Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00095500

Standard Name

NOT1 (CCR4-Not complex component, Not1)

Aliases

PreTt22849 | 7.m00298

Description

NOT1 CCR4-NOT transcription complex subunit 1; CCR4-Not complex component- Not1 family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF06519 ) TolA protein
• ( TIGR02063 ) ribonuclease R
• ( TIGR01612 ) rhoptry protein
• ( TIGR01257 ) rim ABC transporter
• ( PF04054 ) CCR4-Not complex component, Not1
• ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_00095500

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_00255.1	9.997093137033517e-262	CCR4-Not complex component, No t1 family protein (2467 aa)
Oxytricha	Contig14324.0.g26	1.0003926095686843e-81	CCR4-Not complex component, No t1
DictyBase	DDB_G0276029	2.9987037581344066e-55	DDB_G0276029 on chromosome: 2 position 6435703 to 6443825
WormBase	WBGene00002845	9.996696112986116e-50	locus:let-711 status:Confirm ed UniProt:Q20937 protein_ id:CCD70321.2
SGD	YCR093W	1.9991939848149086e-44	CDC39 Component of the CCR4-NO T complex, which has multiple roles in regulating mRNA level s including regulation of tran scription and destabilizing mR NAs by deadenylation; basal tr anscription factor
Stentor Coeruleus	SteCoe_14285	7.281290178321643e-33

