Gene Model Identifier
TTHERM_00569290
Standard Name
LIA2
Aliases
PreTt10459 | 76.m00161 | 3810.m02020 | DRH3
Description
LIA2 DEAD/DEAH-box helicase
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Molecular Function
No Data fetched for Domains
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Signal Peptide Present?: No
TTHERM_00569290
Fullscreen View
No Data fetched for StockID
(v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_03481.1 9.997093137033517e-262 DEAD/DEAH box helicase (588 aa
DictyBase DDB_G0293168 9.997105718980434e-168 ddx17 on chromosome: 6 positio
SGD YNL112W 6.998455025673696e-155 DBP2 Essential ATP-dependent R
Oxytricha Contig21312.0.g80 3.9992399120784785e-154 DEAD/DEAH box helicase
WormBase WBGene00010260 5.997411300273806e-139 locus:ddx-17 status:Confirme
Stentor Coeruleus SteCoe_12603 1.7785284761271306e-68
No Data fetched for General Information
Ref:27892853 : Hamilton EP, Kapusta A, Huvos PE, Bidwell SL, Zafar N, Tang H, Hadjithomas M, Krishnakumar V, Badger JH, Caler EV, Russ C, Zeng Q, Fan L, Levin JZ, Shea T, Young SK, Hegarty R, Daza R, Gujja S, Wortman JR, Birren BW, Nusbaum C, Thomas J, Carey CM, Pritham EJ, Feschotte C, Noto T, Mochizuki K, Papazyan R, Taverna SD, Dear PH, Cassidy-Hanley DM, Xiong J, Miao W, Orias E, Coyne RS (2016) Structure of the germline genome of Tetrahymena thermophila and relationship to the massivelRef:27793833 : McDaniel SL, Zweifel E, Harris PK, Yao MC, Cole ES, Chalker DL (2016) DRH1, a p68-related RNA helicase gene, is required for chromosome breakage in Tetrahymena. Biology open 5(12):1790-1798Ref:17519286 : Yao MC, Yao CH, Halasz LM, Fuller P, Rexer CH, Wang SH, Jain R, Coyne RS, Chalker DL (2007) Identification of novel chromatin-associated proteins involved in programmed genome rearrangements in Tetrahymena. Journal of cell science 120(Pt 12):1978-89
>TTHERM_00569290(coding)ATG TGG GGA AAT AGC TAC AAT AAT AAT AGT TCT AGT AAT GGA TAC TCA AAT AAC AAA AGC AAC GGA TAT TCA AGC AGC AAT AAT AAT GGA AAC TCC TAT GGA ACC GGT GGC AAG TGG AAT GAT AAC GGA GTT GGT TAA AAT TTG GCT GCA ATC GAT TGG ACA AAA GAA AAT CTT ACT ACA TTT TAG AAA GTT TTT TAT AAG GAA AGT TAG AAA ATA AGA ACT GAA GAA GAA ATC GAA GAA TTT TAC CGC CAG AAC CAC ATC TCA GCC AAA TCA CCT CAT GGA AAA GTA CCT GAC CCT TTT TTA AGC TGG ACA GAT ACT CAC TTC CCT TAA TAT ATT ATG AAT GAA GTT ACT CAC GCT AAA TTT GAA AAA CCC TCT CCT ATT TAG TCT TTA GCA TTC CCT GTA GTC CTT AGT GGT CAC GAT TTG ATT GGT ATT GCA GAA ACA GGT AGT GGA AAA ACT CTT TCC TTC CTT TTA CCC TCA ATA GTT CAT ATT AAT GCT CAA CCA ACT GTC AAA AAG GGA GAT GGT CCT ATC GTC CTC GTT CTT GCT CCT ACT AGA GAA CTT GCT ATG CAA ATC GAA AGA GAG TCC GAA AGA TTT GGT AAA TCC TCT AAG CTT AAA TGT GCT TGT ATC TAT GGT GGT GCT GAC AAA TAC TCC TAA AGA GCA CTT CTC CAA TAA GGT GTA GAT GTA GTT ATT