Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01309130

Standard Name

MLL1 (Mixed lineage leukemia 1)

Aliases

PreTt09136 | 319.m00018

Description

SET domain containing protein; homolog to MLL proteins in mammals, Trithorax in Drosophila, and SET1 in yeasts.

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• zinc ion binding (IEA) | GO:0008270
• protein binding (IEA) | GO:0005515

Biological Process

• regulation of transcription, DNA-templated (IEA) | GO:0006355

Domains

• ( PF00628 ) PHD-finger
• ( PF00856 ) SET domain
• ( PF03107 ) DC1 domain
• ( PF00439 ) Bromodomain
• ( PF07649 ) C1-like domain
• ( TIGR01612 ) rhoptry protein
• ( TIGR01257 ) rim ABC transporter
• ( PF02809 ) Ubiquitin interaction motif
• ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein
• ( PF00097 ) zinc finger, C3HC4 type (RING
• ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)
• ( PF00130 ) Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1
• ( TIGR01560 ) uncharacterized phage protein (possible DNA

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_01309130

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_20980.1	9.997093137033517e-262	SET domain-containing protein (2325 aa)
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DictyBase	DDB_G0289257	9.99648502569394e-38	set1 on chromosome: 5 position 2551579 to 2556233
WormBase	WBGene00004782	3.000842737734004e-34	locus:set-2 Probable histone -lysine N-methyltransferase se t-2 status:Partially_confirm ed UniProt:Q18221 protein_ id:CCD65735.1
SGD	YHR119W	1.000137892321693e-31	SET1 Histone methyltransferase , subunit of the COMPASS (Set1 C) complex; COMPASS methylates histone H3K4; Set1p-dependent H3K4 trimethylation recruits Nrd1p, allowing efficient term ination of snoRNAs and cryptic unstable transcripts (CUTs) b y Nrd1p-Nab3p-Sen1p pathway; m odulates histone acetylation l evels in promoter proximal reg ions to ensure efficient Nrd1p -dependent termination; requir ed in transcriptional silencin g near telomeres and at silent mating type loci; has a SET d omain
Stentor Coeruleus	SteCoe_26223	0.000000000000001713908431542013

