Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_001295283

Standard Name

PAMD1 (PArtner of McmD1)

Aliases

None

Description

hypothetical protein; Required for homologous recombination in meiosis; interacts with Mcmd1

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.7%

TetraMine Data

TTHERM_001295283

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_18594.1	9.997093137033517e-262	hypothetical protein (1668 aa)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:31815942: Tian M, Loidl J (2019) An MCM family protein promotes interhomolog recombination by preventing precocious intersister repair of meiotic DSBs. PLoS genetics 15(12):e1008514

Sequences

>TTHERM_001295283(coding)
ATGGAGAAATTTATTAAATTTTTGGAAGAAGACGTAGATTTTAATATAGAAATTCATAAT
AAGATTTAAGATTTAAAAGATTAAAAGTTAATAGATCCTAGCTTTATTGTTTTTAAGTGC
AGTCTCAGATTGGATATTATATAGTTGAATGACTAAGATTTAAACCTTTCCATTTATATT
TAGCAAAATTACCCTAATTTAGATTCGTTAATTAGAGATTATGTATAAAAGATTTTATCT
GAAGATAAATAATTGAGGAATATATAAATAAGACAAGAATAAATACTTCCTGATATCGAG
ATCATCAATGGGAATCTTACTAATAATCTTAATATTTATGCATAGAAAGGTATTCTTCAG
AATTCTTTGTTATAAAATTCTTTTGTTCAAGGACAGCTAGTTCTTATTGAATATTTTTAA
GTATTAAAAATTTTTCCTTTAGAGAATTATTACTCTATTAAGAGATATTCTTATTACTGT
GGTTGCAACAATAATGATTACAAGCTTTAAAATACTAATTTAATTCTTCATATTATTGAA
AACAATTAATCTGCATCCCTAAACAAACAGAGCTCTAATTTAATTAAAAATTTAAGCTGT
GATATATGTCATTAGGAAATGTATGAAGATAAAGAAAAGAGTAAACCTGAATTATGCCAA
AAAGTACTTATATATATTCCAGAGAGATATAATTCAACCAGAAATAGTTTATTAAACGGT
TTTTAAAAAGAAGAGGGAAAACTCATTGAAATGTTTTTAGAAAAATAATACTGCAACAGT
CTTTCATTAAATTAAACTTATAGCTGTATAGCTTATTATTCCCTGGCTACGAGTAACAAA
TAAACAAAGAACGACTTTCTAACAGGTTTTAAACCTTTAAATATTACTGAACACCTGTTT
GCTTGCACAATTTCTATTAATATTAAAGATCCTAATGCTTAATTTAATTAATAAATGATA
AACTAGGTTAGTTTATTTAATTGTATCACAGAACAAGAATAATTGGAGAGTTAAATGAAA
TAAAATTCTAATGATGAAAACGAAAACTTTCATTTTAAATTTAAATAATTAATGTTTGCA
GTTGATTCATTTTTCAATGAAGCAACAAAGTTTAGCTTTTTGTAATTGAAAACTGCTTTA
GTTATGAGTTATGTACTTGCTAATTCAAATAGGATTCTTCAAAAAAATAGCAGTCTCAAT
AGAGAAGGATCATTTAGTTAATTAAATGTACTTTTTTAATGTGAAAGCCAATTTGTCGAT
AGCATAATAGAAGAAATTTTGATGACATTTGGATATCTTTAAAGTTTCAATGTATTTGAT
TGTCTTCTTTAATTTGATATTGCTTCATCCCTTGTAAAATCGAATAATAGCATTCTTCTG
ATAAAAAATATTCAAGATATTTCGAAGCAACAATAAGAACAACTAAATAAAATACTATAA
AATTAAGAGATTTATTTCGATCAGCTTAAAACAAAATTAAATTTAAATGTTACAATATGG
GCTTTCAATTCCACAAGTAAACAATCAGGTAAAATCAAAAAATTTAAAAGTGATAAAAAT
ATTTCTTAAAGTTTTGAGCAGTATTTTGATGTTTGCCTTTCCCAAGATAAGTCAGTATTG
TCTTTAAAGGATTACCACCTGTTGATCCAAAATGAAGTTGATATGTTTTTAGATAAAGAA
TTACAAATGGGTTAAAAATTTTCAAGAAAAGCCCATCATGAACTCTCCACTGAAAAAAAA
CACATTCACTCAAAAAGCAATAGATTCAATGAGTAAATGTCAACTCTTAAGAAAGAAAAA
AGCAGTTAAAATTAGCATGTTTAGGCGTTAATAGGTGATAACTATAAAAATAATAATGAA
GAAGAAGCGCATTGCTTACTGAACAAGTTTATCAATACTGTTAGAAATAGTATGAGTGCG
AAAGAAATAAATTATTCTACAAGCAATATTAGCAGCTTATCGAAATTCGCAATAGCTAGT
TCTATCTTCAGAAATGTTTTTATTAAAAATAATAGCCAAGAATTAATTTCATGCGAGGAA
AATAGCAGAGTAATTATAGATACCTTTGATGCCTTTTTGTCTATATTCTTTAATATTTTG
TCTAGAAAAATATTTTGTAGAGATTTAGACACAAAGTATTTCCTTTCTTTCATAGTGAAC
TATGGCAGCGGCTACTTAGAGAACTCAGAAATGAGAATTCCTTAAGAAAAAGAATTTTTC
ATCGCCTTGGAGAAGATTTAAGATTAGATTTTAGATTTTATAAGATTTTGA

