Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00697500

Standard Name

NRK38 (NIMA-Related Kinase)

Aliases

PreTt17542 | 108.m00194 | 3818.m00727

Description

NIMA-Related Kinase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_00697500

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_18117.19.997093137033517e-262protein kinase domain-containi
ng protein (1059 aa)
OxytrichaContig11669.0.g1053.000235161122315e-61Protein kinase domain
DictyBaseDDB_G02892778.99586662241984e-56nek4 on chromosome: 5 position
2561379 to 2563106
WormBaseWBGene000214615.0007856079333316e-54locus:nekl-1 status:Partiall
y_confirmed UniProt:Q6AW07
protein_id:CCD69902.1
SGDYHR102W8.003613776907505e-34KIC1 Protein kinase of the PAK
/Ste20 family, required for ce
ll integrity; physically inter
acts with Cdc31p (centrin), wh
ich is a component of the spin
dle pole body; part of the RAM
network that regulates cellul
ar polarity and morphogenesis
Stentor CoeruleusSteCoe_193741.0806392777072785e-30

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:16611747: Wloga D, Camba A, Rogowski K, Manning G, Jerka-Dziadosz M, Gaertig J (2006) Members of the NIMA-related kinase family promote disassembly of cilia by multiple mechanisms. Molecular biology of the cell 17(6):2799-810

Sequences

>TTHERM_00697500(coding)
ATGGAAAATTATCAAATTGTAAAAAAGATATACTCAACTAATACAGAAGATAGAGTTGTG
CTATTAGTTGAGAGAGATAGTAAATAATATGCGATGAAAAGACTCAACTTAGATGAAGAC
AATTAGAAATAACAGGTTATATTTAATGAAGTGAAAGTTTTAGAGAATTTAGTTCACCCA
AATATCATAAAATATTATGAGACTTTTCAGTATGAGTAGAAGCTCTGTATAGTTATGGAG
TACGCTGAAGGAGGCGATTTAAAGAAACAAGTTACTGAGAAATAGCATAAAAAGGAATTC
TTTGATGAAAGTCAGATTTGGAATATGTTCTCTCAGATTTGCCTTGCTGTCAAATATCTC
CACGATAACAAAATTCTCCATCGCGATTTAAAAATTCTTAACGTCTTCATCTGCAATAAT
GGATTAATAAAATTGGGTGATTTTGGTGTATCTAAATAGCTTGAAAATAAAGATATTCTT
ACCAGTACTCATGTCGGAACTGCTTATTATCTTTCTCCTGAATAATGTAATTAGCATTCA
TATAACCACAAAGTTGATATTTGGATGCTTGGATGTCTTCTTTATGAGCTATGTACTCTT
GATAAGCCATTCAAAAGCGATAATTTATTAGGACTTATAAAATAAATCACTCAAAACGAC
CCTGCTCCTATTTCTGATCATTACTCATCAACTATGGTTTAGCTGGTACAAGTTATGATG
CAAAAAGAGCCTGATATGAGGCCAGACATAAATTAAATTATTTCTATTCAAGAAATTTAA
AACTAATTTAAAAAATTGAAAGAATAATATCCTGAAGTTTATAAGGATTATTAATTTCCT
AATCCAAAAAAATACACAGGTTTTCTTAGAATAAAATAGAAGCCTACACTTTCTTTTATT
CCAAATGAAAAGAAAACTCTGTTTGTAATTGGAGAGAGAATAGAAAGTGGTTAATCCTAA
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TAATAAAATTAGCAGCAACCTAATTCAGCTTCTACTTCATCACCTGAAAAAATTCAACCA
AAATCATTAACTTAAGATTCTACTTAATAGGCATAAAAAAATTACAATTTAAGTAGTCCG
TAAATTTAATAAGAGGCTTAATCAAGTAAAAAATAATCTATAGACGGCTAGTTCATTAAT
AACAATTAGTCTGAAAGTATCAAGGAATAATCCCGCTCAGTTGAGTCGCAAATTTTCTAA
TAAAATTAAAAAAGTTAAAATGCAGGGACAATTATAAACTAAATGTAATTTTGTTAAGTT
TAATAAGACCAAATTAATAACAACAGCTTCATGATTTAAATGTAATAAAACTAAAAACCC
TTTATGACTCAAGAAGAAACATTTGGAATGAATAAACCGATAGAAGATTATGTTTTATAA
TATCCTCATCATTAATAACAGTAATAAGTTATTTAAAATATGTAGTCTCCCTAATATTAA
ATGCCCTTTTAAAGCCATCCGATAAATAAAAATAGTATTGGGAACCCTATTTATCGTTAT
GTTTAGCAACCAATCTAGCAATAATAAATGACAAATTTTTAATTTTAATAGCAGCACACT
CCTTCCTATTCTACATAAAATTAATACTACGACTTTTTTATAGGAAATGCTACATCAAGT
ACTCAAAGTGAAAATGTTTCTCCTATAAATAATAACAATAACAACCATCCTATTCTCTCT
CAATAAATGTCTTTATAGCATAATCATCTATCTTAAAGTCAATTCGGATACTAATCTGGG
TATGTAGCGAGTGGAACAAATTCGAATAATAGTTCTATGGTTATGGATTTAAGATCACCT
AATACTTAAAATTCAATGCCTTAACAAATAATGTCTGAAATGAGCTCTCCAATTAACATG
CCTTTCTCTCCTATGAACTAATATGAGCATATGCCTAATCACTACTAATAACCTTATCCA
CCATACTCTCAAAACAATAATTCAATACAACAGTTTACTCCAAATAATCAATAACAGCTA
AAAAAATAACCTATGAAAATACCTAGATATAAGCCTCCTATTGTAATCGACACAACTTAT
GGAGGAAACTTTTCATAAAAAAAATCTACTCCTAATTCTGATATTCAAGGACGAGAAAGC
GGATTGGGTAGTGGTAGAAGTGGACACAGTGCTCAAAGTTCTTAGCAAAATTCTTCATTG
TCTAGCATCATGATGATGATGATGATGGATGGTGAAAACAACAATAACTAAGGATAGTCA
ACTTCTATGTATGGAAGTAGTTATAATAATAGCGGTTCAAGCAATACAACAAGTAACTAG
TCATCCACAAAAAATAACTCCACTAAAAACTAACATTGTTAAAATATATCTCAACAATAA
TAATATGCACACAGCCTACCTACTACCAAAGTGAAACCAAAATACTTCAACTTCCCACAA
TCTCCAAATAGGACAATTCTTGTATCTGATTATCTCAAATAAAAATTAGGAGAAGAGAAA
TTTCTTAAAATGAAAAGTATTTTAGATAATTCTTCCAACCCATAAGAATTACTTGAAAAT
AATCCTTAAGTGATCGCAATTATAGGAGAAGAAAACATGGAACTTGCAAAAGTGTTTAGA
TATTTAATTAATTCCCAAAGAACTCCTTCAGGAAGTAACCACCTTCGTCACAAATCTTTT
TAAGGTTTTGAAAATCCTTTTCCTAATTCAGACCAAATAAACAAAATATAAAATATAAAT
ATATCATAATCTCTTCTTCTATCACAAAACATGCAGTAATAGCAACCATAATAAACATAA
AACCCTTCTCATAATTAAAACGTAGCCATCTGA


