Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00328580

Standard Name

PEL1 (E3 ubiquitin ligase)

Aliases

PreTt30262 | 33.m00274 | 3705.m00101

Description

hypothetical protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• protein binding (IEA) | GO:0005515
• zinc ion binding (IEA) | GO:0008270

Domains

• ( PF00628 ) PHD-finger
• ( PF07974 ) EGF-like domain
• ( PF00053 ) Laminin EGF-like (Domains III and
• ( PF00097 ) zinc finger, C3HC4 type (RING

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: Yes
Presense Probability: 84.2%

TetraMine Data

TTHERM_00328580

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_40954.1	6.002270911168926e-31	hypothetical protein (1035 aa)
WormBase	WBGene00017144	0.000000019990673443141236	Uncharacterized RING finger pr otein EEED8.16 status:Confir med UniProt:Q95QN6 protein _id:CCD68743.1
Oxytricha	Contig952.1.g15	0.00000019998969434520019	Ring finger domain
DictyBase	DDB_G0280003	0.000005998506718272351	DDB_G0280003 on chromosome: 3 position 2849525 to 2853250
SGD	YKL034W	0.000019995566179747357	TUL1 Golgi-localized RING-fing er ubiquitin ligase (E3), invo lved in ubiquitinating and sor ting membrane proteins that co ntain polar transmembrane doma ins to multivesicular bodies f or delivery to the vacuole for quality control purposes

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00328580(coding)
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TAACCAATAACCTTAACCGAAGAAGCTAAAGGAACATAATACAGCCAATGA

>TTHERM_00328580(protein)
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RKVNNLIDAQETYRIPSDCLTQQTQMNQILLSSTNNSTNSKNQNEAKKKINANKLKNQIL
KQQSFNVNHQQAKSNRMSLKQPITLTEEAKGTQYSQ

>TTHERM_00328580(gene)
AAATTAAAAAAAACATAAATGAGAATCTCTTAAGCTAATTTAATCATTTTCTATCTTTGC
CTCTTCTAATTTGCATTGTGCTAACAATAATCTACTAAATAAGAGAGCACTTAAAGCATC
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TTTTCAAGCTAAAACGAATAATAAGAATAATAATAAAATAAGCAATCAAGCTCTAATTCA
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AAATATTTTTAAAAGAATGCCCCTAAAATACTACAAGTCGAGAATTAAATAGAGAAACTC
TTTTAACTAAAAACTCATAGAAAAGTTAATAATTTAATTGATGCTTAAGAAACCTACAGA
ATACCTTCAGATTGCCTTACCCAACAAACTCAAATGAATTAAATTTTACTAAGCAGTACT
AATAATTCAACTAATTCCAAAAATTAAAATGAAGCTAAGAAAAAAATCAATGCAAATAAA
CTAAAAAATTAAATACTAAAATAATAGTCTTTTAATGTTAATCATTAATAAGCTAAATCA
AATAGAATGTCTTTAAAATAACCAATAACCTTAACCGAAGAAGCTAAAGGAACATAATAC
AGCCAATGA