GCT ACT CCT GGT AGA CTT ATT GAC TTT TTA GAA AGT GAA ACT ACT ACT TTA CGT AGA GTT ACT TAT CTC GTA TTA GAT GAA GCA GAT AGA ATG TTA GAT ATG GGT TTT GAA ATT TAA ATT AGA AAA ATC TTG GGT TAA ATT AGA CCT GAT CGT TAA ACA TTG ATG TTT TCT GCT ACC TGG CCT AAG AAT GTT TAG AAT CTT GCT TAA GAT TAT TGC AAG AAT ACT CCC GTT TAT GTT CAA ATC GGA AAA CAT GAA TTA GCT ATT AAC GAA AGA ATT AAA TAA ATT GTT TAT GTT ACA GAT CAA TCA AAG AAA ATC AAT CAA CTT ATC AAG CAA TTA GAT TGT TTG ACT TAG AAA GAT AAA GTA TTG ATT TTC GCT TAA ACA AAG AAG GGA TGT GAA AGC ATG AGT CGT ATT TTG AAT AAA GAA GGA TTT AAG TGT CTT GCT ATC CAT GGT GAC AAA GCC TAA AAA GAC AGA GAC TAT GTT ATG AAC AAG TTC AAA AGC GGA GAA TGC AGA ATC CTT ATT GCT ACA GAC GTA GCC AGT AGA GGT TTG GAT GTT AAG GAT GTC TCC CAC GTA TTT AAT TAC GAT TTC CCA AAG GTT ATG GAA GAC TAT GTC CAT AGA ATC GGT AGA ACA GGT AGA GCT GGA GCA TAT GGT TGT GCA GTA TCT TTC CTT ACT TTT GAA GAT GAT AAA AAG ATA TCA AGG GAA TAT GTC CAA ATG CTT CAT GAC GCT AAG TAA GAA ATT CCC ATT GAT CTT CTT GAT CTT GCT AAT CCC AGA TAC AGA ACT TAA TAT AAA ACT GTT TCC TCT TCA TAC TAT GAT ATT AAG AAA TTT AAC AGT GCT GAT ACT TCA AAG CCT TCA GAA AAT CAG AAT GTT TCA AAT ACT GCA AAT AGC AGC GAC AAG TAC ACC AGC AGT AGC AGC TAC AAT TAA TAT AAA AGC AAA AAA GAT GAA GAT GAC AAG AGA AGT AGA AGT AGA AGT CCA TAT AAA TCT GAA AAT AAC AAC AGA TGG GAT AAA TAT AAT CGC ACA AAA AGC CCA GAA TAC CGC AGT TCT AAT GGA TCT TCT CAT TAT AAC AAC GTT AAC AAG TAT TCT TCA AAT TCT AAT AAT AAT TCA AGT TCA TAT TCA AAG AAT TAA TCC TCC ACA TCA TCA TCT TCT TCC TAT GGA TAG AAT AAT TAA TCA TCC AAT TTA ATG AGT AAA CCA TCT AGT AAA TTC TCT GCT CCT ACA AAT GGT AGT TAC ACA AAT GGA TTT TCT TCA GTC TAA TAA AAT TCT CAA GTT TAA AAT CCA TTT ATG CCA ATC AAT CCT TTA CCT CAA CCT TTT ATG TAC TAA ATT CCT GGA TTT AAT GGT TTC CCT AAT CAA GGT TTC AAT AAC TTT TAC ACT GGT ATG GTT CCT CCT CCT CCA CTC CCT ACT GGT GCT CCC TCA TAA TAA TAA AAT GGA TTT GCT TAA AAT ACA ACA ACA TCT TCT TGA >TTHERM_00569290(protein)M W G N S Y N N N S S S N G Y S N N K S N G Y S S S N N N G N S Y G T G G K W N D N G V G Q N L A A I D W T K E N L T T F Q K V F Y K E S Q K I R T E E E I E E F Y R Q N H I S A K S P H G K V P D P F L S W T D T H F P Q Y I M N E V T H A K F E K P S P I Q S L A F P V V L S G H D L I G I A E T G S G K T L S F L L P S I V H I N A Q P T V K K G D G P I V L V L A P T R E L A M Q I E R E S E R F G K S S K L K C A C I Y G G A D K Y S Q R A L L Q Q G V D V V I A T P G R L I D F L E S E T T T L R R V T Y L V L D E A D R M L D M G F E I Q I R K I L G Q I R P D R Q T L M F S A T W P K N V Q N L A Q D Y C K N T P V Y V Q I G K H E L A I N E R I K Q I V Y V T D Q S K K I N Q L I K Q L D C L T Q K D K V L I F A Q T K K G C E S M S R I L N K E G F K C L A I H G D K A Q K D R D Y V M N K F K S G E C R I L I A T D V A S R G L D V K D V S H V F N Y D