Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00497660

Standard Name

KAT3 (KATanin 3)

Aliases

PreTt06931 | 62.m00215 | 3715.m00076

Description

Katanin p80 noncatalytic subunit

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• ciliary basal body (IDA) | GO:0036064 | Ref:27726198

Domains

• ( PF01344 ) kelch repeat protein
• ( PF00400 ) WD domain, G-beta repeat

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.6%

TetraMine Data

TTHERM_00497660

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_12714.1	9.997093137033517e-262	hypothetical protein (795 aa)
Oxytricha	Contig8346.0.g10	2.0007467515522948e-59	WD domain, G-beta repeat
Stentor Coeruleus	SteCoe_21826	1.0806392777072785e-30
SGD	YCR072C	1.9994498063102785e-22	RSA4 WD-repeat protein involve d in ribosome biogenesis; may interact with ribosomes; requi red for maturation and efficie nt intra-nuclear transport or pre-60S ribosomal subunits, lo calizes to the nucleolus
DictyBase	DDB_G0282189	3.0007793728221555e-22	tupA on chromosome: 3 position 5574241 to 5576373
WormBase	WBGene00006474	4.001630327199692e-20	locus:wdr-5.1 WD repeat-cont aining protein wdr-5.1 statu s:Confirmed UniProt:Q17963 protein_id:CAA85487.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:27726198: Waclawek E, Joachimiak E, Hall MH, Fabczak H, Wloga D (2017) Regulation of katanin activity in the ciliate Tetrahymena thermophila. Molecular microbiology 103(1):134-150
2. Ref:17821280: Harrison JA, Fowler EH (1945) AN ANTIGEN-ANTIBODY REACTION WITH TETRAHYMENA WHICH RESULTS IN DYSTOMY. Science (New York, N.Y.) 102(2638):65-6

