Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00694540

Standard Name

IFT122 (IntraFlagellar Transport 122)

Aliases

PreTt02937 | 107.m00117 | 3753.m00409 | IFT122A

Description

intraflagellar transporter; Intraflagelar transport protein; plays a role in returning IFT proteins from the ciliary tip to the cell body during ciliary regeneration

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Biological Process

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.1%

TetraMine Data

TTHERM_00694540

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD01787 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A
  • ( SD01791 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A
  • ( SD01792 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A
  • ( SD01788 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A and of IFT172
  • ( SD01789 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A and of IFT172
  • ( SD01790 ) Micronucleus: Neo3 into coding of IFT122A and of IFT172

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Stentor CoeruleusSteCoe_284140
Tetrahymena borealisEI9_18435.19.997093137033517e-262hypothetical protein (1253 aa)
OxytrichaContig19231.0.g399.997093137033517e-262WD domain, G-beta repeat
WormBaseWBGene000009067.998663834726165e-156locus:daf-10 status:Confirme
d UniProt:G5EFW7 protein_i
d:CAB05177.4
DictyBaseDDB_G02930700.0000007997233352734267DDB_G0293070 on chromosome: 6
position 2426564 to 2433958
SGDYBR198C0.000019995566179747357TAF5 Subunit (90 kDa) of TFIID
and SAGA complexes, involved
in RNA polymerase II transcrip
tion initiation and in chromat
in modification

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:18211962: Tsao CC, Gorovsky MA (2008) Tetrahymena IFT122A is not essential for cilia assembly but plays a role in returning IFT proteins from the ciliary tip to the cell body. Journal of cell science 121(Pt 4):428-36
  2. Ref:18199688: Tsao CC, Gorovsky MA (2008) Different effects of Tetrahymena IFT172 domains on anterograde and retrograde intraflagellar transport. Molecular biology of the cell 19(4):1450-61

