Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_01415190Standard Name
JUB6 (JUnk Buster 6)Aliases
PreTt14740 | 376.m00013 | PRN1Description
hypothetical protein; Prion-like protein Jub6p; required for heterochromatin aggregation process during programmed DNA eliminationGenome Browser (Macronucleus)
![]()
Genome Browser (Micronucleus)
![]()
Gene Ontology Annotations
Cellular Component
- heterochromatin (IMP) | GO:0000792 | Ref:27909245
Biological Process
- heterochromatin domain assembly (IMP) | GO:1902795 | Ref:27909245
- heterochromatin assembly involved in chromatin silencing by small RNA (IMP) | GO:0070924 | Ref:27909245
Domains
- ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 12%
TetraMine Data
TTHERM_01415190
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_03361.1 4.998233068678632e-48 hypothetical protein (568 aa)
General Information
Paragraph No Gene Name Paragraph Text 111 JUB1,
COI16,
JUB6,
COI6,
COI3,
HPL2,
JUB4,
JUB2,
JUB3This protein co-localizes with Pdd1p in heterochromatin body in the new macronucleus.
Associated Literature
- Ref:27909245: Kataoka K, Mochizuki K (2017) Heterochromatin aggregation during DNA elimination in Tetrahymena is facilitated by a prion-like protein. Journal of cell science 130(2):480-489
Sequences
>TTHERM_01415190(coding)
ATGCTTCAGATTTATAATTTTATGACTTATGATAGACCTTATATGCCTTTAACAAATGAT
TTAGCTGAATTCAGATTATAAACTGTTAATGGCCTTTAATTCCAGCAATCTAACACTACC
ACTGCTTATATGAAAATAAACTAGGCTAGCTTGTATAGAGTAGTAGTTGAAATGAACCTC
CATAATGTCTATAATAAGTATTACATTTTCGTTGGTCTTATAAGCAACTTTAGTAAAGAT
AATACATATATTTCTGATGTGAACAAAGTCAACAGTTTTGCAGTTGATAGGTAAAGCACA
AGCAAAGGAGTTAGTAAAATCGTGAAAGGAAGGGTTCTAAAAGACTTACAGTATCCCGAT
GATTACAAGCAGATAGAAATTACCTTTTGTGTTGAATCAAAGCTCTTTTAAGTATGCGAT
TACCCTAACAGAGAAAATGTTAATGAAATTGATGACAACAGATTGTATCTGTTAAATACC
AGTTAAGAATATCTTTTAGGCTTTTAACTCTTTAATAACGGCGACAGCATAACCATTTTA
CAATGTGAAGAATTAGAGTACCAAAACTGA>TTHERM_01415190(protein)
MLQIYNFMTYDRPYMPLTNDLAEFRLQTVNGLQFQQSNTTTAYMKINQASLYRVVVEMNL
HNVYNKYYIFVGLISNFSKDNTYISDVNKVNSFAVDRQSTSKGVSKIVKGRVLKDLQYPD
