Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01308010

Standard Name

POC1 (Proteome of centriole 1)

Aliases

PreTt02574 | 318.m00023

Description

a conserved centriole and basal body protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00400 ) WD domain, G-beta repeat
  • ( TIGR01396 ) flagellar basal-body rod protein FlgB

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

TetraMine Data

TTHERM_01308010

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_14508.19.997093137033517e-262POC1 centriolar protein (614 a
a)
OxytrichaContig20042.0.g313.000935899181433e-99WD domain, G-beta repeat
DictyBaseDDB_G02883759.9981864321491e-40lis1 on chromosome: 5 position
1452516 to 1453990
WormBaseWBGene000030473.9990760533890984e-36locus:lis-1 Lissencephaly-1
homolog status:Confirmed U
niProt:Q9NDC9 protein_id:CAB
03282.3
Stentor CoeruleusSteCoe_367241.3336148155022614e-34
SGDYBR198C9.99967697349061e-30TAF5 Subunit (90 kDa) of TFIID
and SAGA complexes, involved
in RNA polymerase II transcrip
tion initiation and in chromat
in modification

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:27251062: Meehl JB, Bayless BA, Giddings TH, Pearson CG, Winey M (2016) Tetrahymena Poc1 ensures proper intertriplet microtubule linkages to maintain basal body integrity. Molecular biology of the cell 27(15):2394-403
  2. Ref:20008567: Pearson CG, Osborn DP, Giddings TH, Beales PL, Winey M (2009) Basal body stability and ciliogenesis requires the conserved component Poc1. The Journal of cell biology 187(6):905-20

Sequences

>TTHERM_01308010(coding)
ATGAAGAAAACAACAATTGCATCATCAGCAGTAGCATCTCAAAAATAGACTTAAAGTAAA
CTTGGCAATACTTCTAGCAAAATTACTGAATAATAAACAACCCATGATCCAGCTTTGTCT
AGATCATTCAGAGGTCATGAAGATATCATTACTTGTGCTGATTTTGATCCTAAAATGCGC
CAAGTTGCATCTTGTTCTAAGGACTCTATTGTTTATGTTTGGAATTTTAAGCCATAGCAA
AGACCTTTTAAATTTGTAGGACATAAAGGAGCTGTTTATTGCGTAAAATACAGTCCTGAT
GGTGAAACAATTGCAAGTTGTGGCTAGGACAGATAGATCCGTCTTTGGTAGAATACAGTA
TAATCTAAATGCTCTATTATTAAGGCTCACTGCGGTGCTATTAGAAGTATGTCTTTCTCT
GCAGATGGTGGTTACTTGCTTTCTTCCTCTGATGATAAGACTTTAAAACTTTGGAGATTG
TAAGATAAGAAATTTATGTGCTCTTTTGCAGGACACAAAAACTGGGTTCGTTCTGGTGTC
ATTTCTCCAGACATGAGATTGGTTGCATCTGGCTCTGACGATAAGACAGTGATGCTATGG
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GATGGAACCTGCTTGATTTCTTCTTCCTTCGATCATAAAATTAAGATTACTGATATCCGT
TCAAATAAATTAATTTAACATTACAATGCTCATGATGCTTAAGTGAACAGCATTTCTATT
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TAATTCAATCAATCTGGTGACTACTTCGCTACTGGAGGATCTCAAAATCTTTGCATGGTT
TGGAAGACCAATTTTGATCAAAATATTCAAAATATCGAATAGGTTTAAAGATCTACAGTC
AGATAAAATGATGTTGAATACAGCAGTGGTGGATTGTATGCTTAGACACTTTTCAAGACA
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TTATAAGACACATTCAATAATAGAGGCGATGATGAATTAAATAACGGAAGAGTTCACGAA
AATAAATAATCAAATTCACCTACCTTCTCTTAATAATAATAATAACAATAACTCAATTTA
TCTGAAAATTAATATCCTGGACTTGAAATAGTTGGAAATCAATTCAATTTATAATAATCC
ACTCTTTCTAATAACAATAATCAAAACAATCTTATTAAATCTCAAAACGACTCTATTGTT
TCAAATAAAAACGCTATTCCTTTCCATCCTTCTTCTGAATTTTAACAATCTGCTGTTTAA
TAATAATTTTCCCAATAACCTAAATTAGTAGTAAACAACGGAACAGCAACTTATCCCTCG
AACTTCGTACCTAAAGTTGAAGAAGAAAATATTATGACTGAAGCCATAGCCGCAAGCATG
CAACAAATTTATAGCAGATTAGATACAATGTTCTAATATATGACAAACTTGGAAAACAGA
GTTGTCCAATCTGAATAATTACAAAAGAGTTTTGTGAGCTAAAACCACCAAAATACTTTA
GATCCTAAACAATAAACTATGAATTTTGGATATTCTAACATCCAAGACCATTCACTTTCT
GCAAGCTTAAACGACAGAAATGTAGTTAACATCTTCTAAGCCGGAGCTCTTGCAAACACT
GGATCAATTGAAGCTTCATTAATTAATAAGTAATAAGAAGAATGA


