Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00219200

Standard Name

NRK27 (NIMA-Related Kinase )

Aliases

PreTt22348 | 18.m00374 | 3701.m00133

Description

NIMA-Related Kinase

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF00439 ) Bromodomain
• ( PF00904 ) Involucrin repeat
• ( TIGR00020 ) peptide chain release factor 2
• ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_00219200

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_06701.1	9.997093137033517e-262	hypothetical protein (1314 aa)
DictyBase	DDB_G0271052	0.0000000008996637801615584	snf2b on chromosome: 1 positio n 4502537 to 4512340
SGD	YGR252W	0.0000000020002373268528243	GCN5 Acetyltransferase, modifi es N-terminal lysines on histo nes H2B and H3; acetylates Rsc 4p, a subunit of the RSC chrom atin-remodeling complex, alter ing replication stress toleran ce; catalytic subunit of the A DA and SAGA histone acetyltran sferase complexes; founding me mber of the Gcn5p-related N-ac etyltransferase superfamily; m utant displays reduced transcr iption elongation in the G-les s-based run-on (GLRO) assay

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:16611747: Wloga D, Camba A, Rogowski K, Manning G, Jerka-Dziadosz M, Gaertig J (2006) Members of the NIMA-related kinase family promote disassembly of cilia by multiple mechanisms. Molecular biology of the cell 17(6):2799-810

Sequences

>TTHERM_00219200(coding)
ATGGACTAAAATCAAAATTAGTTTATAAATAATTAGAATCCTTAGTATTACTAGCAATTC
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GCAGCTCCTCAACCGCCCAACGAAGGATAATAAAATACCTTATAAACAGTAAACAAAACA
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TCATAAAATTTAAATAATAATATTTAAAATTAAAAAAATTAATAATAAAAGCCTCCATAA
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TTATAACAACCTGCTTAATCTTAATAAAATATTGCTCCTCCATTATCGCCTACACCATCG
TAGCCAATAGTAATTAGTACAATTATTGAAAATTTAGATATAGAAGACTCAAATAAATAA
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GTTCCAAAGAAATCAGAATTACCACCTATTTTATTAAATAATATGTAATCTACATCTAAT
TAACCTTCTAAATAAAATATTCCAGTATTAGCATCACTTCCTCCCATGCTAAGACAACAA
ATGGAGAATTAAAATAAAAATGTTTAAGATCCTTGTAAAAAAGAAAATTAAGGATAAGAA
AGTAATATTCTATCAGAGCCTTTAAAAGAAACGAAAATGGAGATAGAAGAAAACATAGAA
AAATCTAATAAAATTTAAATTAGTTTTAGCAATAATTTAGTAAAAGAGGAAGAGATAAAT
TAATTGAATAAATCTTCTGACCAAATAATCTAAGATTAAAATATAAAGTCTCCTATATTA
CCTCCTTAATAACCAAGCCAGAGACCAAAATCTATTGATTTCCCAAGACCATCTTAACCC
AATTCTTAGCTTTTATTACAGGCTTCTAATTCTTCTAATATCCAAAATAATAAGGAACCA
ATAGTAAAGTCTGAAGAAACTAAAATATTTATAAAAATTCCTGATATTATGACTTCACAA
AGTCAATTAGCTTCTCCAACTAATCCAGAATCTGGTACTGCATTAGCTAGTAATAATATA
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GAAGAAAATATTAATGCAATGGAAATTGAATAACCTATTGAATAATTAGAATATCAAGAT
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TAAAAAGCTATGAGTGAAATAATTTAACGTCTTACAAAAAATAAAAATTCAGAACCATTC
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GCAGTTGATGTTAATAAAATATTTGCAAATGCCAAATTATACAACAAAGAAGACACTGAA
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GAGTATCACACTTACGGAGGAAGATTCTTCTACAGAGAAAATAAAAAAATATAAAAGTAA
GCTTTCATGGAGAGATCAATGTCTTTAGATGAAAAGACTTAGCTTGCTAAAAACATAAGA
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CTAGAAAAACTAGATACCGATTCTTCTTATATTACAGAATCTGATGACTCTATGAAAGAC
CCAGATGAAGATGGAGGTGATTGA

>TTHERM_00219200(protein)
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>TTHERM_00219200(gene)
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