Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00548140
Standard Name
IMB4 (Importin Beta 4)
Aliases
PreTt15063 | 71.m00190 | 3729.m00067
Description
IMB4 karyopherin putative; Importin-beta N-terminal domain containing protein;
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
( PF02985 ) HEAT repeat
( PF01602 ) Adaptin N terminal region
( PF03130 ) PBS lyase HEAT-like repeat
( PF03810 ) Importin-beta N-terminal domain
( PF06827 ) Zinc finger found in FPG
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.4%
TetraMine Data
TTHERM_00548140
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_17057.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (1087 aa)
DictyBase DDB_G0270336 2.0004062814618821e-57 ipo4 on chromosome: 1 position
4662405 to 4666147
Stentor Coeruleus SteCoe_5614 6.054601895401186e-39
SGD YER110C 4.000352986427571e-28 KAP123 Karyopherin beta, media
tes nuclear import of ribosoma
l proteins prior to assembly i
nto ribosomes and import of hi
stones H3 and H4; localizes to
the nuclear pore, nucleus, an
d cytoplasm; exhibits genetic
interactions with RAI1
Oxytricha Contig12471.0.0.g107 2.000769134519826e-18 hypothetical protein
WormBase WBGene00002077 0.00000000009998509410508463 locus:imb-3 status:Confirmed
UniProt:Q9N5V3 protein_id
:CCD67936.1
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:18676955 : Malone CD, Falkowska KA, Li AY, Galanti SE, Kanuru RC, LaMont EG, Mazzarella KC, Micev AJ, Osman MM, Piotrowski NK, Suszko JW, Timm AC, Xu MM, Liu L, Chalker DL (2008) Nucleus-specific importin alpha proteins and nucleoporins regulate protein import and nuclear division in the binucleate Tetrahymena thermophila. Eukaryotic cell 7(9):1487-99
Sequences
>TTHERM_00548140(coding)ATG AGC GGA ACT CCT GAA ATC ACT AAC TTA GAT TAG GCC ATT GAA GTT ATG AAT GGT ATT CTT AGT GGT AAT AAC GAA AAG ATT AAG ATT GGT ACT AAG TTG TTG AAG CAT TTT TGC AAG AAG ACT GAT TCC ATC AGT ATC TTC ACT TAC ATT TTG GCT CAT TGC CAA TAA GAT AAC TTG AGA CAC TTA GCT GGT ATT TTA TTA AAG AGA AAC ATG ATC GCT AAT TTC TCT AAC TTG GCA GAA CAA GCT TAA AAA GAT TTA CAA ATG GTT CTC TTA GAA AGA TTC TTT TCT GAA TCA ATG AAA TCC GTT CGT AAA TCT ATC GGT GCC TTG ATT GGT ATC ATT GCT AAG CTT ACC CTT CCC GAA GGA AAG TGG GCT GAA CTC TTA TAA GTC ATC CAA CAA CAT ACC GAC AAG TCA TAA ACT CTT TAA AAC AGA ATT TAC GGT CTC TAA CTT CTT GAG TTA GTC CTC GAT TAT TCA GCT TCT TCT ATT TCT AGC TTC TAC AAC AAT TTC TAC CCC TTC TTC AAG GAA TCT ATT CAA GAC TCT AAT AAG GAC ATC AGA ATT GGT ACC CTC AAG TGC TTA GTT AAC CTT TTC GAT AAC ATC CAA GAT ATG ACT GCT GAC CAA ATT AAC TTA TAT AAA GAA TTG GTT GGT CCT ATC TTG AAT ATC TTA GAT TCT TTG ATA GAT CAA AAT GAC GAA GAC TTA GTT TAC TAC TGC TTT GAT GCT TTG AAT CTT TTA ACT GAA