>TTHERM_01308010(protein)
MKKTTIASSAVASQKQTQSKLGNTSSKITEQQTTHDPALSRSFRGHEDIITCADFDPKMR
QVASCSKDSIVYVWNFKPQQRPFKFVGHKGAVYCVKYSPDGETIASCGQDRQIRLWQNTV
QSKCSIIKAHCGAIRSMSFSADGGYLLSSSDDKTLKLWRLQDKKFMCSFAGHKNWVRSGV
ISPDMRLVASGSDDKTVMLWDLNFQKIVSKYSTLDDNVKISQINSYSDHMDTVSQVLFHP
DGTCLISSSFDHKIKITDIRSNKLIQHYNAHDAQVNSISIHPTGYFLASAGSDSKIKIWD
LRQGRQIYTLYSNDKDITTVQFNQSGDYFATGGSQNLCMVWKTNFDQNIQNIEQVQRSTV
RQNDVEYSSGGLYAQTLFKTNKTASLSPSKKTISIIPPQQLQDTFNNRGDDELNNGRVHE
NKQSNSPTFSQQQQQQQLNLSENQYPGLEIVGNQFNLQQSTLSNNNNQNNLIKSQNDSIV
SNKNAIPFHPSSEFQQSAVQQQFSQQPKLVVNNGTATYPSNFVPKVEEENIMTEAIAASM
QQIYSRLDTMFQYMTNLENRVVQSEQLQKSFVSQNHQNTLDPKQQTMNFGYSNIQDHSLS
ASLNDRNVVNIFQAGALANTGSIEASLINKQQEE


