Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00527110
Standard Name
KAP104 (KAryoPherin 1)
Aliases
PreTt06443 | 66.m00242 | 3722.m00099
Description
KAP104 importin-beta amine-terminal domain protein; Transportin or cytosolic karyopherin beta 2
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function Biological Process
Domains
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.7%
TetraMine Data
TTHERM_00527110
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_13438.1 9.997093137033517e-262 importin-beta domain-containin
g protein (911 aa)
WormBase WBGene00002076 5.0023264312997875e-87 locus:imb-2 status:Partially
_confirmed UniProt:O62332
protein_id:CAB05586.1
Oxytricha Contig15383.0.g27 4.0017545581927916e-85 HEAT repeats
SGD YBR017C 6.998168281769004e-37 KAP104 Transportin or cytosoli
c karyopherin beta 2; function
s in the rg-nuclear localizati
on signal-mediated nuclear imp
ort/reimport of mRNA-binding p
roteins Nab2p and Hrp1p; regul
ates asymmetric protein synthe
sis in daughter cells during m
itosis
DictyBase DDB_G0269948 9.99893167504554e-35 tnpo on chromosome: 1 position
3916816 to 3919967
Stentor Coeruleus SteCoe_10484 1.2995814250075031e-24
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:18676955 : Malone CD, Falkowska KA, Li AY, Galanti SE, Kanuru RC, LaMont EG, Mazzarella KC, Micev AJ, Osman MM, Piotrowski NK, Suszko JW, Timm AC, Xu MM, Liu L, Chalker DL (2008) Nucleus-specific importin alpha proteins and nucleoporins regulate protein import and nuclear division in the binucleate Tetrahymena thermophila. Eukaryotic cell 7(9):1487-99
Sequences
>TTHERM_00527110(coding)ATG TTT TAG CCT GAT ATT GCA ACA CTT CAA TAA GTT GCT TAG CTC TTA TAG CAA GGC AAG TTA GCT GAC AAT CAA TAG CAA AAA GAA GTA TAT CAA AAA ATA GAG GAA TAT TCT AAG TCC CCT GAA TTT TAT AAT TAC TTA TCC TAC ATT TTG GCT GCA TAA AAC AAC CAA ATT TAG CTT GAG ATT CGT CAT ATG GCT GGT GTT ACA TTA AAG TCG TTA GTA GAG AGA AAT TTT GAG CAT ATT CCT GAA CAA AAT ATC TAG TTC ATT AAG CAA AAC TTG TTC TAG TCA TTT AAC GAT TAA TAA AAA GCC ATT AGA AGC GCT ATA GGT ACT TTG ATG ACC ACT ATA ATT TAC AAG GGA GGA TTT TAA AAA TGG CCA GAA TTG ATT GAG TTT ATG ATC TAA AAC TTA GAG TCC ACA GAC CAA GGT GCT ATT ATT AAC AGT ATA GAT TGC ATT TCT AAA ATC GTA GAA GAT TTA AGA GTA AAC TCT GAA AAT TAT GCA TTT TTA GAT TCT TCA AAG GGA GGA TCT TAG CTC