Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00628440

Standard Name

NRK34 (NIMA-Related Kinase )

Aliases

PreTt24670 | 88.m00138 | 3822.m00659

Description

NIMA-Related Kinase

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%

TetraMine Data

TTHERM_00628440

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_17279.19.997093137033517e-262protein kinase domain-containi
ng protein (760 aa)
OxytrichaContig1689.0.g141.0004982362389172e-141Protein kinase domain
DictyBaseDDB_G02752413.999244945363787e-60nek3 on chromosome: 2 position
4983790 to 4987279
Stentor CoeruleusSteCoe_348014.7111658015535965e-58
WormBaseWBGene000089561.9998745702418095e-48locus:nekl-3 status:Confirme
d UniProt:G5EFM9 protein_i
d:CAA92169.2
SGDYAR018C2.999884853455273e-42KIN3 Nonessential serine/threo
nine protein kinase; possible
role in DNA damage response

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:16611747: Wloga D, Camba A, Rogowski K, Manning G, Jerka-Dziadosz M, Gaertig J (2006) Members of the NIMA-related kinase family promote disassembly of cilia by multiple mechanisms. Molecular biology of the cell 17(6):2799-810

Sequences

>TTHERM_00628440(coding)
ATGTCTTTAAAAGATTTTTAAATAGTCTAAAAGCTAGGCGAGGGAGCTTATAGCAGCGTT
TATAAAGTAAAGAGGTATGGTGATGGCCAAGAATATGCTCTCAAAAAGGTGAAACTATAA
AATTTAAGTGAAAAAGAAAAATAAAATGCCTTAAATGAAGTTAGAATACTTGCCTCAATT
CGCGCAAATAATATTGTTGGATATAAAGAGGCCTTTTTAGACGAAATGTCTAATTCTCTA
TGTATCATTATGGAATATGCTAATAATGGCGATCTTTTTCAAAAAATAGTTGACCATTAA
AAGAAAGGCCAGCTATTCCCTGAGTAGGAGATATGGAACATCTTTATACAAATGGTGAAG
GGCATCAAATCTTTACATGATTTGAAAATTTTTCACCGTGATCTGAAGAGTGCCAATGTG
TTTTTGAATAAAGATGGCACAGTCAAATTAGGTGACATGAATGTTTCAAAAGTTGCCAAA
AAGGGTTTACTCTATACTCAAACAGGAACACCTTACTATGCAAGTCCAGAAGTATGGAAA
GATTAGCCCTATGATGCAAAATCTGATATTTGGTCACTCGGTTGTGTCTTATACGAGATG
ACTACACTCAAACCACCCTTTAGAGCAGAAGATATGGAGGGTTTATACAAAAAAGTTATA
AGAGGATACTATCCTAGAATTCCTCCTCATTTCTCATAAGACCTTGCTAATGTTATCAGA
GCACTGCTTTAAGTAGCTCCTCACTTAAGGCCATCAGCAGACAAGATACTTTAGTTACCA
GCTGTCATCAAAAGAGTAAATGATAGCCACCTCCTTGAAGTTGATGAAGGAGTTCCCTTC
TTGTTGACAACAATCAGAGTTCCTAAAAATTTACATTACCTTACGGATAGGCTTCCTAAA
CCTAACTATGCCCCATTAAAAATGAAAAAAATTGAAAAGTAAAGGTTTTTATAAACCTTA
GCTGGTTACAGAGGTGAAAGAAACGCCAGTCCAATGGATGACGATGAATAATCTTAAGCT
AGTTAAATCATAACTTAAACTCAAACACAGTAATAAGAAAAAGGTTAGCAGTAAATACTT
CATCTTCCCAAAATAAATCCTAAGGTACAAAAGAATCTACCTTCTGCTTAGGCAGCTCCA
ACGTAGGATACTGGGTCACATAACAATAGCCAGCTTATAAGTAATAACAATAATAATGGT
AGCAGTAACTATATAGGTTCAAACCATAAAGATAAGGATAGTGATGCTAATTCGATTAAC
CAGTCAATAATTAACGATCACAATAGCATCAAAAAGAAGAAAAAGAAATAACCTGAATAC
GATTAAAATTCTTCTGTAGTTAGTGCTACAAACATTAATAAAGATATAAGTTTACTAATT
TCTTCACCATAAAATGCAGGAGCAAACCAATAAAACAAACCATAAAAGAAGGATTACAAT
GATAAATAAAAGTATGAAGTCCTTGAAGTTATAAGACAAATAAAATACTATGATTATCCA
TAGTAAGGAGCCCCAAAAGGATCAAAATAGTACCAATAAAGCTCTTAAGGCTCCATATAA
AGTTTGGCACAAGTTCAAGGTTAAAGTGTACATCAACATCAAGCACAATATGATTCCCTT
TCCCCAAACAGAAGAAAAAAGAATGATAACTTAAATCTTTTAGACATAGAAGGTGAGTCA
AAACCCCTCTTAAAAAAGAATCGTAAAAATCCTTCAATCCACAATTCTCCAAATAATAAA
TATGATGATATTTCTGTGAGCTCAAAAAATCCAGTTTTAGAAGAAAGTAATAAATTACCA
TCAATTGGCATTACAAAACTTCCAAAGATATAAGGATTAGCCGGTAATCAAGGAATTGAT
AGTAAATTATTAGCAATATAGTAACCTAAAATTGTAAATGACAAAGAAAACTAGAAGATA
AGAGAGATTTCTAGAGCTTATAAAGTGAATATAAATTAACTAGATGATATAAAAGACAGG
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AGTCTTCCTAGCAGTAATTAATAATAATTAGAAATAGGAGGTAACTAAAAATACTATAAT
TATTCTCTCGTTGATCCCTCAAGTGGATAACATTCAAAAAACAAGTGA