>TTHERM_01308010(gene)
TTGAATTTAAATTCTGAAGAAAATAAATAAATAAATCAAAAGAATTTTAATCAAGTATTA
AAGCCTTTGTAAATAAATAAACAAATAAATAGATAGAGAGAGATATATAAACAAACAAAG
AAAGACATACAAATATAAAATTAAAAATACAACATAGAAATGAAGAAAACAACAATTGCA
TCATCAGCAGTAGCATCTCAAAAATAGACTTAAAGTAAACTTGGCAATACTTCTAGCAAA
ATTACTGAATAATAAACAACCCATGATCCAGCTTTGTCTAGATCATTCAGAGGTCATGAA
GATATCATTACTTGTGCTGATTTTGATCCTAAAATGTAATTTTTTATCAAAAAAGCTCAA
TTTATAAAATGAAAAATAATATAAAATCATTTTTTACAGCTTTAAATCTGCTGTCAGATA
TTTTAGTAAAATTTTTTTTAATAATTAGGCGCCAAGTTGCATCTTGTTCTAAGGACTCTA
TTGTTTATGTTTGGAATTTTAAGCCATAGCAAAGACCTTTTAAATTTGTAGGACATAAAG
GAGCTGTTTATTGCGTAAAATACAGTCCTGATGGTGAAACAATTGCAAGTTGTGGCTAGG
ACAGATAGATCCGTCTTTGGTAGAATACAGTGTAAATAAGATATTTTGTTTTTTGAACAA
ATTTAGAATAATTCAGTTAAATAAATTCAAAAATAATTATGATGATAAGAATAAAAAATA
TATAACTTCAATCAAAAATAAAACCAGCTTTTATAAAAGGAAAAATCATTAAAATGTTTT
ATAAATTCTAAAGCCTTTCAATAATTTGGTGAAGCAAAATGAAAACTAACTCGCAATTTA
AATTTGAAAACTAAAGATTGTATTGATTTATTTAAATTTTATTTTAAAAATAAAATAATG
CTAAACTGAAAATCTAAGTGCAAATCAATAAGTTAAAAAATAAACCAACAACCCCAAAAA
AGATTTGAATTTTTATAATTAATTGCTTTGACAAGCTACTGATAAATTTTAAATTTATTC
GGTCAATATACTAAATTAATTTCAAAGTAGAGTAATAAATATATTTAATATCCAAAACAA
TCTGCAACTAAATTTCATATAACTAAATTTAATATATGTATGCTTAAACAATCTGAGCAT
TTATTTACAATCATATTAAGAGTGGATTTATTTCTTTAATAAACACTTGAAAATCCCTTC
ATTAAAATCAATATTTTTGTTTGAATTTTATTTAAGCAAAAGTACAAGCAATATCTTAAA
TAAAACCTGAGAGTATATATAAAATATAAGCATCAAAAGATAAATTATAAATATAGAAAT
CTACTTAAGCAACAGGCAAGAATAGAAAATATAAATTTTTTTGAAATAATTGTTAATGAT
TAAGTAAATTATCTGTTAACATAATTAACTTTTAAATACAACTTCTGCTCTAAAAATTTT
AATATAATTGCCAAAGAAAATTATTACAAAGTAGTTTTAAATGATTAAAATTATTTTTAT
CATCATCAAAAATGTTTGATCTCTTTGATTAATTTTTAGAATTTATTTCTTTTATTTTCT
AAGATCTAATTTTGATAATTATTAATTGATTTTTTAATAAATTAGATAATCTAAATGCTC
TATTATTAAGGCTCACTGCGGTGCTATTAGAAGTATGTCTTTCTCTGCAGATGGTGGTTA
CTTGCTTTCTTCCTCTGATGATAAGACTTTAAAACTTTGGAGATTGTAAGATAAGAAATT
TATGTGCTCTTTTGCAGGACACAAAAACTGGGTTCGTTCTGGTGTCATTTCTCCAGACAT
GAGATTGGTTGCATCTGGCTCTGACGATAAGACAGTGATGCTATGGGATTTGAATTTCTA
AAAAATAGTTAGCAAATATAGTACTCTAGATGATAATGTTAAAATTAGTTAAATTAACAG
TTATAGTGATCACATGGATACAGTTAGTTAAGTTCTTTTCCATCCCGATGGAACCTGCTT
GATTTCTTCTTCCTTCGATCATAAAATTAAGATTACTGATATCCGTTCAAATAAATTAAT
TTAACATTACAATGCTCATGATGCTTAAGTGAACAGCATTTCTATTCATCCAACTGGTTA
TTTCCTTGCTTCTGCAGGCTCTGACTCTAAGATTAAAATTTGGGATCTCCGTTAAGGCAG
ACAAATCTACACTCTTTATTCCAATGATAAAGACATCACAACCGTATAATTCAATCAATC
TGGTGACTACTTCGCTACTGGAGGATCTCAAAATCTTTGCATGGTTTGGAAGACCAATTT
TGATCAAAATATTCAAAGTAAAAAAATATTTTATTTTTATTGATAATAAGTTTTTATAGA
GATTTTAATAGAATAAAAATACATTGATAAAAAGTTAAACAATATTATTTTAAATGAGAT
AATTTGAAAATCTGTCTTTAAAGTTTTTAGCAGCAATAAAAGTTAAATTTTTTCTTATTT
GTAGAAAAAACAAAAAAAAAATGAATTAACTTTGAAATATTTAAAATAAAATCACATATT
TAAAAGCAAAAAATAGCATTTAAAGGAATTTTTAAAAATAAATTATGATAAAAAATATTT
TTTAAAATTGAAATAAAATTAATAAATTTGAAACAATAAAAGCTATTTCTTTCTTTTGGA
TTAAAATTAATTTTAAATATAATTTATAAAAGATATCGAATAGGTTTAAAGATCTACAGT
CAGATAAAATGATGTTGAATACAGCAGTGGTGGATTGTATGCTTAGACACTTTTCAAGAC
AAACAAAACTGCTTCTCTTTCTCCATCCAAAAAGACCATTTCTATAATTCCTCCTCAATA
GTTATAAGACACATTCAATAATAGAGGCGATGATGAATTAAATAACGGAAGAGTTCACGA
AAATAAATAATCAAATTCACCTACCTTCTCTTAATAATAATAATAACAATAACTCAATTT
ATCTGAAAATTAATATCCTGGACTTGAAATAGTTGGAAATCAATTCAATTTATAATAATC
CACTCTTTCTAATAACAATAATCAAAACAATCTTATTAAATCTCAAAACGACTCTATTGT
TTCAAATAAAAACGCTATTCCTTTCCATCCTTCTTCTGAATTTTAACAATCTGCTGTTTA
ATAATAATTTTCCCAATAACCTAAATTAGTAGTAAACAACGGAACAGCAACTTATCCCTC
GAACTTCGTACCTAAAGTTGAAGAAGAAAATGTAATATTTATATTATTATTTACTTGTTT
TAATTTGTTCTTTAAACTAGATTATGACTGAAGCCATAGCCGCAAGCATGCAACAAATTT
ATAGCAGATTAGATACAATGTTCTAATATATGACAAACTTGGAAAACAGAGTTGTCCAAT
CTGAATAATTACAAAAGAGTTTTGTGAGCTAAAACCACCAAAATACTTTAGATCCTAAAC
AATAAACTATGAATTTTGGATATTCTAACATCCAAGACCATTCACTTTCTGCAAGCTTAA
ACGACAGAAATGTAGTTAACATCTTCTAAGCCGGAGCTCTTGCAAACACTGGATCAATTG
AAGCTTCATTAATTAATAAGTAATAAGAAGAATGA