DYKQIEITFCVESKLFQVCDYPNRENVNEIDDNRLYLLNTSQEYLLGFQLFNNGDSITIL
QCEELEYQN>TTHERM_01415190(gene)
ATGCTTCAGATTTATAATTTTATGACTTATGATAGACCTTATATGCCTTTAACAAATGAT
TTAGCTGAATTCAGATTATAAACTGTTAATGGCCTTTAATGTAACTCAAAAAGCAAAATA
TTTTTAGCTTATTTAGCTTATTTTTATAACATTTCTCAAAATATTAATTATTCCTTCAGC
CTGATATTATTGAGTGTCTAAAACCTAATCTTAAAAGCTTTTATTACTTGGACTTTTCAA
ATGTTTCAAACCACACTTTAGCTCTAAGCAATAATGAAAACATCAATCCAAAATTGAGAT
TTTCACTTATGGATATTTGGGTATAGATAGCATTAATATAACTTTTCGAAAAAACAGAGC
TAATTAAACTGAATAGATAATTTGATAAATGGCTTTAATTCCTTCCTAAGATTTATATGA
TATATTTCATAATAAATTGAGTCAAGCTACATGAATGCTTTTATCTACACAGTTTCTAAT
CAGGCTATTCTTTGTAATTGCCGCATTAGCAGGTATCATCAATAAAACAAGGACTAAACT
TTTTTAGAGAGGATGATTTACTTTCTCTTCACTAATTTTATAAATTTAGTAGAATTAAGT
GTAGGATAAATAATATGCTCTTTATTAGGCTTGTACAGAAGCTTAGAGTGTTTCAATCAT
TTATCTTAATGAGATTTCTTAATAAATTTAAATATTATATCCTCTCTTCCATTAGTTCTA
GTTTTAGTCAACATCATTTTTACTCTACGTTCCTCCATTTTTTTTAGTTCTTTTTTCAGT
TTTCTAAAAATTTTTATGTTTATACATGCTTTTTGTACAAATTTTTAAAATATAGATAGA
GATCTATCCGAATTATTCGGATTTAGATTTTTAGCATGCCTGCATCCTGCTTTTTCAGCA
GTGGCAATTTTTACAAGGGAAAAGTATATATATATATATGCAACGAGGGCATACAATTTT
CAATTTTTTTAAAAAATAATTTTTTGGCCCTGAGGTTTTTCTTGGCTGAAAATTTAAATA
AAAAAAATATCCCTATTATATAGCCCCCGCTAGAAATTTTAAGGAGAAGAGATAATTGAT
TTAAATTAATTAAATTTACTATTTTATTATTTTTAATGTTAAATAGATAATTTCGATTAA
ATTTATGAATGCTAAATCAAATTTAAATTAAAATTTCAGCAATATTTGAGTAAAATCTAT
ATGTTTATTTGTAATCTACTTTTAATTGTATTTAAGTTAATTAATTTTCCTTTATTTTAA
TTTTGGGTAGATAACATCATTTATTTATTTATTTGTTTTGTATAATATTTGTTAGAAAAC
AAACCAATAAAATCGATCAATCGATTAATTGAGGAAACAAAAATTAGATTTAAATAAAAA
TAAATTTTTTTTAATTTTATTTATTTTTTGAACATAATAATTTGAGCTAAGAAAGGAAAT
GATTTTAATAAGGAAACTTTGTTTATCGATTATTATAGAAATGCAAAAAATTATAAGATA
AACTTGATATTAGATGAATAATTTATTTTAATAAAAACAAATGTAAAATAAAATGACAAA
ATATTTATTATACTAAATTTAACTAAAGTTAATTTTTATCAAAAAATTGTTTAGAAATTT
CAATCATTTAATTTTCTATTTTATAAAAATTATTATTTAAAAGATAGATAGTTAGATTTT
AAAGATTTAATTTAAATATTTGCTTATATTTTATTTGTTGCAATAATAAATAATTATTAA
CCAGCTATATATAATAAAAAAGCTTATTGTTTATAGATATTAATTGAATTAGCTAAGATT
CTAATTTAGAAAAGTGCACTAATCTCTCAAATTTGACACTTAATCTTTAGTAAAAAGCGT
TTATTGTATTTTTAAATATTGAGAAATTCTTATAATAAATTAGGAAATAAATATTTTTAA
