Login
Recent Papers
Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00497660Standard Name
KAT3 (KATanin)Aliases
PreTt06931 | 62.m00215 | 3715.m00076Description
katanin p80 noncatalytic subunitGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
- Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.6%
TetraMine Data
TTHERM_00497660
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_12714.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (795 aa)
Oxytricha Contig8346.0.g10 2.0007467515522948e-59 WD domain, G-beta repeat
Stentor Coeruleus SteCoe_21826 1.0806392777072785e-30 SGD YCR072C 1.9994498063102785e-22 RSA4 WD-repeat protein involve
d in ribosome biogenesis; may
interact with ribosomes; requi
red for maturation and efficie
nt intra-nuclear transport or
pre-60S ribosomal subunits, lo
calizes to the nucleolus
DictyBase DDB_G0282189 3.0007793728221555e-22 tupA on chromosome: 3 position
5574241 to 5576373
WormBase WBGene00006474 4.001630327199692e-20 locus:wdr-5.1 WD repeat-cont
aining protein wdr-5.1 statu
s:Confirmed UniProt:Q17963
protein_id:CAA85487.1
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:17821280: Harrison JA, Fowler EH (1945) AN ANTIGEN-ANTIBODY REACTION WITH TETRAHYMENA WHICH RESULTS IN DYSTOMY. Science (New York, N.Y.) 102(2638):65-6
Sequences
>TTHERM_00497660(coding)
ATGAAGCGTAGGAATGCTAAGCTGATTGACTTTTAAAATAATCCTGGTTGTAAGATTTTA
ACTGCTAAATTTGGTAATTAGTCAAAATCAATTATTGCTTCTGGTGATGATAAAAATAAC
ATTTGTTTATGGAAATTCTCAAACGATATACCCATAAAAAAATTTGCTGGTTAAAATTAG
ACAAACCATTAAATAGAAACAACAGCTGTTTAATTTAACCATAGCGATAATATTTTATAT
ACTGGAACAAATAGAGGTATCATAAGTGTCTTGGATTTAGAAGCATAAAAATTAAGTCAT
ACTCTCAAGGGACATGGAGGCGGAATTAGTTCCTTAGCAATATTTCCTTATGAAGATTAA
AAAAATTTGTTGATATCTGGTTCAATGGATACTAATATTAAAATTTGGGATTTAAGAACT
AAAGAATGTGTTCACTAATTTAAGGGTCATACTATGCTAGTTAATTGCTTGGCAGGTTCT
CCTGATGGAAAAATGATAGCATCTGGTGGGTCAGATAGTTAAGTGAGGCTTTGGGATTAA
ACTACAGGAAAATGTTCTAATATATTTACACTACACGATGCATCAGTAACATGCTTATAA
TTTAATCCTGTAGAAATGGCTTTAGCAAGCGCAAGTGCTGATAGAACAGTGAAGTATTAT
