Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00455610Standard Name
NUP88 (NUcleoPorin 88)Aliases
PreTt20290 | 53.m00192 | 3712.m00053Description
hypothetical protein; Nucleoporin proteinGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.7%
TetraMine Data
TTHERM_00455610
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Stentor Coeruleus SteCoe_36368 0 Tetrahymena borealis EI9_13753.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (937 aa)
DictyBase DDB_G0279039 0.000019995566179747357 DDB_G0279039 on chromosome: 3
position 1541078 to 1544303
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:28386019: Iwamoto M, Osakada H, Mori C, Fukuda Y, Nagao K, Obuse C, Hiraoka Y, Haraguchi T (2017) Compositionally distinct nuclear pore complexes of functionally distinct dimorphic nuclei in the ciliate Tetrahymena. Journal of cell science 130(10):1822-1834
Sequences
>TTHERM_00455610(coding)
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CAAGATAATTGA>TTHERM_00455610(protein)
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RNKLKYHMKILDNQIIQTNPQDN>TTHERM_00455610(gene)
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TCTTACTAGGAGGTGTAATTTAATCTTTAATAACTTCCACGCTTTGGTAGAAACGAAGAG
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TTTTTCACTAGCTATTCGAAAACCAATTTCTAAATTCCTTCTGATTTCGATTTTCTGTCA
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TACAAATTGATGAAAACACTTTATAAAAAATTAATGAAACAAGAAATAAGCTAAAATACC
ACATGAAAATCCTTGATAATTAGATCATTTAAACCAATCCTCAAGATAATTGA