>TTHERM_00697500(protein)
MENYQIVKKIYSTNTEDRVVLLVERDSKQYAMKRLNLDEDNQKQQVIFNEVKVLENLVHP
NIIKYYETFQYEQKLCIVMEYAEGGDLKKQVTEKQHKKEFFDESQIWNMFSQICLAVKYL
HDNKILHRDLKILNVFICNNGLIKLGDFGVSKQLENKDILTSTHVGTAYYLSPEQCNQHS
YNHKVDIWMLGCLLYELCTLDKPFKSDNLLGLIKQITQNDPAPISDHYSSTMVQLVQVMM
QKEPDMRPDINQIISIQEIQNQFKKLKEQYPEVYKDYQFPNPKKYTGFLRIKQKPTLSFI
PNEKKTLFVIGERIESGQSQPQSNEDELSNSIISSDSSFQQQNQQQPNSASTSSPEKIQP
KSLTQDSTQQAQKNYNLSSPQIQQEAQSSKKQSIDGQFINNNQSESIKEQSRSVESQIFQ
QNQKSQNAGTIINQMQFCQVQQDQINNNSFMIQMQQNQKPFMTQEETFGMNKPIEDYVLQ
YPHHQQQQQVIQNMQSPQYQMPFQSHPINKNSIGNPIYRYVQQPIQQQQMTNFQFQQQHT
PSYSTQNQYYDFFIGNATSSTQSENVSPINNNNNNHPILSQQMSLQHNHLSQSQFGYQSG
YVASGTNSNNSSMVMDLRSPNTQNSMPQQIMSEMSSPINMPFSPMNQYEHMPNHYQQPYP
PYSQNNNSIQQFTPNNQQQLKKQPMKIPRYKPPIVIDTTYGGNFSQKKSTPNSDIQGRES
GLGSGRSGHSAQSSQQNSSLSSIMMMMMMDGENNNNQGQSTSMYGSSYNNSGSSNTTSNQ
SSTKNNSTKNQHCQNISQQQQYAHSLPTTKVKPKYFNFPQSPNRTILVSDYLKQKLGEEK
FLKMKSILDNSSNPQELLENNPQVIAIIGEENMELAKVFRYLINSQRTPSGSNHLRHKSF
QGFENPFPNSDQINKIQNINISQSLLLSQNMQQQQPQQTQNPSHNQNVAI


