Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_01001250
Standard Name
ITU2 (Iota-TUbulin)
Aliases
PreTt15745 | 190.m00055 | 3820.m00278
Description
ITU2 tubulin/FtsZ family GTPase domain protein; Iota-tubulin
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Cellular Component Biological Process
Domains
No Data fetched for Domains
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 13.2%
TetraMine Data
TTHERM_01001250
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_07346.1 4.0003031991288476e-163 tubulin/FtsZ family, GTPase do
main-containing protein (438 a
a)
SGD YFL037W 6.000034430729774e-56 TUB2 Beta-tubulin; associates
with alpha-tubulin (Tub1p and
Tub3p) to form tubulin dimer,
which polymerizes to form micr
otubules
WormBase WBGene00006538 5.0007856079333316e-54 locus:tbb-4 Tubulin beta-4 c
hain status:Partially_confir
med UniProt:P41937 protein
_id:CAA86310.1
Oxytricha Contig12717.0.g75 2.9994376937714457e-52 Tubulin/FtsZ family, GTPase do
main
DictyBase DDB_G0269196 3.9991604984848653e-48 tubB on chromosome: 1 position
3261649 to 3263130
Stentor Coeruleus SteCoe_5719 2.6102790696677047e-23
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:16933976 : Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,
Sequences
>TTHERM_01001250(coding)ATG TCT AGT ATT GTT TCA ATT GCA ATA GGA TAA TGT GGT ATT TCA ATA TAA GAA AAA CAA TGG ATA ACT CTG CTT TAA GAG TAT GGG ATT GAT GAA TGC GGA ATA ATC AAT AAA TTG GAA AAT GAT AAA AAA TTA GAC TCA TAT TTT TAT GAA GTA AAA GAA AAC GTT TAC AAG CCT AGA GCT CTT TTT ACA GAT TTA GAT GAT CAT CGT ATT AAT TCC TTG CAG AGT GCT AGT CTA AAA TAA CTA TTT TAA GGA GTA CCG ACA GTT TAT TCA ATT GAT GGT AGT CAT AAT CTG TTT GCA AGG GGA ATG TAT TCA GTA GGA AGT GAA TTA AAA GAT GAA ATT TAA AAC TAA ATT ACA TAT TTA TTA GAA TAA TGT GAC AGT GTA GAC TCT ATC TAA ATT TAA AAC TCG CTA TAC GGA GGG ACA GGT TCT GGA TTA GGT GGT TTA ATA TAT GAT ATA CTA AAT GAG GTT GCT CCA TAA TAC ATA ACT AAC AAT CTT GTG TAA TAT CCA GAT TTA AGT ACA TAA AGC TAA ATG ACA CTA GAA ATT TAT AAT AAT ATT CTG GGT TAA AAT AAA TAA GCT CAT TTA ACA TTA ATT TTA CCC TTT TGT AAC TAA AAT ATA TAG TTT TTG AAT GAT GGC TCA TAT AAA ATT TAA AAA TAA AAA GGA TTT GAC AAT ATA AAT AAT GTT ATA TCA CAA ATT CAC CCA CTC ATC ACT AGT GGA TCG AGA TAT CAT GGC TCA ATT AAT GCA AGC ACT AGA AAA ATA TGT ACA AAT ATA ATA CCT TTT CCA AGA TTA AAA CAT ATG AGT ATG ATC TGC TTA CCT CTT AAT TAT TAC AAA TAA AAA TAG TAA ACA TAA TTA GAT TAT ATA GAA ATG ATA CAT GAT AGT GTT AAT TAA GAA TAT TCT TTT TTC AGT AAG GAT ACA TTT AGA ATA CTG TGT TCT CAT CAT ATG ATA CGG GGA GTT GAT ATT CAT TAA GAA GAA ATA GAA TCA GAG TAT AAT AAA TTA TAC AGA TCA AAT AAT ATT TTT GCA ACA AAT TGG ATA CCA AAT TCT TGC TCA ATT TCT TAT TGC AAT GTT CCA TGT CAA TAC AAT TCA AAA TTA ATT TTT TCT ATA ATT TCA AAT TAC AAT ATA TGT AGG CAC TTT GAA AAA TAC ACT TAA TAA TAT TCA TAA CTA TTT AGA AGA AAG GCA TAT TTG CAT TAC TAT CTA TAA GAA GGT ATG GAT GAA ATG GAG