Sequences

>TTHERM_00694540(coding)
ATGAAGTGTTCAGAACTATGGACGGAAATCATTCCCAAGAATGACCCCAATTCTAATATA
ACAAATCAAGTATGGAGTTGTAGCTTCAATAATGATGGCTCTATATTATTAGCTTGTGTA
GGAGATGCTATTCTTGTATACGATTCATTTACTGGCAATTTAGTAAATAAAGCAATTAGA
GGAGGATAAAAGGAATAAATTAATTGCATCAAGTTCTCAAAAGATGGAAAAAGGTTTGCA
ACTGCTAGTAATGATAAAACTGTTTGGGTCTGGTCATTCGATGTAAATAAAAATCCCAAA
TTAGCACCTGAAGTAAAATATTCTCATACAGATAAGGTTTTATGTCTTGCTTTTAATCCA
TTGACGCATCAAATTTTCTCTGGAGGTGCTTAGGACTATGCTTTATGGACTCCAGATCAA
CAAAGTATAGAAAAATCTAAATTTAAAGATAAAATAATAACTTGTGCATGGAGTTGGGAT
GGTTTATATTTAGGTTTTGGTACTATGGGAGGTATTATTGGAATAAGAAACAGAGCTCTC
GAATAGTTAGCAGAAATTTAAAGGTCATTCCCTATATGGTGTATGGATTGGACGCCAATT
ACTCCTGACTATTAAAACAGTGTTCTCGTAGTAGGTGTTTGGGAATAGTCAATAGCTCAC
TATAATATTTAAGGTCAATAATTAGGTTCGGATAAAAAGCTTACATATGATCCTATAGAT
ATCAATTTTAGCACTCAAGGAGAATTCCTTTTAGTAAGTGGAACTAATAACAAATGCACT
CTATACACCAGAGAAGGTGGCTTTTTAATAGATGTTGCAACAAAAAATGATTGGGTTTGG
AATAATAAATTGAAACCTGTAATTAAAGAAGCTGGATCTGTTGCTGTTTAAGATTAGTTA
CACGTTGCTTTAACTACAAATGATGGCGAAATCAGTATGTTTAAAATTCAATAACTAACA
GTGCATGCACTTGAAGGTGATAAATATGCTTATAGAGATAATTTAACAGATATTGTTGTT
TAGAGCATGAGCTCAAATTAAAGAATTCGTTTGAAATGCAAAGAACTAGTTAAGAACATT
AGTATATATAAAGATAAGCTTGCTGCTCATTTAACAGAAAGAATTTTGATTTATGGAACT
TCTTCAGAAGATAGCTAAATGAAATATAAGTTGCATAAGAGAATAGTTAAAAAAGTTGAA
GCTCATATCTTAGAAATAGTTTCAAATCACTTGATAGCTTGTGTAAAAAATAAAGTATAA
TTATATTAATTATCAGGAGATTTAGAAAAAGAATGGGTTTTTGACTCAAGAGTTAATTGC
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TAAATTTTCAAAATATTTGTTGATAACAGTTTCCCTATTCCTATATTAAACCACAATATT
TCTATTAAAAATATTGATGCTTCTCAAAAAAGAAAAAGATTAGCAGTTGTTGATAAAAAT
AGCAACCTAACTGTTTATGATCTTTCAAACAAAGAATAAGTCTTCTAAGAAATGAATATT
GTTTCTTGCGCTTTCAACAATAATTTTGATGACTTGCTTGCTTTTTCATCAACTGACACA
ACATTTATCAGGTGCTCTAATCATCCACCTCTATCTCAAAAAATATCAGGATAAGTTGTA
GGATTTAAAGCAAATAAATTATTTGTTTTGAATGACAATGTTATGAGTACAATTGATGTT
TCGATGACTTAGACTATGATTAAATACTTAGAAAGAAAAGAATTTTAATCTGCATATGAA
ATATCTTTATTAGGAGTAACTGATTAAGATTTCTTATATTTAGGTAATGAAGCATTAATC
GCAACACAATTTGCTATTGCTAGAAAATGCTACACAAGAATAAAAAAATTAGACTTCATC
TATCTCCTTGAAAAGGCAGAAAAAGATTTTAAAAAGAATACATTTGTTGAGGGATTCTAT
TAAGGTGAGATATATGCTTTATAAACTAAATTCTATGAAGCAGAAAACGCACTCACTAAG
TCAAATTTAGCTTCTTAAGCAAAAGAAATGTGGATCATTCTTAAGGAATTTGATAAGGCT
ATGAGAATTACAGATACTGGTGCTAGTCCTATTAATAGAGGCCAGAATAAAGAAATAAAT
TCTGATGCTTCTAGAAAGGACCTACTCATTTAGAGGGCAGAATGGGAAGTCAAACAAGGA
AATTGGAAAAAGGGTGGTGAATTGTACATTCAAGCTGAAGTATATAAAAAGGCTATAGAA
GTATATGTAACCAATAATTTCTCAGAAGGTATTGTTGAAGTTTGCAGAAACGCAGATGCA
GAAACTCAAAGAAAAGAAATAGAATAATGTGCTGCATACTTTAAGAAAGCAAAACTTCAT
CAATACACAAAAGAAGCTTACTTGAAGCTGTAAGATAACAAAGCTTTACTTTAATTGAAT
ATTGATCTAGAAAAATGGGATGAAGCTATGACTCTTGCAAAGGCTCATCCTGAATTCATG
GAGATAGTCAAACTGCCTTATGCCAATTGGCTTGCTAAATAAGATAGATACGAAGAATCT
TTAAAGGCATACAGAAAAATTGGTAAACATGATATGGCTACTAAGATGCTCTATAACTTA
TCTTAGAATGCTGTATTTGAAAAAAGATTCTCTGACGCTGCTTTATTTACTTGGATGATA
GCTACTGAGCACTTAGGTTTGATTCGTAATATGAAAGCTCCAACCCCTGAAGATATTGAG
AATTTAATGAAATTTTATTAGTACAGAGATGATGCTGAAATATATTTTGCATACTCCAAA
GTTTAATCTTTTGTTGATGAACCATTCTTACCTTTATCAGGTCATGCTTACATGTTAAAT
ATCTTCAATGCTGCTCGCTTCGCCATAAACAAACTAGGAAACAGGCAGTTATACGGAGTC
TAACACAGTTATCTCTATTATTCATTAGGAAAAGTAAGTAAATAGCTTGAAGGTTACAAG
ACAGCCCGTATTTGCTATGAAAAACTAGCTAGCTACAAAATTCCTACTGAATGGAGCGAA
GAAATAGAATTAAGTACACTCTTAATTAGATCTAAGCCATATAGTGATTAGGAGTCTTTA
CTTCCTATTTGCAATAGATGCTATAATTAAAACCCAGCTCTCACAGAAGGTAACAGATGT
TCTTCTTGTATGCACTAATTTTAAAACTGCTTCATAAGCTTTGAAAATCTACCTTTGGTT
GAGTTTAAATTGGATCCTAAAATCACACATAAGAGATTTATTGAATTAATCAATTCTGAT
AAATCAAAAACACAACCTAATAAAAAGAAGAAGAAAGCAAACGACGGATGGTAAGAATCT
CACTAAGGAGATTAATAAGTTCTCACCTTTAACAATTCACCTTAAAAAGGAGGAAATGAC
AATGAAAGCAGTCCTTTCTTAGATAAACTTAACGAAGTATTCGAAATTTAATAAACTACT
TAAGAATACATACCTGTTACATTAGATGAAAATATAGTATCATCTCTTAGTATAGATGAG
GTTTATTGGGTAGACTATACAAAATATTGCTACACAGCAGAAATAAAATATTACAAGAGT
ATGTTAACAGACATTCCTCTCAAGAATTGTTAAGAATGTGGAACATTCTACATTTTGGAT
GAATATGAATTTGAAATAAGTAAGACATAAAAATGTCCTTTCTGCAGATCAGTTGATGAA
AGAGCAGGACCTTAGAAGGATGTTTTTGATTTCTGA