F P K V M E D Y V H R I G R T G R A G A Y G C A V S F L T F E D D K K I S R E Y V Q M L H D A K Q E I P I D L L D L A N P R Y R T Q Y K T V S S S Y Y D I K K F N S A D T S K P S E N Q N V S N T A N S S D K Y T S S S S Y N Q Y K S K K D E D D K R S R S R S P Y K S E N N N R W D K Y N R T K S P E Y R S S N G S S H Y N N V N K Y S S N S N N N S S S Y S K N Q S S T S S S S S Y G Q N N Q S S N L M S K P S S K F S A P T N G S Y T N G F S S V Q Q N S Q V Q N P F M P I N P L P Q P F M Y Q I P G F N G F P N Q G F N N F Y T G M V P P P P L P T G A P S Q Q Q N G F A Q N T T T S S >TTHERM_00569290(gene)ATG TGG GGA AAT AGC TAC AAT AAT AAT AGT TCT AGT AAT GGA TAC TCA AAT AAC AAA AGC AAC GGA TAT TCA AGC AGC AAT AAT AAT GGA AAC TCC TAT GGA ACC GGT GGC AAG TAA TAT TTC TAT TTC ACT TTT CTT AAA TTT TCT TAT CTC TCT TAG CTC CTT TTA GGC TAA GAG CTT AGC AAG ATA TTT AAA TCA AAG TCT GGG ACA ATG ATT TGA AAC ATT TCT ATT TAA AAA TTA GGT GGA ATG ATA ACG GAG TTG GTT AAA ATT TGG CTG CAA TCG ATT GGA CAA AAG AAA ATC TTA CTA CAT TTT AGA AAG TTT TTT ATA AGG AAA GTT AGA AAA TAA GAA CTG AAG AAG AAA TCG AAG AAT TTT ACC GCC AGA ACC ACA TCT CAG CCA AAT CAC CTC ATG GAA AAG TAC CTG ACC CTT TTT TAA GCT GGA CAG ATA CTC ACT TCC CTT AAT ATA TTA TGA ATG AAG TTA CTC ACG CTA AAT TTG AAA AAC CCT CTC CTA TTT AGT CTT TAG GTA TTG TTT GAT TGA ATT TAA ACC AAC AAA CCA ACC TAC GAT GGA ACA TTT TGA AAC ATA AAT AAA TAA ATA AAA ACC TAC ACA CAT AGT TTG TTT AAA ATA TAT TTG CAA AAA ATA AAC ATT TAA ACA AGC CAA TTT CTA CAC TTA GCA TAC AAA ATT CAA ATC ACA AAC GAG TGT GTG TAA TTT AAT TAA CAA TAT ATA TCA ATG CGG GAA TCA ATC AAT CAA TGT TAA GAA GAA GCC AAA GGT TAT TCC TTA AGA ATA AGC ATC GCT CAA TGT TTC CAA AGA GAC CAA TGT ATT TAT TCA ATA TGA ATC TAC TTG AAT AAA GGT GAA TTT ATT CTT TCT GAG GGA ATT ATT GAT CGA AGT GCT TAT CAT CCT CAT TCT TAA TAT TGT TTG TAC AGC AGA TTA TTA TCA GGA GGA GAA CGA AAT GGA TCC AAA AAA GAT AAT CAG AGC TGA ATG TAA CTG TAC TGT CAT TTA TCT TTT TGA TTC ATT TCA ATT CTC TTG AAA AAC TGC ATT TTC CCT TCA GAA TTT TGA TTT TCA AAT CAA TCA TCC ATT CTA TTT CAC ATT TCC ATC TTA AAA AAG AAA CAA TCA TCC CCG TCA TTT ATT TAT TCC TTA CAG CCA ACA AAT TTC ATT TAT AAA CTT ATA TTT ATT TTA ATA ATC CTT CAG TAT AAC CAT ATA ATT TGG CTT TTT TGC TAA ATT TTA AAC ACA AAT CAA TCA ATC AAT CAA AAA TAA ATT TAA ATA GGA TAG ACA GAT GTA TCA ATT TGC ATA TAT TTA AAA TAA ATA GCC TTT GCA AAT TTT CAA ATT TGC TTT ATT ATA TAA TTA ATT TGT CTA ATA ACT TTA ATC TAA TTT TTT TTT TTT TCA TTA TTG ATT GAT AGA GGA TTG ACA AAC AAA ATT ATC TTT TTT TTA AAC AAA TAA TGA AAT TTA CAA GAG TTT GAA AAA TCA AAT TCT AAA GGG AAA ATT ATT TTT ATC GCT CAA TAT TGT TTC TTT TCA TTA TAG ATT ATT TTA TCA AAA GCT CTA TTT ATT GGA AAA ATT TAC TTA CCA ATT TAT AGC TGA TTA ATA ATT ACT ACT CAC AAA TGA TTA AAT ATT TAT AAG TTT GAT TTT CCC TAA AAT TAA CTA GCA TTC CCT GTA GTC CTT AGT