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_01309130(coding)
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TAAAATCTTTTAAAAATTGATGAAAAAGAGCTGATAACAATGACTGAAAAAACATCTATT
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TTAAATGATCTCATGAACAACAATACTCTTGATGAATCGAATGAATAAAATTAATTGGAT
AATGCACAGTCAGATAATTCTTCCTAAGAAGGAGGGGTTTCAAGTTAATTTATTTCATTC
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TGCTTTATGTGTGGGGCATTCGATGGTTATAAATCATTACTTTTTTGCACAAGCTGCTTC
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ATGGAAAGAGCCATGAACAATAGGGAATGGAACTGTCCTAAATGCTAGGTCTGCAAAGTT
TGTAGTAAGGGTCCTAACATTACAAAGAATCTTTTTTGCAGAAAATGTGATGCTATGGTT
CATTTTGAATGTGAATTTAAAGACGTTCAAGTATGGAATGAATCTAAAAATGAACTTTAC
TGGTAGTGCTCAGATTGCTTTAATTGTGCCAAATGTTCGTCAAAATCTTTAATTGATGAA
TCAGATAAACAACTCATGATCAATTTAGATTTTACTGATAACTTTTCATTATGCTACAAA
TGTGGTTTTTTGGACGCTTATTACAGATTCTGTAAATTTTGCAACAAATATTGTAAAAAA
ATACCAACTTTACCTAAGCCCGCTAATTAGCAACCTCTTGATGACCTATTTTAAGAGAAA
AGCGTAAGGCTAAAATATTTAGATTAATATCTTGAAGAAGTTCTGTATCAGTGCAAACTG
TGCTAATAAGTTTACCACAAAAAATGCTTTGAAAAAGCTTATCCAGAATATATTTAGTAG
TTCTTTTGCTATACATGCAAAGACTCAAATCAAAGTTACATGTAAAAGATTTATGAAAAT
AGCTTAATTAGCACTAAGTGTAGGATTATCCATATCCGTAAAGTGTAAGAGTTTCTTCCT
ATAGTTGAGCTAATAATAGAAAAGTAGGCTTAAACTTACAAACTAAACAGGAAAGACATA
GGTGATTTCATAGCAGAATATTTACATTATTTCGAAAGCGATTAATTTGGTATTTATAAA
TAAAATACTATGGCTTATGACAAACTTTGTTAACAACTAAGAGATGAAGGAATTCTGATA
ACACCTTATAACATTAAATAAATGGCTATATATGATGAAAAGGTTATTTCACAAACAATA
GAGCAACTAAAAAATAAAAAATCATTTTGGAGAGACACATATATCTAATCCAATTAATTT
TATTATAAATCAGAATAAATTTATTCAATAGCTTACTTAGATTTGTATAAAAGAGGAATA
ACAGCTCCAGAAACAGCAGAAATTGCATATAAATTTTCATTCGAATCTAATGAAGGCGTA
TTTAGACAACTTCAGTATAGCATTTTCAAATTTGAGTTAAAAGAATCAATCAGATATGAT
TACAGATATGATGAAAATGGATAATTAGAAGTTATTTTTATTGAAAATGATAGAAGACAT
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ATTAGAGAAAGGGGACTATCAAATCAAAGCTCATCTTAAGCTATATAATTCCCTTCAAGA
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TACTTTAATCAAACAATACTTGACTTATAAATGAAAATTTAATAAGAAAATAGCCAATAT
TAAAAATGTTTTAAAACATATATTAACATTCCTATATTAGAAGAAAAGAGCACTGTTTAA
TTATCGACTGTTACTGGAATAAATAAAAGAAGGGATATTGCTTAGTGTATAATCTTATTG
CAAGCTTAAGAAGAATAACTTGTTGCTTCTGTTAGACAAATGCTTGATGAGTTTATGGAA
AAGAAAAAAGATAAAACTAAGATATCTCTTACTCAATAAGTTTTAAATTCATATCAAAAT
TTTTCTAAGAGTATACTTGGATCTGTTTATTAAACACCTATGTCATATTAAGAAATCATC
AATTAATTCAGAGAAGCTTAGAAAAAATTAATTCTTGTTGATAATAATATAATCGATGAT
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GAAGTTAAAGAAAATATAGATGGTGCTCTAAAAAATTTCATACCAGCTTACAAAAAGTCT
CTATAAGTGTAATGTAAACATTGTAATAAATTTGGAGCCACTATCTCTTGTATGATAGCT
AGTTGCAAAGATAAGTACCATTTCCCTTGTTTATTGAAATCAAATGGTTTTATGACAGAT
CAAAAAACCGTTCTTTGCAAGAGCTGTTGGGATATAATCCTTAAAAACGATGACACTGAA
ATTATTTTAAAAATGCAATATTTAAAATTGGTCAACAATTTTAACACAGATAGAAGAATT
TTTATATCACTTACAAAATAAGAAGGAGGAAACATCGATTTTAGTGGAGAGTGCTATAAT
AGATTTGGTTCTTTTATACTTGTCAATCTTGACACACAAGAAACAAATGATGATGAATTT
TTCTCATCTTATTTCTTTATGAGATACATTAGACCTTTTGTTTCACAAAAATATCAGTCT
TATGTTACTGCATTTTGGTTGAAAAAAAAGAAAGATGAATATATTTTAAAATCTTGTTTG
CTTGCAGAAACTAACAAAATATTTTCATAGACAAAAAATATTGATGAAAACAAAAATGAA
TTTTCAATAGAAAAAGATAGACCATTCACTAATGAATTAAGTGCCAACATAAAAAATTTA
GCAGGATATAAAGAAATAAGCGAATCAAACAATAATATACCTAGATTTACTAACAATGTA
TTGAAAGATAAAGATATATTTAATCATGACCAACTTGATTGCTTCACTTCATTAAAAGGT
ATACAATAGCTCCTCTAAGAAAAGATAAATTAAATATACTAAAGATACAAGGGTGATTAA
CCTAATAAAAGTACTGATGTTAACAAATTTGTTATGGAATACATTGGTTTTGGTATTCCT
CAAATAGTCAAAGCTTGCTAATAGTCTTCAAAATAAAATAAAAATAACAATATATTCTAG
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AATTAAAAATAGTAACAATAATTACAAAACTTAGGATAGTAATAAATGAATTCAAAAGAA
AATTAGTAGTCTTCACATTTAAATATTCCAATTTTACAGCATTTAAGTAATAAAAAATAA
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AGACCCGATGATATTATGCTAGAAGCTAATCCCGATTACATGAAATAAGATACTCGTTAA
ACGATAAGAGAAAAAGAAATAGAAAAAAAGATTAAAGCAGAATATCCGAATTACATAAAT
AGCAAAAAGAGACATCTAAATATTTATGCTGGTCCTTCTAAAATTCACAAATATGGGTTA
TTTGCAAAAACTTACTTTAAATAAGACGATATTGTTGTTGAATATCTTGGTGAAACAATT
AGATAAGTTCTTGCAGACTATAGAGAGAAGATATACAAATAAAGAGGTTTTGGAGATTGC
TATATGTTCAAAGCATGCCCTGATAAAATTATTGATGCCACTTTTAAAGGGAATGAAGCC
AGATACTTAAATCACTCTTGCAATCCAAATTGCTCCAGTTTAGTTATTGAATACGAAAAA
GATTCAAAAATCATAATTTATGCAAAGAGAGATATAAAACCTGGAGAGGAGCTTACATAT
GATTACTGCTTTGATATAGAAGAAGAGAAGATTAACTGTAACTGCAATGATCCTAATTGC
ACAAGAATAATGAATTGA