>TTHERM_001295283(protein)
MEKFIKFLEEDVDFNIEIHNKIQDLKDQKLIDPSFIVFKCSLRLDIIQLNDQDLNLSIYI
QQNYPNLDSLIRDYVQKILSEDKQLRNIQIRQEQILPDIEIINGNLTNNLNIYAQKGILQ
NSLLQNSFVQGQLVLIEYFQVLKIFPLENYYSIKRYSYYCGCNNNDYKLQNTNLILHIIE
NNQSASLNKQSSNLIKNLSCDICHQEMYEDKEKSKPELCQKVLIYIPERYNSTRNSLLNG
FQKEEGKLIEMFLEKQYCNSLSLNQTYSCIAYYSLATSNKQTKNDFLTGFKPLNITEHLF
ACTISINIKDPNAQFNQQMINQVSLFNCITEQEQLESQMKQNSNDENENFHFKFKQLMFA
VDSFFNEATKFSFLQLKTALVMSYVLANSNRILQKNSSLNREGSFSQLNVLFQCESQFVD
SIIEEILMTFGYLQSFNVFDCLLQFDIASSLVKSNNSILLIKNIQDISKQQQEQLNKILQ
NQEIYFDQLKTKLNLNVTIWAFNSTSKQSGKIKKFKSDKNISQSFEQYFDVCLSQDKSVL
SLKDYHLLIQNEVDMFLDKELQMGQKFSRKAHHELSTEKKHIHSKSNRFNEQMSTLKKEK
SSQNQHVQALIGDNYKNNNEEEAHCLLNKFINTVRNSMSAKEINYSTSNISSLSKFAIAS
SIFRNVFIKNNSQELISCEENSRVIIDTFDAFLSIFFNILSRKIFCRDLDTKYFLSFIVN
YGSGYLENSEMRIPQEKEFFIALEKIQDQILDFIRF

