Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00576820

Standard Name

JSL5 (JUB6-like 5)

Aliases

PreTt28973 | 77.m00185 | 3812.m02660

Description

hypothetical protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_00576820

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_04042.1	1.0000297864968827e-159	hypothetical protein (995 aa)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:27909245: Kataoka K, Mochizuki K (2017) Heterochromatin aggregation during DNA elimination in Tetrahymena is facilitated by a prion-like protein. Journal of cell science 130(2):480-489

Sequences

>TTHERM_00576820(coding)
ATGATTAATTAAGAAAAAGGAACCGACAAAATTCTACAAATATAAGAAATATTAAGTAGA
TAATGTCCTAAACATAATGAGTATCCTCTTGACCTTCTTTATATCACAAATAAATCTAAT
CAGCATGAAATTTGCTATATGTGTTTTTAGAGTTATCCAATAAAAAAAGAAGAAATTATC
AATATTAGATAGATTCTATTTGCAAAAGAAGATACTGTCCTTTAAAATTACCCTCCTTTA
GAGAATTAAAATTTGTATACTTAGTTGATTAATATTTTCAACGAATAAATGATCCTTGAT
TAATCAATCATTAAAATCTAGCAATTTTTCAAAGAGTTTGAAGAAAAGTTAATAGGTATT
ATTAAGCAATTACAAAGGGATATGGAAAATAAAATTGAAAATATAAAATATTTAAAAAAA
CAATTAGTTGAAACTTATAATTCTATTTCTTAAAAATCTGAATTAAAGAACTATTTTCAA
AATAACAACAAGGATAATTCTGCTCTGCACGATCTAATTTCTAAAAAATTTGACGAGTTA
CCAGAAAACACATAAAAAATAAAAGAATTAATAGATAAATTTAATACCTATAAAAGATCA
GTAAATTTCGATGGACCTGTTAAAATAGAAGAAGCAGTCATAAGTTTAATGAATTAAATA
GACTTTTTCTCAGACTTCAATGCTGAAAAATACACTTAAATAATATTTTAATAGGAGTTA
AACGATAATCATAAATACTAACTGTTAAATACAAGTAAACAAAAAAAGACAAATGTTGAT
TATTTGTTAGAACTTATTAAAAACTAGACAAATTATTGCAATAATTCAAGCTATGATGAA
ATTTAAAAGCTACTGAAAAAATATTCATTGCTTTTAAATTAAATTGAATTAAATTAACCA
ATTTGGGAAGAAGCTAAAAGAAATAGCTTCGTTAACCTTAGCGATTAGCAGCTAGAAAGA
GTAAGACTCATTTCAGAAAAGATTATTTCTATTGATAAATAATACGAAGAAAATGAAGCA
TCATCTTCACTTAAAGAAGACTCTGCTCTTTCAGATAAAAGCTTATAAAATTATTAGCCT
TACTGTTTGTAAGCTTGTATTTAACCTAATTCTTATGAAATATACAATAATTTGTTCAGT
GGAAAAGCAAGTTAGTATTAGAGATTTTAAAATTTATTAAAAGAGTACCCCATTTTTGAG
CTAGATAGTGTATAAGTTGGTTGCCATTAATTAATATTTTTTAATATGATAAAATCAATT
TATGCAGATTCTTAGAATCTTCATATTTAGAGATTGCCAAATTTGAATATATAAATTCAA
AAGATAAATAAGAAAGGTCATGCTATTTGCTATAGCAATACTCAATTAGAAGAAGACAAA
AAATATTTAATAAGATTAACTATTTAATCAAATCCGAAAAATTCAAATAACTTGATTTTG
TTTGGTTTAATACCTGAGTAAAGTAAAGACATATCATATCTCAGAGACTCAGGTTTAACT
TACAATGAGAGAGCAGATAGTTGCTACACTTTAACAAAGCTTATCAAAGGTGATCCAATT
CCTGAAATAAATAAGCTGAACATAAACAAGCAAATAGAGATAAGGATTCATCTTAAAAAA
AAACTATTTAGAATTGCTACGATTCCAGGCTACGAAAATATTTCTGAGTTAGATAATAGA
AATAGAATTAAAGATAATCTTAATTATAGATTTGGTATTGAGCTATACTAATAAGACGAT
TAAATTATTATAAATGAGTTTATGGTAGAAGATTAATTTAATGATGACATGTGA