>TTHERM_00697500(gene)
ATGGAAAATTATCAAATTGTAAAAAAGATATACTCAACTAATACAGAAGATAGAGTTGTG
CTATTAGTTGAGAGAGATAGTAAAGTAATTTGAGCTTAGTTTTATATATAATAAAAATAA
AAATAAAATATAATTGCTTTGAAACCATATATTGACTTCACCTTATTTTTTCAACCCTAT
AATTTTTACATTATTATTGTGCCTTCTTTCAAATTAATTGACTCAGCTTATATTTCAAAT
AAATCAAGTAATATGCGATGAAAAGACTCAACTTAGATGAAGACAATTAGAAATAACAGG
TTATATTTAATGAAGTGAAAGTTTTAGAGAATTTAGTTCACCCAAATATCATAAAATATT
ATGAGACTTTTCAGTATGAGTAGAAGCTCTGTATAGTTATGGAGTACGCTGAAGGAGGTA
GGGTTAAAAAATTCATAATATTTGATTTACAAATTATAAAAAATTTTGTTCAATTTTAGA
AAGATGCAAGCAAACCCTTCTTTTACTCAAATAAAAATAGAAAAAGGAGAGATTGTTTGT
TAAAGAATCTAATATTAGGAAATCATTTTCTTTAATTGTTATATTAGCTTACATTTAGCC
ATATTTATGTTATTATAAAAGGCGATTTAAAGAAACAAGTTACTGAGAAATAGCATAAAA
AGGAATTCTTTGATGAAAGTCAGGTATGCTAATTAAATTCATTCATTCATTAACTCATTC
GCTTATTTACAATATCTCCTATTCATATTTATTGATTGAATTTGATTTTAGTAAACAACA
ATTAAATTAATAAAATTTTGAATTTCTTAATCTCTCTCTAAATTATTCAAAATTTCTATT
CAAATTAGATTTGGAATATGTTCTCTCAGATTTGCCTTGCTGTCAAATATCTCCACGATA
ACAAAATTCTCCATCGCGATTTAAAAATTCTTAACGTCTTCATCTGCAATAATGGATTAG
TACACTAATTTTTTATACTTAAAGGACTATATTAATATTAATTGTATGATTACTACAAAA
TTTTTAAAATGTAAGAGCTGTTCTGCTCACCAATAAAATAATTTGGTATATTCAAAGCAA
ATAAAATAATCTACATAAGAAAACTGAGCCAGTATTTTAGTTTGTAAAAATATGGTTTAA
ATCATAGAAGAAAAATAATAAATCGGATAAAATTCTCCTAAGCTTAAATAGATATAAAAA
TTGATAGAACAAAAGTTAATTTATTTTTTATAAAATCAGATAAAATTGGGTGATTTTGGT
GTATCTAAATAGCTTGAAAATAAAGATATTCTTACCAGTACTCATGTCGGAACTGCTTAT
TATCTTTCTCCTGAATAATGTAATTAGCATTCATATAACCACAAAGTTGATATTTGGATG
CTTGGATGTCTTCTTTATGAGCTATGTACTCTTGATAAGCCATTCAAAAGCGATAATTTA
TTAGTAAATAAAATTATTTCTTGAAGAAATTATTTAGTTAGACCCAAATTATATTTTTAA
TTAGGGACTTATAAAATAAATCACTCAAAACGACCCTGCTCCTATTTCTGATCATTACTC
ATCAACTATGGTTTAGCTGGTACAAGTTATGATGCAAAAAGAGCCTGATATGTAACACTT
TTGCATAAAATTTACTTGTATGTATAATATTATTCTTTTAATGTATTATAGGAGGCCAGA
CATAAATTAAATTATTTCTATTCAAGAAATTTAAAACTAAGTAAAATATTTATTTTATTT
TTTATGATACATTTATCACTCAGAATTATACGATTAAACAATTAGTTTAAAAAATTGAAA
GAATAATATCCTGAAGTTTATAAGGATTATTAATTTCCTAATCCAAAAAAATACACAGGT
TTTCTTAGAATAAAATAGAAGCCTACACTTTCTTTTATTCCAAATGAAAAGAAAACTCTG
