Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00857860

Standard Name

MRNC50 (Membrane Occupation and Recognition Nexus protein C-terminal)

Aliases

PreTt09050 | 152.m00070

Description

protein with predicted MORN domains localized at the C-terminus of the protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.7%

TetraMine Data

TTHERM_00857860

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_07182.19.997093137033517e-262hypothetical protein (585 aa)
OxytrichaContig13677.0.1.g353.999925618735366e-62MORN repeat
Stentor CoeruleusSteCoe_233758.75651076269652e-27
DictyBaseDDB_G03494885.000468829272308e-18DDB_G0349488 on chromosome: 2
position 6912714 to 6914186
WormBaseWBGene000021790.0000007001298633766835locus:jph-1 status:Confirmed
UniProt:Q22667 protein_id
:CAA99924.2

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00857860(coding)
ATGAATAATTCAAAGTCAAACGAATCAAATTAGCTTTGTTGTTCAAAACACAACCAAAAA
TAAATTCGCTTTATTTGTTGTTTTGATGGTTGTAATTTTGGTAATTTAATATGCGATACT
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AAAAATTGGGTTTGA


>TTHERM_00857860(protein)
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AKLIKKNGPLNLIRAESFALSQELSQIKSKKVNYKHLDESKKLFEQIKDAFENQTKDMYR
KFKALLEGADNEDLRQSIFAGIKSTVSLSNSMILSKKASVVSIDLSSSSSSNPLKRSITL
TSEDNEKKPARQLKKVAQFPSLSNKNVLEAIRINGSFNYRIEDSYLNNQPEQGPFEFEDG
SIYYGHIQDSKRNGRGKQMFQDGAYYEGFWKDDIPFGMGRIIRNNGDVYQGQINNFKAHG
KGVFKTLKGEYMYNGDWLEDLKHGRGDEVIQGKYLYSGDFSYGKKHGNGEIKFVDGTIYL
GEFKEGEITGEGQFIYPNGEKYVGCVKDGQKYGKGSYVWPDGRNYDGTYMNNLPHGKGMF
IWPDGYIYNGNWVNGVQHGQGLEIDPEGNEKEGVWENGVWKNWV


>TTHERM_00857860(gene)
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ATATTAATTAACTAGTTAATAAATTATTAAAAAATTAGTTTAGCAGAACAAGCCATTAAG
TCTACTAATATATAAATAGTTTTGCATTTAACAAAGTAAAGGGAAAAAGCAAATATTCCA
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AAACTAAAATGACATAAAAATTGCTTCCTTCTATAGCCGAATCTGTTTAAGATATAGATA
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ATTTATCATCTTCATCATCTTCAAATCCCCTAAAAAGATCTATCACTTTAACATCTGAGG
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TGCTAGATAATTAAAAAAAGTAGCCCAATTCCCTAGCTTATCAAATAAAAATGTTTTAGA
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GGAAAGATGATATTCCTTTCGGCATGGGAAGAATTATAAGAAATAATGGAGATGTCTATT
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AATATATGTACAATGGAGATTGGTTAGAAGATTTAAAGCATGGAAGAGGTGATGAAGTCA
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AGGATCTTATGTTTGGCCAGATGGCAGAAATTATGATGGTACTTACATGAATAATTTGCC
TCATGGTAAAGGAATGTTTATATGGTAATTTTTATTTATAATTATTTTAACATTAATAAA
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