Sequences

>TTHERM_00497660(coding)
ATGAAGCGTAGGAATGCTAAGCTGATTGACTTTTAAAATAATCCTGGTTGTAAGATTTTA
ACTGCTAAATTTGGTAATTAGTCAAAATCAATTATTGCTTCTGGTGATGATAAAAATAAC
ATTTGTTTATGGAAATTCTCAAACGATATACCCATAAAAAAATTTGCTGGTTAAAATTAG
ACAAACCATTAAATAGAAACAACAGCTGTTTAATTTAACCATAGCGATAATATTTTATAT
ACTGGAACAAATAGAGGTATCATAAGTGTCTTGGATTTAGAAGCATAAAAATTAAGTCAT
ACTCTCAAGGGACATGGAGGCGGAATTAGTTCCTTAGCAATATTTCCTTATGAAGATTAA
AAAAATTTGTTGATATCTGGTTCAATGGATACTAATATTAAAATTTGGGATTTAAGAACT
AAAGAATGTGTTCACTAATTTAAGGGTCATACTATGCTAGTTAATTGCTTGGCAGGTTCT
CCTGATGGAAAAATGATAGCATCTGGTGGGTCAGATAGTTAAGTGAGGCTTTGGGATTAA
ACTACAGGAAAATGTTCTAATATATTTACACTACACGATGCATCAGTAACATGCTTATAA
TTTAATCCTGTAGAAATGGCTTTAGCAAGCGCAAGTGCTGATAGAACAGTGAAGTATTAT
GACTTAGATACTTATACTCTAATAAGCTAAACTAAGCCAGAGGCTACTAGCATCTAAAAA
ATTTTGTTTAACGTTGATGGAGATGTTCTATTTAGTGCAGCACATGAAAGTCTAAAAGTA
TGGAACCTAGATAAAGATGGATTGCTTCTTGATAATGTAGAGTCTTAATGGAGAGGAATC
ATGGATATGTAAATTTCAGAGAATGAAGATAATATAATTGGCGTTACTTCATATTAATAA
AACTTTGCTTTATGGGTATGCCCTTTAAAATTAATAAATATGGATTCTTCTGAGCAAGCT
ATCAATAATTAACTAAACAGAGTAAAAACAGGTTAATAAAATAATTCTAATAATCCTCCT
TAAAGAAACTTCTTACCATAAATAGACCCCATAAAAGGAAAATCTCCTCCTACGGATGAT
AATACATACGCTAAAATTCATAGCCCAGAAAACCATCTTCCTGGAAACTAAAGATCATAT
TCAGAAATGCATTCAAATAATTATTAGAACAACTAAGATTATCAGTATTTAAATTAAGGA
TATCAAAATACTCCTCAAATATTGCAAACTAAAGTAGAGAGCTATCCTAATTTACCATAA
ATAAATAATAACAGTGTCCATCATAATCTACCAAACTAATATGGGTATGCAAAATAATAA
TCTTAAGAATAGTTTGGTTACCCTAATTAATAGTAGGTCACAAACCAAAATATGCTTCCT
CCAACAAAGAGCCCTTAAATCATTAATGCAGTAATTCACAATTAGTACTCAAACGATGAT
TAAATGTTAAATAAAAAGAAAATTGTTGAATAAGAAGAAGATGAACACATAAATGAAGCA
ATAATTAACAAATAATTTGAAGAACTCAACAACTAATCAAGAATTTATAATTAAATTCTT
CCTCCAAAAGAATAAATTAAAATTGAATCCAACCTAAGCTCCTAATCTTCAAAAGAGGAA