AAT AAG AAA AGT ATT CTC GAC CAA CAT TTG GGT CAA ATC GTT GAA TAT ATG TGC TCA AAT AAG GTT TTA GGA AAT CCC AAG CTT TCT AAG AAG ATC AAA GAA GTC GTT ATT GAT ATG ATT TTC TCT GCA TCC TAA TAC CAT AAA TCT GTT TTC AAC AAG AAT ACT CCC TTA TTG AAG AAA GTT ATT GAA TCT ATT TGC CTT ATT ATT GCT ACT CCT TTC TCT GAA GAA GAT TTA GAA GAT GGT GAA GAA CCC TTA TAA GAT ATT GCT TTA TGG TTA GTT TTA TCT TTG AGC ATG GTT TTG AAT AAG AAG AAA ACT TAC GGT GTC CTC TTG GAA GCT ATC ACT GCT TTA ATT CAC TCT GGT GAA CCC AAT AAA ATG AAC AGT GGT TTC CTC ATT TTG GCT TAA TTA GCT GAA GGT TGC TAC GAA TAA ATT GCC AGA AAC TTA GCT AAT CCT ATT ATG AGT GAC TTC ATG GTT AAG GGT TTG AAT CAC CCT GCT GGT GAA GTT AGA GGT GCT GCT ATT AAA GCT TTG ACT TAC TTC GCT GAA TAC TTG CCC GTT GAT GTT TGC AAA TAT CAT AGC ACT ATC GTT CCC GCC ATT ATC AGT ACC TTC GAT GAT CTC AAT AAC AAG GTT GCT GAA AAA GCC ATT ATT GCT ATT GAT ATC TTC TGC GAT AAC TTA GAA CCT GAA GAT TTA GAA TTA TAC ATG TAA TCC ATC ACT GAA AAG TTA TGC ATG ATT GCT ATG AAG GAT AAC TCT ACT ATG TTA ATG AGA AGA GTT TCA GTT AGT GCT CTC GCT TCT TGC ATT TCT ACT GTT GAA CAC AAA TTC AAG CCT TTC GTT ACT GTT GTT GCT AAT TTA ATG CAC TAA ATT ATT GGA CTT GCA CAC AAT GCT GAA GTC ATC GCT TTA AAG GCA GAA GCT ATC AAC TGC TTA GGT AAA ATT GCT GCC GCC TTC ATT TCT GAA GAC AGA TCT ATC TAT GAG CAA CAC GTC GTT CCT TGC TTA GAA ACT ATT TAC CAC TTA TTA ACT ACT GTT GAT GAC TTT GAA ATG AGA GAA GGT TGT TTC TCA TTC TTC TAC AAT CTC GCT CAC GCC ATC GGC AGT GAA TTC GAA GTC ATG TTC GAT AAG CTC ATC GAA TTT ACT CTT AAG TAA GCT GCC AGT GAA GAA GGT GTC ACT TAC AAC AAA AAC GGT AAG AAC GGT GAA TTC TCA CTT GAC TCC GAT AGC GAA GAA GAA GAT GAA GAT TTG CTT GAA GAC GAA GAC CAC AAT ACT GCT GTC AAC ATC AAA ACT GCC TTT GTT TTA GAA AAA TCT GCT GCC ATC ACT GCT GTT GGT CAA TTC GCA GTT GCA TGC CCT ATG AAG TTT ATT CCT TAC TAC GAA AAA GCC TTA TCC ATT CTT GAA ACT TGC TAC AAT TAT TTC GAC GAA AAT GTC CGT CAA TAA GTC TGC AAA TGC TAC AAG GAT CTC TGT GTT GCC ATG GTT AAA ACT GCC AAT AAT GGT GTT CTT CCC AAG TTC GAA AGA GGT CTC CCC GTT AAG GCT CGT TTC CCT GAA AAG ATT GAA AAC GTT ATT CAA ATT GAC ATC TTC TAG AAA TTC TTG TAC TAT CTC AAC TAA GAA GAA GCC TGC GAA GTC ACT GGT ATG GCT ATT GAA ATT ATT GTT GAA TTA TTT AAG ACA CTT GGT CCT GCT TGC TTT GAT AAA AAC TTA GAC GAT ATT TCT AAT GCT ATC GTT AAG CTT TTA GAA AAC GAA AGC GAA GAT GAT GAA CTT GGT GGT GAT GAT GAA GAA GAT GAA GAC GAT GCT GAT GGA TAC GTT ATT GAA GCT CTC ACT GAC TTA ATT CCT ACT TTG TGC AAG CTC TGT GGT GAT ACT TTT AGC TTA AAC TTC TAA AAG ATC TAC CCT TCC ATG ATG AAA TAC CTT AAC CCC AAG AGA GAT ATC AGC GAA AAT ATC TAT ATG GTT GGT TGT TTC TCT GAA GTC ATG AAA TAT ACT CCT AAT TTC CTC CTC TTC ACC AGA GAA ACT CTT ATT CCC ACT TTG TTA GAA AAG GTC TAA TAC GGT GAT GAT GAA ATG AAT AGA AAC CTT GCT