Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00378500

Standard Name

MRNC38 (Membrane Occupation and Recognition Nexus protein C-terminal)

Aliases

PreTt10304 | 40.m00189

Description

protein with predicted MORN domains localized at the C-terminus of the protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 19.9%

TetraMine Data

TTHERM_00378500

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_00124.19.997093137033517e-262hypothetical protein (385 aa)
OxytrichaContig5991.0.g701.0004559842325763e-117MORN repeat
Stentor CoeruleusSteCoe_219912.2856936767186716e-49
DictyBaseDDB_G03494880.00000000000001000191320216021DDB_G0349488 on chromosome: 2
position 6912714 to 6914186
WormBaseWBGene000021790.00000000019994075865167896locus:jph-1 status:Confirmed
UniProt:Q22667 protein_id
:CAA99924.2

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00378500(coding)
ATGATTGAATAATTAGGTATAATAATTTAAAATTTATAAAGAATGGGAAGAAAGAGATGG
TAATTATTTATTTAATAATTATTATTCATTAGATAAATATTGCAAATACGATATTGTTTG
AAAAGAAAAAGAATTCAGTTAGATAGATAGATTGATAGATTTAATAATATAAGAAAATAA
TACTTTAGGTTAATAGGTATGGGTAATGAATGTTCAGCTTGTTCAAACTGTTAGAAGACA
GAGAAACAAACAGAATTTACAACAGACAATATAAAAGTAAATGAAATGGAGTAAGCTACT
GCCTAGTTGTAAGAATAAAACAAGATAAATTATTATGCTAAGGGTAATGAACAATTTGAT
TAAGTTAGCGGAGCAGCTGAAACTTAAGGATTAAATTTAAGTCATCAGTTTGCGCAAGGT
ATAGTAAATCAGTCTATGTAGCACAATCAAAGTTAGAGCTAATTGTAATAGAATAACAAC
AATTTCGCTAATAACAGCTAGTTTACAGATGAGCCATAAAATGATGATTAAAATGGGGCA
GGGCTTTATGATTACGAACCTAAGTATTTCACAAAAGAAGAATCGAGCGAAACAATGGCT
TAAAATCATGAAAATTCTAAGATCAGAGAAAAAAGACCACCTTATATGTTCAAGAGCGGA
GCAAATTATGATGGAGAGTGGTTAGGTAATATGAGAGATGGCTACGGAGTTTAAACATGG
CCAGATGGCGCTAAGTATGAAGGTGAATGGAAGCAAAATAAGGCATGTGGAAGAGGAAAA
TTCTATCATGTCGACGGAGATACCTATGAAGGAGAATGGAAAGACGATAAAGCAAACGGA
AGAGGTGTTTATATTCATGTTAATGGTGCTAAATATGATGGAACTTGGAAAGATGATTTG
CAAGATGGATAAGGTACTGAAACATGGGCTGATGGATCTTGTTATTAAGGGTCATATAAA
GAAACTAAAAAGCACGGCTTTGGTATTTACACTTGGTCTGATGGATCAAGATATGAAGGA
AATTGGGTAGAAAATAGAATATCCGGATATGGAGTTTATACATGGCTTGATGGAAGAAAA
TATGAGGGTGATTGGTAGAACAACAACATGCACGGTAAAGGTGTATATACATGGAGAGAT
GGTAGAAGATATAGCGGTTAATATTAATATGATAAAAAGCATGGTATTGGTACTTATACT
TGGGCAGATGGTAGAAAATATGAAGGCGAGTGGTAATTTGGAAAGTAACATGGATAAGGT
AAATATATACTATAAAATGGCGAAGTAAAAATTGGATTATGGGAAGAAGGCAAAAGAATT
AAGTGGTTAAGTTGA


>TTHERM_00378500(protein)
MIEQLGIIIQNLQRMGRKRWQLFIQQLLFIRQILQIRYCLKRKRIQLDRQIDRFNNIRKQ
YFRLIGMGNECSACSNCQKTEKQTEFTTDNIKVNEMEQATAQLQEQNKINYYAKGNEQFD
QVSGAAETQGLNLSHQFAQGIVNQSMQHNQSQSQLQQNNNNFANNSQFTDEPQNDDQNGA
GLYDYEPKYFTKEESSETMAQNHENSKIREKRPPYMFKSGANYDGEWLGNMRDGYGVQTW
PDGAKYEGEWKQNKACGRGKFYHVDGDTYEGEWKDDKANGRGVYIHVNGAKYDGTWKDDL
QDGQGTETWADGSCYQGSYKETKKHGFGIYTWSDGSRYEGNWVENRISGYGVYTWLDGRK
YEGDWQNNNMHGKGVYTWRDGRRYSGQYQYDKKHGIGTYTWADGRKYEGEWQFGKQHGQG
KYILQNGEVKIGLWEEGKRIKWLS