ATTGAAGAAGAAATAGAAACATAAGAAAATAATAAAAAACAAAAACCCAAACCTCAATCA
CACGATGCTGTTGATAGAAATTTTGTGTAACCTTAATCATCAGGAGAGTAGCCCTTAGAT
TAGTCAAGTCTATCTATAGTAGATTCAATAGCTTAAAGCTTTCATTTGAATGCTGTTTTT
GATTAATAGTAATAATAATTACTAAAGCAAACTGAATTTATTGGCGATATCTCCAAAGAA
CATCAAAAATTTTTGATACTCATGAATAATAGATTAAACTATGTAAAGCCAATATAACAT
TGGTGGAATTAGGGAAATTCAAAATCATCTTTATATGCAATAAGTTAATTATATGATCCT
TGTTATGTTATGGATGCTCTATAAATGACATTAAATATGAATAAATTATAATACGTAAAT
GTTGAAGGTGTTGGAACTTTACTCTAAAAATGCAAAATCTTGATTGAAAGCAAATATTAG
TCGCATATTAAATTTGGTTTAGAATTTGTAAAGAAGATATTAGAATAATACAGAGATGAA
TTAATTAATGTGAAGACTTTTTCATTAATGAGCAAGGTAGATTTAGCAAGAGAGGAAAGA
ATAAAAAAGTATAACTCATTGATAGATGAGTTAAGGTCTATCTAAAAAATTTCAAGAATA
AAAAAAATAGTTGAACGCAAAGCTAAAGAAGATATTGGTCAGCTAGCTAATTTAGTATTG
ACAGATTTGAATTATCTTTTCGGTAAATTAGACAATGCAGCTCAGTAAGTTTGA

>TTHERM_00497660(protein)
MKRRNAKLIDFQNNPGCKILTAKFGNQSKSIIASGDDKNNICLWKFSNDIPIKKFAGQNQ
TNHQIETTAVQFNHSDNILYTGTNRGIISVLDLEAQKLSHTLKGHGGGISSLAIFPYEDQ
KNLLISGSMDTNIKIWDLRTKECVHQFKGHTMLVNCLAGSPDGKMIASGGSDSQVRLWDQ
TTGKCSNIFTLHDASVTCLQFNPVEMALASASADRTVKYYDLDTYTLISQTKPEATSIQK
ILFNVDGDVLFSAAHESLKVWNLDKDGLLLDNVESQWRGIMDMQISENEDNIIGVTSYQQ
NFALWVCPLKLINMDSSEQAINNQLNRVKTGQQNNSNNPPQRNFLPQIDPIKGKSPPTDD
NTYAKIHSPENHLPGNQRSYSEMHSNNYQNNQDYQYLNQGYQNTPQILQTKVESYPNLPQ
INNNSVHHNLPNQYGYAKQQSQEQFGYPNQQQVTNQNMLPPTKSPQIINAVIHNQYSNDD
QMLNKKKIVEQEEDEHINEAIINKQFEELNNQSRIYNQILPPKEQIKIESNLSSQSSKEE
IEEEIETQENNKKQKPKPQSHDAVDRNFVQPQSSGEQPLDQSSLSIVDSIAQSFHLNAVF
DQQQQQLLKQTEFIGDISKEHQKFLILMNNRLNYVKPIQHWWNQGNSKSSLYAISQLYDP
CYVMDALQMTLNMNKLQYVNVEGVGTLLQKCKILIESKYQSHIKFGLEFVKKILEQYRDE
LINVKTFSLMSKVDLAREERIKKYNSLIDELRSIQKISRIKKIVERKAKEDIGQLANLVL
TDLNYLFGKLDNAAQQV

