Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01415190

Standard Name

JUB6 (JUnk Buster 6)

Aliases

PreTt14740 | 376.m00013 | PRN1

Description

hypothetical protein; Prion-like protein Jub6p; required for heterochromatin aggregation process during programmed DNA elimination

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• heterochromatin (IMP) | GO:0000792 | Ref:27909245

Biological Process

• heterochromatin domain assembly (IMP) | GO:1902795 | Ref:27909245
• heterochromatin assembly involved in chromatin silencing by small RNA (IMP) | GO:0070924 | Ref:27909245

Domains

• ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 12%

TetraMine Data

TTHERM_01415190

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_03361.1	4.998233068678632e-48	hypothetical protein (568 aa)

General Information

Paragraph No	Gene Name	Paragraph Text
111	JUB1, COI16, JUB6, COI6, COI3, HPL2, JUB4, JUB2, JUB3	This protein co-localizes with Pdd1p in heterochromatin body in the new macronucleus.

Associated Literature

1. Ref:27909245: Kataoka K, Mochizuki K (2017) Heterochromatin aggregation during DNA elimination in Tetrahymena is facilitated by a prion-like protein. Journal of cell science 130(2):480-489

Sequences

>TTHERM_01415190(coding)
ATGCTTCAGATTTATAATTTTATGACTTATGATAGACCTTATATGCCTTTAACAAATGAT
TTAGCTGAATTCAGATTATAAACTGTTAATGGCCTTTAATTCCAGCAATCTAACACTACC
ACTGCTTATATGAAAATAAACTAGGCTAGCTTGTATAGAGTAGTAGTTGAAATGAACCTC
CATAATGTCTATAATAAGTATTACATTTTCGTTGGTCTTATAAGCAACTTTAGTAAAGAT
AATACATATATTTCTGATGTGAACAAAGTCAACAGTTTTGCAGTTGATAGGTAAAGCACA
AGCAAAGGAGTTAGTAAAATCGTGAAAGGAAGGGTTCTAAAAGACTTACAGTATCCCGAT
GATTACAAGCAGATAGAAATTACCTTTTGTGTTGAATCAAAGCTCTTTTAAGTATGCGAT
TACCCTAACAGAGAAAATGTTAATGAAATTGATGACAACAGATTGTATCTGTTAAATACC
AGTTAAGAATATCTTTTAGGCTTTTAACTCTTTAATAACGGCGACAGCATAACCATTTTA
CAATGTGAAGAATTAGAGTACCAAAACTGA

>TTHERM_01415190(protein)
MLQIYNFMTYDRPYMPLTNDLAEFRLQTVNGLQFQQSNTTTAYMKINQASLYRVVVEMNL
HNVYNKYYIFVGLISNFSKDNTYISDVNKVNSFAVDRQSTSKGVSKIVKGRVLKDLQYPD
DYKQIEITFCVESKLFQVCDYPNRENVNEIDDNRLYLLNTSQEYLLGFQLFNNGDSITIL
QCEELEYQN