GACTTAGATACTTATACTCTAATAAGCTAAACTAAGCCAGAGGCTACTAGCATCTAAAAA
ATTTTGTTTAACGTTGATGGAGATGTTCTATTTAGTGCAGCACATGAAAGTCTAAAAGTA
TGGAACCTAGATAAAGATGGATTGCTTCTTGATAATGTAGAGTCTTAATGGAGAGGAATC
ATGGATATGTAAATTTCAGAGAATGAAGATAATATAATTGGCGTTACTTCATATTAATAA
AACTTTGCTTTATGGGTATGCCCTTTAAAATTAATAAATATGGATTCTTCTGAGCAAGCT
ATCAATAATTAACTAAACAGAGTAAAAACAGGTTAATAAAATAATTCTAATAATCCTCCT
TAAAGAAACTTCTTACCATAAATAGACCCCATAAAAGGAAAATCTCCTCCTACGGATGAT
AATACATACGCTAAAATTCATAGCCCAGAAAACCATCTTCCTGGAAACTAAAGATCATAT
TCAGAAATGCATTCAAATAATTATTAGAACAACTAAGATTATCAGTATTTAAATTAAGGA
TATCAAAATACTCCTCAAATATTGCAAACTAAAGTAGAGAGCTATCCTAATTTACCATAA
ATAAATAATAACAGTGTCCATCATAATCTACCAAACTAATATGGGTATGCAAAATAATAA
TCTTAAGAATAGTTTGGTTACCCTAATTAATAGTAGGTCACAAACCAAAATATGCTTCCT
CCAACAAAGAGCCCTTAAATCATTAATGCAGTAATTCACAATTAGTACTCAAACGATGAT
TAAATGTTAAATAAAAAGAAAATTGTTGAATAAGAAGAAGATGAACACATAAATGAAGCA
ATAATTAACAAATAATTTGAAGAACTCAACAACTAATCAAGAATTTATAATTAAATTCTT
CCTCCAAAAGAATAAATTAAAATTGAATCCAACCTAAGCTCCTAATCTTCAAAAGAGGAA
ATTGAAGAAGAAATAGAAACATAAGAAAATAATAAAAAACAAAAACCCAAACCTCAATCA
CACGATGCTGTTGATAGAAATTTTGTGTAACCTTAATCATCAGGAGAGTAGCCCTTAGAT
TAGTCAAGTCTATCTATAGTAGATTCAATAGCTTAAAGCTTTCATTTGAATGCTGTTTTT
GATTAATAGTAATAATAATTACTAAAGCAAACTGAATTTATTGGCGATATCTCCAAAGAA
CATCAAAAATTTTTGATACTCATGAATAATAGATTAAACTATGTAAAGCCAATATAACAT
TGGTGGAATTAGGGAAATTCAAAATCATCTTTATATGCAATAAGTTAATTATATGATCCT
TGTTATGTTATGGATGCTCTATAAATGACATTAAATATGAATAAATTATAATACGTAAAT
GTTGAAGGTGTTGGAACTTTACTCTAAAAATGCAAAATCTTGATTGAAAGCAAATATTAG
TCGCATATTAAATTTGGTTTAGAATTTGTAAAGAAGATATTAGAATAATACAGAGATGAA
TTAATTAATGTGAAGACTTTTTCATTAATGAGCAAGGTAGATTTAGCAAGAGAGGAAAGA
ATAAAAAAGTATAACTCATTGATAGATGAGTTAAGGTCTATCTAAAAAATTTCAAGAATA
AAAAAAATAGTTGAACGCAAAGCTAAAGAAGATATTGGTCAGCTAGCTAATTTAGTATTG
ACAGATTTGAATTATCTTTTCGGTAAATTAGACAATGCAGCTCAGTAAGTTTGA>TTHERM_00497660(protein)
MKRRNAKLIDFQNNPGCKILTAKFGNQSKSIIASGDDKNNICLWKFSNDIPIKKFAGQNQ
TNHQIETTAVQFNHSDNILYTGTNRGIISVLDLEAQKLSHTLKGHGGGISSLAIFPYEDQ
KNLLISGSMDTNIKIWDLRTKECVHQFKGHTMLVNCLAGSPDGKMIASGGSDSQVRLWDQ
TTGKCSNIFTLHDASVTCLQFNPVEMALASASADRTVKYYDLDTYTLISQTKPEATSIQK
