Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00371100

Standard Name

LRR5 (Leucine Rich Repeat family protein 5)

Aliases

PreTt28626 | 39.m00199 | 3693.m00046

Description

Leucine Rich Repeat family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF00560 ) Leucine Rich Repeat
• ( PF07723 ) Leucine Rich Repeat

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_00371100

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_12260.1	9.997093137033517e-262	leucine rich repeat family pro tein (1120 aa)
Oxytricha	Contig1198.1.g79	1.0002758036576784e-62	Leucine Rich repeat
Stentor Coeruleus	SteCoe_19933	2.9374821117108028e-30
DictyBase	DDB_G0292386	0.0000000400154582995175	carmil on chromosome: 6 positi on 1735919 to 1739473

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00371100(coding)
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AATAACCATCAAAATGACCACAATGAAATATTTTCAGCACAAAATATTCAATTTTATAAG
AAAAATAGTAAATGA

>TTHERM_00371100(protein)
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TMNSSYKHPFMTEIQQNLDTSANLSLKQVLVHSEKKFNLKEERKMQHFTNKLPSINASDD
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IILKTRKDYEFKQSVSHGALQRFSKVKLLSNQSKFLPSVFNNHQNDHNEIFSAQNIQFYK
KNSK

>TTHERM_00371100(gene)
ATGGGTTTTGAAACTGGCAAATAACTATTAAAAGGAAGACATCACAATAGTGCTAGCAAC
GCAACAGAATTTTATGCATCAGGTTTTCACGATGATTAAGAATCCATATTAATGTCTGTA
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CTTCAATAAAATATGTTGACTTGGTAACATTTAGTGATTTCATCGTTAACAAAATATGTC
ATCTGCATCCTCTAAATCAAGCATTAGAAATATAAATAAGAAGTGCATTTTAAATGAGCT
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