Gene Model Identifier
TTHERM_00449390
Standard Name
PKD1
Aliases
PreTt15452 | 52.m00230 | 3811.m00988
Description
Protein kinase domain containing protein. Sequence similarity to a protein kinase family unique to Tetrahymena thermophila (Eisen et al., 2006)."
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Molecular Function Biological Process
No Data fetched for Domains
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Signal Peptide Present?: No
TTHERM_00449390
Fullscreen View
No Data fetched for StockID
(v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_16860.1 9.995938456217754e-149 protein kinase domain-containi
DictyBase DDB_G0276465 2.999758165421992e-18 sepA on chromosome: 2 position
Oxytricha Contig15160.0.g60 5.000468829272308e-18 Protein kinase domain
WormBase WBGene00017033 9.997764199084386e-16 locus:nekl-4 Serine/threonin
SGD YAR019C 9.997764199084386e-16 CDC15 Protein kinase of the Mi
Stentor Coeruleus SteCoe_37998 0.0000000001026187963170189
Paragraph No Gene Name Paragraph Text 35 PKD1 Tetrahymena thermophila PKD1 (protein kinase domain) is homologous with other protein kinase-like proteins that are involved in catalytic functions and phosphorylation in cellular processes. PKD1 is located near the C-terminus of the protein appears to contain only one known domain (E-value= 1.2x10-42) in the protein kinase family although the substrate specificity of the PKD1 is unknown. Paragraph by: Victoria Nguyen and Joseph Grotts (undergraduates), Keck Science Department of Claremont McKenna, Pitzer, and Scripps Colleges.
Ref:16933976 : Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,
>TTHERM_00449390(coding)ATG GCA TTT TAA AGA TGC TAT ATA CAA CAA AGT GCT TTC TTT TAA ATA AAG AAG TTT AAT TAA AGT AGT ATT GTA ATT GGC TAA ATT ATA TAC CCT TAA ACT CTA CCG ATT TTT TGG AAC TCT AAT GGA ATT TCG TCT GAA AAT AGT TTT TAG ACT GTT TCA TAG GAA TTA GAG GTT AAT GGA GAT GAA AAT GAA AAT GAT GAA TTG GAA GAT ATT TTA ACA AAT GGA AAT AAC AGT TTT ATA GTG AAT ACT CAA AAA AAT TCT TAT GTA ATT GAA GAT AAT TTA ATT ACT AAA ATT TTA CCT TAA ACA AAT GTT TAC TTA TTC TTA TAT AAC CTT CAA TTT AAT GGT AAA TTT TAT GAT GAA ATA TAA GAC ATT AGT GAG GAG GTT TAG AAA TAT GCA GAT TTT CCA AAA TTC AAC TAT AAC TTA TAA TAA AGA GAT TAA TAT AAC AAA ATT ATG AGT TAC AGA GAT CCA TTT TCT GAA AAT GAA CAA AAA ATT GAA TAT GTT TAT TAG ATC AAA TTA AAA TAT GGA TAA TTT ATT TAA AAA CTT TAT CAA TAA GAA AAT AAA ACA AGT CTT TAT TTA ACT TAT ACT TCA AAT TTT GTT GTA ATA TCT TAA ATA AAT GAT GGA GAC ACA ATA TCA TTT ATT TTA TCA TTT GCT TTT AGT CTC TTG ATA TTT AGA AGA TCG AAA AAG AGA AAA GAA ATT AGA GCT CAA ACT GAG GAT TTG ATA TAT AAA TAG GTT ATT TAA ATT TCT AGA TAG GAA TTT TAA AAG AAA TAT GAA CTA AAT TAT AGA GAT TCT ATT GGA TGT GGT AGC TTT GGA CAG GTC TAT AAA GTT AAA AAT AAA TAT AAA CAA ATT ATA AAA AAT CCT GAT ATT TTA CAA AAC ATG CCA GAT TAT TAC GCT TGC AAG CAA ATA CAT ATA TCT TAA GAT GGA GAA AAC TAG AGT TAA TAG ATT TTC CAT GAA ATC