TTC TGT CTT GGT AAC ATT GTT GAA AAG GGT CTC AAC CAC GTC TAA GAA GCT CTT CCT ACC ATT CTC AAT ATC TTA AAG AAT ATC TTT GAA ACA TCA GTT GAA TAA GCC ACT AAG GAC AAT GCT GCT GCT GCC CTC TGC AGA GTT ATG ATG ACT ATT CCT GAC TAG TTC CCT CTT GAT GCT GCT CTT GAT TAA ATT CTT TCT ATC GCT CCC TTC TAA GGT GAT GAA GCT GAA GAA AAG ACT GTC ATT AGA ACC CTC CTT TTC CTT GCA GAA AAG TAT CCT TAA GTT ATT ACT CCC AAG ATC AAC AAA GCC ATC GCT CTT TTC GTT GAT GGT CTT GCT AAC CTC AAA TTA TAC AAC ATT AAG GAT GAA TTA AAG GGT AAA ATT GTT CTC CTT CTT AAG AAC CTT GCT AAC AAC TCT GCT GAA CAC AAA GCT CAA TTA GAA TAG GTT GTC TTC GCT AGT GAA GAA AAG GAA AAG CTT ATC AAG TTA TTA TAA TGA >TTHERM_00548140(protein)M S G T P E I T N L D Q A I E V M N G I L S G N N E K I K I G T K L L K H F C K K T D S I S I F T Y I L A H C Q Q D N L R H L A G I L L K R N M I A N F S N L A E Q A Q K D L Q M V L L E R F F S E S M K S V R K S I G A L I G I I A K L T L P E G K W A E L L Q V I Q Q H T D K S Q T L Q N R I Y G L Q L L E L V L D Y S A S S I S S F Y N N F Y P F F K E S I Q D S N K D I R I G T L K C L V N L F D N I Q D M T A D Q I N L Y K E L V G P I L N I L D S L I D Q N D E D L V Y Y C F D A L N L L T E N K K S I L D Q H L G Q I V E Y M C S N K V L G N P K L S K K I K E V V I D M I F S A S Q Y H K S V F N K N T P L L K K V I E S I C L I I A T P F S E E D L E D G E E P L Q D I A L W L V L S L S M V L N K K K T Y G V L L E A I T A L I H S G E P N K M N S G F L I L A Q L A E G C Y E Q I A R N L A N P I M S D F M V K G L N H P A G E V R G A A I K A L T Y F A E Y L P V D V C K Y H S T I V P A I I S T F D D L N N K V A E K A I I A I D I F C D N L E P E D L E L Y M Q S I T E K L C M I A M K D N S T M L M R R V S V S A L A S C I S T V E H K F K P F V T V V A N L M H Q I I G L A H N A E V I A L K A E A I N C L G K I A A A F I S E D R S I Y E Q H V V P C L E T I Y H L L T T V D D F E M R E G C F S F F Y N L A H A I G S E F E V M F D K L I E F T L K Q A A S E E G V T Y N K N G K N G E F S L D S D S E E E D E D L L E D E D H N T A V N I K T A F V L E K S A A I T A V G Q F A V A C P M K F I P Y Y E K A L S I L E T C Y N Y F D E N V R Q Q V C K C Y K D L C V A M V K T A N N G V L P K F E R G L P V K A R F P E K I E N V I Q I D I F Q K F L Y Y L N Q E E A C E V T G M A I E I I V E L F K T L G P A C F D K N L D D I S N A I V K L L E N E S E D D E L G G D D E E D E D D A D G Y V I E A L T D L I P T L C K L C G D T F S L N F Q K I Y P S M M K Y L N P K R D I S E N I Y M V G C F S E V M K Y T P N F L L F T R E T L I P T L L E K V Q Y G D D E M N R N L A F C L G N I V E K G L N H V Q E A L P T I L N I L K N I F E T S V E Q A T K D N A A A A L C R V M M T I P D Q F P L D A A L D Q I L S I A P F Q G D E A E E K T V I R T L L F L A E K Y P Q V