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Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00424700Standard Name
POL1 (DNA polymerase alpha-primase complex catalytic subunit POL1)Aliases
PreTt14004 | 47.m00199Description
DNA polymerase catalytic subunitGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- nucleotide binding (IEA) | GO:0000166
- DNA-directed DNA polymerase activity (IEA) | GO:0003887
- DNA binding (IEA) | GO:0003677
Biological Process
- DNA replication (IEA) | GO:0006260
Domains
Gene Expression Profile
- Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.3%
TetraMine Data
TTHERM_00424700
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_00216.1 9.997093137033517e-262 DNA polymerase catalytic subun
it (3569 aa)
Oxytricha Contig22794.0.g89 4.998437866964194e-166 DNA polymerase family B
WormBase WBGene00012936 5.0014192254601655e-126 DNA polymerase status:Partia
lly_confirmed UniProt:Q9NAH1
protein_id:CAB97239.2
SGD YNL102W 9.997962730346853e-122 POL1 Catalytic subunit of the
DNA polymerase I alpha-primase
complex, required for the ini
tiation of DNA replication dur
ing mitotic DNA synthesis and
premeiotic DNA synthesis
DictyBase DDB_G0282191 8.002072745601587e-114 polA1 on chromosome: 3 positio
n 5500018 to 5504728
Stentor Coeruleus SteCoe_30428 4.248354255291589e-18
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00424700(coding)
ATGAGTGACAAATTAACAAGATTAGAGAGACTCAATAAAGAAGTCAAAAAGCAAAACAAG
CTCAAATAGCACTCAAAGAACAATCGCTTTGATGATGACATGGATATTGAGGCATATGAG
GATGATGAATAGATAGAAGAAGATGATTTTATAGATGACACATAAGAGGATAAAAAATAT
AAAAAGAAATATAGAGAAATAGAAGATGAGTTCGACCAAGAGATTGAAGAGGAAGAGGAG
TTAAATAAAAAGAAGAAGACTAAGAATACAATTTTAAATTATACAAACACCACAGCTGTT
ACCAATAATAAGAAAAAGGCAATTAGCAAGTAGATTCCAGATATTGATATTGAAGAAATT
ATGAAGCTAACTGAGAGGAAAAAAAAAATAGAGTAAGAAGAAGCTCAGCTACTTTAGGAA
GAACAAGAACTCTTAGAATAAGAAAAAAGGGAGGAAGAGGAAAAGAAGCGTATTAGTTAA
GAAGCAAAAAGTATTTTAAGAGAAGATTGTGCCTCTTCAAAGACAGCAAATAGCAGCAAA
GGGAAAGTAGATTAGAATATTTTAAATGCAATCAACAGAGACTTTTCTGATGACAGTAAT
ACAGTAGACAGCATTTCTGAATTTTAGAAATTAAAAAGTTTAGCACAAAAAGCTAATTTG
GCAAACGAGAGCCTAAAATAAAGCAAAGTCAGCAATACAGAAATTAATTTGACTAACCTC
TCTATTTCTTAAGTGAAAAAGATCAATGACTATAAGAATGAAGATGGTTCTGTTGATGCT
TATTTGTATGATTACTTTTATGATGCCTAAGTTAAACCTGATAAAATATATGCATTTGCC
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GCTTTTGTTGATAAGAACTACGCTTTTGAATTGCCTATACCAAGAGGTAAAAGTAGATGG
