Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00627190

Standard Name

MCF6 (Mitochondrial carrier family)

Aliases

PreTt24644 | 88.m00112 | 3822.m00635

Description

Mitochondrial carrier protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 20.3%

TetraMine Data

TTHERM_00627190

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_17298.1	9.997093137033517e-262	mitochondrial carrier protein (304 aa)
SGD	YPR058W	9.995951036711152e-55	YMC1 Mitochondrial protein, pu tative inner membrane transpor ter with a role in oleate meta bolism and glutamate biosynthe sis; member of the mitochondri al carrier (MCF) family; has s imilarity with Ymc2p
DictyBase	DDB_G0290913	2.000704504372864e-47	mcfS on chromosome: 5 position 4740703 to 4741678
WormBase	WBGene00008320	6.999359373303508e-39	status:Partially_confirmed U niProt:Q18844 protein_id:CAA 99811.1
Stentor Coeruleus	SteCoe_35463	8.75651076269652e-27
Oxytricha	Contig20765.0.g62	1.0000422327488734e-24	Mitochondrial carrier protein

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00627190(coding)
ATGTAAAAATAAATAAATATTAACTTTTCTTTGCAGTTGGTTGGTATATCCAAACAATTT
TTGATTACATTTTAAAATGAAAACAGAATTAGATTCTTTAAAAGCTCAAAAATCTCCACT
TAGTTATAATTAAAAACAATCATAAACATAACAAATATCTGCTAATAAAAAAAAGGAATT
AAAAGCAAAAGCGCTTCACTTTAAATAGGTAAACTACTTCTCACAAAACACTACTCTTAC
TCAAAATCATTTAAATTCATGAGCTACTCTGCTAAAACTTAAAAATCCTACATTTCCCAA
GACTCTTTGGTTTTCAAATACAGAGATTACATCGCTGGATGTTTGGGAGGTATCGCATAA
GCCTTAATTGGTTAGCCCTTTGATACAATTAAAGTTAGATTACAATCTTCCACAGGCTAG
ATTTCAACTGGCTAATGCATCAAAAATCTTATCAAGAATGAAGGACCCCTTGCTTTTTAC
AAAGGTATTGGATCACCTTTAATTTGCATGAGTGGTGTAGTTTCTATTTAATTCGGTGTT
TTCCAAAGAGTTGTTAACGCTTTCAAAGAAGCTTAAAAAACTAAATTCCTTTCTACATTC
TAAATGGGTGTTTGTGGATCAATTGCTGGTTTATTCGCTTGTTCTGTTCTTTCTCCTATG
GAACACATCAGAATCAGACTTTAAGTTATGCAAAACTCTATCTACAATGGAGCTATAGAT
TGTGCTAAGAAGATATACCTTGAACATGGTTTAAGAGGAATCTATAAGGGTTTAACAATT
ACCTGTTTAAGAGAAGTTCCTGCCTTATTTGCTTACTTTGGATCTTACCACGGTGTCTTG
AGAGCTATCTAAGGAGCTTACAATAATAATCAATAAGAATTAGCTGTCAAGTGTGCCCCT
CTTGTCGCTGGTGCTGTTGCTGGTATTGCATACTGCACCTTTACCTATCCTATCGATACT
ATTAAATCAAGAATCTAAACTGACAACTTTGTCAATCCTAAATACAACGGCATTGTTGAT
GGCTTTAAAAAGACTATCAAGGCTCAAGGATTTGGTTCTTTATATAAAGGTTATGGTATC
ACTTTTGTTAGAGGTATTCCCGTCAATGCAGCAAGTTTCTTAATTTTTGAAAATGTTAAG
GCCTTGATCGAAGAAAATGCCATGTATTGA