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00095500(coding)
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GAAAGTTTGGATATGAACTCACAGAATTCCCAAAATAAGGCAAATTTGCACACCACAGTT
AAAGGCTAATTTTTGAGCCAACATTTGCATGATTTAATATTCAGCAATAGCTTCTCAAAT
TTTCTTGATTTCATGCCCAACGTCTTCATTAAAGTAGTTTGTGGACCTAATAGTTTTTCA
AATTAAACCAATACAAAGCAGCTAAATTAAGTGGTAAATTATGCTTAAGAACTGAGCAAG
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TAGTAGCAAAATTAAATTGCTTTGCCTCAAAATAACCTTCCAATTATTTTATTACAATTT
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AACTATCCTAAGCCAGAAGAGTTAAACCACATAATAGGACCAGCTGACATTCTTAAAGAT
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GACTCTTTAATTGCTCTCACAAATAGTAACAACTACTCTTTTTCTGTATCACTTGGTATT
TTAGCTGGTAAGAGAGAATTCCTACACTTTGACTAATGGCTAAATGAGCGTGTTAAGACT
ATTGGGGATCCATTTGTAAATGCTCTACTAGCATATATCGAAGACAATGTTATTAATCCA
ATTAAAGAAATAAATATGAGACTAAACAACCCCAACAATTAAGCTTAACAGTAATATGAA
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CTATTAGAGTAACACCCTGAAAAACTTACTAGCAAAAATCGTTAAAAGTTGTAAGATCAA
TATAAAGAAATATTGTAATATTTCCCCTAATTAAGTGGAACTTCGGATTCACCAGGACAA
GCTACAGAAAAAAAAGCCAATTACAATTACCAAAGATTTTATATGAGAGAAATAACAATA
GAGGAAATGATTGCAAATTTAAAATAATTAATGAATTCCAACAACTCTGAAGACAAAGAA
GTGTTTGCATGCATGATCACAAGCTTGATTGAAGAAGCTAAATACCACTAGTAATACCCC
ATAGCTGAGCTTCTTTTAACAGGCTAACTCCAAGGAAGCATCATAAATGCACAACTTGTC
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AGATAAGTTGAGTAATCAGTAAAAGCAATAGAAGCTATGAAAGATCGCCTTCATGAATTC
CCTTACTTTGTAAATGCTCTTTTCGACCCATCCTGCCATCTTTCTGAGCAATTTCCTCAA
CTTCTAATTAATATTTATAATATTATGATTGAGAAGAAGGTATAAATTAATGTAACTAGT
AAGCAAATTGAATAGCTTAAATAAAGAGTAGAATCCCTTAAAAATGAAGCAAACAAACCA
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GTAGAAACTTCATCTGAAAATACCTCCTAACAACAATAAAATCAACAAGCATAGAACTAA
GCTGCTGCTGTAGCTCAATCTGATTAATCATCAGCACAGCCATAAGCATAAAATTAATAA
TAGTAATAACCATTATAGCAATAGGAAGGAAGTGCTTAGACAAAATAACAACAAGAATAA
GATACTAAAGCAAAAGCTGATTAGAATAACTAGCCTAGAAATCCTAGTGTTTAAAATGTA
AGCTAATAAAATTTAGGTGAAGAAAAATAACCTTCTGATAACACCACACAAAGTAAAGGT
AAAACTAAAAAGCCTCTTTTTGCTGGATCTTCCGTATTTCCTTTGAGCAATTTAACTGCA
AACTAACCAAAAATGGTATTCGAAAATCCTATTAATCAATAGATGAGATTCTAAGATACT
TAAATAGGAATGTATGACCAAGGATTGTATAATAATAATAATAATAGCACTAATAATAAC
AATAATGGCAATAATACAGAAGAGATAGTTGTAAAAGCAAGACCTTACTAAGGAGGTGTT
GGTTTTGTTTAAAGACCTATATTTACAAACGGTGAACAATAAATCTATGCTTCTAAATCT
ATTAATGAAATTTTAGAATATGAAAACTCACTTTAAATAGATGAATCAACAAAGATGAGA
GTTAATTTTGCACTAAATAATTTATCAGATGGAAACATAGAGAAACACTAAAATGATTTT
AGAAATTACGCAGAAAATGAAAATTTTTAGAAATGGTTTGCTAGGCATCTTGTCACTCAA
AGAGCTACTTTGAAATCAGAAATTAATGTCTTGCTGTACACTAAGCTCTGTGAAAGAATA
GATAAGCCTAAACTCTTTTCCTTTATCATAAAAGATTCTTTGTTACTTTTGCACAAACTT
CTCTTATCAGAAGCTGCCATTCATGCTTCTATCCGTATTACCACTCTTAAAAATCTAGCT
CATTGGATAGGCATGTTTACTTTGAATCGTAACAAACCAATCAATTCAAAATATTTGAAT
ATCAAGGCATTAATTGTCAATTCTTATCCGAACAAAGTTGATGTAATTATTCCTATTGTT
ATCAACATTCTACTTTGCTGTAAAGAATCAAAGATTTTTAATCCTTAAACTAACCGCTGG
GTCAAGCGTATTCTTTCTCTCTTAGAAGAATTCAAAAATGTGGTTCAGAAGGAAACTGTC
AAGCATCAAATTAATCAGTTGTTCTCTAATTTATAAATTGACGTAAATAGTTTAGAACCT
TGTACCTACTTTAGATACTACTTACAAGAAAGTAAAAAGGAAGCTAAGCCAGCTTAATAG
CCTGCTACTATTGTTTCTTTTTGCATCCGTGATAGACTAATAATTACAGATGATCTTCGC