GAA GTG TTA GAA AAG CTA AAA AAA TAT GAA TAT GTA ATT AAA TTA CAA AAT TAT ATT ATT GAA GAA AGG TCA GCA TAT CTT GTC TTA GAT CTA GCA GAG TCC ACA TTA TAG GAT AAA ATA AAT GAA AAG TAG GCA AAT TCA GAA AAG TTT GAT GAG AGC GAA ATT GTG AAG TTT TTA TCC TAA ATA GGT AAA ACT TTA GCA TTA ATA TAC ATT GAA GAA GGG ATA GCT CAT AGA GAT ATT AAG CCT TCA AAT ATA CTA ATT AAA GAT GAC AAT TTT TAC TTA TCT GAT TTC GGA TGT GCA GAA ATA CTA TTT GAA TCG CAA GAA GCT AGA AAC AAT TTA GTC ATG GGA ACT TTA AAA TGG ATG TCA CCT GAA TTA AAA GAA ATG AAG AAA AAT CAA GTA GTT GAC TAT TTC AAA AGT GAC ATA TTT AGT TTG GGA ATG TTA TTG CTT TAT ATG CTT ACT CTT TCA GAT ATT TCT TCT GTA AAC TCA GAT GAG TTT ACT AAG AAC CAA AAG ATA AGA ATC ATG AAA AAT TAT TGT AAA GGT ATT TCT AAT GAA ATA ATT TTA CTT ATA AAA AGA ATG TTA GAA ACA AAC CCT GAC AAT AGG CCT GAT GCA GCA ATA ATA ATT AAT GCA ATT TAA GAT ATA GAA AAT AAC TTT AAA TAA AAA AAT TTA AGC AAA GAT TTA TGA >TTHERM_00449390(protein)M A F Q R C Y I Q Q S A F F Q I K K F N Q S S I V I G Q I I Y P Q T L P I F W N S N G I S S E N S F Q T V S Q E L E V N G D E N E N D E L E D I L T N G N N S F I V N T Q K N S Y V I E D N L I T K I L P Q T N V Y L F L Y N L Q F N G K F Y D E I Q D I S E E V Q K Y A D F P K F N Y N L Q Q R D Q Y N K I M S Y R D P F S E N E Q K I E Y V Y Q I K L K Y G Q F I Q K L Y Q Q E N K T S L Y L T Y T S N F V V I S Q I N D G D T I S F I L S F A F S L L I F R R S K K R K E I R A Q T E D L I Y K Q V I Q I S R Q E F Q K K Y E L N Y R D S I G C G S F G Q V Y K V K N K Y K Q I I K N P D I L Q N M P D Y Y A C K Q I H I S Q D G E N Q S Q Q I F H E I E V L E K L K K Y E Y V I K L Q N Y I I E E R S A Y L V L D L A E S T L Q D K I N E K Q A N S E K F D E S E I V K F L S Q I G K T L A L I Y I E E G I A H R D I K P S N I L I K D D N F Y L S D F G C A E I L F E S Q E A R N N L V M G T L K W M S P E L K E M K K N Q V V D Y F K S D I F S L G M L L L Y M L T L S D I S S V N S D E F T K N Q K I R I M K N Y C K G I S N E I I L L I K R M L E T N P D N R P D A A I I I N A I Q D I E N N F K Q K N L S K D L >TTHERM_00449390(gene)ATG GCA TTT TAA AGA TGC TAT ATA CAA CAA AGT GCT TTC TTT TAA ATA AAG AAG TTT AAT TAA AGT AGT ATT GTA ATT GGC TAA ATT ATA TAC CCT TAA ACT CTA CCG ATT TTT TGG AAC TCT AAT GGA ATT TCG TCT GAA AAT AGT TTT TGT ATT TAT TAA ATA TTA GAT AAT AAT TTA CAG ATA AAG TTT TAT TAT CAT TAT TAA GAG ACT GTT TCA TAG GAA TTA GAG GTT AAT GGA GGT AAT TTG TTT TTT ATT AAT TAA TTT TAT GAA TAA ATA ATT AAG TAG AAT TAA TTT ATA ATT GAT TTT TAA AGG GCA TAG CTT TAA ATT AGG TTA AAT ATA TCG ATT TAA ATC TGA AGT ATT TTA AAT AAA TTT GCT TCA TAA AAT CAT ATT ATT TTA CCA ATT ATT TTA AAA ATT ATA ATT TCA AAT ATA AAA TAA TAT AAA ATA TGA ATC TTT TGT GTA ATA ATT CTT TTA TTG TAA ATA AAT TAA TAA ATA AGT GAA GGA GAT TTT GCA AGT ATC TTA GTC AAA TGA TAG CTA TTA CTT TTA TAT TTT AGA TAA TCA GAA TTA GGC TAT ATT ATA TTA TGT AAC TAA AAA ACT CAT TCT TAA ATA TTT ATT GGA TGA AAA ACC TAA ATT AAT AAA GAC TAA TCT ATT TAC CTA ACA AAT GAA