AAC GTT TTG ATT CCT AAA CTT TTT TCC TTC TGT GAT CCA AAA TAT GGT ACA GAA ATA CAA TCA AAC GCT ATC CAC ACA TTG AAC TTA TGC GTT TAA CCA ATG CCT GCT GCT TTG GCA GAA AAT TTA GAT CAA TAT TTA TAG ATC CTC CTA AGC AAC GTA TAA AAC AGT GAA AAG AGT ATC AGA CAA AGA GCT TTC CAA GGA ATT ACA GCA TTA ACT GAA ATA AGA AGA GAC GCA ATA ATG AAA AGA ATA AAT CAA GTC ATT CAA TCA ATC ATT ATT GGT AGT TAA GAT GCT GAA TAT GAT GTT GCT AAA AGT GCC TGC AAC TTC TGG TTT GAA TAT CTT GGT ATG GAA TAA AGT CCA GAA GAC ATA TAA CAA AGT ATG AAA TGT GTT TAA CCA TAC TTA AAA GAT TTG CTT CCT GCT TTA TTG AAG GGT CTT TAA TAC ACT GAC GAT GAT TTA ATG AAT ATT TTG CCT AGC ACA TAA AAC ATA AAT AAT AGA CCT GAA ATT TCA GAA GTA GGT GAC ATT GAT GAT TGT GAT TTT GAT GAA AAT GAG AAT TAA TAT GAT TTT GAA GGA AAT GAT AAT GAG AGA GAA ACA AAC GAT TAT GGT GAG TAC ACA TTG AGA AAA GTT TGT GGA AGA ATT ATA TAA AAA TTT TCA TAG CAA TTT AGA GAT GAC GTT TTC CAA ATT TTA TAA CCT TTA ATT GAG CAA TGC TTC TAG AGC AAC GAT TGG AAA ATA AAA GAA GTT GGC ATA ATT TGT TTA GGC GAT ATT TCT GAA GGA AGC ATT AAT TCT GTT TAG GTA CAT TTA GGA AAT ATA ATT CCT TCA TTG ATA TAG TTG TTC AAT GTT CCT GGA TAA AAT TAT CTC CTT CAA ACC TCA ATT ATG TGG ACC ATT TGT TAG TAT AGA AGC TGG TTG ATT GAC AAC TAC AAT TAA TAT TTC GAT GTA ATC AAA AGC TAT TTG TAA TGC ATG GCT TTC GGA ATC ACT CAC TAA ATG CAA CAC TTG TAA GAG TGT TCT TGC CAG TGC TTA AAG GAT TTT GTA GAT AAT GGA TCT ATG ATT CTT AGA CCA TAC TTG CAC GAT TTC ATT AAA GTT GTT ACT GAA GCA ATT AAA GTT TAT TAA AAC AGC AAT TTA AAT ATG CTT TTA GAT GCT GTG TGC ACT ATT GTT AGT ACC ATG TAA GAA GAA GTG AAT ACT CCA GAA GTC CTC CAA ACA CTA CTT CCA CCT ATC CTT GAA AAA TGG GGA TAA CTC AAA TCA ACT GAT ATT GCT ATA AAA GGA TTT GCA GAA TGC TTC TCT CTT CTT GCT CAA GAA TTA GAA TCC AAT TTC TTA ATC TAT ACC GAA TAC ATT TAT CCT AAA TGC TTT GAA ATG TTA CAA AAT TAT GTC ATA GCT TTA AAC ACA GAA AGT AAA GAT AGA AAA CAT ATT AAT TAA AAG AAG TAA ATA TTC CTT ATG GGT ACC GAT CTC ATG AGC AGC ATA GTC TAT TGC ACA AAA TAA AAC TTT GCT CTC CTT GCT CAA CAT ACA GAT TTA AAC TCT ATA ATT ATT AAT ACA ATA GAT TCT TAA GAC AGT GAG GTT AGA TCT TTC ATA TTC ACC TTG ATA AGT GAA ATT TCA ATC CAT TGT CCA AAC TAT ATT GCA TAA AAA GTA GAG ATA TAT ACT CAA ATG ATA TCT TAG CAT GTT ATT CTT TTC CCA CAT TCC CTA GAT CCC GGT AAT TAT TAC TTG AAT ACT TGC AAT AAT GCT GTA CTT TGT CTC AAC TAA TTA TGC ATT AGT TAT CCT GAA ATA ATG