Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00194810

Standard Name

MSH6 (homolog to human protein MSH6)

Aliases

PreTt06765 | 16.m00421

Description

MutS domain III family protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

TetraMine Data

TTHERM_00194810

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_03750.19.997093137033517e-262MutS domain III family protein
(1232 aa)
OxytrichaContig820.1.g1229.997093137033517e-262MutS domain V
DictyBaseDDB_G02686142.0004037638327014e-151msh6 on chromosome: 1 position
238722 to 242663
WormBaseWBGene000034222.998573346093879e-125locus:msh-6 status:Partially
_confirmed UniProt:Q9N3T8
protein_id:CCD72556.1
SGDYDR097C9.995417076252815e-72MSH6 Protein required for mism
atch repair in mitosis and mei
osis, forms a complex with Msh
2p to repair both single-base
& insertion-deletion mispairs;
potentially phosphorylated by
Cdc28p
Stentor CoeruleusSteCoe_175851.6458114310822737e-38

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00194810(coding)
ATGAAGCAAAGTTCACTATTAAGCTTTTTTGGAAATGTGTAGAGAAGGAAAAGAGAAGAG
ATGGAGAAGGAATAGGCCTAAAACGATAATAAAATTGCTGAATCCACTCAAATTTCTTTA
TCTACATAAAAGAGCAATAAAGAAGTTAAGGAAATTTCTACTTGTGATGATACAGAAGTA
GCAAATTCAAGCGTTTAGGGTACCAGAAAAAGTAATTTAAAACGTCCTAAATTGGCAATA
GATTCTGATGAAGATGATGTTTTTAATCCAGAAGATTTAAAATAATTTTCTCATACTAGC
CCTTAGAAAAATAGCTAGAAAAAAGGAATAAGGTTTTAAAAAAATGATATGATTGATGAA
GATAATGATGATGAATCTTTTAAGGAAGATGATATAGAAGACATTGAAGATGAAGAAGAT
GATGATGATTTTATTGAAGATAGTGATGAAGAAGTTAAGCCTAAACGCAAACAAAAACAA
AGTTAGTAAAAAACACCTGTCAAGAAAACTGGTTCAGCTTCAAAAGCAGGAGCAACAAAG
AGTACTCCCAAATTTGGATAAGAAAGTGCTAAAAAATCAGCAACTAAATAAAGTACAGCT
AAAAAAGCAGAAGATGAGTTTATAAATTGTGATTAAGAAAATGATTTAGCAAGAGCTGCT
GTAGATTAATTAGATGACACTACTCCCTATTTTGCGCTACCAGAAAATGCTATGGATTCA
AAGAAAAGAAAGAGGACGGATCCTAATTATGATCCTACTACTCTTTACGTACCTCCAGAG
TCGTTAAAGTAATTCACACCTGTTATGAGATAATACTGGGAAATTAAGTCTACTAATTTT
GATAAAATTCTTTTTTTTAAGCTAGGTAAATTCTATGAACTCTTTTACGAAGATGCCTTA
ATTACCCATAAAGAGTTAGATCTTAATTGGATGGGTAAAAAAATGCATACAGGTTTTCCT
GAAAAAGCTTTGGATAAAATGGCTTCTAAGCTAATTAGTTTAGGATATAAAGTAGCCGTA
GCTGAACAAACAGAAACTCCTGAGCAGATGAAATAGCGTTTAATGAGGGAAAAAAGTGGA
CCTAAGTGTGTTTCGAGAGAATTAGTATAGGTTATGACAAAAGGTACTTATGATTAAAAT
AACGAAACTGACTACCAGCCAAGATATTTAATGTCATTAAGAAATTTCTAAACAAAATTT
GGTATAATTATAGTTGAAAGTTCAACAAACGTTATAACTGTCGCTTACTTAAATGATGAC
ATACATTTTACACAATTTAAAACATTACTTTGTCAGGTTAAACCTTAAGAAATTGTTTAT
