Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00683350

Standard Name

JAL1

Aliases

PreTt16172 | 103.m00163 | 3734.m00075

Description

ABC transporter family protein; homolog of human CFTR; expressed 4 hours and 8 hours post-conjugation

Genome Browser (Macronucleus)

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Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF08477 ) Miro-like protein
  • ( PF04665 ) Poxvirus A32 protein
  • ( PF07196 ) Flagellin hook IN motif
  • ( PF01926 ) GTPase of unknown function
  • ( TIGR01978 ) FeS assembly ATPase SufC
  • ( TIGR00955 ) pigment precursor permease
  • ( TIGR01194 ) cyclic peptide transporter
  • ( TIGR00740 ) methyltransferase, putative
  • ( PF02463 ) RecF/RecN/SMC N terminal domain
  • ( TIGR00958 ) antigen peptide transporter 2
  • ( TIGR01842 ) type I secretion system ATPase
  • ( TIGR01846 ) type I secretion system ATPase
  • ( TIGR03375 ) type I secretion system ATPase
  • ( TIGR01288 ) nodulation ABC transporter NodI
  • ( TIGR01193 ) ABC-type bacteriocin transporter
  • ( PF00005 ) ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( PF00664 ) ABC transporter transmembrane region
  • ( TIGR01192 ) glucan exporter ATP-binding protein
  • ( TIGR03063 ) sortase B cell surface sorting
  • ( TIGR02673 ) cell division ATP-binding protein FtsE
  • ( TIGR02769 ) nickel import ATP-binding protein NikE
  • ( TIGR02770 ) nickel import ATP-binding protein NikD
  • ( TIGR02323 ) phosphonate C-P lyase system protein
  • ( TIGR02324 ) phosphonate C-P lyase system protein
  • ( TIGR02857 ) thiol reductant ABC exporter, CydD
  • ( TIGR02868 ) thiol reductant ABC exporter, CydC
  • ( TIGR01166 ) cobalt ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR01189 ) heme ABC exporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR00968 ) sulfate ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR03415 ) choline ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR00954 ) Peroxysomal long chain fatty acyl
  • ( TIGR01277 ) thiamine ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR02204 ) ABC transporter, permease/ATP-binding protein
  • ( TIGR02633 ) D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR02982 ) ABC exporter ATP-binding subunit, DevA
  • ( TIGR00957 ) multi drug resistance-associated protein (MRP)
  • ( TIGR00972 ) phosphate ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR01187 ) polyamine ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR02142 ) molybdate ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR03410 ) urea ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR03411 ) urea ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR02203 ) lipid A export permease/ATP-binding protein
  • ( TIGR02315 ) phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR03269 ) methyl coenzyme M reductase system,
  • ( TIGR02211 ) lipoprotein releasing system, ATP-binding protein
  • ( TIGR02314 ) D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( PF03205 ) Molybdopterin guanine dinucleotide synthesis protein
  • ( TIGR01184 ) nitrate ABC transporter, ATP-binding proteins
  • ( TIGR01186 ) glycine betaine/L-proline transport ATP binding
  • ( TIGR01271 ) cystic fibrosis transmembrane conductor regulator
  • ( TIGR00960 ) Type II (General) Secretory Pathway
  • ( TIGR01188 ) daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding
  • ( TIGR03005 ) ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein
  • ( TIGR03265 ) putative 2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding
  • ( TIGR03258 ) 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.6%

TetraMine Data

TTHERM_00683350

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_17824.19.997093137033517e-262ABC transporter (1470 aa)
DictyBaseDDB_G02809772.0008287304234426e-177abcC10 on chromosome: 3 positi
on 4347748 to 4352153
WormBaseWBGene000034079.996149531968772e-161locus:mrp-1 status:Confirmed
UniProt:Q3S1M2 protein_id
:CCD69453.1
SGDYDR135C8.998247049188826e-159YCF1 Vacuolar glutathione S-co
njugate transporter of the ATP
-binding cassette family, has
a role in detoxifying metals s
uch as cadmium, mercury, and a
rsenite; also transports uncon
jugated bilirubin; similar to
human cystic fibrosis protein
CFTR
OxytrichaContig7364.0.0.g837.00255097081577e-156ABC transporter
Stentor CoeruleusSteCoe_248881.3485799642996046e-77