>TTHERM_00628440(protein)
MSLKDFQIVQKLGEGAYSSVYKVKRYGDGQEYALKKVKLQNLSEKEKQNALNEVRILASI
RANNIVGYKEAFLDEMSNSLCIIMEYANNGDLFQKIVDHQKKGQLFPEQEIWNIFIQMVK
GIKSLHDLKIFHRDLKSANVFLNKDGTVKLGDMNVSKVAKKGLLYTQTGTPYYASPEVWK
DQPYDAKSDIWSLGCVLYEMTTLKPPFRAEDMEGLYKKVIRGYYPRIPPHFSQDLANVIR
ALLQVAPHLRPSADKILQLPAVIKRVNDSHLLEVDEGVPFLLTTIRVPKNLHYLTDRLPK
PNYAPLKMKKIEKQRFLQTLAGYRGERNASPMDDDEQSQASQIITQTQTQQQEKGQQQIL
HLPKINPKVQKNLPSAQAAPTQDTGSHNNSQLISNNNNNGSSNYIGSNHKDKDSDANSIN
QSIINDHNSIKKKKKKQPEYDQNSSVVSATNINKDISLLISSPQNAGANQQNKPQKKDYN
DKQKYEVLEVIRQIKYYDYPQQGAPKGSKQYQQSSQGSIQSLAQVQGQSVHQHQAQYDSL
SPNRRKKNDNLNLLDIEGESKPLLKKNRKNPSIHNSPNNKYDDISVSSKNPVLEESNKLP
SIGITKLPKIQGLAGNQGIDSKLLAIQQPKIVNDKENQKIREISRAYKVNINQLDDIKDR
YRSIKRMEQSKSKQYVLKNSSLPSSNQQQLEIGGNQKYYNYSLVDPSSGQHSKNK