GATCCAGACAATATGACTCATGATATTAAAAAAATCATTTAATCAGGCTATTTAGCTCCT
TAATTATCTCCCCTTTAAAATAAAAATGATAACTGGAATAAAGGAATGGCTTATAATCAT
CTAGATAAAACACACGGTGATGTTCTAGAAGGCAAGTGGCCTAAATTGCTAAATAATTTG
TACAATACTGAAGAAACGAAGAGAGATCTTATATTTGAATCTATGGCAGGACTTTTTAAT
TATTTAAAATCTATTTTAATTTTAGATTAAGTTATTTCAGTTGCCAGATATCAAATTTAT
GATATTGAGAAGGGTGTTAGAAGCTGTATGATTTTAGACAGCTAGTCTCTATAGCACTTA
GAAATATTAGACTCTTCAAGCGGGCCAGTAAGCACTTAGAAAGAAAATTATAAGCTACAT
TTCGATGATGGATCACTACTTGGTTATATAAACAAAACAAAAACTCCATTTGGTTATAGA
ATGCTTAAGAATTGGATTTGTGCTCCTTTAATGGATATTAACAAAATTTATGATAGGTAT
GATGCTATTGAAGATCTTTAAAAGTTTAATTCTGAGAGAGATACCTTCCTCAGAGGTATT
GAAAAGCTTCCAGATCTTGAAAAAATGTGTGGTAGAATATACAAGTATTCCATCAGACAA
TAAAATTAAAATGTAGTTTATTTTGAAGATTTCTCATATTCTCGTTTAAAAGAGTTTAAA
GATTTAACAACTAAATTGGCAGAATCAGAAAAGCTCATTAAAACCCATCTTACTCCTTTT
GCTGACTAGTTTAAGAGTAAAAGACTGAGAAAATTGGTAACCCCAAACACCATTGACCAC
GAAGATGAAGAAGAGTATGAATTACCTGCTATGATTTACCATGGCTATTCAGATGAAGAA
GATGAGGTTGAAGAAAATATAAACTAGCATGCAGCAAAAGCAGAAAAGATGGAAATAGAA
AATAAACAAAGTAAAAAATCTAAAAGTTCTGGTTTACTTCCACCTGCTTCTAAATATATA
TAAGAATTCTAAAATTATATTGTCTGGTAAGGTCCTAAGGGCTAGGAAAAACCTTTACCT
AAAAAAGGGTTAGTTAATTCATATGATTTAGCCACAGAAGCTGTTTAGAATGTCGAGAAA
AAACTTTAAAATTACTTAGTTTAAATCTAATAGCAAATGAAAGACAAAACTATTAAATAT
GGCTTGAGATATGAATTAGAAATAAATGAAGATTTAGTTAAAGGAAATAAAAAACCTAAA
AACTTTGATTTCACAAGTAAAGCAGGCAAATATCAAAGATTCTAAACAAAAGAATTGCGT
GAACTCATAGCTGAGCTCGATGAAGCTGAAGATGTTCAAAAAAAAGAACTCAAAGAATTT
TGCAGATTCATTTTCAAAGAGTTCTATGAAAGCTATAAAACATGGGATACCTTAATTAAT
ATTCTTGCAGAATTAGATTGCTTAATAAGCTTAAGCAGAGTAAGTTTCTTGCTTGCTGAT
GGAGTTATGAGCAGACCTGAATTATATCCTGCTTCTGAAAAATATGTACCATTCATTGAG
TTAACCTCTGGAAGACATCCATGCTTAGCTTCGATGGGAGTTAACTTTATCCCTAACGAT
ATTTATCTTGGTGACATAAAATAGACAGGACAGTTTGAAGACAATAAGAACTTGATTCTT
TTAACAGGTCCTAACATGGGTGGTAAATCTACAACTTTGAGAATGGCTTGTGTAATGGCA
ATTTTAGCTTAAATTGGATGTTATGTACCTGCTAAATCTTTGAGAATGACATTGGTAGAT
CGTATATTCACTCGTATTGGTGCAAGTGATAAATTGATGGATGGAAAAAGTACTTTCTTC
ATTGAAATGGAAGAAACATCAAATGCAGTCAAGTAAGGTTCAAAGCATTCTTTGATTATT
ATGGATGAATTAGGAAGAGGTACTTCCACTTTTGATGGAGTTGCCATTGCATACTCTATA
GTAAGATACTTGGTAGAAAATTTACAAAGTCGTTGTTTATTTGCTACTCATTATCATGTA
TTACTTGATGAATTTAGACATTATCCATAAATAGCATATTATCACATGGCATGTCATGTT
GATGAGAAGAGAAGTAAAGTCATATTTTTATATAGATTAAAAGCAGGAGAATGTTCATCT
AGTTTTGGTATAAATGTTGCAAAGGTTGTTGGTATAAGCGATAATTTGATTGAAATTGCA
AAGTAAAAAGCTAAAGAATTTGAAGAAAATTTAAATATTTAGCATGCTTACAACACAAAT
AAGCGTTTTGGAATTTTGATGAAAGCAATCTAAGAATATGATAGAGATGAAAATTTGGAA
TAAATTATTGAATAATTTAATAAAGTTTAACTTTTATGA


