Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01084170

Standard Name

MRNC36 (Membrane Occupation and Recognition Nexus protein C-terminal)

Aliases

PreTt05936 | 225.m00039 | 3801.m00216

Description

protein with predicted MORN domains localized at the C-terminus of the protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

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Domains

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Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_01084170

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_20466.19.997093137033517e-262hypothetical protein (362 aa)
OxytrichaContig18206.0.g232.0006821221283624e-88MORN repeat
Stentor CoeruleusSteCoe_122708.194012623990515e-40
DictyBaseDDB_G03494880.00000000000001000191320216021DDB_G0349488 on chromosome: 2
position 6912714 to 6914186
WormBaseWBGene000021790.00000000019994075865167896locus:jph-1 status:Confirmed
UniProt:Q22667 protein_id
:CAA99924.2

General Information

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Associated Literature

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Sequences

>TTHERM_01084170(coding)
ATGGGAAACATAAATTGTGCTACTTGTACTTGCGATCCAAATAAAGGATAGCCAGATACA
GAATACATAACAATACCTAATGGTAAAACAGATCATCATCAAAATTAGAGTAGAATAACT
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GGTAGTGGAACTCTTTTGTTTGCAGATAAGAGCAAATATATTGGAGAATTCTTAGATAAT
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GGAGAATACTTGGATGATAAAAAGCATGGTTTTGGTGTATTTGAATGGGGAAATGGTAAG
AAATACGAAGGCGAGTGGCTCAACGGAAAATAACATGGAAAAGGTGCTATTATTTTGCCC
ACAAACGAAAGGAAAGAAGGTATTTGGGAAGATGGTAAGCGTATTAAATGGATTACCGAA
GAATGA


>TTHERM_01084170(protein)
MGNINCATCTCDPNKGQPDTEYITIPNGKTDHHQNQSRITSAQDAGQSSEKINQKVYNAK
SQNGESNKNEYDSQPYQPQRSLKDQINANGQTASGSVKKSLHEDNQPTDSQIDLVNSTIG
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GSGTLLFADKSKYIGEFLDNEISGYGEYYWQDGKIYKGQWRNNKMNGKGETIWVDKKRYV
GEYLDDKKHGFGVFEWGNGKKYEGEWLNGKQHGKGAIILPTNERKEGIWEDGKRIKWITE
E


>TTHERM_01084170(gene)
AAGAAAGTAGGCAAACATAAACAAATAAATAAAATTTGAAATCGATTCAATATAATTTTT
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AATAGGTAGCTTAGCTTGGATAGGTTTTGTTGCAAATTAACGCTTACAGCAAATATAACA
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AATACGACTCTTAGCCATACCAGCCACAAAGATCTTTAAAAGATTAAATAAATGCAAATG
GTTAAACAGGTAATAAATAAAAATCTTAAATATTAATTTATAATTTTAAAAAATTCAGCA
AAAAATAAAATAATTTTAGAGTGTAATTTGATTTTTCAAAATAATAATTTGAGTTAGTTG
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ATCAATTAAAAATAAAAAATAATTGGAAGAAAATTTAGTTAATTTTTTTAATCAAGCAAT
TATTCACAAATTTATTAATTTTTAAACACTCTTTTACTTTCCATAAAATATGTCATTGCT
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CCCTTATTAATTTTTGAATAATTTTATTTTTCTATTATTTCTTCTTTTCCTCTGAAGTCA
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GATATTTATGAAGGTGAATGGAAAAATGATATGGCTAATGGTAAAGGTATTTATCTTCAC
AGTGGCGGCGCTAAATATGAGGGAGAATGGAAAGATGATTTATAAAATGGACATGGTATA
GAAACTTGGCCAGATAATGCTCGCTATGAAGGAAGCTACTTAAATGGTAAAAAAAATGGT
AGTGGAACTCTTTTGTTTGCAGATAAGAGCAAATATATTGGAGAATTCTTAGATAATGAA
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TAAATGATAAAAAATTAATTTTCATTTTAAATTTTAAAAGAGGAGAGACCATATGGGTTG
ATAAAAAGAGGTATGTAGGAGAATACTTGGATGATAAAAAGCATGGTTTTGGTGTATTTG
AATGGGGAAATGGTAAGAAATACGAAGGCGAGTGGCTCAACGGAAAATAACATGGAAAAG
GTAAATTCATTCAATTAGTTTTTGCAATTTTTACTTAGATTAAGTATTTCGTTTCTAAAA
AAAGGTGCTATTATTTTGCCCACAAACGAAAGGAAAGAAGGTATTTGGGAAGATGGTAAG
CGTATTAAATGGATTACCGAAGAATGAAAGCAAATGCCTCGAATTTTTAAAACTTACTAC
CTTCTTTTAATAAATACAAATTAGACAGATATATTAATAAGCATTTTTAACAACTCTCAA
TAAAATTTAAAAAATTACAAGTATACTGGTAAATTATAGTAAAATCAAATAAAACAAACA
ATCTTTTAATTTAAGATGTTTAAAGTTATCAAAGCTTTAGAAAAACAAAATTAAGCACAC
TCACAAGCAAACACAAACATTAAATAAATAAAAAATGAATGTTTAATAAAGCAATATAAA
TAAATATAAAATGATAAATTATGTATTATGTAAACTTGATGTATTAGCAGGTGAGAAAAA
TAAATAAATAAATCATTCAGTCAATCAAACAATCAAAAAATTATAATTGTAAATTACTCT
TATTTGAATAAATTAAATTATATAAATAAATAAATCAATACTTCCTTCCAAAAGCAAAAT
ATATCAAAAAAAGAATCAATCTATGAATATCTAAGAATATAGCTAGCTAACTACTTGAGT
AATCAGTTAGTTAGTCATAATAAAATATAAAAACTCAATTACCTGCTTATATTTAATAAT
TTTTACAGATTATAAAACAACTTTCAGTAAGTTATCTAATATATTCATCTATCTATTTAT
CTACCTGTAAATTTACATTTTCTTATTTCTTAGTATTTCCGAAATATTATGACTTCAATT
AAATTTTC