>TTHERM_01415190(gene)
ATGCTTCAGATTTATAATTTTATGACTTATGATAGACCTTATATGCCTTTAACAAATGAT
TTAGCTGAATTCAGATTATAAACTGTTAATGGCCTTTAATGTAACTCAAAAAGCAAAATA
TTTTTAGCTTATTTAGCTTATTTTTATAACATTTCTCAAAATATTAATTATTCCTTCAGC
CTGATATTATTGAGTGTCTAAAACCTAATCTTAAAAGCTTTTATTACTTGGACTTTTCAA
ATGTTTCAAACCACACTTTAGCTCTAAGCAATAATGAAAACATCAATCCAAAATTGAGAT
TTTCACTTATGGATATTTGGGTATAGATAGCATTAATATAACTTTTCGAAAAAACAGAGC
TAATTAAACTGAATAGATAATTTGATAAATGGCTTTAATTCCTTCCTAAGATTTATATGA
TATATTTCATAATAAATTGAGTCAAGCTACATGAATGCTTTTATCTACACAGTTTCTAAT
CAGGCTATTCTTTGTAATTGCCGCATTAGCAGGTATCATCAATAAAACAAGGACTAAACT
TTTTTAGAGAGGATGATTTACTTTCTCTTCACTAATTTTATAAATTTAGTAGAATTAAGT
GTAGGATAAATAATATGCTCTTTATTAGGCTTGTACAGAAGCTTAGAGTGTTTCAATCAT
TTATCTTAATGAGATTTCTTAATAAATTTAAATATTATATCCTCTCTTCCATTAGTTCTA
GTTTTAGTCAACATCATTTTTACTCTACGTTCCTCCATTTTTTTTAGTTCTTTTTTCAGT
TTTCTAAAAATTTTTATGTTTATACATGCTTTTTGTACAAATTTTTAAAATATAGATAGA
GATCTATCCGAATTATTCGGATTTAGATTTTTAGCATGCCTGCATCCTGCTTTTTCAGCA
GTGGCAATTTTTACAAGGGAAAAGTATATATATATATATGCAACGAGGGCATACAATTTT
CAATTTTTTTAAAAAATAATTTTTTGGCCCTGAGGTTTTTCTTGGCTGAAAATTTAAATA
AAAAAAATATCCCTATTATATAGCCCCCGCTAGAAATTTTAAGGAGAAGAGATAATTGAT
TTAAATTAATTAAATTTACTATTTTATTATTTTTAATGTTAAATAGATAATTTCGATTAA
ATTTATGAATGCTAAATCAAATTTAAATTAAAATTTCAGCAATATTTGAGTAAAATCTAT
ATGTTTATTTGTAATCTACTTTTAATTGTATTTAAGTTAATTAATTTTCCTTTATTTTAA
TTTTGGGTAGATAACATCATTTATTTATTTATTTGTTTTGTATAATATTTGTTAGAAAAC
AAACCAATAAAATCGATCAATCGATTAATTGAGGAAACAAAAATTAGATTTAAATAAAAA
TAAATTTTTTTTAATTTTATTTATTTTTTGAACATAATAATTTGAGCTAAGAAAGGAAAT
GATTTTAATAAGGAAACTTTGTTTATCGATTATTATAGAAATGCAAAAAATTATAAGATA
AACTTGATATTAGATGAATAATTTATTTTAATAAAAACAAATGTAAAATAAAATGACAAA
ATATTTATTATACTAAATTTAACTAAAGTTAATTTTTATCAAAAAATTGTTTAGAAATTT
CAATCATTTAATTTTCTATTTTATAAAAATTATTATTTAAAAGATAGATAGTTAGATTTT
AAAGATTTAATTTAAATATTTGCTTATATTTTATTTGTTGCAATAATAAATAATTATTAA
CCAGCTATATATAATAAAAAAGCTTATTGTTTATAGATATTAATTGAATTAGCTAAGATT
CTAATTTAGAAAAGTGCACTAATCTCTCAAATTTGACACTTAATCTTTAGTAAAAAGCGT
TTATTGTATTTTTAAATATTGAGAAATTCTTATAATAAATTAGGAAATAAATATTTTTAA
AAGCGATTTATTGTAAAAGCAATTAAAATATTTTTTGGTTTTTAAGACTAAAATTTTATT
GACAAGATATCTTAATATTTTATAGACAAGATTTGTTAATGTTTTATCTGTTTAAAGTTT
ATCAAATTATATAAAAAATTAAATTTTAGTTGATTTTTTCCTATATTTAAATTGAAATAT
CTATATATTTGTTTGTTGGTTTGATCATTAAAGACAGATATTTAAACTGGATGTATTTGT
AAAAATTTTATAAAAAAAAATAAATAAATAAATTAGTTATATTCATGATGGATTAAATAA
ATAATAGCAATATCTAAAACTAATTATTGTGCTTGAAGCACTATTAGCAATCAGAATACT
TGCAATTTGCCAGTGATAATGAAGAAGATCTATTTTGCTGCTACAATTGTTTGTATGAAG
AGTGTTATAAAGTAAAGAATATGATACCTTTAGAAAAAATTTAAAGTTGTGAAGAAGATC
ATATTATATTTTCGTGGCCTCCTCTTGACGAGTAAGATTTAGTTTGTTAGATATACCAAA
TTAGCCAATATGATAACCCTATTAGCATATAAAAGTTAATTTAATTTTTTGATGAATTAG
AAACAGAAATTATAACTCATTTATAGAAATAAAAAAAGGCCTTTTTAGTAAAAATTAATA
ATATTTCCACTTAAAATTAAGAATTATTAGATTTCTATTCTAAAATTTCTAAATTAAGTG
ACATAAAAGGTATAATTTAGGATTAAAATCTAACTCAATTGCAAAAAGCTAAACAAGTAT
TAGCTATTATCAACAAAATGAAAGAAAAGTCAACTGAAAACACACATAAACTTAAGCAAA
TGCTTTAAAAATCAATTTAGTAAAAAGCTGTTGATTTATAATTGCTAACGAAGCTTAAAA
ATTCTATCTTAAAGTAACTCAGCTTCATTAACTCTCAATCTATGCAATAGCTGCAGTAAT
TTCTTGAAAAGAATTACTGTTTGATAGAGCAATAAAAAAGTGAAAACAATTTACAGAATG
AAAACATAAAACTTTAAGAAAATGGAAATCTTGACACAATTTTAAAATTAGTTGCAAACA
AAACAAATCAATGCGACTCAAAATACTTGGATTCACTTCAATCTGAGCTTCTCAAAATTT
AAGTCATAATAAATGACTTGAAAATAGAAAAGAATGTTTTTCTACCAAGCAAGCAATAAA
TCAACTTTTAAGATTTTACTTAAGAGTAAATCGATGACATTCATTTGCTTAGTAAAAAAA
TAAGCGAGATGAACAACAAATACAGATGCAGCTAAGAATAAGAAATTTTATCATTCAAAA
TTTAACCATCTTCTTATTCTACTTGTAGAGCTTTGTTTAATTAAAACATAATTAAGCAAA
ATAAATTAAATTATTATTATAATTTACTAAAAAAATACCCTATTTTCGAGTTTGAAAGCT
TTTATAAGTCTTACTTTAATTGTAGATATTAATTACAACTTAGCTCTCTAAACAACAGCT
AGCAGTATGGACAAATAATTCAAAACAATTCAAATTATATATTCTAAGTAGTCCAGCAAT
CTAACACTACCACTGCTTATATGAAAATAAACTAGGCTAGCTTGTATAGAGTAGTAGTTG
AAATGAACCTCCATAATGTCTATAATAAGTATTACATTTTCGTTGGTCTTATAAGCAACT
TTAGTAAAGATAATACATATATTTCTGATGTGAACAAAGTCAACAGTTTTGCAGTTGATA
GGTAAAGCACAAGCAAAGGAGTTAGTAAAATCGTGAAAGGAAGGGTTCTAAAAGACTTAC
AGTATCCCGATGATTACAAGCAGATAGAAATTACCTTTTGTGTTGAATCAAAGCTCTTTT
AAGTATGCGATTACCCTAACAGAGAAAATGTTAATGAAATTGATGACAACAGATTGTATC
TGTTAAATACCAGTTAAGAATATCTTTTAGGCTTTTAACTCTTTAATAACGGCGACAGCA
TAACCATTTTACAATGTGAAGAATTAGAGTACCAAAACTGA