>TTHERM_00194810(protein)
MKQSSLLSFFGNVQRRKREEMEKEQAQNDNKIAESTQISLSTQKSNKEVKEISTCDDTEV
ANSSVQGTRKSNLKRPKLAIDSDEDDVFNPEDLKQFSHTSPQKNSQKKGIRFQKNDMIDE
DNDDESFKEDDIEDIEDEEDDDDFIEDSDEEVKPKRKQKQSQQKTPVKKTGSASKAGATK
STPKFGQESAKKSATKQSTAKKAEDEFINCDQENDLARAAVDQLDDTTPYFALPENAMDS
KKRKRTDPNYDPTTLYVPPESLKQFTPVMRQYWEIKSTNFDKILFFKLGKFYELFYEDAL
ITHKELDLNWMGKKMHTGFPEKALDKMASKLISLGYKVAVAEQTETPEQMKQRLMREKSG
PKCVSRELVQVMTKGTYDQNNETDYQPRYLMSLRNFQTKFGIIIVESSTNVITVAYLNDD
IHFTQFKTLLCQVKPQEIVYDPDNMTHDIKKIIQSGYLAPQLSPLQNKNDNWNKGMAYNH
LDKTHGDVLEGKWPKLLNNLYNTEETKRDLIFESMAGLFNYLKSILILDQVISVARYQIY
DIEKGVRSCMILDSQSLQHLEILDSSSGPVSTQKENYKLHFDDGSLLGYINKTKTPFGYR
MLKNWICAPLMDINKIYDRYDAIEDLQKFNSERDTFLRGIEKLPDLEKMCGRIYKYSIRQ
QNQNVVYFEDFSYSRLKEFKDLTTKLAESEKLIKTHLTPFADQFKSKRLRKLVTPNTIDH
EDEEEYELPAMIYHGYSDEEDEVEENINQHAAKAEKMEIENKQSKKSKSSGLLPPASKYI
QEFQNYIVWQGPKGQEKPLPKKGLVNSYDLATEAVQNVEKKLQNYLVQIQQQMKDKTIKY
GLRYELEINEDLVKGNKKPKNFDFTSKAGKYQRFQTKELRELIAELDEAEDVQKKELKEF
CRFIFKEFYESYKTWDTLINILAELDCLISLSRVSFLLADGVMSRPELYPASEKYVPFIE
LTSGRHPCLASMGVNFIPNDIYLGDIKQTGQFEDNKNLILLTGPNMGGKSTTLRMACVMA
ILAQIGCYVPAKSLRMTLVDRIFTRIGASDKLMDGKSTFFIEMEETSNAVKQGSKHSLII
MDELGRGTSTFDGVAIAYSIVRYLVENLQSRCLFATHYHVLLDEFRHYPQIAYYHMACHV
DEKRSKVIFLYRLKAGECSSSFGINVAKVVGISDNLIEIAKQKAKEFEENLNIQHAYNTN
KRFGILMKAIQEYDRDENLEQIIEQFNKVQLL