AAA CCT TAT GCT TAC CAA ATA GCT TTA AAA ATA ATT AAA ATT TTA GAA GAA ACC AAA AAA ATG GTT ATT GAT GTA GCC AGA AAT GTA TGT TGC TCT TTA TGC TCC ATA GCA TTA CTT GAT TAC TAA AAC GTT AGT TAA CAT CTT TCT AGT TTC GTC TAA AAA TTC TGT CTT AGT GTG AGA TAA TAC AAT GGA TAA TAA AAG AGA AGA GCT TTT GAG GGT TTA TTC AAA ATG GCA TTC CAC AAT CCT AAT GGT ATC ATT AAT TAT ATG AGC TAC ATT GTT GAT TCT TTC ATA AGA TAC TAA AAC CCT CCA TAG GAG TTG AAA TTG TAA TTC AAG ACT CTG TTG ATC GAA TAT AAA AAA ACT CTT AAC GAT GAA CAG TGG TAA AAC TTC CTT TTG AAC AGT AAT TTC GAC TAA ATA GTT ATC AAA AAC TTA ATT TAG CAA TAC CTT TCT TGA >TTHERM_00527110(protein)M F Q P D I A T L Q Q V A Q L L Q Q G K L A D N Q Q Q K E V Y Q K I E E Y S K S P E F Y N Y L S Y I L A A Q N N Q I Q L E I R H M A G V T L K S L V E R N F E H I P E Q N I Q F I K Q N L F Q S F N D Q Q K A I R S A I G T L M T T I I Y K G G F Q K W P E L I E F M I Q N L E S T D Q G A I I N S I D C I S K I V E D L R V N S E N Y A F L D S S K G G S Q L N V L I P K L F S F C D P K Y G T E I Q S N A I H T L N L C V Q P M P A A L A E N L D Q Y L Q I L L S N V Q N S E K S I R Q R A F Q G I T A L T E I R R D A I M K R I N Q V I Q S I I I G S Q D A E Y D V A K S A C N F W F E Y L G M E Q S P E D I Q Q S M K C V Q P Y L K D L L P A L L K G L Q Y T D D D L M N I L P S T Q N I N N R P E I S E V G D I D D C D F D E N E N Q Y D F E G N D N E R E T N D Y G E Y T L R K V C G R I I Q K F S Q Q F R D D V F Q I L Q P L I E Q C F Q S N D W K I K E V G I I C L G D I S E G S I N S V Q V H L G N I I P S L I Q L F N V P G Q N Y L L Q T S I M W T I C Q Y R S W L I D N Y N Q Y F D V I K S Y L Q C M A F G I T H Q M Q H L Q E C S C Q C L K D F V D N G S M I L R P Y L H D F I K V V T E A I K V Y Q N S N L N M L L D A V C T I V S T M Q E E V N T P E V L Q T L L P P I L E K W G Q L K S T D I A I K G F A E C F S L L A Q E L E S N F L I Y T E Y I Y P K C F E M L Q N Y V I A L N T E S K D R K H I N Q K K Q I F L M G T D L M S S I V Y C T K Q N F A L L A Q H T D L N S I I I N T I D S Q D S E V R S F I F T L I S E I S I H C P N Y I A Q K V E I Y T Q M I S Q H V I L F P H S L D P G N Y Y L N T C N N A V L C L N Q L C I S Y P E I M K P Y A Y Q I A L K I I K I L E E T K K M V I D V A R N V C C S L C S I A L L D Y Q N V S Q H L S S F V Q K F C L S V R Q Y N G Q Q K R R A F E G L F K M A F H N P N G I I N Y M S Y I V D S F