>TTHERM_01309130(protein)
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>TTHERM_01309130(gene)
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TAATTGTCCAATAATTTAAAGCAAGCAGTAGGATTGATCTGTTTTTTTTAAAAAATATAG
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TTTAATCTATTTAGAATGATGAAGTGTTTGAAGAGATATTTAAAAAGTTTGTAGATTTAG
AGCGCGATGCTTTTTTGGACATCCCAGAGTTAAATAGCACTTTACATGGATAGTTTTATT
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TCACTCTCTTAAATAAATTTCCCTTCATAATAGCAAATCCCTCTTTAAAGAAGTTTATCT
GTTTAATATTAATAAAACGATGTTCTTATATGGTTTATTGGCACTAATAGATATTCTATG
TAATCTTCTTATAATGATTTATTTTTTTTATCAAAACTAACTATTGTAATTACTTTAAAT
TTTTTTTTTTTTCCCTTTATATTATAGAGTAAATATGTCTCAGCTTATGAAAGTGGAAGA
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AACTTCCAAACTTCATTGGATTAATCTAAATTAATCAGAAAGAAATATTATAACCTCACT
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AAAGGAATCTATTAATCCGAAAGAAATTGTAATTTAAAGTTTAATCTTATTTAATCATGC
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TCCAACTAAATTATTGTAAAATTTGAAGATATTTGTAAGATATTTGAGCATATTGCTTCG
AAAGGTAAAAACGAAATAAAATACATCTAATCAGTTTTAAAAAATGAAACTTTAAACAAA
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AATGAATAAAATTAATTGGATAATGCACAGTCAGATAATTCTTCCTAAGAAGGAGGGGTT
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TTTGCTACGATAAAGTTGTTGCTTTATGTGTGGGGCATTCGATGGTTATAAATCATTACT
TTTTTGCACAAGCTGCTTCGAATCTTATCATCCCTATTGCCTTATGATTCCAGGAAGATA
AGAATATTTCAAAGAAAAAATGGAAAGAGCCATGAACGTAATAATTTTATTATTTACATT
TTTTTATAAAATTTATCTCCAGAATAGGGAATGGAACTGTCCTAAATGCTAGGTCTGCAA
AGTTTGTAGTAAGGGTCCTAACATTACAAAGAATCTTTTTTGCAGAAAATGTGATGCTAT
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TTACTGGTAGTGCTCAGATTGCTTTAATTGTGCCAAATGTTCGTCAAAATCTTTAATTGA
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TGCTATACATGCAAAGACTCAAATCAAAGTTACATGTAAAAGATTTATGAAAATAGCTTA
ATTAGCACTAAGTGTAGGATTATCCATATCCGTAAAGTGTAAGAGTTTCTTCCTATAGTT
GAGCTAATAATAGAAAAGTAGGCTTAAACTTACAAACTAAACAGGAAAGACATAGGTGAT
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