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AATAGAAAATTAGAATTTAGAGTAGATTATACTAATTAATCAAATATATAAGTATTACAA
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AAGCTTATAAATATTGGCTCGTCTGACATTCCAAAATATGGTTCTTCTACTTTTAAAACT
AAAATGGCAATGAAAGGTCGTCTTTTAGTAGACACTTTATTGAGTTCTCAAGAATTCGTT
AACTGTGTTGAGTACACTCTTGAAGCCTTGGCTTAAAAGCTCTTTAAAATAGAAATTCCC
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GTAGATGACACATATTAGGATATTGATTATGCACTTAGGATCATGTACCATTTACAAATT
GTTCCTCTTACTAAGTAACTTACTTCAATTTGTGGTAACATTTGGATGGGTTCCCTATAA
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GAGTACATCGTACTGTTGGATTTCAACTCTCTTTATCCTTCAATTATATAGGAATTCAAT
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GTAGAACAAAGAAAAGTTGTAAAGAATCAAATCAAAGGCTAAAAAGATCCATAAGTTATC
GAAACTTTAGATATTAAATAGAAAGCTTTCAAGCTTGTTGCTAATTCTATGTATGGTTGC
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TATGGTGACACAGATTCTTTGATGATAAAACCTGGCACAAATGAGTTCCTTGAAGCAGTA
AAAACAGGCTTAAGCATAAAAATAAAAGTCAACAGCAAATATAAGAAACTTTAATTAGAC
ATTGATGGTGTGTTCAAAAATATGCTTTTACTCAAAAAGAAAAAATATGCTACTTTGAAG
GTTGCAAACTGGGAAGAGGTAAAAAATACAAATGCTCCTGAAAAGTTAGAAAAAGAAATT
AAAGGTATTGACGTTGTTCGTAGAGATTGGTGTTAATTATCCAGAGATGCTGGTAATAAA
ATCCTAGAAATTATATTAGAGAGCAAAAGCAGTGAAAATATGTTAGATGATATCAAGAAA
TATTTGATTTAGCTGAATGATGACATAAATTAAAAGAACATTAAAAACAGCAACTATTAT
ATCACTAAGCGTTTGACTAAAAGAGTAGATTAATATGGTGAAAAGAACCTTCCTCACGTA
GCTGTTGCTCAAAGATCCATTTAAGAAAAAGGTATTGACCCTTAAACATACGTCAATCAA
ATTATCAGTTATATCATCTGCAAAAATGAATAATCTAGCAGATTAGTAGATAAGGCTTAT
AGTCCTTAAGAATTTATCACTTAAAGTAAAAGTTTGGAAATAGACTTATAATACTATAAG
AGATTTTAACTTTTTGAACCAATAAAGAGAATGTTAGAAGTAATCGAGGGTATTAATCTT
TAAGAAATTGCAAGTATTCTTGAAGTTCACTACTCTGTCTAGCATGTTAGTTAAAATAAT
GAACTAAATGCTGAAAATGTACTTAACTTGAAGAGTAAAAGAAATCAATTTTTAACATCT
ATTCCTCGTGTATTGGTAGATTGTAAGAAGTGTGATCAAACTTTCTTGTTTTTAGGTATT
CTTGAAGAAAATGCAGATGCTGCTTCGATTCTAAAATGCAAGTGTGGAAACGATATTTAT
ATTTAACTTAAAAATAAAATAGCTCTTGTTGTTAAAGAGTTAATTAGAAATTTTGAAGAA
AATGCAATTCAAATTGATAATGAAGAATTTGAATATACTCACTAAATTTCTTTAGTAGGA
AAAGCCAAATAATAAAAAATGAGTAGCTTCACTTTGAACTAAAAGCTTCTTTCTATTCAA
GCTATGTTTGATATCACAAAAGAGGAATAAGAAAATACTCAAAAGGTCACTATAGAAAAA
ATAAAAACAATTAAAAAAACACTTGATGATTTATTGTCAAAATCTTAATACAATAATTTA
AATTTAAGCAATATTTTTACAAGTTTCGGGTTATTAAAATGA>TTHERM_00424700(protein)
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KKKYREIEDEFDQEIEEEEELNKKKKTKNTILNYTNTTAVTNNKKKAISKQIPDIDIEEI
MKLTERKKKIEQEEAQLLQEEQELLEQEKREEEEKKRISQEAKSILREDCASSKTANSSK