TAA ATG CTT ATA TAA AAT AGA TAA TAT ACA GTA GAA TTT GTA ATA AAC AAT TAT TTT TTG TAT AGA TGA AAA TGA AAA TGA TGA ATT GGA AGA TAT TTT AAC AAA TGG AAA TAA CAG TTT TAT AGT GAA TAC TCA AAA AAA TTC TTA TGT AAT TGA AGA TAA TTT AAT TAC TAA AAT TTT ACC TTA AAC AAA TGT TTA CTT ATT CTT ATA TAA CCT TCA ATT TAA TGG TAA ATT TTA TGA TGA AAT ATA AGA CAT TAG TGA GGA GGT TTA GAA ATA TGC AGA TTT TCC AAA ATT CAA CTA TAA CTT ATA ATA AAG AGA TTA ATA TAA CAA AAT TAT GAG TTA CAG AGA TCC ATT TTC TGA AAA TGA ACA AAA AAT TGA ATA TGT TTA TTA GAT CAA ATT AAA ATA TGG ATA ATT TAT TTA AAA ACT TTA TCA ATA AGA AAA TAA AAC AAG TCT TTA TTT AAC TTA TAC TTC AAA TTT TGT TGT AAT ATC TTA AAT AAA TGA TGG AGA CAG TAT TTA TTA ATA TTA TAG TTT TTT ACT GAA TAA TAA TCA AAA AGA TTT ACC TAG CAG CGC ATT TAT AAC TTA ATT TGT ATA TTT TTA AAC AGC AAT ATC ATT TAT TTT ATC ATT TGC TTT TAG TCT CTT GAT ATT TAG AAG ATC GAA AAA GAG AAA AGA AAT TAG AGC TCA AAC TGA GGA TTT GAT ATA TAA ATA GGT TAT TTA AAT TTC TAG ATA GGA ATT TTA AAA GAA ATA TGA ACT AAA TTA TAG AGA TTC TAT TGG ATG TGG TAG CTT TGG ACA GGT CTA TAA AGT TAA AAA TAA ATA TAA ACA AAT TAT AAA AAA TCC TGA TAT TTT ACA AAA CAT GCC AGA TTA TTA CGC TTG CAA GCA AAT ACA TAT ATC TTA AGA TGG AGA AAA CTA GAG TTA ATA GAT TTT CCA TGA AAT CGA AGT GTT AGA AAA GCT AAA AAA ATA TGA ATA TGT AAT TAA ATT ACA AAA TTA TAT TAT TGA AGA AAG GTC AGC ATA TCT TGT CTT AGA TCT AGC AGA GTC CAC ATT ATA GGA TAA AAT AAA TGA AAA GTA GGC AAA TGT AAG AAG AAG AAT TTT TTT TAA TTT TCT TTA CTT CAT TTT CAA ATA AAA TTT TGT TTG ATA TTT ATT ATA GAA TTA ATA TTT TTT TGA ATA ACT TAC TTC AAA AGT TAT TTA AAC AAT ACA AAT TTC TTT TTA TTC ATA AAA TTA ATT ATC CCA AAA CTC AAA TTA CTA CTT TTA TTG TTT TTC TTT TTA TAT TCA AGA TTA AAA ATC TTT TTA TTG TCT GTC TTA CTG TTT TTT ACC ATA ACA TAA CAT AAG ATA AAT TTA AAT TTT ATT GCT TTG AAA ATT TTA TAA AAT AAT TTT GAT TAA TTT AAT TAA TTA CTA CTT TCA AAG ATT TTA TCA ATA AAT TTC AAG CTC TTT TTG TGT TAA ATT ATT TTT AAG TTA TTA AAA ATT TAA ATT TCA TTT AAA AAA ATC GAA AAA AAG TCA GAA AAG TTT GAT GAG AGC GAA ATT GTG AAG TTT TTA TCC TAA ATA GGT AAA ACT TTA GCA TTA ATA TAC ATT GAA GAA GGG ATA GCT CAT AGA GAT ATT AAG CCT TCA AAT ATA CTA ATT AAA GAT GAC AAT TTT TAC TTA TCT GAT TTC GGA TGT GCA GAA ATA CTA TTT GAA TCG CAA GAA GCT AGA AAC AAT TTA GTC ATG GGA ACT TTA AAA TGG ATG TCA CCT GAA TTA AAA GAA ATG AAG AAA AAT CAA GTA GTT GAC TAT TTC AAA AGT GAC ATA TTT AGT TTG GGA ATG TTA TTG CTT TAT ATG CTT ACT CTT TCA GAT ATT TCT TCT GTA AAC TCA GAT GAG TTT ACT AAG AAC CAA AAG ATA AGA ATC ATG AAA AAT TAT TGT AAA GGT ATT TCT AAT GAA ATA ATT TTA CTT ATA AAA AGA ATG TTA GAA ACA AAC CCT GAC AAT AGG CCT GAT GCA GCA ATA ATA ATT AAT GCA ATT TAA GAT ATA GAA AAT AAC TTT AAA TAA AAA AAT TTA AGC AAA GAT TTA TGA
Login
Recent Activity
Recent Papers
Identifiers and Description
Gene Ontology Annotations 
Domains
Gene Expression Profile
Signal Peptide
Homologs (v.2006 protein sequences)
General Information 
Associated Literature 
Sequences