ILFNVDGDVLFSAAHESLKVWNLDKDGLLLDNVESQWRGIMDMQISENEDNIIGVTSYQQ
NFALWVCPLKLINMDSSEQAINNQLNRVKTGQQNNSNNPPQRNFLPQIDPIKGKSPPTDD
NTYAKIHSPENHLPGNQRSYSEMHSNNYQNNQDYQYLNQGYQNTPQILQTKVESYPNLPQ
INNNSVHHNLPNQYGYAKQQSQEQFGYPNQQQVTNQNMLPPTKSPQIINAVIHNQYSNDD
QMLNKKKIVEQEEDEHINEAIINKQFEELNNQSRIYNQILPPKEQIKIESNLSSQSSKEE
IEEEIETQENNKKQKPKPQSHDAVDRNFVQPQSSGEQPLDQSSLSIVDSIAQSFHLNAVF
DQQQQQLLKQTEFIGDISKEHQKFLILMNNRLNYVKPIQHWWNQGNSKSSLYAISQLYDP
CYVMDALQMTLNMNKLQYVNVEGVGTLLQKCKILIESKYQSHIKFGLEFVKKILEQYRDE
LINVKTFSLMSKVDLAREERIKKYNSLIDELRSIQKISRIKKIVERKAKEDIGQLANLVL
TDLNYLFGKLDNAAQQV>TTHERM_00497660(gene)
ATGAAGCGTAGGAATGCTAAGCTGAGTAAATTTTAACTTCTTTTTTCTAAAAATATTTAC
AAGCATCCTTCAATTCAGATTCATTTTAAAAAACATGAATTTGATTGACTAATAAAAATG
AAAAATCATATTTTTTAATGACTGAAGAAGGTTTAGTTTATAGAATGGCATTTAAAAATA
TTGTTAAAATAATTAATGCATATATTTCATAATATTTTTGTTTTTAGTTGACTTTTAAAA
TAATCCTGGTTGTAAGATTTTAACTGCTAAATTTGGTAATTAGTCAAAATCAATTATTGC
TTCTGGTGATGATAAAAATAACATTTGTTTATGGAAATTCTCAAACGATATACCCATAAA
AGTAAAATCTAATCAATAATTTTAATAGCTAGCCATTTAATTTAAATTTAATTTTAAATA
ATTCGTAGAAATTTGCTGGTTAAAATTAGACAAACCATTAAATAGAAACAACAGCTGTTT
AATTTAACCATAGCGATAATATTTTATATACTGGAACAAATAGAGGTATCATAAGTGTCT
TGGATTTAGAAGCATAAAAATGTATAAAACTAGATTTTGTTACAAAAATTGTTTGCATAA
ACCTATTATTATTTTGAATAGTAAGTCATACTCTCAAGGGACATGGAGGCGGAATTAGTT
CCTTAGCAATATTTCCTTATGAAGATTAAAAAAATTTGTTGATATCTGGTTCAATGGATA
CTAATATTAAAATTTGGGATTTAAGAACTAAAGAATGTGTTCACTAATTTAAGGGTCATA
CTATGCTAGTTAATTGCTTGGCAGGTTCTCCTGATGGAAAAATGATAGCATCTGGTGGGT
CAGATAGTTAAGTGAGGGTATACTAATTCGCATTTATTAACTTAGCTAATTAACTTTAAA
ATTAATAATTTATTAAAAGCTTTGGGATTAAACTACAGGAAAATGTTCTAATATATTTAC
ACTACACGATGCATCAGTAACATGCTTATAATTTAATCCTGTAGAAATGGCTTTAGCAAG
CGCAAGTGCTGATAGAACAGTGAAGTATTATGACTTAGATACTTATACTCTAGTAAATAT
ATATTTATGAAAAAAGTATTTACAATATTGATATTAATTAGATAAGCTAAACTAAGCCAG
AGGCTACTAGCATCTAAAAAATTTTGTTTAACGTTGATGGAGATGTTCTATTTAGTGCAG
CACATGAAAGTCTAAAAGTAAATTAAAAGTTGCCATTTTAAAGAATGAAAAACTAGTTAA
TTAATTAAAATTTAATTAGGTATGGAACCTAGATAAAGATGGATTGCTTCTTGATAATGT
AGAGTCTTAATGGAGAGGAATCATGGATATGTAAATTTCAGAGAATGAAGATAATATAAT