AACCTGTGCAATATTTAAAACTTTGACTTAAAGTAAGCAGTTTTCCAATCCTTAGACGAA
GCAATCATGGAAATTATACAACCAGTAATTTCTCGTAGTGTTACTATTGCCTTAGTCACC
ACTCGTGAATTAGTCTTAAAAGATCACTGCACTGATCCTGATGAGAACAATCTTATAAAT
GGCATCTCTAACATGGTTTAAAAACTATCTGGCTGTCTTGCTTTAATCACCTGCAAAGAT
CCACTCAGATCAAGCTTCCAAACCCACTTAAAGACTAATTTAGAAAAAGTGACTGAATTA
AATGCCAACGAAAAGGAATAAATCATTAATAAGGTAGTTATCGATAACATTGATATTGGC
TGCCAAGAAATCCGCTAAAGAGTAATGGATTAAGCTCTTAAGGAAATAAAATAAGATGAT
GCTATCCTTGAAGCTATTGAAATGAGAAGAGCCGCAAAAGAAAAGTAGTAAGTATTTGTT
GATGAAAGATATTACAAGTTCACCAAAAACCTTCCTCCTGCTTTACAACCTAAATTCCCC
AGCTCTTCTGCAGCATACTCAGAATTCGATAGAACTTCTTTAAATGAAAACTTGGTAAGC
GAATACAACACATAAACTTTAGAATAATTCAAAAAGATTGTCAACAATTTTAGTCCAGAA
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GATAAGCTATATAACGAATTAATTGAATTAAATTTCTAATTGATGTACCAAAGCGAGGGT
GCTTCTAAGATTAGATTATTTGTTGAAATTCTTGACAAATTACGTGAACAGCACAAAGGA
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CTGATTAAGACCAACCTTCATATAATTTTGAATAGCCTTTTCATAAAAAGAATAATAACT
AATAAAGAATATCAAGAAATTATGTTGCTTCTTGTTTCTAGAAATCAAAGCAATGATATG
ATAATATGTTTGGTATCTGCCTTGAGAGAGCTTATTTTTGAGAAAAAGGAATACACTCCT
TAAGATTTTAATGACTCAATTATTGCTCTTAAGTTAACAATGTCTAGTAAATAAGACATT
CCTCCTCATTACTCCTAGTTCTTGCAAGACCTCAACAAAATTGCATCTGAAAACTCTAAT
TAATCAAATAACATTATCACCTTTGAGCGTGCTCTTGATGTTATTACCAACTTCTATGGC
AATTTCGATAAAAAGCAGTATGAAGAAATATAGGAGAAGGTTGAAAAATGGCTTTCTTTG
TCAACTGAAGTTCAAATGGGCTAATTCATTTAAGGCCTTGTTAATATTATCATTGATAAT
CATGATGAAAACTCTTTAAAATTCTTTGTCTACTTTGCTGATATCTGCATCAACTACTCC
TTAGAAAGCGCTAAAAAGAATTAAAGAATTAGCATACAAAATATTACTAGTATGGACTTT
ACTTGCGTTGATAGTTTCACAAAATTGATTGAAATTATTCAAAAGACTTGCAAAATTGAA
CAATATAAGAAGCAATTACTTAATCAAATTTTCGATAGTATATTCATCACATTGACTAAA
TATCATGAAACTGATATGTATGAATTCAACCAGCGTCCATTCTTCCGTATCTTCTTTAAT
TTAATTTATGACAACCAAAGACCTAAATACGATTTCTCTAAGAATGAAATATCTGAAACT
TACAGCATGTTGGCTAACATATTCCATCAACTTTCCCCTGTAAAATACCCAGGATTTGCT
TTCTCTTGGTTAGAACTCATTTCAAATCGTTACTTCATGCCAGTGATTATGGAAAAGGAA
GAATTGTGGGGATTATACAGCCAACTCATAATAGATTTAATCAAATTCTTTAAAGAAATA
ATGCAAGAAGAAAACCTTCAATTAGAATACATTAAGATATTCTACAGAGGCACCATTCGT
ATTTTACTTGTCTTGCTTCATGACTGGCCTGATTTCTTAGCAAAATACTCTAATTCTTTA
TGTGATGAAATTCCTGAAAATTACATTTAAATTAGAAACATTATTCTCGCTGCTTTCCCT
AAAACTATGAAGCCACCTGATCCGTTCTCAAACAAAAACGAACAAATCTTTGAAAACAAT
GAAGACTTTAAGAATCCTCCTATTATGGACTACCCAGTTTATAATGAAAAAATCCAAGTC
GATCTCATGAATGATCTTCAGAATTATCTTCGCACTAAGAGCGAAGATATTTTCAAGACT
ATTTGCTCTAAATTGACTCTTAAAGAAAAATCATAATTTGTAATTGATTAGAAGGCTGTT
AACATACTCATTTTGGCTATACCTTTGCATTTACACAAGCAATCTGTAAATTAAGGAAAT
AAGGATACTAAAACAATCCCTCTAAACAACGATTTATACAATTTCTTACTTAAATTGCTT
AAAACAAGTCATTACGAAATGAGAGAAGTAATTCTTAACTTGATAATAAATCAAGTTAGA
TATCCTAACTTTATCACAAAGTTCTACATTAAATACATTCTGTTGACATTCTAAGAACAA
AATATTAATGATATTTAAGAACAAACCATTCGTATCATTGTAGAGAGATTGTTTGTATAG
AAACCTCACCCTTGGGGCATAATCTACACATTTATTGAGATCATTAAGTCTAATTCTAAT
TTCAGATCAAAGCCTTTTGTCAGAGATGCTGAATTGAAATAAGTTTTCCGCTTCATCTAC
TAAGAACCACCCAGATAAAGACCACCTCAATAATAGTAATAGCAACCATCATAACAACAG
ATTGGTCAGCACATACAACCTCAAGAGATGAACATAGATCAGTAAATGCACATGAATAGT
ATTTAGTACTAGCAGATATTGTAATAGCAACAATAGTAACAATACTAGCAACAATAGCAA
TATCAATAACAAATAGCAGGAGCTATAAGCCATCCTAACTATGTTAATAGAAATAATTGA