>TTHERM_00576820(protein)
MINQEKGTDKILQIQEILSRQCPKHNEYPLDLLYITNKSNQHEICYMCFQSYPIKKEEII
NIRQILFAKEDTVLQNYPPLENQNLYTQLINIFNEQMILDQSIIKIQQFFKEFEEKLIGI
IKQLQRDMENKIENIKYLKKQLVETYNSISQKSELKNYFQNNNKDNSALHDLISKKFDEL
PENTQKIKELIDKFNTYKRSVNFDGPVKIEEAVISLMNQIDFFSDFNAEKYTQIIFQQEL
NDNHKYQLLNTSKQKKTNVDYLLELIKNQTNYCNNSSYDEIQKLLKKYSLLLNQIELNQP
IWEEAKRNSFVNLSDQQLERVRLISEKIISIDKQYEENEASSSLKEDSALSDKSLQNYQP
YCLQACIQPNSYEIYNNLFSGKASQYQRFQNLLKEYPIFELDSVQVGCHQLIFFNMIKSI
YADSQNLHIQRLPNLNIQIQKINKKGHAICYSNTQLEEDKKYLIRLTIQSNPKNSNNLIL
FGLIPEQSKDISYLRDSGLTYNERADSCYTLTKLIKGDPIPEINKLNINKQIEIRIHLKK
KLFRIATIPGYENISELDNRNRIKDNLNYRFGIELYQQDDQIIINEFMVEDQFNDDM

>TTHERM_00576820(gene)
ATGATTAATTAAGAAAAAGGAACCGACAAAATTCTACAAATATAAGAAATATTAAGTAGA
TAATGTCCTAAACATAATGAGTATCCTCTTGACCTTCTTTATATCACAAATAAATCTAAT
CAGCATGAAATTTGCTATATGTGTTTTTAGAGTTATCCAATAAAAAAAGAAGAAATTATC
AATATTAGATAGATTCTATTTGCAAAAGAAGATACTGTCCTTTAAAATTACCCTCCTTTA
GAGAATTAAAATTTGTATACTTAGTTGATTAATATTTTCAACGAATAAATGATCCTTGAT
TAATCAATCATTAAAATCTAGCAATTTTTCAAAGAGTTTGAAGAAAAGTTAATAGGTATT
ATTAAGCAATTACAAAGGGATATGGAAAATAAAATTGAAAATATAAAATATTTAAAAAAA
CAATTAGTTGAAACTTATAATTCTATTTCTTAAAAATCTGAATTAAAGAACTATTTTCAA
AATAACAACAAGGATAATTCTGCTCTGCACGATCTAATTTCTAAAAAATTTGACGAGTTA
CCAGAAAACACATAAAAAATAAAAGAATTAATAGATAAATTTAATACCTATAAAAGATCA
GTAAATTTCGATGGACCTGTTAAAATAGAAGAAGCAGTCATAAGTTTAATGAATTAAATA
GACTTTTTCTCAGACTTCAATGCTGAAAAATACACTTAAATAATATTTTAATAGGAGTTA
AACGATAATCATAAATACTAACTGTTAAATACAAGTAAACAAAAAAAGACAAATGTTGAT
TATTTGTTAGAACTTATTAAAAACTAGACAAATTATTGCAATAATTCAAGCTATGATGAA
ATTTAAAAGCTACTGAAAAAATATTCATTGCTTTTAAATTAAATTGAATTAAATTAACCA
ATTTGGGAAGAAGCTAAAAGAAATAGCTTCGTTAACCTTAGCGATTAGCAGCTAGAAAGA
GTAAGACTCATTTCAGAAAAGATTATTTCTATTGATAAATAATACGAAGAAAATGAAGCA
TCATCTTCACTTAAAGAAGACTCTGCTCTTTCAGATAAAAGCTTATAAAATTATTAGCCT
TACTGTTTGTAAGCTTGTATTTAACCTAATTCTTATGAAATATACAATAATTTGTTCAGT
GGAAAAGCAAGTTAGTATTAGAGATTTTAAAATTTATTAAAAGAGTACCCCATTTTTGAG
CTAGATAGTGTATAAGTTGGTTGCCATTAATTAATATTTTTTAATATGATAAAATCAATT
TATGCAGATTCTTAGAATCTTCATATTTAGAGATTGCCAAATTTGAATATATAAATTCAA
AAGATAAATAAGAAAGGTCATGCTATTTGCTATAGCAATACTCAATTAGAAGAAGACAAA
AAATATTTAATAAGATTAACTATTTAATCAAATCCGAAAAATTCAAATAACTTGATTTTG
TTTGGTTTAATACCTGAGTAAAGTAAAGACATATCATATCTCAGAGACTCAGGTTTAACT
TACAATGAGAGAGCAGATAGTTGCTACACTTTAACAAAGCTTATCAAAGGTGATCCAATT
CCTGAAATAAATAAGCTGAACATAAACAAGCAAATAGAGATAAGGATTCATCTTAAAAAA
AAACTATTTAGAATTGCTACGATTCCAGGCTACGAAAATATTTCTGAGTTAGATAATAGA
AATAGAATTAAAGATAATCTTAATTATAGATTTGGTATTGAGCTATACTAATAAGACGAT
TAAATTATTATAAATGAGTTTATGGTAGAAGATTAATTTAATGATGACATGTGA