>TTHERM_00194810(gene)
ATGAAGCAAAGTTCACTATTAAGCTTTTTTGGAAATGTGTAGAGAAGGAAAAGAGAAGAG
ATGGAGAAGGAATAGGCCTAAAACGATAATAAAATTGCTGAATCCACTCAAATTTCTTTA
TCTACATAAAAGAGCAATAAAGAAGTTAAGGAAATTTCTACTTGTGATGATACAGAAGTA
GCAAATTCAAGCGTTTAGGGTACCAGAAAAAGTAATTTAAAACGTCCTAAATTGGCAATA
GATTCTGATGAAGATGATGTTTTTAATCCAGAAGATTTAAAATAATTTTCTCATACTAGC
CCTTAGAAAAATAGCTAGAAAAAAGGAATAAGGTTTTAAAAAAATGATATGATTGATGAA
GATAATGATGATGAATCTTTTAAGGAAGATGATATAGAAGACATTGAAGATGAAGAAGAT
GATGATGATTTTATTGAAGATAGTGATGAAGAAGTTAAGCCTAAACGCAAACAAAAACAA
AGTTAGTAAAAAACACCTGTCAAGAAAACTGGTTCAGCTTCAAAAGGTAACAATTATCAT
AAATTTGAAATACTTAATATAAAATATTAATGATAAAGAAAATGATTTAGCAAGCCAATA
ATTTAATTTTTATAATTAAAAAGCAGGAGCAACAAAGAGTACTCCCAAATTTGGATAAGA
AAGTGCTAAAAAATCAGCAACTAAATAAAGTACAGCTAAAAAAGCAGAAGATGAGTTTAT
AAATTGTGATTAAGAAAATGATTTAGCAAGAGCTGCTGTAGATTAATTAGATGACACTAC
TCCCTATTTTGCGCTACCAGAAAATGCTATGGATTCAAAGAAAAGAAAGAGGACGGATCC
TAATTATGATCCTACTACTCTTTACGTACCTCCAGAGTCGTTAAAGTAATTCACACCTGT
TATGAGATAATACTGGGAAATTAAGTCTACTAATTTTGATAAAATTCTTTTTTTTAAGCT
AGGTAAAGAAAAAGATATAAAATATTTTGAGTTAGTAAGTAAGTGATATGTTATTTTTAA
AATCAAAATAGGTAAATTCTATGAACTCTTTTACGAAGATGCCTTAATTACCCATAAAGA
GTTAGATCTTAATTGGATGGGTAAAAAAATGCATACAGGTTTTCCTGAAAAAGCTTTGGA
TAAAATGGCTTCTAAGCTAATTAGTTTAGGATATAAAGTAGCCGTAGCTGAACAAACAGA
AACTCCTGAGCAGATGAAATAGCGTTTAATGAGGGAAAAAAGTGGACCTAAGTGTGTTTC
GAGAGAATTAGTATAGGTTATGACAAAAGGTACTTATGATTAAAATAACGAAACTGACTA
CCAGCCAAGATATTTAATGTCATTAAGAAATTTCTAAACAAAATTTGGTATAATTATAGT
TGAAAGTTCAACAAACGTTATAACTGTCGCTTACTTAAATGATGACATACATTTTACACA
ATTTAAAACATTACTTTGTCAGGTTAAACCTTAAGAAATTGTTTATGATCCAGACAATAT
GACTCATGATATTAAAAAAATCATTTAATCAGGCTATTTAGCTCCTTAATTATCTCCCCT
TTAAAATAAAAATGATAACTGGAATAAAGGAATGGCTTATAATCATCTAGATAAAACACA
CGGTGATGTTCTAGAAGGCAAGGTAAATTTAATAAATCATTTATTGACATTAAGTTATTG
ATATTAAACTAAATTAAATTAAAAGTGGCCTAAATTGCTAAATAATTTGTACAATACTGA
AGAAACGAAGAGAGATCTTATATTTGAATCTATGGCAGGACTTTTTAATTATTTAAAATC
TATTTTAATTTTAGATTAAGTTATTTCAGTTGCCAGATATCAAATTTATGATATTGAGAA
GGGTGTTAGAAGCTGTATGATTTTAGACAGCTAGTCTCTATAGCACTTAGAAATATTAGA
CTCTTCAAGCGGGCCAGTAAGCACTTAGAAAGAAAATTATAAGCTACATTTCGATGATGG
ATCACTACTTGGTTATATAAACAAAACAAAAACTCCATTTGGTTATAGAATGCTTAAGAA
