Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00328570

Standard Name

PET1 (E3 ubiquitin ligase)

Aliases

PreTt30261 | 33.m00273 | 3705.m00100

Description

PET1 RING-H2 zinc finger protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• protein binding (IEA) | GO:0005515
• zinc ion binding (IEA) | GO:0008270

Domains

• ( PF00628 ) PHD-finger
• ( PF07974 ) EGF-like domain
• ( PF07720 ) Tetratricopeptide repeat
• ( PF00097 ) zinc finger, C3HC4 type (RING

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: Yes
Presense Probability: 73.7%

TetraMine Data

TTHERM_00328570

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_40954.1	2.999180586171967e-98	hypothetical protein (1035 aa)
WormBase	WBGene00007226	0.0000000020002373268528243	status:Confirmed UniProt:Q17 573 protein_id:CAA84635.1
Oxytricha	Contig3298.0.g70	0.000000030002053728821195	Ring finger domain
DictyBase	DDB_G0284807	0.000009999254677478949	DDB_G0284807 on chromosome: 4 position 2501891 to 2505360
SGD	YOL013C	0.000009999254677478949	HRD1 Ubiquitin-protein ligase required for endoplasmic retic ulum-associated degradation (E RAD) of misfolded proteins; ge netically linked to the unfold ed protein response (UPR); reg ulated through association wit h Hrd3p; contains an H2 ring f inger
Stentor Coeruleus	SteCoe_30698	0.000045399929762484854

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00328570(coding)
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>TTHERM_00328570(protein)
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NQKNTHKSIDNIPEEVSYPIQNQNYFSSKSQVFTKKTLNLKNKNSITHNHLKMQDENQNQ
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>TTHERM_00328570(gene)
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TAGACATATAGTTAGCAATAAAATTCTACAAATACTTCAAATTAAACTTAAAAATATTAG
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TAAAATAACACAATTTACCTAACAGTGCTATACTAATCCACTAATAGCATTTAAAAAGCT
TCTTTAATACCCTTACCTTAACCAATTAATTATGATGTGTATGTTTATTACTACAGTAAA
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