Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_001295283Standard Name
PAMD1 (PArtner of McmD1)Aliases
NoneDescription
hypothetical protein; Required for homologous recombination in meiosis; interacts with Mcmd1Genome Browser (Macronucleus)
![]()
Genome Browser (Micronucleus)
![]()
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
No Data fetched for Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.7%
TetraMine Data
TTHERM_001295283
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_18594.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (1668 aa)
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:31815942: Tian M, Loidl J (2019) An MCM family protein promotes interhomolog recombination by preventing precocious intersister repair of meiotic DSBs. PLoS genetics 15(12):e1008514
Sequences
>TTHERM_001295283(coding)
ATGGAGAAATTTATTAAATTTTTGGAAGAAGACGTAGATTTTAATATAGAAATTCATAAT
AAGATTTAAGATTTAAAAGATTAAAAGTTAATAGATCCTAGCTTTATTGTTTTTAAGTGC
AGTCTCAGATTGGATATTATATAGTTGAATGACTAAGATTTAAACCTTTCCATTTATATT
TAGCAAAATTACCCTAATTTAGATTCGTTAATTAGAGATTATGTATAAAAGATTTTATCT
GAAGATAAATAATTGAGGAATATATAAATAAGACAAGAATAAATACTTCCTGATATCGAG
ATCATCAATGGGAATCTTACTAATAATCTTAATATTTATGCATAGAAAGGTATTCTTCAG
AATTCTTTGTTATAAAATTCTTTTGTTCAAGGACAGCTAGTTCTTATTGAATATTTTTAA
GTATTAAAAATTTTTCCTTTAGAGAATTATTACTCTATTAAGAGATATTCTTATTACTGT
GGTTGCAACAATAATGATTACAAGCTTTAAAATACTAATTTAATTCTTCATATTATTGAA
AACAATTAATCTGCATCCCTAAACAAACAGAGCTCTAATTTAATTAAAAATTTAAGCTGT
GATATATGTCATTAGGAAATGTATGAAGATAAAGAAAAGAGTAAACCTGAATTATGCCAA
AAAGTACTTATATATATTCCAGAGAGATATAATTCAACCAGAAATAGTTTATTAAACGGT
TTTTAAAAAGAAGAGGGAAAACTCATTGAAATGTTTTTAGAAAAATAATACTGCAACAGT
CTTTCATTAAATTAAACTTATAGCTGTATAGCTTATTATTCCCTGGCTACGAGTAACAAA
TAAACAAAGAACGACTTTCTAACAGGTTTTAAACCTTTAAATATTACTGAACACCTGTTT
GCTTGCACAATTTCTATTAATATTAAAGATCCTAATGCTTAATTTAATTAATAAATGATA
AACTAGGTTAGTTTATTTAATTGTATCACAGAACAAGAATAATTGGAGAGTTAAATGAAA
TAAAATTCTAATGATGAAAACGAAAACTTTCATTTTAAATTTAAATAATTAATGTTTGCA
GTTGATTCATTTTTCAATGAAGCAACAAAGTTTAGCTTTTTGTAATTGAAAACTGCTTTA
GTTATGAGTTATGTACTTGCTAATTCAAATAGGATTCTTCAAAAAAATAGCAGTCTCAAT
AGAGAAGGATCATTTAGTTAATTAAATGTACTTTTTTAATGTGAAAGCCAATTTGTCGAT