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:SUPR000097

Sequences

>TTHERM_00683350(coding)
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TTAAATGAAGTAGGTGTTTTAGATAATGATAGCTAGTACTAAGATGAGGCTAATTAATAA
CCGGTTGTAGATTAATTGAAGCTAGATGATGTTCAAATCAATACCTAAGAAAATGGAACA
TCCTTGCCAATTAGATAAGACAGTGAAAACTAATAGCTTTAAAAATAGGAAAGCAATGGA
TAATAAAATAATACAGGTGATAAAAAGGATTAAGATAAGTAAGAAACAATAGGCTAGTAA
TAAAATAAATCGCAGCCAGAAGATCTCAGATTTGATGACATGGATTACGATTAGAATGTC
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GCTATTGTGAAGGGATGCAATTTAGGCTTGTAGCATCTCCCAAAGATAAAAGAAAATCAT
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AAACTGTAGCCTTTTTAAATATTTAAGAAATCAATTAAGCTATATAAGGCTGAAATTTTT
TAAACATTTGTCATGTGCTTCTTAGATGCAGGATTTAAACTTTTTAATTCAGTGGCTTTA
AACTATTGCATATAGTATATGATATATGAAGACCATAGATCAGCTTATATTTGGGGTGGT
ATTGTGCTAGCATCATTGGTTTTATCTACTACTTTCAGACACGGTTCTTGGGCAGTAGGT
TAAAATATATTGTGCCGTGTTAGACTTTTGTATGTTAATGCTTTGTATAAAAAAATTAGC
AAACTCAGCTCATACTCAATTAAAGAAGCTAACTTGGGTAAAGTAATAAACTTGATTTCT
AGTGATCTCAATTCCACAGAATTGAAGGGTTTCTTCATATTTAATATGATTGTTGCTCCA
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AGTGTATTGTTTTTATCCTTTGTGTTTCCCATGCAAAACTATTTTGGAAAAAAAGCTGCT
CTGTACACTTAGAAAAGAACTGTGAAGAGTGATGAGAGAGTAAAATTAATTAATGAAGCC
ATTGAAGGAATAAGATTGATAAAAATGTATGGCTGGGAAAAGGCATTCAGATAAATGGTT
GAAAAGATTCGTAGTGACGAAATTTCAATGGCTATCAAGTCAATCTGCATTCAATGTATT
GAAAAGACTTTCTCTAAGTGCTTTGTGCTTTTTGTTGCAACAATAATATTCTGTATTATT
CATTACACTGGGTATGAACTGAATAGCGCAAAAATATTTTCAACTATCGAAATGCTTTAA
TATATCCGTGTTAATGTTATGCTTTTCACAGGAATGGGTATCTCTTATCTTTTCGAGTTG
CGTATCTTTTATAATAGATTTATAGACATCATAACTATTAAAGAAACTGAAATGACAGCT
CTCAACATGGAAAGTAATACAGCTCAATAATAGTTAAGTGATGATTTAGCAGCTAAATTT
AGTAATTTCAATGCTTACTGGAGATCTAGAGTTAATACAGATAAAAAGGAAAATAATTAA
CAAGTCGTAATTTTGTAAACTGAGGGAGATTAAAAGATGTTAGCAACAGAAAATAATGAA
TTAATAGAAAATTAAATGAAGCCTGCTTTGAAGAACATCAACTTATCTATTAAAAAGGGT
GAGTTACTCGGTATAGTAGGTAAAATAGGAAGTGGAAAAACAACATTTTTGCAATGTTTC
CTTAGAGAAATACCTTCCTATGATGGTTCTTTTTTAACATAAAATAACAGCTCAGTTGCC
TATGTAGAGCAAGAACCTTATATTTTCTCAAGTACTGTGAGAGAAAACATTCTATTTGGA
AAATCATATGAAGAATCATGGTACAATTAGGTAGTAAAATAATGTTGCTTACTTCCTGAT
TTTAAAGAAATGGGTAAAGGAGATTAAACTGAAATAGGAGAAAGAGGTATAAATATTAGT
GGAGGTTAGAAGGCTAGAATCAGTTTAGCTAGAGCTGTATACAGTAAGGCAGATATATAT
CTCTTAGATGATCCTCTTAGTGCTGTTGATTCAAAAGTTGCTAAAAAGCTTTTCCATAAT