I T P K I N K A I A L F V D G L A N L K L Y N I K D E L K G K I V L L L K N L A N N S A E H K A Q L E Q V V F A S E E K E K L I K L L Q >TTHERM_00548140(gene)ATG AGC GGA ACT CCT GAA ATC ACT AAC TTA GAT TAG GCC ATT GAA GTT ATG AAT GGT ATT CTT AGT GGT AAT AAC GAA AAG ATT AAG ATT GGT ACT AAG TTG TTG AAG CAT TTT TGC AAG AAG ACT GAT TCC ATC AGT ATC TTC ACT TAC ATT TTG GCT CAT TGC CAA TAA GAT AAC TTG AGA CAC TTA GCT GGT ATT TTA TTA AAG AGA AAC ATG ATC GCT AAT TTC TCT AAC TTG GCA GAA CAA GCT TAA AAA GAT TTA CAA ATG GTT CTC TTA GAA AGA TTC TTT TCT GAA TCA ATG AAA TCC GTT CGT AAA TCT ATC GGT GCC TTG ATT GGT ATC ATT GCT AAG CTT ACC CTT CCC GAA GGA AAG TGG GCT GAA CTC TTA TAA GTC ATC CAA CAA CAT ACC GAC AAG TCA TAA ACT CTT TAA AAC AGA ATT TAC GGT CTC TAA CTT CTT GAG TTA GTC CTC GAT TAT TCA GCT TGT AAT ATA TTG TTT ATT TCA TAG CTT TTT GTT CAA TTT TTT AGA TTT TTA GTG GTC ATT ATT CAT CTT CTA CTT TTT AGA AGC AAA TAT CTG CAA CAA GGC TTA TTT TTA AAC AAG CTA GTC ATA CTT TTA AAG CAG GAA AAA AAT GAT AAC TTT AAA TTA CTT CAA AAA TTA ATA GCT AAC TAT TCA AAT TAT AAA AAA TAG CTT CTA TTT CTA GCT TCT ACA ACA ATT TCT ACC CCT TCT TCA AGG AAT CTA TTC AAG ACT CTA ATA AGG ACA TCA GAA TTG GTA CCC TCA AGT GCT TAG TTA ACC TTT TCG ATA ACA TCC AAG ATA TGA CTG CTG ACC AAA TTA ACT TAT ATA AAG AAT TGG TTG GTC CTA TCT TGA ATA TCT TAG ATT CTT TGA TAG ATC AAA ATG ACG AAG ACT TAG TTT ACT ACT GCT TTG ATG CTT TGA ATC TTT TAA CTG AAA ATA AGG TAA ATA AAT AAA CAA ATA TTT CTA ACT AAA AAT ATA AAT GAA GAT AAT CTA AAT CAT AGG CTA ACT AAC TAG CTG ACT ATC AGC AAA TAA AAT CAT GTT AAA TAT TTT TAA AAT GAA AAA GCA TAC TAA GAA CAA TGC AAA TAA TAG AAA AAT TTG AGG AAA TAT ATT TTA AAA TTT AGA TAT AAA TTA ATT TCA CTC AAA CAT TAA ACA AAT ATC TTA ATT TTG CAA ACA AAC AAA GAA AGA TAT ATA AAA ATT AAT AAA TTA GTT AAT TTT GCA ACC ATT CAA AAA ATC AAT ATT ACA AAT CTT TGC TAT TCA AAA AAA TAA TTA AAT TAC ACA TTC AAG AAT GAA ATA ATT ATA CCT AAT TCC GCG AAA ATT AAA TAA ATA AAT AAA TAT ACA AAG CAT ATT TAG TTA GAT AAA TAG CTT GTT TGC TTA GAT TTT CTT TTC ATT TAA ATA TTT AAT TTA AAA TTA AAT GAT TTA TTT AAT ATA AAA CAG AAA AGT ATT CTC GAC CAA CAT TTG GGT CAA ATC GTT GAA TAT ATG TGC TCA AAT AAG GTT TTA GGA AAT CCC AAG CTT TCT AAG AAG ATC AAA GAA GTC GTT ATT GAT ATG ATT TTC TCT GCA TCC TAA TAC CAT AAA TCT GTT TTC AAC AAG AAT ACT CCC TTA TTG AAG AAA GTT ATT GAA TCT ATT TGC CTT ATT ATT GCT ACT CCT TTC TCT GAA GAA GAT TTA GAA GAT GGT GAA GAA CCC TTA TAA GAT ATT GCT TTA TGG TTA GTT TTA TCT TTG AGC ATG GTT TTG AAT AAG AAG AAA ACT TAC GGT GTC CTC TTG GAA GCT ATC ACT GCT TTA ATT CAC TCT GGT GAA CCC AAT AAA ATG AAC AGT GGT TTC CTC ATT TTG GCT TAA TTA GCT GAA GGT TGC TAC GAA TAA ATT GCC AGA AAC TTA GCT AAT CCT ATT ATG AGT GAC TTC ATG GTT AAG GGT TTG AAT CAC CCT