>TTHERM_00628440(gene)
ATGTCTTTAAAAGATTTTTAAATAGTCTAAAAGCTAGGTAAAGATAAATCAAAACAATTT
AATAGATTTTACAATTGACTTCCATAATTAAAAATAAGGCGAGGGAGCTTATAGCAGCGT
TTATAAAGTAAAGAGGTATGGTGATGGCCAAGAATATGCTCTCAAAAAGGTGAAACTATA
AAATTTAAGTGAAAAAGAAAAATAAAATGCCTTAAATGAAGTTAGAATACTTGCCTCAAT
TCGCGCAAATAATATTGTTGGATATAAAGAGGCCTTTTTAGACGAAATGTCTAATTCTCT
ATGGTAAACACTTAAACCTCTTTCATCATGATCTATATTTTTAATAAACATTATCTTTTA
AATGCTCTGCAGATATTTAAATAATCAATTTTATAAACTCATAAAATGAGCTATTGTCAT
AGCTTGAAAGTTATTCAAGATTAACTGCAAAGAATTTTTTAGGATGAGTATATGTTTAGA
ATTTAAGAATTACTTTTTGTATTAATAGTATCATTATGGAATATGCTAATAATGGCGATC
TTTTTCAAAAAATAGTTGACCATTAAAAGAAAGGCCAGCTATTCCCTGAGTAGGAGATAT
GGAACATCTTTATACAAGTATTAAAACGTTATTTAAAAAAAAAGACTTTCAATCAATATA
TTAATTTTCATTTATTTAAAAGATGGTGAAGGGCATCAAATCTTTACATGATTTGAAAAT
TTTTCACCGTGATCTGAAGGTAATTTATTAATTAATTAATGCTCATATTTAAGATTTGAT
CCAAATTATCATAACTCCTTTCAAATCAATTTATCAGAATAATTAAATTATTGGTGATGC
ATATAATTAATACTGACTTGCTTGTTTCTTACCAAAATCTAATTATAGATAGCAAAAAAA
TAATAAATTTAATAAAAAGCAACTTCCATCTATCATTTATTTTTTTATTTATTTGCTTAT
CCTGCTAAACTGATAAATCAATCAGCTATTAAAATATTTAATTTATCTTAAGTTATTTCA
TATGTTTTATTTTATAAAATTAAGAGTGCCAATGTGTTTTTGAATAAAGATGGCACAGTC
AAATTAGGTGACATGAATGTTTCAAAAGTTGCCAAAAAGGGTTTACTCTATACTCAAACA
GGAACACCTTACTATGCAAGGTATTTCATTTAAAATTAAAAAGAAATCTTTATTTATATA
TCTAATAAAGTCCAGAAGTATGGAAAGATTAGCCCTATGATGCAAAATCTGATATTTGGT
CACTCGGTTGTGTCTTATACGAGATGACTACACTCAAACCACCCTTTAGAGCAGAAGATA
TGGAGGGTTTATACAAAAAAGTTATAAGAGGATACTATCCTAGAATTCCTCCTCATTTCT
CATAAGACCTTGCTAATGTTATCAGAGCACTGCTTTAAGTAGCTCCTCACTTAAGGCCAT
CAGCAGGTATTTTAAACCATAATTAATTCATATTTGTATACTCATAGATCATCAAAAATA
AAAAAAATATTTTTTGTCATTTTTATTAAACAAAATAACATTTTTCAAAGAGAAAATATT
TAAAATAATAATAAATTTTTGAAAAAGTTTAGATAAGCAATTTTTGGCCAGTTAAATTTT
AAAAAATAAAGATTTTCAATTAATTAATTACAAGTTTTTAATAGAAATATTTAATAAACT
GATTAGACGATTAATTTTATCAATTAAACTAATTATATTTATTTTTAAATGATTTTAGAC
AAGATACTTTAGTTACCAGCTGTCATCAAAAGAGTAAATGATAGCCACCTCCTTGAAGTT
GATGAAGGAGTTCCCTTCTTGTTGACAACAATCAGAGTTCCTAAAAATTTACATTACCTT
ACGGATAGGCTTCCTAAACCTAACTATGCCCCATTAAAAATGAAAAAAATTGAAAAGTAA
AGGTTTTTATAAACCTTAGCTGGTTACAGAGGTGAAAGAAACGCCAGTCCAATGGATGAC
GATGAATAATCTTAAGCTAGTTAAATCATAACTTAAACTCAAACACAGTAATAAGAAAAA
GGTTAGCAGTAAATACTTCATCTTCCCAAAATAAATCCTAAGGTACAAAAGAATCTACCT
TCTGCTTAGGCAGCTCCAACGTAGGATACTGGGTCACATAACAATAGCCAGCTTATAAGT
AATAACAATAATAATGGTAGCAGTAACTATATAGGTTCAAACCATAAAGATAAGGATAGT
GATGCTAATTCGATTAACCAGTCAATAATTAACGATCACAATAGCATCAAAAAGAAGAAA
AAGAAATAACCTGAATACGATTAAAATTCTTCTGTAGTTAGTGCTACAAACATTAATAAA
GATATAAGTTTACTAATTTCTTCACCATAAAATGCAGGAGCAAACCAATAAAACAAACCA
TAAAAGAAGGATTACAATGATAAAGTAAATTAATTTATTATTATTTTTATAAAACAAATA
TAAAAATCTTATTTAATTAATTTAGTAAAAGTATGAAGTCCTTGAAGTTATAAGACAAAT
AAAATACTATGATTATCCATAGTAAGGAGCCCCAAAAGGATCAAAATAGTACCAATAAAG
CTCTTAAGGCTCCATATAAAGTTTGGCACAAGTTCAAGGTTAAAGTGTACATCAACATCA
AGCACAATATGATTCCCTTTCCCCAAACAGAAGAAAAAAGAATGATAACTTAAATCTTTT
AGACATAGAAGGTGAGTCAAAACCCCTCTTAAAAAAGAATCGTAAAAATCCTTCAATCCA
CAATTCTCCAAATAATAAATATGATGATATTTCTGTGAGGTAATCTTAATAAAAAAATAT
AAAAATTAAAATTTATAAATTGATATTTAAAAAAAAAATGATTCTAATTAATTTAATTAT
AAAAAGCTCAAAAAATCCAGTTTTAGAAGAAAGTAATAAATTACCATCAATTGGCATTAC
AAAACTTCCAAAGATATAAGGATTAGCCGGTAATCAAGGAATTGATAGTAAATTATTAGC
AATATAGTAACCTAAAATTGTAAATGACAAAGAAAACTAGAAGATAAGAGAGATTTCTAG
AGCTTATAAAGTGAATATAAATTAACTAGATGATATAAAAGACAGGTACAGATCTATTAA
AAGAATGGAGTAATCTAAGAGTAAACAATATGTGTTGAAGAATTCTAGTCTTCCTAGCAG
TAATTAATAATAATTAGAAATAGGAGGTAACTAAAAATACTATAATTATTCTCTCGTTGA
TCCCTCAAGTGGATAACATTCAAAAAACAAGTGA