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YQVVMSYEYEVISPDTKGQYFSYCVGSTYSALETFLITKKITGPSWVRFQNVKDTTSCIT
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VANWEEVKNTNAPEKLEKEIKGIDVVRRDWCQLSRDAGNKILEIILESKSSENMLDDIKK
YLIQLNDDINQKNIKNSNYYITKRLTKRVDQYGEKNLPHVAVAQRSIQEKGIDPQTYVNQ
IISYIICKNEQSSRLVDKAYSPQEFITQSKSLEIDLQYYKRFQLFEPIKRMLEVIEGINL
QEIASILEVHYSVQHVSQNNELNAENVLNLKSKRNQFLTSIPRVLVDCKKCDQTFLFLGI
LEENADAASILKCKCGNDIYIQLKNKIALVVKELIRNFEENAIQIDNEEFEYTHQISLVG
KAKQQKMSSFTLNQKLLSIQAMFDITKEEQENTQKVTIEKIKTIKKTLDDLLSKSQYNNL
NLSNIFTSFGLLK>TTHERM_00424700(gene)
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GAAATAGCACTCAAAGAACAATCGCTTTGATGATGACATGGATATTGAGGCATATGAGGA
TGATGAATAGATAGAAGAAGATGATTTTATAGATGACACATAAGGTTAATTAATTAATTA
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AAATATTTAGATAAAAAGAAATATAGAGAAATAGAAGATGAGTTCGACCAAGAGATTGAA
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TATTATCAGAAATCTCTTCTTCTATCCTTCTTCTGACACAGTTACTGAGCAGGTATCAAT
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GTTCCCTATAAAACTAAAGAGCAGAAAGAAACGAAATGCTTCTCCTTCATAAGTTTAATT
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AATGGCTCCCTTCTTGGGAAATAAAAAGGCTGCTATTTAATACTCTAAAAATTAAAATAC
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AACTCATGATGTTCTTCCTACCATAGAAGTTATTAAAGGAATTGCTCCTCTTCCATCAAT
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TCCATAAGTTATCGAAACTTTAGATATTAAATAGAAAGCTTTCAAGCTTGTTGCTAATTC
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TTTTTATGAAATACTTTATTAATTTATTATTTAATTTAACAGAGCAGATTAGTAGATAAG
GCTTATAGTCCTTAAGAATTTATCACTTAAAGTAAAAGTTTGGAAATAGACTTATAATAC
TATAAGAGATTTTAACTTTTTGAACCAATAAAGAGAATGTTAGAAGTAATCGAGGGTATT
AATCTTTAAGAAATTGCAAGTATTCTTGAAGTTCACTACTCTGTCTAGCATGTTAGTTAG
TAAAAAAAACAAGATTAATTTATTATAATATTAACTTTTAATCTAAAATTAATTTAGAAA
TAATGAACTAAATGCTGAAAATGTACTTAACTTGAAGAGTAAAAGAAATCAATTTTTAAC
ATCTATTCCTCGTGTATTGGTAGATTGTAAGAAGTGTGATCAAACTTTCTTGTTTTTAGG
TATTCTTGAAGAAAATGCAGATGCTGCTTCGATTCTAAAATGCAAGTGTGGAAACGATAT
TTATATTTAACTTAAAAATAAAATAGCTCTTGTTGTTAAAGAGTTAATTAGAAATTTTGA
AGAAAATGCAATTCAAATTGATAATGAAGAATTTGAATATACTCACTAAATTTCTTTAGT
AGGAAAAGCCAAATAATAAAAAATGAGTAGCTTCACTTTGAACTAAAAGCTTCTTTCTAT
TCAAGCTATGTTTGATATCACAAAAGAGTAAATTTGAAAATAATTAGAAATAAGTAAATA
AATATATCATGAATTTTAATTTTATTTAATCAGGGAATAAGAAAATACTCAAAAGGTCAC
TATAGAAAAAATAAAAACAATTAAAGTAATTTATTTATTCAATATATTTTATTCATTAAT
TAATCTATTTTTATTTTAAAAGAAAACACTTGATGATTTATTGTCAAAATCTTAATACAA
TAATTTAAATTTAAGCAATATTTTTACAAGTTTCGGGTTATTAAAATGA