>TTHERM_001295283(gene)
ATGGAGAAATTTATTAAATTTTTGGAAGAAGACGTAGATTTTAATATAGAAATTCATAAT
AAGATTTAAGATTTAAAAGATTAAAAGTTAATAGATCCTAGCTTTATTGTTTTTAAGTGC
AGTCTCAGATTGGATATTATATAGTTGAATGACTAAGATTTAAACCTTTCCATTTATATT
TAGCAAAATTACCCTAATTTAGATTCGTTAATTAGAGATTATGTATAAAAGATTTTATCT
GAAGATAAATAATTGAGGAATATATAAATAAGACAAGAATAAATACTTCCTGATATCGAG
ATCATCAATGGGAATCTTACTAATAATCTTAATATTTATGCATAGAAAGGTATTCTTCAG
AATTCTTTGTTATAAAATTCTTTTGTTCAAGGACAGCTAGTTCTTATTGAATATTTTTAA
GTATTAAAAATTTTTCCTTTAGAGAATTATTACTCTATTAAGAGATATTCTTATTACTGT
GGTTGCAACAATAATGATTACAAGCTTTAAAATACTAATTTAATTCTTCATATTATTGAA
AACAATTAATCTGCATCCCTAAACAAACAGAGCTCTAATTTAATTAAAAATTTAAGCTGT
GATATATGTCATTAGGAAATGTATGAAGATAAAGAAAAGAGTAAACCTGAATTATGCCAA
AAAGTACTTATATATATTCCAGAGAGATATAATTCAACCAGAAATAGTTTATTAAACGGT
TTTTAAAAAGAAGAGGGAAAACTCATTGAAATGTTTTTAGAAAAATAATACTGCAACAGT
CTTTCATTAAATTAAACTTATAGCTGTATAGCTTATTATTCCCTGGCTACGAGTAACAAA
TAAACAAAGAACGACTTTCTAACAGGTTTTAAACCTTTAAATATTACTGAACACCTGTTT
GCTTGCACAATTTCTATTAATATTAAAGATCCTAATGCTTAATTTAATTAATAAATGATA
AACTAGGTTAGTTTATTTAATTGTATCACAGAACAAGAATAATTGGAGAGTTAAATGAAA
TAAAATTCTAATGATGAAAACGAAAACTTTCATTTTAAATTTAAATAATTAATGTTTGCA
GTTGATTCATTTTTCAATGAAGCAACAAAGTTTAGCTTTTTGTAATTGAAAACTGCTTTA
GTTATGAGTTATGTACTTGCTAATTCAAATAGGATTCTTCAAAAAAATAGCAGTCTCAAT
AGAGAAGGATCATTTAGTTAATTAAATGTACTTTTTTAATGTGAAAGCCAATTTGTCGAT
AGCATAATAGAAGAAATTTTGATGACATTTGGATATCTTTAAAGTTTCAATGTATTTGAT
TGTCTTCTTTAATTTGATATTGCTTCATCCCTTGTAAAATCGAATAATAGCATTCTTCTG
ATAAAAAATATTCAAGATATTTCGAAGCAACAATAAGAACAACTAAATAAAATACTATAA
AATTAAGAGATTTATTTCGATCAGCTTAAAACAAAATTAAATTTAAATGTTACAATATGG
GCTTTCAATTCCACAAGTAAACAATCAGGTAAAATCAAAAAATTTAAAAGTGATAAAAAT
ATTTCTTAAAGTTTTGAGCAGTATTTTGATGTTTGCCTTTCCCAAGATAAGTCAGTATTG
TCTTTAAAGGATTACCACCTGTTGATCCAAAATGAAGTTGATATGTTTTTAGATAAAGAA
TTACAAATGGGTTAAAAATTTTCAAGAAAAGCCCATCATGAACTCTCCACTGAAAAAAAA
CACATTCACTCAAAAAGCAATAGATTCAATGAGTAAATGTCAACTCTTAAGAAAGAAAAA
AGCAGTTAAAATTAGCATGTTTAGGCGTTAATAGGTGATAACTATAAAAATAATAATGAA
GAAGAAGCGCATTGCTTACTGAACAAGTTTATCAATACTGTTAGAAATAGTATGAGTGCG
AAAGAAATAAATTATTCTACAAGCAATATTAGCAGCTTATCGAAATTCGCAATAGCTAGT
TCTATCTTCAGAAATGTTTTTATTAAAAATAATAGCCAAGAATTAATTTCATGCGAGGAA
AATAGCAGAGTAATTATAGATACCTTTGATGCCTTTTTGTCTATATTCTTTAATATTTTG
TCTAGAAAAATATTTTGTAGAGATTTAGACACAAAGTATTTCCTTTCTTTCATAGTGAAC
TATGGCAGCGGCTACTTAGAGAACTCAGAAATGGTAAATTAAACAATATTAAAAATAAAA
TTGTAAGCTTTTATTATTAAAAATGAATGTAGAGAATTCCTTAAGAAAAAGAATTTTTCA
TCGCCTTGGAGAAGATTTAAGATTAGATTTTAGATTTTATAAGATTTTGA