TGCATTTAAGGAATTTTAAAAAATAGGACTGTGATTTTAGTAACTCACTAGATTCATTAT
ACTAAAAACTGCGACAGAATTATTATATTTGAAGAAAATGAGATTAAAGACGAAGGTACC
TTTTAGCAAATGGAAGAAGAACTTAAAAAATTAGCAGCTGGTTAACTGAAATTCGAAACA
CAATCTCAAAAAAGTATATCAAATTCTAACAGCTAAAGAGATTTGATTGATTAAATAAAT
GAAAAAAACGCAGAATTAAAAAATAAAGAAAAAGCAGAAGCTTAAAATAAACTTTAACCT
AAATAAGTCAAAGATAATACAAAAGTTACATTAAGAACTTATTAAAGATTCTTTGGTATT
GTAAACAGAAAGATATTTGGTTTTCCTCTTATTCTATTTGTACTATTTGTAAGTTCAGAA
ATAGCATTCACAGTTTTCAATAGAGGTTTGGGATATTACGATTCAACAAGCGATGAATCA
AAAGGAAAGTTGTTTGGTTTCCTATTCGGCTTTTCTTCTTTATATTTGATCTTGAATTTC
TTGAAATACATTTTGCTTTCTGTTGGTATTTTGAAAGGAAGTTAAATCCTTCATGACGAT
ATGTTTAAATCTTTAACTAGAGCACCTGTGTTATTTTTTGATTAAACTCCTGGTGGATAT
CTGATGAATAAATTTTCAAATGATATTGGTCTAATGGATAATGCACTAAATTATTCTGCT
AATGATGGTCTTGATATCATGTTCTATTTCTTGAATTTGATGATTACTTGTTGTGTAATT
AATCCTTTTGTCATTATCCCTGCAGTATGCACAATCATTTTGTTGCTATTTTTCTTAAAT
TATAGCAAGGATATAATTATAAGATCAAAAATTATTGACTTATAGTTTAAAAACCCAGTG
TTTTAGTTCTTCCAATCAACTTTATCAGGTGTTATTCCCATAAAAATTTATAATTAAAAG
TAAAATTTTGCTACAAAAATGTAACAACTTTGCAATAATAGCATTTAGACAAACATTATT
TATTGGCTTGTTGGTAGATTCTTTGGAGTTTTCTGCTAATATATAGCTACAGCGGGTTCT
GGTGCTGGTGTCTTTATTATTATAGGTTTATCTTCAGGTAATCCAGGGTTAGCAGGGTAG
AGTTTAACATATTTTATGATGATGACAGATTCTATTTAATGGTGTTTGAGATAATTGTTA
AATGTAGATTCAGTTATGTCCTCCTGTGAAAGAGGTTACTAAATGGTAGATTAGCCTTCT
GAAGCTGAACTGATTAGCGAATACGATATAAAAAATGGTTTAGTTAATAAATAAGATTTG
CTTGAAGATAATATTAAGGTAACAAAAACAGAGCTTGCAAAACCAAATGCAATTACTTAA
TGGCCTAAGCAAGGAAATTTAGAGTTCAAAAATGTTTTTATGAGATACTCCAAAGATCTT
AACCCAGTATTAAAAGGTCTTAATTTTAATATCAAGTAAGGATAAAAGGTAGGATGTATT
GGCAGAACAGGTGCTGGAAAATCTTCAATTCTATAAGCCCTTTTTAGAATGACAGAAGTA
GAATAAGGATCTCAAATTATTTTTGATGACTAAGATACAGCTAAACTCGGTTTGCATACT
CTTCGTTAAAAAATTTCTATTATTCCATAGGTTCCTTTTGTATTTGCTGGTACTATTCGT
AGAAATTTGGATCCACTAGGCCATCACAGTGAGAAGGAATTATGGGATTCGCTCAAAATG
GTCGAGTTAGATCAACATGTTTTAAAAAATTGTCCTCAATAACTTGATACTGATATGACT
AATGTCTAGAGTGTATTTTCAGTTGGTTAAAAGTAGTTGATTTGCCTAGCAAGAGCAATT
TTAAAGAAAAATAAAATGTTGGTTTTAGATGAAGCAACAGCTAATGTAGATATGGAGACA
GATAAGTTGATTTAAAAAACAATACGTGAAAAATTTGAAGATAGCAGTGTTCTTACTATA
GCACACAGATTAAATACTATTGCAGATTATGATAAAGTTATAGTAATGGATTAAGGTGTT
GTAGCAGAATGTGACGAACCTTACAATTTATTAGCTGAAAGTGTTGAAGACACATTTATA
ACAAAAAACACTTTGTTTGCATAGATGGTTTTACATACAGGAAAAAACAATGCAATTAAT
ATTTTCAGCAATGCTAAGAGTAAGTACTTGCAAATGCATAACATTGAAGAATTCTGA


