Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00219200

Standard Name

NRK27 (NIMA-Related Kinase )

Aliases

PreTt22348 | 18.m00374 | 3701.m00133 | BrEt-1

Description

NRK27 bromodomain domain protein; NIMA-Related Kinase. Bromodomain and ET domain.

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Gene Ontology Annotations

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Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_00219200

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_06701.19.997093137033517e-262hypothetical protein (1314 aa)
DictyBaseDDB_G02710520.0000000008996637801615584snf2b on chromosome: 1 positio
n 4502537 to 4512340
SGDYGR252W0.0000000020002373268528243GCN5 Acetyltransferase, modifi
es N-terminal lysines on histo
nes H2B and H3; acetylates Rsc
4p, a subunit of the RSC chrom
atin-remodeling complex, alter
ing replication stress toleran
ce; catalytic subunit of the A
DA and SAGA histone acetyltran
sferase complexes; founding me
mber of the Gcn5p-related N-ac
etyltransferase superfamily; m
utant displays reduced transcr
iption elongation in the G-les
s-based run-on (GLRO) assay

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:29523178: Saettone A, Garg J, Lambert JP, Nabeel-Shah S, Ponce M, Burtch A, Thuppu Mudalige C, Gingras AC, Pearlman RE, Fillingham J (2018) The bromodomain-containing protein Ibd1 links multiple chromatin-related protein complexes to highly expressed genes in Tetrahymena thermophila. Epigenetics & chromatin 11(1):10
  2. Ref:16611747: Wloga D, Camba A, Rogowski K, Manning G, Jerka-Dziadosz M, Gaertig J (2006) Members of the NIMA-related kinase family promote disassembly of cilia by multiple mechanisms. Molecular biology of the cell 17(6):2799-810

Sequences

>TTHERM_00219200(coding)
ATGGACTAAAATCAAAATTAGTTTATAAATAATTAGAATCCTTAGTATTACTAGCAATTC
CATGCTGGAGGCAATGGATAAGAATTATAATAGTAAACAGGGTAGGCTCAATAAGGAACA
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ACATCTCAAAATCTAAATTAATCAAATTTAGTCAATAATTAAGAAAAAAATGTTTCAATT
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GTTCCAAAGAAATCAGAATTACCACCTATTTTATTAAATAATATGTAATCTACATCTAAT
TAACCTTCTAAATAAAATATTCCAGTATTAGCATCACTTCCTCCCATGCTAAGACAACAA
ATGGAGAATTAAAATAAAAATGTTTAAGATCCTTGTAAAAAAGAAAATTAAGGATAAGAA
AGTAATATTCTATCAGAGCCTTTAAAAGAAACGAAAATGGAGATAGAAGAAAACATAGAA
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TAATTGAATAAATCTTCTGACCAAATAATCTAAGATTAAAATATAAAGTCTCCTATATTA
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GCAGTTGATGTTAATAAAATATTTGCAAATGCCAAATTATACAACAAAGAAGACACTGAA
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GCTTTCATGGAGAGATCAATGTCTTTAGATGAAAAGACTTAGCTTGCTAAAAACATAAGA
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AACAAAAAGCTCGATAAAGCTTAAGGTAAATAGACAAGCGAGTATGTGGACCCTGCAAAA
CTAGAAAAACTAGATACCGATTCTTCTTATATTACAGAATCTGATGACTCTATGAAAGAC
CCAGATGAAGATGGAGGTGATTGA


>TTHERM_00219200(protein)
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RLERYVKAKLNCIQKAREKKNKKLDKAQGKQTSEYVDPAKLEKLDTDSSYITESDDSMKD
PDEDGGD


>TTHERM_00219200(gene)
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CATCCTCTAGTTCAAGTAACGTGTCTAGAGCTGGCTCATCTTAAAATATTAATATTCCAG
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CTACTCCAAAGTAGTGTAGGAGGTTAGAAAGATATGTAAAAGCAAAGTTAAATTGTATTT
AAAAGGCAAGAGAGAAAAAGAACAAAAAGCTCGATAAAGTAAATATTTTTTAACTATTTG
TCATCTTTATTTTGTATTTATTTCTTTAATTATTTAAATCAAAATAGGCTTAAGGTAAAT
AGACAAGCGAGTATGTGGACCCTGCAAAACTAGAAAAACTAGATACCGATTCTTCTTATA
TTACAGGTATTTTAGGAAATTAAGCTTTTTCTATTTTCTTAAAAATTCTATTTTTTTAAA
CAGAATCTGATGACTCTATGAAAGACCCAGATGAAGATGGAGGTGATTGA