>TTHERM_00378500(gene)
ATGATTGAATAATTAGGTATAATAATTTAAAATTTATAAAGAATGGGAAGAAAGAGATGG
TAATTATTTATTTAATAATTATTATTCATTAGATAAATATTGCAAATACGATATTGTTTG
AAAAGAAAAAGAATTCAGTTAGATAGATAGATTGATAGATTTAATAATATAAGAAAATAA
TACTTTAGGTTAATAGGTATGGGTAATGAATGTTCAGCTTGTTCAAACTGTTAGAAGACA
GAGAAACAAACAGAATTTACAACAGACAATATAAAAGTAAATGAAATGGAGTAAGCTACT
GCCTAGTTGTAAGAATAAAACAAGATAAATTATTATGCTAAGGGTAATGAACAATTTGAT
TAAGTTAGCGGAGCAGCTGAAACTTAAGGATTAAATTTAAGTCATCAGTTTGCGCAAGGT
ATAGTAAATCAGTCTATGTAGCACAATCAAAGTTAGAGCTAATTGTAATAGAATAACAAC
AATTTCGCTAATAACAGCTAGTTTACAGATGAGCCATAAAATGATGATTAAAATGGGGCA
GGGCTTTATGATTACGAACCTAAGTATTTCACAAAAGAAGAATCGAGCGAAACAATGGCT
TAAAATCATGAAAATTCTAAGATCAGAGAAAAAAGACCACCTTATATGTTCAAGAGCGGA
GCAAATTATGATGGAGAGTGGTTAGGTAAATAATTAATCTCTTTATTTTTGATAATAATT
GCAATCATTTTTAATATTTGACAAACTATTTGTTTGGATATTACTAACTATTAATCAATC
TTTTTACACTAACATGCAACAAAGAATAAAATATTCAATTCAGTTAGATAATATATACAT
AAATCTCACCAAATTTTGTTTGAATTTCAAATTAATATTTCATATTAAAAAGGTAATATG
AGAGATGGCTACGGAGTTTAAACATGGCCAGATGGCGCTAAGTATGAAGGTAATATTTTT
AATAATTAAAATTAATTATTATAGCAAAATCAAAAGCATTTATTCAAATTTTGTGTTTAT
GCGTTCTCTAATAAATTCATTTTTCTTTAAATTAAAAAGGTGAATGGAAGCAAAATAAGG
CATGTGGAAGAGGAAAATTCTATCATGTCGACGGAGATACCTATGAAGGAGAATGGAAAG
ACGATAAAGCAAACGGAAGAGGTGTTTATATTCATGTTAATGGTGCTAAATATGATGGTA
AATAACTTTTTAGTGCTTTATTTTGATTTAGAAAAAGAAGTTATTAATTTTATTACTTAA
ATCTAAGGAACTTGGAAAGATGATTTGCAAGATGGATAAGGTACTGAAACATGGGCTGAT
GGATCTTGTTATTAAGGGTCATATAAAGAAACTAAAAAGCACGGCTTTGGTATTTACACT
TGGTCTGATGGATCAAGATATGAAGGAAATTGGGTAGAAAATAGGTATTTTATTAAATTT
AAAAGTATTCATCAATTAAATTAAATATTTATCATTTTAAATGTTAGAATATCCGGATAT
GGAGTTTATACATGGCTTGATGGAAGAAAATATGAGGTAATTTGCTTAGAATTCTAAAGT
TTCTTTACTTAAAAATAATTTCTCAATTTATATTTTAAAAAAATAAATTAACGCTAAAAA
ATACTAAAATAATTTTAATAAAAAAGGGTGATTGGTAGAACAACAACATGCACGGTAAAG
GTGTATATACATGGAGAGATGGTAGAAGATATAGCGGTTAATATTAATATGATAAAAAGC
ATGGTATTGGTACTTATACTTGGGCAGATGGTAGAAAATATGAAGGCGAGTGGTAATTTG
GAAAGTAAGATCTTTTTTATTTAAATAAACATTTTTTTCAGTGATTAAGTTAATATTTAT
TATAATAAATAATCTATTTTCTTTATTTATTCATTTATTATTATAAATTTAGGTAACATG
GATAAGGTAAATATATACTATAAAATGGCGAAGTAAAAATTGGATTATGGGAAGAAGGCA
AAAGAATTAAGTGGTTAAGTTGA