Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00726460

Standard Name

PARP1 (Poly(ADP-Ribosyl) transferase 1)

Aliases

PreTt21911 | 117.m00163

Description

WGR domain containing protein; homolog of human PARP1

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF05406 ) WGR domain
  • ( PF00644 ) Poly(ADP-ribose) polymerase catalytic domain
  • ( PF02877 ) Poly(ADP-ribose) polymerase, regulatory domain

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_00726460

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_04636.19.997093137033517e-262WGR domain-containing protein
(625 aa)
OxytrichaContig12012.0.g599.998285701479858e-93Poly(ADP-ribose) polymerase ca
talytic domain
DictyBaseDDB_G02928203.0006488705143073e-92adprt2 on chromosome: 6 positi
on 2124835 to 2127096
WormBaseWBGene000040492.9993408039826107e-81locus:pme-1 Poly(ADP-ribose)
polymerase pme-1 status:Con
firmed UniProt:Q9N4H4 prot
ein_id:CCD73512.1
Stentor CoeruleusSteCoe_271802.8946403116483003e-63

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00726460(coding)
ATGTCAGATTAGTCTTCTAATAATTCAGGCAATAATGATTAGATTGGTAATAGTTAGCCT
GTTACAAAAGATGATAAACATAATACTAATGTTGGCTCTAATACTAACATAGATGGAACT
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TCTTATATAAACATTTATGATGATGTAACAGTTCCTATAGGTAAAGGTCAGGTTAGAGAT
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TAAATAATGCTAAAATACCTTTTAAGATTGAAATTTAATTTTAAAAGATGA


>TTHERM_00726460(protein)
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PVDEFCPQKGVEVYYDKDKIYSAKLNQANMTKNNNKFYVIQILKGKINEFFVFSRWGRVG
FQGQSSLKGPYNLQRAIQEYNQKLLEKTTVKDYRILDMDYGHDDILQNLEEKMKKDTDTC
QLPKQVISLMSLIFDMNMFNNQMKEIGYDAKKMPLGKLSKDNINKAYGILKDLYDEVEKQ
DKDIVKIATMCNDFYSYIPHDFGFKKMQDQILDSTQKVKEKLEMIDSIQNIQIATKILED
QSQGQNGNAVNLIQSQYEKLNCSITPLKDEKIYQTIKTYLDNTHSYIHDRYTLEIEDIFE
VERQGEKERYMKQLNNKMLLWHGSRLTNYVGILSQGLRIAPPEAPANGYMFGKGVYFADM
CSKSANYCQANKLNNTGLMFLCEVALGNTNDLISAGYNASKLPYGKYSVRALGQIAPPKN
SYINIYDDVTVPIGKGQVRDYKNRLKTPLLHNEYIVYNVKQIMLKYLLRLKFNFKR


>TTHERM_00726460(gene)
ATGTCAGATTAGTCTTCTAATAATTCAGGTAAAACTATTTTTAAAACATTTCAAACTTAA
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TCATGATAGATATACATTAGAAATTGAAGATATTTTCGAGGTAGAAAGATAAGGAGAAAA
AGAGAGGTACATGAAATAGCTAAATAACAAAATGCTCCTTTGGCACGGTTCACGATTGAC
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TGGTTATATGTTTGGAAAAGGAGTTTATTTTGCTGATATGTGTAGTAAATCTGCTAATTA
TTGTTAAGCTAATAAGCTTAACAATACTGGCTTAATGTTTCTTTGTGAAGTAGCTCTAGG
AAATACAAATGACTTAATCTCAGCAGGCTACAATGCTTCTAAATTACCCTATGGTAAATA
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TGATGTAACAGTTCCTATAGGTAAAGGTCAGGTTAGAGATTATAAAAATAGACTTAAAAC
TCCATTACTGCATAATGAATATATTGTTTATAATGTAAAGTAAATAATGCTAAAATACCT
TTTAAGATTGAAATTTAATTTTAAAAGATGA