AGCATAATAGAAGAAATTTTGATGACATTTGGATATCTTTAAAGTTTCAATGTATTTGAT
TGTCTTCTTTAATTTGATATTGCTTCATCCCTTGTAAAATCGAATAATAGCATTCTTCTG
ATAAAAAATATTCAAGATATTTCGAAGCAACAATAAGAACAACTAAATAAAATACTATAA
AATTAAGAGATTTATTTCGATCAGCTTAAAACAAAATTAAATTTAAATGTTACAATATGG
GCTTTCAATTCCACAAGTAAACAATCAGGTAAAATCAAAAAATTTAAAAGTGATAAAAAT
ATTTCTTAAAGTTTTGAGCAGTATTTTGATGTTTGCCTTTCCCAAGATAAGTCAGTATTG
TCTTTAAAGGATTACCACCTGTTGATCCAAAATGAAGTTGATATGTTTTTAGATAAAGAA
TTACAAATGGGTTAAAAATTTTCAAGAAAAGCCCATCATGAACTCTCCACTGAAAAAAAA
CACATTCACTCAAAAAGCAATAGATTCAATGAGTAAATGTCAACTCTTAAGAAAGAAAAA
AGCAGTTAAAATTAGCATGTTTAGGCGTTAATAGGTGATAACTATAAAAATAATAATGAA
GAAGAAGCGCATTGCTTACTGAACAAGTTTATCAATACTGTTAGAAATAGTATGAGTGCG
AAAGAAATAAATTATTCTACAAGCAATATTAGCAGCTTATCGAAATTCGCAATAGCTAGT
TCTATCTTCAGAAATGTTTTTATTAAAAATAATAGCCAAGAATTAATTTCATGCGAGGAA
AATAGCAGAGTAATTATAGATACCTTTGATGCCTTTTTGTCTATATTCTTTAATATTTTG
TCTAGAAAAATATTTTGTAGAGATTTAGACACAAAGTATTTCCTTTCTTTCATAGTGAAC
TATGGCAGCGGCTACTTAGAGAACTCAGAAATGAGAATTCCTTAAGAAAAAGAATTTTTC
ATCGCCTTGGAGAAGATTTAAGATTAGATTTTAGATTTTATAAGATTTTGA>TTHERM_001295283(protein)
MEKFIKFLEEDVDFNIEIHNKIQDLKDQKLIDPSFIVFKCSLRLDIIQLNDQDLNLSIYI
QQNYPNLDSLIRDYVQKILSEDKQLRNIQIRQEQILPDIEIINGNLTNNLNIYAQKGILQ
NSLLQNSFVQGQLVLIEYFQVLKIFPLENYYSIKRYSYYCGCNNNDYKLQNTNLILHIIE
NNQSASLNKQSSNLIKNLSCDICHQEMYEDKEKSKPELCQKVLIYIPERYNSTRNSLLNG
FQKEEGKLIEMFLEKQYCNSLSLNQTYSCIAYYSLATSNKQTKNDFLTGFKPLNITEHLF
ACTISINIKDPNAQFNQQMINQVSLFNCITEQEQLESQMKQNSNDENENFHFKFKQLMFA
VDSFFNEATKFSFLQLKTALVMSYVLANSNRILQKNSSLNREGSFSQLNVLFQCESQFVD
SIIEEILMTFGYLQSFNVFDCLLQFDIASSLVKSNNSILLIKNIQDISKQQQEQLNKILQ
NQEIYFDQLKTKLNLNVTIWAFNSTSKQSGKIKKFKSDKNISQSFEQYFDVCLSQDKSVL
SLKDYHLLIQNEVDMFLDKELQMGQKFSRKAHHELSTEKKHIHSKSNRFNEQMSTLKKEK
SSQNQHVQALIGDNYKNNNEEEAHCLLNKFINTVRNSMSAKEINYSTSNISSLSKFAIAS
SIFRNVFIKNNSQELISCEENSRVIIDTFDAFLSIFFNILSRKIFCRDLDTKYFLSFIVN
YGSGYLENSEMRIPQEKEFFIALEKIQDQILDFIRF>TTHERM_001295283(gene)
ATGGAGAAATTTATTAAATTTTTGGAAGAAGACGTAGATTTTAATATAGAAATTCATAAT
AAGATTTAAGATTTAAAAGATTAAAAGTTAATAGATCCTAGCTTTATTGTTTTTAAGTGC
AGTCTCAGATTGGATATTATATAGTTGAATGACTAAGATTTAAACCTTTCCATTTATATT
TAGCAAAATTACCCTAATTTAGATTCGTTAATTAGAGATTATGTATAAAAGATTTTATCT