>TTHERM_00683350(protein)
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SLPIRQDSENQQLQKQESNGQQNNTGDKKDQDKQETIGQQQNKSQPEDLRFDDMDYDQNV
HFMFRIIFIHLVKLSVKIKKAIVKGCNLGLQHLPKIKENHKVEKVTDDFYDDILMLKATN
KLQPFQIFKKSIKLYKAEIFQTFVMCFLDAGFKLFNSVALNYCIQYMIYEDHRSAYIWGG
IVLASLVLSTTFRHGSWAVGQNILCRVRLLYVNALYKKISKLSSYSIKEANLGKVINLIS
SDLNSTELKGFFIFNMIVAPFIFIGALIILYFRLGPYGLLSVLFLSFVFPMQNYFGKKAA
LYTQKRTVKSDERVKLINEAIEGIRLIKMYGWEKAFRQMVEKIRSDEISMAIKSICIQCI
EKTFSKCFVLFVATIIFCIIHYTGYELNSAKIFSTIEMLQYIRVNVMLFTGMGISYLFEL
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FKEMGKGDQTEIGERGINISGGQKARISLARAVYSKADIYLLDDPLSAVDSKVAKKLFHN
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QSQKSISNSNSQRDLIDQINEKNAELKNKEKAEAQNKLQPKQVKDNTKVTLRTYQRFFGI
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>TTHERM_00683350(gene)
ATGGATGAATTTGATATTAATCATAGTCCTCATAATAAACCAGTGAGGACAGATTTTTCT
TTAAATGAAGTAGGTGTTTTAGATAATGATAGCTAGTACTAAGATGAGGCTAATTAATAA
CCGGTTGTAGATTAATTGAAGCTAGATGATGTTCAAATCAATACCTAAGAAAATGGAACA
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TAAAATAAATCGCAGCCAGAAGATCTCAGATTTGATGACATGGATTACGATTAGAATGTC
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GCTATTGTGAAGGGATGCAATTTAGGCTTGTAGCATCTCCCAAAGATAAAAGAAAATCAT
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TTATAATAATATAAGCAGTGATCTTGATCATTTGATTACATTTATTATAAATCAATTCTT
TCTTCTAACAATTATCTGAAAGAATAATTAATTATTTTTGATCTAAATTGTTATATTTAA
ATAAAATTTTCCTATCATCAAAGTAATCTTAGTATTCTTCAAATTTTCCAGAAGAATTTT
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TTTTATTTATTTTTTTCAATGGAGAAGATCATTTTTTGTGGTTTTTTAATTCAAAATCTC
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TTATTAACTATTATCACAAAAAATGTTTTATCATCCATCATTTTATTTAGATTTTTTTTT
TGTAATTACAAATATACTAATTTTTTTGTTTTAATAAAAAAAGCCTTTTTAAATATTTAA
GAAATCAATTAAGCTATATAAGGCTGAAATTTTTTAAACATTTGTCATGTGCTTCTTAGA
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GGGTTTCTTCATATTTAATATGATTGTTGCTCCATTCATCTTTATTGGTGCTCTTATAAT
TTTATATTTCCGTCTTGGACCATATGGTAAATTTAATTTAAATAAATTGATTGCTGACAA
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AACTATTTTGGAAAAAAAGCTGCTCTGTACACTTAGAAAAGAACTGTGAAGAGTGATGAG
AGAGTAAAATTAATTAATGAAGCCATTGAAGGAATAAGATTGATAAAAATGTATGGCTGG
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GCAACAATAATATTCTGTATTATTCATTACACTGGGTATGAACTGAATAGCGCAAAAATA
TTTTCAACTATCGAAATGCTTTAATATATCCGTGTTAATGTTATGCTTTTCACAGGAATG