AAGCGATTTATTGTAAAAGCAATTAAAATATTTTTTGGTTTTTAAGACTAAAATTTTATT
GACAAGATATCTTAATATTTTATAGACAAGATTTGTTAATGTTTTATCTGTTTAAAGTTT
ATCAAATTATATAAAAAATTAAATTTTAGTTGATTTTTTCCTATATTTAAATTGAAATAT
CTATATATTTGTTTGTTGGTTTGATCATTAAAGACAGATATTTAAACTGGATGTATTTGT
AAAAATTTTATAAAAAAAAATAAATAAATAAATTAGTTATATTCATGATGGATTAAATAA
ATAATAGCAATATCTAAAACTAATTATTGTGCTTGAAGCACTATTAGCAATCAGAATACT
TGCAATTTGCCAGTGATAATGAAGAAGATCTATTTTGCTGCTACAATTGTTTGTATGAAG
AGTGTTATAAAGTAAAGAATATGATACCTTTAGAAAAAATTTAAAGTTGTGAAGAAGATC
ATATTATATTTTCGTGGCCTCCTCTTGACGAGTAAGATTTAGTTTGTTAGATATACCAAA
TTAGCCAATATGATAACCCTATTAGCATATAAAAGTTAATTTAATTTTTTGATGAATTAG
AAACAGAAATTATAACTCATTTATAGAAATAAAAAAAGGCCTTTTTAGTAAAAATTAATA
ATATTTCCACTTAAAATTAAGAATTATTAGATTTCTATTCTAAAATTTCTAAATTAAGTG
ACATAAAAGGTATAATTTAGGATTAAAATCTAACTCAATTGCAAAAAGCTAAACAAGTAT
TAGCTATTATCAACAAAATGAAAGAAAAGTCAACTGAAAACACACATAAACTTAAGCAAA
TGCTTTAAAAATCAATTTAGTAAAAAGCTGTTGATTTATAATTGCTAACGAAGCTTAAAA
ATTCTATCTTAAAGTAACTCAGCTTCATTAACTCTCAATCTATGCAATAGCTGCAGTAAT
TTCTTGAAAAGAATTACTGTTTGATAGAGCAATAAAAAAGTGAAAACAATTTACAGAATG
AAAACATAAAACTTTAAGAAAATGGAAATCTTGACACAATTTTAAAATTAGTTGCAAACA
AAACAAATCAATGCGACTCAAAATACTTGGATTCACTTCAATCTGAGCTTCTCAAAATTT
AAGTCATAATAAATGACTTGAAAATAGAAAAGAATGTTTTTCTACCAAGCAAGCAATAAA
TCAACTTTTAAGATTTTACTTAAGAGTAAATCGATGACATTCATTTGCTTAGTAAAAAAA
TAAGCGAGATGAACAACAAATACAGATGCAGCTAAGAATAAGAAATTTTATCATTCAAAA
TTTAACCATCTTCTTATTCTACTTGTAGAGCTTTGTTTAATTAAAACATAATTAAGCAAA
ATAAATTAAATTATTATTATAATTTACTAAAAAAATACCCTATTTTCGAGTTTGAAAGCT
TTTATAAGTCTTACTTTAATTGTAGATATTAATTACAACTTAGCTCTCTAAACAACAGCT
AGCAGTATGGACAAATAATTCAAAACAATTCAAATTATATATTCTAAGTAGTCCAGCAAT
CTAACACTACCACTGCTTATATGAAAATAAACTAGGCTAGCTTGTATAGAGTAGTAGTTG
AAATGAACCTCCATAATGTCTATAATAAGTATTACATTTTCGTTGGTCTTATAAGCAACT
TTAGTAAAGATAATACATATATTTCTGATGTGAACAAAGTCAACAGTTTTGCAGTTGATA
GGTAAAGCACAAGCAAAGGAGTTAGTAAAATCGTGAAAGGAAGGGTTCTAAAAGACTTAC
AGTATCCCGATGATTACAAGCAGATAGAAATTACCTTTTGTGTTGAATCAAAGCTCTTTT
AAGTATGCGATTACCCTAACAGAGAAAATGTTAATGAAATTGATGACAACAGATTGTATC
TGTTAAATACCAGTTAAGAATATCTTTTAGGCTTTTAACTCTTTAATAACGGCGACAGCA
TAACCATTTTACAATGTGAAGAATTAGAGTACCAAAACTGA