GGT CAC GAT TTG ATT GGT ATT GCA GAA ACA GGT AGT GGA AAA ACT CTT TCC TTC CTT TTA CCC TCA ATA GTT CAT ATT AAT GCT CAA CCA ACT GTC AAA AAG GGA GAT GGT CCT ATC GTC CTC GTT CTT GCT CCT ACT AGA GAA CTT GCT ATG CAA ATC GAA AGA GAG TCC GAA AGA TTT GGT AAA TCC TCT AAG CTT AAA TGT GCT TGT ATC TAT GGT GGT GCT GAC AAA TAC TCC TAA AGA GCA CTT CTC CAA TAA GGT GTA GAT GTA GTT ATT GCT ACT CCT GGT AAA TAT ATA TCA ACA TTT GAA CAC TTT TAA CCA ACT TTC AAA TAA ATT TCT TAA ATT AAA CTT TTT TTT AAT TTA AAT TAC AGG TAG ACT TAT TGA CTT TTT AGA AAG TGA AAC TAC TAC TTT ACG TAG AGT TAC TTA TCT CGT ATT AGA TGA AGC AGA TAG AAT GTT AGA TAT GGG TTT TGA AAT TTA AAT TAG AAA AAT CTT GGG TTA AAT TAG ACC TGA TCG TTA AAC ATT GAT GTT TTC TGC TAC CTG GCC TAA GAA TGT TTA GAA TCT TGC TTA AGA TTA TTG CAA GAA TAC TCC CGT TTA TGT TCA AAT CGG AAA ACA TGA ATT AGC TAT TAA CGA AAG AAT TAA ATA AAT TGT TTA TGT TAC AGA TCA ATC AAA GAA AAT CAA TCA GTA TTT AAA TAT TTT AAC AAT TAT TTT TTC AAT TAT CTA AAT ATT CTT TTT TAA TTA ATA GAC TTA TCA AGC AAT TAG ATT GTT TGA CTT AGA AAG ATA AAG TAT TGA TTT TCG CTT AAA CAA AGA AGG GAT GTG AAA GCA TGA GTC GTA TTT TGA ATA AAG AAG GAT TTA AGT GTC TTG CTA TCC ATG GTG ACA AAG CCT AAA AAG ACA GAG ACT ATG TTA TGA ACA AGT TCA AAA GCG GAG AAT GCA GAA TCC TTA TTG CTA CAG ACG TAG CCA GTA GAG GTT TGG ATG TTA AGG ATG TCT CCC ACG TAT TTA ATT ACG ATT TCC CAA AGG TTA TGG AAG ACT ATG TCC ATA GAA TCG GTA GAA CAG GTA GAG CTG GAG CAT ATG GTT GTG CAG TAT CTT TCC TTA CTT TTG AAG ATG ATA AAA AGA TAT CAA GGG AAT ATG TCC AAA TGC TTC ATG ACG CTA AGT AAG AAA TTC CCA TTG ATC TTC TTG ATC TTG CTA GTA TTA GTA ATT ATT TAT TAA TAT GAA TTC AAT TCT AAA TTT TTT ACT TAA ATA AAA TAG ATC CCA GAT ACA GAA CTT AAT ATA AAA CTG TTT CCT CTT CAT ACT ATG ATA TTA AGA AAT TTA ACA GTG CTG ATA CTT CAA AGC CTT CAG AAA ATC AGA ATG TTT CAA ATA CTG CAA ATA GCA GCG ACA AGT ACA CCA GCA GTA GCA GCT ACA ATT AAT ATA AAA GCA AAA AAG ATG AAG ATG ACA AGA GAA GTA GAA GTA GAA GTC CAT ATA AAT CTG AAA ATA ACA ACA GAT GGG ATA AAT ATA ATC GCA CAA AAA GCC CAG AAT ACC GCA GTT CTA ATG GAT CTT CTC ATT ATA ACA ACG TTA ACA AGT ATT CTT CAA ATT CTA ATA ATA ATT CAA GTT CAT ATT CAA AGA ATT AAT CCT CCA CAT CAT CAT CTT CTT CCT ATG GAT AGA ATA ATT AAT CAT CCA ATT TAA TGA GTA AAC CAT CTA GTA AAT TCT CTG CTC CTA CAA ATG GTA GTT ACA CAA ATG GAT TTT CTT CAG TCT AAT AAA ATT CTC AAG TTT AAA ATC CAT TTA TGC CAA TCA ATC CTT TAC CTC AAC CTT TTA TGT ACT AAA TTC CTG GAT TTA ATG GTT TCC CTA ATC AAG GTT TCA ATA ACT TTT ACA CTG GTA TGG TTC CTC CTC CTC CAC TCC CTA CTG GTG CTC CCT CAT AAT AAT AAA ATG GAT TTG CTT AAA ATA CAA CAA CAT CTT CTT GA
Login
Recent Activity
Recent Papers
Identifiers and Description
Gene Ontology Annotations 
Domains
Gene Expression Profile
Signal Peptide
Homologs (v.2006 protein sequences)
General Information 
Associated Literature 
Sequences