I R Y Q N P P Q E L K L Q F K T L L I E Y K K T L N D E Q W Q N F L L N S N F D Q I V I K N L I Q Q Y L S >TTHERM_00527110(gene)ATG TTT TAG CCT GAT ATT GCA ACA CTT CAA TAA GTT GCT TAG CTC TTA TAG CAA GGC AAG TTA GCT GAC AAT CAA TAG CAA AAA GAA GTA TAT CAA AAA ATA GAG GAA TAT TCT AAG TCC CCT GAA TTT TAT AAT TAC TTA TCC TAC ATT TTG GCT GCA TAA AAC AAC CAA ATT TAG CTT GAG ATT CGT CAT ATG GCT GGT AAA TAC TCA CTC ACT TTT AGT CTT TTA TAA TAA ATA ACT TAT ACT AAA ATA ATT TCT TTT TGC CCC CCA ATT AAG CTA TTT CTC ATA TCA CAT AAG AAA ACA TTT ACC TAA ATT GTT TAT TTT ATG ATT TTA AAA AAA TGG GTT TTA GTT ATA ATT TAT TTT TTT ATT TAT TAT TTT TTA AGC ATG TCT AAA ATT GAT TCA TAT TTT ATG CAA AAA TAT TTT GAA TTT CAA AGC AAG GCT TAA ATT TAT TCT AAT TTT AAA ATA TTT TGT TAG GTG TTA CAT TAA AGT CGT TAG TAG AGA GAA ATT TTG AGC ATA TTC CTG AAC AAA ATA TCT AGT TCA TTA AGC AAA ACT TGT TCT AGT CAT TTA ACG ATT AAT AAA AAG CCA TTA GAA GCG CTA TAG GTA CTT TGA TGA CCA CTA TAA TTT ACA AGG GAG GAT TTT AAA AAT GGC CAG AAT TGA TTG AGT TTA TGA TCT AAA ACT TAG AGT CCA CAG ACC AAG GTG CTA TTA TTA ACA GTA TAG ATT GCA TTT CTA AAA TCG TAG AAG ATT TAA GAG TAA ACT CTG AAA ATT ATG CAT TTT TAG ATT CTT CAA AGG GAG GAT CTT AGC TCA ACG TTT TGA TTC CTA AAC TTT TTT CCT TCT GTG ATC CAA AAT ATG GTA CAG AAA TAC AAT CAA ACG CTA TCC ACA CAT TGA ACT TAT GCG TTT AAC CAA TGC CTG CTG CTT TGG CAG AAA ATT TAG ATC AAT ATT TAT AGA TCC TCC TAA GCA ACG TAT AAA ACA GTG AAA AGA GTA TCA GAC AAA GAG CTT TCC AAG GAA TTA CAG CAT TAA CTG AAA TAA GAA GAG ACG CAA TAA TGA AAA GAA TAA ATC AAG TCA TTC AAT CAA TCA TTA TTG GTA GTT AAG ATG CTG AAT ATG ATG TTG CTA AAA GTG CCT GCA ACT TCT GGT TTG AAT ATC TTG GTA TGG AAT AAA GTC CAG AAG ACA TAT AAC AAA GTA TGA AAT GTG TTT AAC CAT ACT TAA AAG AGT ATA TAA TTG TTT TTT TTA AAT TCA ACT TTT AGT TAA AAC TAA GAA TTT TCT TTA ATT TAA AAG TTT GCT TCC TGC TTT ATT GAA GGG TCT TTA ATA CAC TGA CGA TGA TTT AAT GAA TAT TTT GCC TAG CAC ATA AAA CAT AAA TAA TAG ACC TGA AAT TTC AGA AGT AGG TGA CAT TGA TGA TTG TGA TTT TGA TGA AAA TGA GAA TTA ATA TGA TTT TGA AGG AAA TGA TAA TGA GAG AGA AAC AAA CGA TTA TGG TGA GTA CAC ATT GAG AAA AGT TTG TGG AAG AAT TAT ATA AAA ATT TTC ATA GCA ATT TAG AGA TGA CGT TTT CCA AAT TTT ATA ACC TTT AAT TGA GCA ATG CTT CTA GAG CAA CGA TTG GAA AAT AAA GTA ATT TCC TTT ATA AGT CTT TGA TAT AAA TTG TGT TAT AAA AAT CTT TTT TAT TTT AAA