>TTHERM_00627190(protein)
MQKQININFSLQLVGISKQFLITFQNENRIRFFKSSKISTQLQLKTIINITNICQQKKGI
KSKSASLQIGKLLLTKHYSYSKSFKFMSYSAKTQKSYISQDSLVFKYRDYIAGCLGGIAQ
ALIGQPFDTIKVRLQSSTGQISTGQCIKNLIKNEGPLAFYKGIGSPLICMSGVVSIQFGV
FQRVVNAFKEAQKTKFLSTFQMGVCGSIAGLFACSVLSPMEHIRIRLQVMQNSIYNGAID
CAKKIYLEHGLRGIYKGLTITCLREVPALFAYFGSYHGVLRAIQGAYNNNQQELAVKCAP
LVAGAVAGIAYCTFTYPIDTIKSRIQTDNFVNPKYNGIVDGFKKTIKAQGFGSLYKGYGI
TFVRGIPVNAASFLIFENVKALIEENAMY

>TTHERM_00627190(gene)
ATGTAAAAATAAATAAATATTAACTTTTCTTTGCAGTTGGTTGGTATATCCAAACAATTT
TTGATTACATTTTAAAATGAAAACAGAATTAGATTCTTTAAAAGCTCAAAAATCTCCACT
TAGTTATAATTAAAAACAATCATAAACATAACAAATATCTGCTAATAAAAAAAAGGAATT
AAAAGCAAAAGCGCTTCACTTTAAATAGGTAAACTACTTCTCACAAAACACTACTCTTAC
TCAAAATCATTTAAATTCATGAGCTACTCTGCTAAAACTTAAAAATCCTACATTTCCCAA
GACTCTTTGGTTTTCAAATACAGAGATTACATCGCTGGATGTTTGGGAGGTAATTTTTCA
TTTTTATTAATATTTATCATAAAAAATTCACTCAAAAAGACACAGTCTAAGTCTATCTAT
CTAATATAAAATAGGTATCGCATAAGCCTTAATTGGTTAGCCCTTTGATACAATTAAAGT
TAGATTACAATCTTCCACAGGCTAGATTTCAACTGGCTAATGCATCAAAAATCTTATCAA
GAATGAAGGACCCCTTGCTTTTTACAAAGGTAATTAATTATTTTTTATATTAAATTCAAC
ATTGACAAGATTCAAATAAATTAGCTAGTAATAAATAAATAAATTAATTAATTAGCAAGA
TAGATAGATTGATTGAAATAGAGATAAATTGATATTAAGGATTCGAAATTTTAACCTATT
TCAAAAATACCAAAAAATATAAAAAAACGGATTAATTAAAGCTGAATCATTTATTTTAAT
AGATTAATTGATTGATTGATTTGAAAATAAAATTTTTTTGATAAGGATTAATAACTAGTT
AAAATATTAGCCTGAATTTAAAAAAGTCTATCTATCTTTCTATTTCATTTTGTTGTGAAT
CTTTAATCGGTGTTGTTTTAAAAGCAAAAATAAATTGACGATCAAATTGTTTTTATGAAT
CATATTTACTTTATCATTATCAAATAGGTATTGGATCACCTTTAATTTGCATGAGTGGTG
TAGTTTCTATTTAATTCGGTGTTTTCCAAAGAGTTGTTAACGCTTTCAAAGAAGCTTAAA
AAACTAAATTCCTTTCTACATTCTAAATGGGTGTTTGTGGATCAATTGCTGGTTTATTCG
CTTGTTCTGTTCTTTCTCCTATGGAACACATCAGAATCAGACTTTAAGTTATGCAAAACT
CTATCTACAATGGAGCTATAGATTGTGCTAAGAAGATATACCTTGAACATGGTTTAAGAG
GAATCTATAAGGGTTTAACAATTACCTGTTTAAGAGAAGTTCCTGCCTTATTTGCTTACT
TTGGATCTTACCACGGTGTCTTGAGAGCTATCTAAGGAGCTTACAATAATAATCAATAAG
AATTAGCTGTCAAGTGTGCCCCTCTTGTCGCTGGTGCTGTTGCTGGTATTGCATACTGCA
CCTTTACCTATCCTATCGATACTATTAAATCAAGAATCTAAACTGACAACTTTGTCAATC
CTAAATACAACGGCATTGTTGATGGCTTTAAAAAGACTATCAAGGCTCAAGGATTTGGTT
CTTTATATAAAGGTTATGGTATCACTTTTGTTAGAGGTATTCCCGTCAATGCAGCAAGTT
TCTTAATTTTTGAAAATGTTAAGGCCTTGATCGAAGAAAATGCCATGTATTGA