TTT ACA GAA GCA GAA TCA AAT ATT AAT GAT GTA ATT TGT GAT TAT TAG GCA TCT GGA TAT TAT GAA AAT GTT GTT GAA GAA GAT AAT CAT GAT GAT GAT GAT CAA TAT ATG TTA AAT TAT TTT GAT TGA >TTHERM_01001250(protein)M S S I V S I A I G Q C G I S I Q E K Q W I T L L Q E Y G I D E C G I I N K L E N D K K L D S Y F Y E V K E N V Y K P R A L F T D L D D H R I N S L Q S A S L K Q L F Q G V P T V Y S I D G S H N L F A R G M Y S V G S E L K D E I Q N Q I T Y L L E Q C D S V D S I Q I Q N S L Y G G T G S G L G G L I Y D I L N E V A P Q Y I T N N L V Q Y P D L S T Q S Q M T L E I Y N N I L G Q N K Q A H L T L I L P F C N Q N I Q F L N D G S Y K I Q K Q K G F D N I N N V I S Q I H P L I T S G S R Y H G S I N A S T R K I C T N I I P F P R L K H M S M I C L P L N Y Y K Q K Q Q T Q L D Y I E M I H D S V N Q E Y S F F S K D T F R I L C S H H M I R G V D I H Q E E I E S E Y N K L Y R S N N I F A T N W I P N S C S I S Y C N V P C Q Y N S K L I F S I I S N Y N I C R H F E K Y T Q Q Y S Q L F R R K A Y L H Y Y L Q E G M D E M E F T E A E S N I N D V I C D Y Q A S G Y Y E N V V E E D N H D D D D Q Y M L N Y F D >TTHERM_01001250(gene)ATG TCT AGT ATT GTT TCA ATT GCA ATA GGA TAA TGT GGT ATT TCA ATA TAA GAA AAA CAA TGG ATA ACT CTG CTT TAA GAG TAT GGG ATT GAT GAA TGC GGA ATA ATC AAT AAA TTG GAA AAT GAT AAA AAA TTA GAC TCA TAT TTT TAT GAA GTA AAA GAA AAC GTT TAC AAG CCT AGA GCT CTT TTT ACA GAT TTA GAT GAT CAT CGT ATT AAT TCC TTG CAG AGT GCT AGT CTA AAA TAA CTA TTT TAA GGA GTA CCG ACA GTT TAT TCA ATT GAT GGT AGT CAT AAT CTG TTT GCA AGG GGA ATG TAT TCA GTA GGA AGT GAA TTA AAA GAT GAA ATT TAA AAC TAA ATT ACA TAT TTA TTA GAA TAA TGT GAC AGT GTA GAC TCT ATC TAA ATT TAA AAC TCG CTA TAC GGA GGG ACA GGT TCT GGA TTA GGT GGT TTA ATA TAT GAT ATA CTA AAT GAG GTT GCT CCA TAA TAC ATA ACT AAC AAT CTT GTG TAA TAT CCA GAT TTA AGT ACA TAA AGC TAA ATG ACA CTA GAA ATT TAT AAT AAT ATT CTG GGT TAA AAT AAA TAA GCT CAT TTA ACA TTA ATT TTA CCC TTT TGT AAC TAA AAT ATA TAG TTT TTG AAT GAT GGC TCA TAT AAA ATT TAA AAA TAA AAA GGA TTT GAC AAT ATA AAT AAT GTT ATA TCA CAA ATT CAC CCA CTC ATC ACT AGT GGA TCG AGA TAT CAT GGC TCA ATT AAT GCA AGC ACT AGA AAA ATA TGT ACA AAT ATA ATA CCT TTT CCA AGA TTA AAA CAT ATG AGT ATG ATC TGC TTA CCT CTT AAT TAT TAC AAA TAA AAA TAG TAA ACA TAA TTA GAT TAT ATA GAA ATG ATA CAT GAT AGT GTT AAT TAA GAA TAT TCT TTT TTC AGT AAG GAT ACA TTT AGA ATA CTG TGT TCT CAT CAT ATG ATA CGG GGA GTT GAT ATT CAT TAA GAA GAA ATA GAA TCA GAG TAT AAT AAA TTA TAC AGA TCA AAT AAT ATT TTT GCA ACA AAT TGG ATA CCA AAT TCT TGC TCA ATT TCT TAT TGC AAT GTT CCA TGT CAA TAC AAT TCA AAA TTA ATT TTT TCT ATA ATT TCA AAT TAC AAT ATA TGT AGG CAC TTT GAA AAA TAC ACT TAA TAA TAT TCA TAA CTA TTT AGA AGA AAG GCA TAT TTG CAT TAC TAT CTA TAA GAA GGT ATG GAT GAA ATG GAG TTT ACA GAA GCA GAA TCA AAT ATT AAT GAT GTA ATT TGT GAT TAT TAG GCA TCT GGA TAT TAT GAA AAT GTT GTT GAA GAA GAT AAT CAT GAT GAT GAT GAT CAA TAT ATG TTA AAT TAT TTT GAT TGA