GCT GGT GAA GTT AGA GGT GCT GCT ATT AAA GCT TTG ACT TAC TTC GCT GAA TAC TTG CCC GTT GAT GTT TGC AAA TAT CAT AGC ACT ATC GTT CCC GCC ATT ATC AGT ACC TTC GAT GAT CTC AAT AAC AAG GTT GCT GAA AAA GCC ATT ATT GCT ATT GAT ATC TTC TGC GAT AAC TTA GAA CCT GAA GAT TTA GAA TTA TAC ATG TAA TCC ATC ACT GAA AAG TTA TGC ATG ATT GCT ATG AAG GAT AAC TCT ACT ATG TTA ATG AGA AGA GTT TCA GTT AGT GCT CTC GCT TCT TGC ATT TCT ACT GTT GAA CAC AAA TTC AAG CCT TTC GTT ACT GTT GTT GCT AAT TTA ATG CAC TAA ATT ATT GGA CTT GCA CAC AAT GCT GAA GTC ATC GCT TTA AAG GCA GAA GCT ATC AAC TGC TTA GGT AAA ATT GCT GCC GCC TTC ATT TCT GAA GAC AGA TCT ATC TAT GAG CAA CAC GTC GTT CCT TGC TTA GAA ACT ATT TAC CAC TTA TTA ACT ACT GTT GAT GAC TTT GAA ATG AGA GAA GGT TGT TTC TCA TTC TTC TAC AAT CTC GCT CAC GCC ATC GGC AGT GAA TTC GAA GTC ATG TTC GAT AAG CTC ATC GAA TTT ACT CTT AAG TAA GCT GCC AGT GAA GAA GGT GTC ACT TAC AAC AAA AAC GGT AAG AAC GGT GAA TTC TCA CTT GAC TCC GAT AGC GAA GAA GAA GAT GAA GAT TTG CTT GAA GAC GAA GAC CAC AAT ACT GCT GTC AAC ATC AAA ACT GCC TTT GTT TTA GAA AAA TCT GCT GCC ATC ACT GCT GTT GGT CAA TTC GCA GTT GCA TGC CCT ATG AAG TTT ATT CCT TAC TAC GAA AAA GCC TTA TCC ATT CTT GAA ACT TGC TAC AAT TAT TTC GAC GAA AAT GTC CGT CAA TAA GTC TGC AAA TGC TAC AAG GAT CTC TGT GTT GCC ATG GTT AAA ACT GCC AAT AAT GGT GTT CTT CCC AAG TTC GAA AGA GGT CTC CCC GTT AAG GCT CGT TTC CCT GAA AAG ATT GAA AAC GTT ATT CAA ATT GAC ATC TTC TAG AAA TTC TTG TAC TAT CTC AAC TAA GAA GAA GCC TGC GAA GTC ACT GGT ATG GCT ATT GAA ATT ATT GTT GAA TTA TTT AAG ACA CTT GGT CCT GCT TGC TTT GAT AAA AAC TTA GAC GAT ATT TCT AAT GCT ATC GTT AAG CTT TTA GAA AAC GAA AGC GAA GAT GAT GAA CTT GGT GGT GAT GAT GAA GAA GAT GAA GAC GAT GCT GAT GGA TAC GTT ATT GAA GCT CTC ACT GAC TTA ATT CCT ACT TTG TGC AAG CTC TGT GGT GAT ACT TTT AGC TTA AAC TTC TAA AAG ATC TAC CCT TCC ATG ATG AAA TAC CTT AAC CCC AAG AGA GAT ATC AGC GAA AAT ATC TAT ATG GTT GGT TGT TTC TCT GAA GTC ATG AAA TAT ACT CCT AAT TTC CTC CTC TTC ACC AGA GAA ACT CTT ATT CCC ACT TTG TTA GAA AAG GTC TAA TAC GGT GAT GAT GAA ATG AAT AGA AAC CTT GCT TTC TGT CTT GGT AAC ATT GTT GAA AAG GGT CTC AAC CAC GTC TAA GAA GCT CTT CCT ACC ATT CTC AAT ATC TTA AAG AAT ATC TTT GAA ACA TCA GTT GAA TAA GCC ACT AAG GAC AAT GCT GCT GCT GCC CTC TGC AGA GTT ATG ATG ACT ATT CCT GAC TAG TTC CCT CTT GAT GCT GCT CTT GAT TAA ATT CTT TCT ATC GCT CCC TTC TAA GGT GAT GAA GCT GAA GAA AAG ACT GTC ATT AGA ACC CTC CTT TTC CTT GCA GAA AAG TAT CCT TAA GTT ATT ACT CCC AAG ATC AAC AAA GCC ATC GCT CTT TTC GTT GAT GGT CTT GCT AAC CTC AAA TTA TAC AAC ATT AAG GAT GAA TTA AAG GGT AAA ATT GTT CTC CTT CTT AAG AAC CTT GCT AAC AAC TCT GCT GAA CAC AAA GCT CAA TTA GAA TAG GTT GTC TTC GCT AGT GAA GAA AAG GAA AAG CTT ATC AAG TTA TTA TAA TGA