TTGGATTTGTGCTCCTTTAATGGATATTAACAAAATTTATGATAGGTATGATGCTATTGA
AGATCTTTAAAAGTTTAATTCTGAGAGAGATACCTTCCTCAGAGGTATTGAAAAGCTTCC
AGATCTTGAAAAAATGTGTGGTAGAATATACAAGTATTCCATCAGACAATAAAATTAAAA
TGTAGTTTATTTTGAAGATTTCTCATATTCTCGTTTAAAAGAGTTTAAAGATTTAACAAC
TAAATTGGCAGAATCAGAAAAGCTCATTAAAACCCATCTTACTCCTTTTGCTGACTAGTT
TAAGAGTAAAAGACTGAGAAAATTGGTAACCCCAAACACCATTGACCACGAAGATGAAGA
AGAGTATGAATTACCTGCTATGATTTACCATGGCTATTCAGATGAAGAAGATGAGGTTGA
AGAAAATATAAACTAGCATGCAGCAAAAGCAGAAAAGATGGAAATAGAAAATAAACAAAG
TAAAAAATCTAAAAGTTCTGGTTTACTTCCACCTGCTTCTAAATATATATAAGAATTCTA
AAATTATATTGTCTGGTAAGGTCCTAAGGGCTAGGAAAAACCTTTACCTAAAAAAGGGTT
AGTTAATTCATATGATTTAGCCACAGAAGCTGTTTAGAATGTCGAGAAAAAACTTTAAAA
TTACTTAGTTTAAATCTAATAGCAAATGAAAGACAAAACTATTAAATATGGCTTGAGATA
TGAATTAGAAATAAATGAAGATTTAGTTAAAGGAAATAAAAAACCTAAAAACTTTGATTT
CACAAGTAAAGCAGGCAAATATCAAAGATTCTAAACAAAAGAATTGCGTGAACTCATAGG
TAAATAAAAAATTTAATTTTTATTAAGTAAATTTTAAAACAATTTTTAAATTAGCTGAGC
TCGATGAAGCTGAAGATGTTCAAAAAAAAGAACTCAAAGAATTTTGCAGATTCATTTTCA
AAGAGTTCTATGAAAGCTATAAAACATGGGATACCTTAATTAATATTCTTGCAGAATTAG
ATTGCTTAATAAGCTTAAGCAGAGTAAGTTTCTTGCTTGCTGATGGAGTTATGAGCAGAC
CTGAATTATATCCTGCTTCTGAAAAATATGTACCATTCATTGAGTTAACCTCTGGAAGAC
ATCCATGCTTAGCTTCGATGGGAGTTAACTTTATCCCTAACGATATTTATCTTGGTGACA
TAAAATAGACAGGACAGTTTGAAGACAATAAGAACTTGATTCTTTTAACAGGTCCTAACA
TGGGTGGTAAATCTACAACTTTGAGAATGGCTTGTGTAATGGCAATTTTAGCTTAAATTG
GATGTTATGTACCTGCTAAATCTTTGAGAATGACATTGGTAGATCGTATATTCACTCGTA
TTGGTGCAAGTGATAAATTGATGGATGGAAAAAGTACTTTCTTCATTGAAATGGAAGAAA
CATCAAATGCAGTCAAGTAAGGTTCAAAGCATTCTTTGATTATTATGGATGAATTAGGAA
GAGGTACTTCCACTTTTGATGGAGTTGCCATTGCATACTCTATAGTAAGATACTTGGTAG
AAAATTTACAAAGTCGTTGTTTATTTGCTACTCATTATCATGTATTACTTGATGAATTTA
GACATTATCCATAAATAGCATATTATCACATGGCATGTCATGTTGATGAGAAGAGAAGTA
AAGTCATATTTTTATATAGATTAAAAGCAGGAGAATGTTCATCTAGTTTTGGTATAAATG
TTGCAAAGGTAATTTAATAATTTTATTTCACTTCTAAATTATTAATTCTATTAAATAAAT
TAATAAAACAGGTTGTTGGTATAAGCGATAATTTGATTGAAATTGCAAAGTAAAAAGCTA
AAGAATTTGAAGAAAATTTAAATATTTAGCATGCTTACAACACAAATAAGCGTTTTGGAA
TTTTGATGAAAGCAATCTAAGAATATGATAGAGATGAAAATTTGGAATAAATTATTGAAT
AATTTAATAAAGTTTAACTTTTATGA