GAAGATAAATAATTGAGGAATATATAAATAAGACAAGAATAAATACTTCCTGATATCGAG
ATCATCAATGGGAATCTTACTAATAATCTTAATATTTATGCATAGAAAGGTATTCTTCAG
AATTCTTTGTTATAAAATTCTTTTGTTCAAGGACAGCTAGTTCTTATTGAATATTTTTAA
GTATTAAAAATTTTTCCTTTAGAGAATTATTACTCTATTAAGAGATATTCTTATTACTGT
GGTTGCAACAATAATGATTACAAGCTTTAAAATACTAATTTAATTCTTCATATTATTGAA
AACAATTAATCTGCATCCCTAAACAAACAGAGCTCTAATTTAATTAAAAATTTAAGCTGT
GATATATGTCATTAGGAAATGTATGAAGATAAAGAAAAGAGTAAACCTGAATTATGCCAA
AAAGTACTTATATATATTCCAGAGAGATATAATTCAACCAGAAATAGTTTATTAAACGGT
TTTTAAAAAGAAGAGGGAAAACTCATTGAAATGTTTTTAGAAAAATAATACTGCAACAGT
CTTTCATTAAATTAAACTTATAGCTGTATAGCTTATTATTCCCTGGCTACGAGTAACAAA
TAAACAAAGAACGACTTTCTAACAGGTTTTAAACCTTTAAATATTACTGAACACCTGTTT
GCTTGCACAATTTCTATTAATATTAAAGATCCTAATGCTTAATTTAATTAATAAATGATA
AACTAGGTTAGTTTATTTAATTGTATCACAGAACAAGAATAATTGGAGAGTTAAATGAAA
TAAAATTCTAATGATGAAAACGAAAACTTTCATTTTAAATTTAAATAATTAATGTTTGCA
GTTGATTCATTTTTCAATGAAGCAACAAAGTTTAGCTTTTTGTAATTGAAAACTGCTTTA
GTTATGAGTTATGTACTTGCTAATTCAAATAGGATTCTTCAAAAAAATAGCAGTCTCAAT
AGAGAAGGATCATTTAGTTAATTAAATGTACTTTTTTAATGTGAAAGCCAATTTGTCGAT
AGCATAATAGAAGAAATTTTGATGACATTTGGATATCTTTAAAGTTTCAATGTATTTGAT
TGTCTTCTTTAATTTGATATTGCTTCATCCCTTGTAAAATCGAATAATAGCATTCTTCTG
ATAAAAAATATTCAAGATATTTCGAAGCAACAATAAGAACAACTAAATAAAATACTATAA
AATTAAGAGATTTATTTCGATCAGCTTAAAACAAAATTAAATTTAAATGTTACAATATGG
GCTTTCAATTCCACAAGTAAACAATCAGGTAAAATCAAAAAATTTAAAAGTGATAAAAAT
ATTTCTTAAAGTTTTGAGCAGTATTTTGATGTTTGCCTTTCCCAAGATAAGTCAGTATTG
TCTTTAAAGGATTACCACCTGTTGATCCAAAATGAAGTTGATATGTTTTTAGATAAAGAA
TTACAAATGGGTTAAAAATTTTCAAGAAAAGCCCATCATGAACTCTCCACTGAAAAAAAA
CACATTCACTCAAAAAGCAATAGATTCAATGAGTAAATGTCAACTCTTAAGAAAGAAAAA
AGCAGTTAAAATTAGCATGTTTAGGCGTTAATAGGTGATAACTATAAAAATAATAATGAA
GAAGAAGCGCATTGCTTACTGAACAAGTTTATCAATACTGTTAGAAATAGTATGAGTGCG
AAAGAAATAAATTATTCTACAAGCAATATTAGCAGCTTATCGAAATTCGCAATAGCTAGT
TCTATCTTCAGAAATGTTTTTATTAAAAATAATAGCCAAGAATTAATTTCATGCGAGGAA
AATAGCAGAGTAATTATAGATACCTTTGATGCCTTTTTGTCTATATTCTTTAATATTTTG
TCTAGAAAAATATTTTGTAGAGATTTAGACACAAAGTATTTCCTTTCTTTCATAGTGAAC
TATGGCAGCGGCTACTTAGAGAACTCAGAAATGGTAAATTAAACAATATTAAAAATAAAA
TTGTAAGCTTTTATTATTAAAAATGAATGTAGAGAATTCCTTAAGAAAAAGAATTTTTCA
TCGCCTTGGAGAAGATTTAAGATTAGATTTTAGATTTTATAAGATTTTGA