TTA ATC AGA GAA GTT GGC ATA ATT TGT TTA GGC GAT ATT TCT GAA GGA AGC ATT AAT TCT GTT TAG GTA CAT TTA GGA AAT ATA ATT CCT TCA TTG ATA TAG TTG TTC AAT GTT CCT GGA TAA AAT TAT CTC CTT CAA ACC TCA ATT ATG TGG ACC ATT TGT TAG TAT AGA AGC TGG TTG ATT GAC AAC TAC AAT TAA TAT TTC GAT GTA ATC AAA AGC TAT TTG TAA TGC ATG GCT TTC GGA ATC ACT CAC TAA ATG CAA CAC TTG TAA GAG TGT TCT TGC CAG TGC TTA AAG GAT TTT GTA GAT AAT GGA TCT ATG ATT CTT AGA CCA TAC TTG CAC GAT TTC ATT AAA GTA TTT AAT TTG AAG AGA ATC GGA TAA TTA TTT TTT TTT GTT AAC TGT AAT AGG TTG TTA CTG AAG CAA TTA AAG TTT ATT AAA ACA GCA ATT TAA ATA TGC TTT TAG ATG CTG TGT GCA CTA TTG TTA GTA CCA TGT AAG AAG AAG TGA ATA CTC CAG AAG TCC TCC AAA CAC TAC TTC CAC CTA TCC TTG AAA AAT GGG GAT AAC TCA AAT CAA CTG ATA TTG CTA TAA AAG GAT TTG CAG GTA AAT TAG ATT GAA ATA ACA AAC AAG CAT TTT AAG TTA AAA TAA AAT TAT TAG AAT GCT TCT CTC TTC TTG CTC AAG AAT TAG AAT CCA ATT TCT TAA TCT ATA CCG AAT ACA TTT ATC CTA AAT GCT TTG AAA TGT TAC AAA ATT ATG TCA TAG CTT TAA ACA CAG AAA GTA AAG ATA GAA AAC ATA TTA ATT AAA AGA AGT AAA TAT TCC TTA TGG GTA CCG ATC TCA TGA GCA GCA TAG TCT ATT GCA CAA AAT AAA ACT TTG CTC TCC TTG CTC AAC ATA CAG ATT TAA ACT CTA TAA TTA TTA ATA CAA TAG ATG TAA TTA AAT TAG TCA TTA TTT TCT GTT TAT CAA AAT TCT TTT TCT TAA AAA AAA GTC TTA AGA CAG TGA GGT TAG ATC TTT CAT ATT CAC CTT GAT AAG TGA AAT TTC AAT CCA TTG TCC AAA CTA TAT TGC ATA AAA AGT AGA GAT ATA TAC TCA AAT GAT ATC TTA GCA TGT TAT TCT TTT CCC ACA TTC CCT AGA TCC CGG TAA TTA TTA CTT GAA TAC TTG CAA TAA TGC TGT ACT TTG TCT CAA CTA ATT ATG CAT TAG TTA TCC TGA AAT AAT GAA ACC TTA TGC TTA CCA AAT AGC TTT AAA AAT AAT TAA AAT TTT AGA AGA AAC CAA AAA AGT ATT TAA ATT TAA AAT TTG AAT TTT ATA TTA ATG TTC TTT ACA AAA ATA GAT GGT TAT TGA TGT AGC CAG AAA TGT ATG TTG CTC TTT ATG CTC CAT AGC ATT ACT TGA TTA CTA AAA CGT TAG TTA ACA TCT TTC TAG TTT CGT CTA AAA ATT CTG TCT TAG TGT GAG ATA ATA CAA TGG ATA ATA AAA GAG AAG AGC TTT TGA GTA TTT ATT TAG TTT TAT TGT TTT CAT TAA TAT ATT TTA TTA ATT AAT ATA AAA AAG GGG TTT ATT CAA AAT GGC ATT CCA CAA TCC TAA TGG TAT CAT TAA TTA TAT GAG CTA CAT TGT TGA TTC TTT CAT AAG ATA CTA AAA CCC TCC ATA GGA GTT GAA ATT GTA ATT CAA GAC TCT GTT GAT CGA ATA TAA AAA AAC TCT TAA CGA TGA ACA GTG GTA AAA CTT CCT TTT GAA CAG TAA TTT CGA CTA AAT AGT TAT CAA AAA CTT AAT TTA GCA ATA CCT TTC TTG A