TGGCGTTACTTCATATTAATAAAACTTTGCTTTATGGGTATGCCCTTTAAAATTAATAAA
TATGGATTCTTCTGAGCAAGCTATCAATAATTAACTAAACAGAGTAAAAACAGGTTAATA
AAATAATTCTAATAATCCTCCTTAAAGAAACTTCTTACCATAAATAGACCCCATAAAAGG
AAAATCTCCTCCTACGGATGATAATACATACGCTAAAATTCATAGCCCAGAAAACCATCT
TCCTGGAAACTAAAGATCATATTCAGAAATGCATTCAAATAATTATTAGAACAACTAAGA
TTATCAGTATTTAAATTAAGGATATCAAAATACTCCTCAAATATTGCAAACTAAAGTAGA
GAGCTATCCTAATTTACCATAAATAAATAATAACAGTGTCCATCATAATCTACCAAACTA
ATATGGGTATGCAAAATAATAATCTTAAGAATAGTTTGGTTACCCTAATTAATAGTAGGT
CACAAACCAAAATATGCTTCCTCCAACAAAGAGCCCTTAAATCATTAATGCAGTAATTCA
CAATTAGTACTCAAACGATGATTAAATGTTAAATAAAAAGAAAATTGTTGAATAAGAAGA
AGATGAACACATAAATGAAGCAATAATTAACAAATAATTTGAAGAACTCAACAACTAATC
AAGAATTTATAATTAAATTCTTCCTCCAAAAGAATAAATTAAAATTGAATCCAACCTAAG
CTCCTAATCTTCAAAAGAGGAAATTGAAGAAGAAATAGAAACATAAGAAAATAATAAAAA
ACAAAAACCCAAACCTCAATCACACGATGCTGTTGATAGAAATGTAATAATTTAAATTAT
CTTAAAACAATTTTATTATTATCATTTTATAATTTTTAAAATTAATTATTTATTTCTATT
TTATACAATCAAGTTTGTGTAACCTTAATCATCAGGAGAGTAGCCCTTAGATTAGTCAAG
TCTATCTATAGTAGATTCAATAGCTTAAAGCTTTCATTTGAATGCTGTTTTTGATTAATA
GTAATAATAATTACTAAAGCAAACTGAATTTATTGGCGATGTAATTGTTTTAGAATTTTA
TTAATTTAATTAAACTGTTTTTTTTAACTAAGATCTCCAAAGAACATCAAAAATTTTTGA
TACTCATGAATAATAGATTAAACTATGTAAAGCCAATATAACATTGGTGGAATTAGGGAA
ATTCAAAATCATCTTTATATGCAATAAGTTAGTAAAATATATTTTTTGTTTTAAAATAAC
TGAGAATTTGGATTTTTTTAAAATTGAATTTATATTTTTTGAAAAAAATGAACACATTTT
TTCAAATTGAGATGTTTGAATCTAATATTTATAATAATTTAGATTATATGATCCTTGTTA
TGTTATGGATGCTCTATAAATGACATTAAATATGAATAAATTATAATACGTAAATGTTGA
AGGTGTTGGAACTTTACTCTAAAAATGCAAAATCTTGATTGAAAGCAAATATTAGGTAAA
TTTGTATTAAAAATGATGAAATTTAACAAATTGTATAATTAAATTAAAGTCGCATATTAA
ATTTGGTTTAGAATTTGTAAAGAAGATATTAGAATAATACAGAGATGTAATTTTATTTAA
TTATATTATGTAAATTTATATCGTTTCTTGTAAAGGAATTAATTAATGTGAAGACTTTTT
CATTAATGAGCAAGGTAGATTTAGCAAGAGAGGAAAGAATAAAAAAGTATAACTCATTGA
TAGATGAGTTAAGGTCTATCTAAAAAATTTCAAGAATAAAAAAAATAGTTGAACGCAAAG
CTAAAGAAGATGTAAATCAATTTCATTAAAAATTTAATCCACTAATTGAATAAATAAATA
AATAGATTGGTCAGCTAGCTAATTTAGTATTGACAGATTTGAATTATCTTTTCGGTAAAT
TAGACAATGCAGCTCAGTAAGTTTGA