>TTHERM_00497660(gene)
ATGAAGCGTAGGAATGCTAAGCTGAGTAAATTTTAACTTCTTTTTTCTAAAAATATTTAC
AAGCATCCTTCAATTCAGATTCATTTTAAAAAACATGAATTTGATTGACTAATAAAAATG
AAAAATCATATTTTTTAATGACTGAAGAAGGTTTAGTTTATAGAATGGCATTTAAAAATA
TTGTTAAAATAATTAATGCATATATTTCATAATATTTTTGTTTTTAGTTGACTTTTAAAA
TAATCCTGGTTGTAAGATTTTAACTGCTAAATTTGGTAATTAGTCAAAATCAATTATTGC
TTCTGGTGATGATAAAAATAACATTTGTTTATGGAAATTCTCAAACGATATACCCATAAA
AGTAAAATCTAATCAATAATTTTAATAGCTAGCCATTTAATTTAAATTTAATTTTAAATA
ATTCGTAGAAATTTGCTGGTTAAAATTAGACAAACCATTAAATAGAAACAACAGCTGTTT
AATTTAACCATAGCGATAATATTTTATATACTGGAACAAATAGAGGTATCATAAGTGTCT
TGGATTTAGAAGCATAAAAATGTATAAAACTAGATTTTGTTACAAAAATTGTTTGCATAA
ACCTATTATTATTTTGAATAGTAAGTCATACTCTCAAGGGACATGGAGGCGGAATTAGTT
CCTTAGCAATATTTCCTTATGAAGATTAAAAAAATTTGTTGATATCTGGTTCAATGGATA
CTAATATTAAAATTTGGGATTTAAGAACTAAAGAATGTGTTCACTAATTTAAGGGTCATA
CTATGCTAGTTAATTGCTTGGCAGGTTCTCCTGATGGAAAAATGATAGCATCTGGTGGGT
CAGATAGTTAAGTGAGGGTATACTAATTCGCATTTATTAACTTAGCTAATTAACTTTAAA
ATTAATAATTTATTAAAAGCTTTGGGATTAAACTACAGGAAAATGTTCTAATATATTTAC
ACTACACGATGCATCAGTAACATGCTTATAATTTAATCCTGTAGAAATGGCTTTAGCAAG
CGCAAGTGCTGATAGAACAGTGAAGTATTATGACTTAGATACTTATACTCTAGTAAATAT
ATATTTATGAAAAAAGTATTTACAATATTGATATTAATTAGATAAGCTAAACTAAGCCAG
AGGCTACTAGCATCTAAAAAATTTTGTTTAACGTTGATGGAGATGTTCTATTTAGTGCAG
CACATGAAAGTCTAAAAGTAAATTAAAAGTTGCCATTTTAAAGAATGAAAAACTAGTTAA
TTAATTAAAATTTAATTAGGTATGGAACCTAGATAAAGATGGATTGCTTCTTGATAATGT
AGAGTCTTAATGGAGAGGAATCATGGATATGTAAATTTCAGAGAATGAAGATAATATAAT
TGGCGTTACTTCATATTAATAAAACTTTGCTTTATGGGTATGCCCTTTAAAATTAATAAA
TATGGATTCTTCTGAGCAAGCTATCAATAATTAACTAAACAGAGTAAAAACAGGTTAATA
AAATAATTCTAATAATCCTCCTTAAAGAAACTTCTTACCATAAATAGACCCCATAAAAGG
AAAATCTCCTCCTACGGATGATAATACATACGCTAAAATTCATAGCCCAGAAAACCATCT
TCCTGGAAACTAAAGATCATATTCAGAAATGCATTCAAATAATTATTAGAACAACTAAGA
TTATCAGTATTTAAATTAAGGATATCAAAATACTCCTCAAATATTGCAAACTAAAGTAGA
GAGCTATCCTAATTTACCATAAATAAATAATAACAGTGTCCATCATAATCTACCAAACTA
ATATGGGTATGCAAAATAATAATCTTAAGAATAGTTTGGTTACCCTAATTAATAGTAGGT
CACAAACCAAAATATGCTTCCTCCAACAAAGAGCCCTTAAATCATTAATGCAGTAATTCA
CAATTAGTACTCAAACGATGATTAAATGTTAAATAAAAAGAAAATTGTTGAATAAGAAGA
AGATGAACACATAAATGAAGCAATAATTAACAAATAATTTGAAGAACTCAACAACTAATC
AAGAATTTATAATTAAATTCTTCCTCCAAAAGAATAAATTAAAATTGAATCCAACCTAAG
CTCCTAATCTTCAAAAGAGGAAATTGAAGAAGAAATAGAAACATAAGAAAATAATAAAAA
ACAAAAACCCAAACCTCAATCACACGATGCTGTTGATAGAAATGTAATAATTTAAATTAT
CTTAAAACAATTTTATTATTATCATTTTATAATTTTTAAAATTAATTATTTATTTCTATT
TTATACAATCAAGTTTGTGTAACCTTAATCATCAGGAGAGTAGCCCTTAGATTAGTCAAG
TCTATCTATAGTAGATTCAATAGCTTAAAGCTTTCATTTGAATGCTGTTTTTGATTAATA
GTAATAATAATTACTAAAGCAAACTGAATTTATTGGCGATGTAATTGTTTTAGAATTTTA
TTAATTTAATTAAACTGTTTTTTTTAACTAAGATCTCCAAAGAACATCAAAAATTTTTGA
TACTCATGAATAATAGATTAAACTATGTAAAGCCAATATAACATTGGTGGAATTAGGGAA
ATTCAAAATCATCTTTATATGCAATAAGTTAGTAAAATATATTTTTTGTTTTAAAATAAC
TGAGAATTTGGATTTTTTTAAAATTGAATTTATATTTTTTGAAAAAAATGAACACATTTT
TTCAAATTGAGATGTTTGAATCTAATATTTATAATAATTTAGATTATATGATCCTTGTTA
TGTTATGGATGCTCTATAAATGACATTAAATATGAATAAATTATAATACGTAAATGTTGA
AGGTGTTGGAACTTTACTCTAAAAATGCAAAATCTTGATTGAAAGCAAATATTAGGTAAA
TTTGTATTAAAAATGATGAAATTTAACAAATTGTATAATTAAATTAAAGTCGCATATTAA
ATTTGGTTTAGAATTTGTAAAGAAGATATTAGAATAATACAGAGATGTAATTTTATTTAA
TTATATTATGTAAATTTATATCGTTTCTTGTAAAGGAATTAATTAATGTGAAGACTTTTT
CATTAATGAGCAAGGTAGATTTAGCAAGAGAGGAAAGAATAAAAAAGTATAACTCATTGA
TAGATGAGTTAAGGTCTATCTAAAAAATTTCAAGAATAAAAAAAATAGTTGAACGCAAAG
CTAAAGAAGATGTAAATCAATTTCATTAAAAATTTAATCCACTAATTGAATAAATAAATA
AATAGATTGGTCAGCTAGCTAATTTAGTATTGACAGATTTGAATTATCTTTTCGGTAAAT
TAGACAATGCAGCTCAGTAAGTTTGA