTTCTTAG
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AAATGAAGATTAGATATAAAAAATAAGTATCCTTTATAGAGTTTTTCTCTATAATAAATA
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TTTTTATTTAAATTTAACATTAAAAACACAATAAAATTGAACATTTTTATGATGCTAATT
TTAAAAATATTTCTTCAAAAAAAGCTAAAATTATAATGGAAAAATTTTTTATAACAATAA
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TTTTTATGAAATACTTTATTAATTTATTATTTAATTTAACAGAGCAGATTAGTAGATAAG
GCTTATAGTCCTTAAGAATTTATCACTTAAAGTAAAAGTTTGGAAATAGACTTATAATAC
TATAAGAGATTTTAACTTTTTGAACCAATAAAGAGAATGTTAGAAGTAATCGAGGGTATT
AATCTTTAAGAAATTGCAAGTATTCTTGAAGTTCACTACTCTGTCTAGCATGTTAGTTAG
TAAAAAAAACAAGATTAATTTATTATAATATTAACTTTTAATCTAAAATTAATTTAGAAA
TAATGAACTAAATGCTGAAAATGTACTTAACTTGAAGAGTAAAAGAAATCAATTTTTAAC
ATCTATTCCTCGTGTATTGGTAGATTGTAAGAAGTGTGATCAAACTTTCTTGTTTTTAGG
TATTCTTGAAGAAAATGCAGATGCTGCTTCGATTCTAAAATGCAAGTGTGGAAACGATAT
TTATATTTAACTTAAAAATAAAATAGCTCTTGTTGTTAAAGAGTTAATTAGAAATTTTGA
AGAAAATGCAATTCAAATTGATAATGAAGAATTTGAATATACTCACTAAATTTCTTTAGT
AGGAAAAGCCAAATAATAAAAAATGAGTAGCTTCACTTTGAACTAAAAGCTTCTTTCTAT
TCAAGCTATGTTTGATATCACAAAAGAGTAAATTTGAAAATAATTAGAAATAAGTAAATA
AATATATCATGAATTTTAATTTTATTTAATCAGGGAATAAGAAAATACTCAAAAGGTCAC
TATAGAAAAAATAAAAACAATTAAAGTAATTTATTTATTCAATATATTTTATTCATTAAT
TAATCTATTTTTATTTTAAAAGAAAACACTTGATGATTTATTGTCAAAATCTTAATACAA
TAATTTAAATTTAAGCAATATTTTTACAAGTTTCGGGTTATTAAAATGA