TTTGTAATTGGAGAGAGAATAGAAAGTGGTTAATCCTAACCTCAATCTAATGAAGATGAA
TTAAGTAACTCAATAATATCATCTGATTCTAGCTTTTAATAATAAAATTAGCAGCAACCT
AATTCAGCTTCTACTTCATCACCTGAAAAAATTCAACCAAAATCATTAACTTAAGATTCT
ACTTAATAGGCATAAAAAAATTACAATTTAAGTAGTCCGTAAATTTAATAAGAGGCTTAA
TCAAGTAAAAAATAATCTATAGACGGCTAGTTCATTAATAACAATTAGTCTGAAAGTATC
AAGGAATAATCCCGCTCAGTTGAGTCGCAAATTTTCTAATAAAATTAAAAAAGTTAAAAT
GCAGGGACAATTATAAACTAAATGTAATTTTGTTAAGTTTAATAAGACCAAATTAATAAC
AACAGCTTCATGATTTAAATGTAATAAAACTAAAAACCCTTTATGACTCAAGAAGAAACA
TTTGGAATGAATAAACCGATAGAAGATTATGTTTTATAATATCCTCATCATTAATAACAG
TAATAAGTTATTTAAAATATGTAGTCTCCCTAATATTAAATGCCCTTTTAAAGCCATCCG
ATAAATAAAAATAGTATTGGGAACCCTATTTATCGTTATGTTTAGCAACCAATCTAGCAA
TAATAAATGACAAATTTTTAATTTTAATAGCAGCACACTCCTTCCTATTCTACATAAAAT
TAATACTACGACTTTTTTATAGGAAATGCTACATCAAGTACTCAAAGTGAAAATGTTTCT
CCTATAAATAATAACAATAACAACCATCCTATTCTCTCTCAATAAATGTCTTTATAGCAT
AATCATCTATCTTAAAGTCAATTCGGATACTAATCTGGGTATGTAGCGAGTGGAACAAAT
TCGAATAATAGTTCTATGGTTATGGATTTAAGATCACCTAATACTTAAAATTCAATGCCT
TAACAAATAATGTCTGAAATGAGCTCTCCAATTAACATGCCTTTCTCTCCTATGAACTAA
TATGAGCATATGCCTAATCACTACTAATAACCTTATCCACCATACTCTCAAAACAATAAT
TCAATACAACAGTTTACTCCAAATAATCAATAACAGCTAAAAAAATAACCTATGAAAATA
CCTAGATATAAGCCTCCTATTGTAATCGACACAACTTATGGAGGAAACTTTTCATAAAAA
AAATCTACTCCTAATTCTGATATTCAAGGACGAGAAAGCGGATTGGGTAGTGGTAGAAGT
GGACACAGTGCTCAAAGTTCTTAGCAAAATTCTTCATTGTCTAGCATCATGATGATGATG
ATGATGGATGGTGAAAACAACAATAACTAAGGATAGTCAACTTCTATGTATGGAAGTAGT
TATAATAATAGCGGTTCAAGCAATACAACAAGTAACTAGTCATCCACAAAAAATAACTCC
ACTAAAAACTAACATTGTTAAAATATATCTCAACAATAATAATATGCACACAGCCTACCT
ACTACCAAAGTGAAACCAAAATACTTCAACTTCCCACAATCTCCAAATAGGACAATTCTT
GTATCTGATTATCTCAAATAAAAATTAGGAGAAGAGAAATTTCTTAAAATGAAAAGTATT
TTAGATAATTCTTCCAACCCATAAGAATTACTTGAAAATAATCCTTAAGTGATCGCAATT
ATAGGAGAAGAAAACATGGAACTTGCAAAAGTGTTTAGATATTTAATTAATTCCCAAAGA
ACTCCTTCAGGAAGTAACCACCTTCGTCACAAATCTTTTTAAGGTTTTGAAAATCCTTTT
CCTAATTCAGACCAAATAAACAAAATATAAAATATAAATATATCATAATCTCTTCTTCTA
TCACAAAACATGCAGTAATAGCAACCATAATAAACATAAAACCCTTCTCATAATTAAAAC
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