GGTATCTCTTATCTTTTCGAGTTGCGTATCTTTTATAATAGATTTATAGACATCATAACT
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GTTGCTAAAAAGCTTTTCCATAATTGCATTTAAGGAATTTTAAAAAATAGGACTGTGATT
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TTTGTACTATTTGTAAGTTCAGAAATAGCATTCACAGTTTTCAATAGAGGTTTGGGATAT
TACGATTCAACAAGCGATGAATCAAAAGGAAAGTTGTTTGGTTTCCTATTCGGCTTTTCT
TCTTTATATTTGATCTTGAATTTCTTGAAATACATTTTGCTTTCTGTTGGTAAAAAAAAT
TACTTTTTTTGAAAAAATTTTTAAAACAAAACTTTTGAATTTAATCTGAAATTATTTTTT
TGATATTGAAAAGGTATTTTGAAAGGAAGTTAAATCCTTCATGACGATATGTTTAAATCT
TTAACTAGAGCACCTGTGTTATTTTTTGATTAAACTCCTGGTGGATATCTGATGAATAAA
TTTTCAAATGATATTGGTCTAATGGATAATGCACTAAATTATTCTGCTAATGATGGTCTT
GATATCATGTTCTATTTCTTGAATTTGATGATTACTTGTTGTGTAATTAATCCTTTTGTC
ATTATCCCTGCAGTATGCACAATCATTTTGTTGCTATTTTTCTTAAATTATAGCAAGGAT
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CAATCAACTTTATCAGGTGTTATTCCCATAAAAATTTATAATTAAAAGTAAAATTTTGCT
ACAAAAATGTAACAACTTTGCAATAATAGCATTTAGACAAACATTATTTATTGGCTTGTT
GGTAGATTCTTTGGAGTTTTCTGCTAATATATAGCTACAGCGGGTTCTGGTGCTGGTGTC
TTTATTATTATAGGTTTATCTTCAGGTAATCCAGGGTTAGCAGGGTAGAGTTTAACATAT
TTTATGATGATGACAGATTCTATTTAATGGTGTTTGAGATAATTGTTAAATGTAGATTCA
GTTATGTCCTCCTGTGAAAGAGGTTACTAAATGGTAGATTAGCCTTCTGAAGCTGAACTG
ATTAGCGAATACGATATAAAAAATGGTTTAGTTAATAAATAAGATTTGCTTGAAGATAAT
ATTAAGGTAACAAAAACAGAGCTTGCAAAACCAAATGCAATTACTTAATGGCCTAAGCAA
GGAAATTTAGAGTTCAAAAATGTTTTTATGAGATACTCCAAAGATCTTAACCCAGTATTA
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GCTGGAAAATCTTCAATTCTATAAGTAAAAACAACAAACAAACTATAAATATACACATAA
ACTAATTAAAATTACATATTTTTTAATTATTAAAAGGCCCTTTTTAGAATGACAGAAGTA
GAATAAGGATCTCAAATTATTTTTGATGACTAAGATACAGCTAAACTCGGTTTGCATACT
CTTCGTTAAAAAATTTCTATTATTCCATAGGTTCCTTTTGTATTTGCTGGTACTATTCGT
AGAAATTTGGATCCACTAGGCCATCACAGTGAGAAGGAATTATGGGATTCGCTCAAAATG
GTCGAGTTAGATCAACATGTTTTAAAAAATTGTCCTCAATAACTTGATACTGATATGAGT
AAAAAATTAGACATTTAAAAAAAATATCTTAACAATTTTGAAATAGAAATTCAAATATAA
AAATAATATTTTTTTCAAATTTAATAGCTAATGTCTAGAGTGTATTTTCAGTTGGTTAAA
AGTAGTTGATTTGCCTAGCAAGAGCAATTTTAAAGAAAAATAAAATGTTGGTTTTAGATG
AAGCAACAGCTAATGTAGATATGGAGACAGATAAGTTGATTTAAAAAACAATACGTGAAA
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ATAAAGTTATAGTAATGGATTAAGGTGTTGTAGCAGAATGTGACGAACCTTACAATTTAT
TAGCTGAAAGTGTTGAAGACACATTTATAACAAAAAACACTTTGTTTGCATAGATGGTTT
TACATACAGGAAAAAACAATGCAATTAATATTTTCAGCAATGCTAAGAGTAAGTACTTGC
AAATGCATAACATTGAAGAATTCTGA