>TTHERM_00095500(protein)
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>TTHERM_00095500(gene)
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GATATTATAAAGTCTTTTTCGGATCATTGTTTTCTCTTTAAAGATTAATCAATAAGTGAA
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GAAGCTCGATGCAATAAAATACATCATAATTAATTTTGTTTGTTTGTAAATTCATAGATA
GTACAATAACTAGGATCAGAAGGAAATTAGTATTTGTTGGAATGCCTTTTAGAAAGTTTG
GATATGAACTCACAGAATTCCCAAAATAAGGCAAATTTGCACACCACAGTTAAAGGCTAA
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TTCATGCCCAACGTCTTCATTAAAGTAGTTTGTGGACCTAATAGTTTTTCAAATTAAACC
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GTAGCATCAGAAGGTAATTTTTTTACATGCGTTTTCAAACTTGATAAATCCTAAATTTAT
TTTGAAGCCCATTTTCTAGTGATTAATTAGCATTAGATTAAGTATTTAAATAAAAAAAAA
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GTTTTCAGCAAATAATAAAATGCTAATAAATCAAATGAATTTAAATATAAAATATATTTT
TTCAAGTCAAAATATAAAAATGTAAATAGAGAGCATCTAAATAAAAGGCAATTATTTATT
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CGCATTTTTTATTTAATTATTTTTTATGATTATTATCATAATTGGTTGATCTATTAAATC
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TATCTTATTTATTAATAAGTAGTAGTATAAAAATTTAAAGTAATAGCAAATTCTAAAAAA
AATTGAAAAAAAGCATCTAAAATTTTGTATAACAAATATCAAAAAAGACCTCTAAAATAT
TTAAGCATAGAACATTTTTAAAAACTTAAGCAGCATCTTATACATATAAATTAATTCAAG
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TAATTTTCAAATAGCTTAAATTCTATTTATTATGAAAACAATTAAAAAATAATAGTTTCA
AATCAAATCAATAATTTAAATATTAATTTCATTAAGAAACGATAAATACTTTACCTTAAA
TATATTTTTGATTAATAATTTTTTGGCATGTAAAAAATAGTCAAATATAATAATAAAATT
ATAATTAATTACTTTTTACTTTTTTTCAAATTTTTAATTATTTTTTTGTTTAAAATAGTG
GGTTTCCGTATTGACAGAAATTGATAGACCTTATTTGAAATTGAAGGACGAAAAATCTTT
TAAATAATTCTTTACTAATATGCTATTAATTCACAAAAAAGCTCCATTTTAAATGCCTGC
ATATTTGTTACTCAAGCCTTGGAAGAATATTAGAAGCCAAGCCTTATTCTTAAAGAATAT
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TTTAGAATTCAATCCATAATATAAATATAACACACTACCTTCTCCTATGCAGTTCTGGGC
CTGCTTGGATTTCCTCGATTTATTGTGTGAAATTAGTGAAGGAGATAACTATATGGCTAT
CCATGAGTTATTTGAGCTTCCTATTGCAAAATATCCAGATATCTTAATAGTCGCTTTATC
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TGCTCTCACAAATAGTAACAACTACTCTTTTTCTGTATCACTTGGTATTTTAGCTGGTAA
GAGAGAATTCCTACACTTTGACTAATGGCTAAATGAGCGTGTTAAGACTATTGGGGATCC
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AAATATGAGACTAAACAACCCCAACAATTAAGCTTAACAGTAATATGAAGGTGTTTTAGA
AAAGGCCTAACTAACTATTGAACTACTGACTATTATTTTTGAATCTCTTCTATTAGAGTA
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ATTGTAATATTTCCCCTAATTAAGTGGAACTTCGGATTCACCAGGACAAGCTACAGAAAA
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TGCAAATTTAAAATAATTAATGAATTCCAACAACTCTGAAGACAAAGAAGTGTTTGCATG
CATGATCACAAGCTTGATTGAAGAAGCTAAATACCACTAGTAATACCCCATAGCTGAGCT
TCTTTTAACAGGCTAACTCCAAGGAAGCATCATAAATGCACAGTAATTTAAAATTTATAA
ATTAGACTAATTTAATTATTCAATTAGCTTTAACTATTAATTATTTTTATCAATTTTATT
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TAGAAACCATTAGGCATTATGCTAGAATAAATTTTGGAATCATCAAAAAAGACACAGAGA
TAAGTTGAGTAATCAGTAAAAGCAATAGAAGCTATGAAAGATCGCCTTCATGAATTCCCT
TACTTTGTAAATGCTCTTTTCGACCCATCCTGCCATCTTTCTGAGCAATTTCCTCAACTT
CTAATTAATATTTATAATGTAATTAAGTGTTTTACTTTTATTTATTTATTGACTTATTCT
TTTTTAATAAAGATTATGATTGAGAAGAAGGTATAAATTAATGTAACTAGTAAGCAAATT
GAATAGCTTAAATAAAGAGTAGAATCCCTTAAAAATGAAGCAAACAAACCATCTCAAACT
TACTAGGCAACAACAACTTAACAAGTAAACAATTTCAATCTAAAATTTTCCTTTTTACAA
TTGACTTTATTTTTTTAATAAAAAAGAAGAAGATCTTAAAGTTAAGAGGAGAAGTAGAAA
CTTCATCTGAAAATACCTCCTAACAACAATAAAATCAACAAGCATAGAACTAAGCTGCTG
CTGTAGCTCAATCTGATTAATCATCAGCACAGCCATAAGCATAAAATTAATAATAGTAAT
AACCATTATAGCAATAGGAAGGAAGTGCTTAGACAAAATAACAACAAGAATAAGATACTA
AAGCAAAAGCTGATTAGAATAACTAGCCTAGAAATCCTAGTGTTTAAAATGTAAGCTAAT
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GAATGTATGACCAAGGATTGTATAATAATAATAATAATAGCACTAATAATAACAATAATG
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