>TTHERM_00694540(protein)
MKCSELWTEIIPKNDPNSNITNQVWSCSFNNDGSILLACVGDAILVYDSFTGNLVNKAIR
GGQKEQINCIKFSKDGKRFATASNDKTVWVWSFDVNKNPKLAPEVKYSHTDKVLCLAFNP
LTHQIFSGGAQDYALWTPDQQSIEKSKFKDKIITCAWSWDGLYLGFGTMGGIIGIRNRAL
EQLAEIQRSFPIWCMDWTPITPDYQNSVLVVGVWEQSIAHYNIQGQQLGSDKKLTYDPID
INFSTQGEFLLVSGTNNKCTLYTREGGFLIDVATKNDWVWNNKLKPVIKEAGSVAVQDQL
HVALTTNDGEISMFKIQQLTVHALEGDKYAYRDNLTDIVVQSMSSNQRIRLKCKELVKNI
SIYKDKLAAHLTERILIYGTSSEDSQMKYKLHKRIVKKVEAHILEIVSNHLIACVKNKVQ
LYQLSGDLEKEWVFDSRVNCIKIIGGMPNKEGAYVGLKNGQIFKIFVDNSFPIPILNHNI
SIKNIDASQKRKRLAVVDKNSNLTVYDLSNKEQVFQEMNIVSCAFNNNFDDLLAFSSTDT
TFIRCSNHPPLSQKISGQVVGFKANKLFVLNDNVMSTIDVSMTQTMIKYLERKEFQSAYE
ISLLGVTDQDFLYLGNEALIATQFAIARKCYTRIKKLDFIYLLEKAEKDFKKNTFVEGFY
QGEIYALQTKFYEAENALTKSNLASQAKEMWIILKEFDKAMRITDTGASPINRGQNKEIN
SDASRKDLLIQRAEWEVKQGNWKKGGELYIQAEVYKKAIEVYVTNNFSEGIVEVCRNADA
ETQRKEIEQCAAYFKKAKLHQYTKEAYLKLQDNKALLQLNIDLEKWDEAMTLAKAHPEFM
EIVKLPYANWLAKQDRYEESLKAYRKIGKHDMATKMLYNLSQNAVFEKRFSDAALFTWMI
ATEHLGLIRNMKAPTPEDIENLMKFYQYRDDAEIYFAYSKVQSFVDEPFLPLSGHAYMLN
IFNAARFAINKLGNRQLYGVQHSYLYYSLGKVSKQLEGYKTARICYEKLASYKIPTEWSE
EIELSTLLIRSKPYSDQESLLPICNRCYNQNPALTEGNRCSSCMHQFQNCFISFENLPLV
EFKLDPKITHKRFIELINSDKSKTQPNKKKKKANDGWQESHQGDQQVLTFNNSPQKGGND
NESSPFLDKLNEVFEIQQTTQEYIPVTLDENIVSSLSIDEVYWVDYTKYCYTAEIKYYKS
MLTDIPLKNCQECGTFYILDEYEFEISKTQKCPFCRSVDERAGPQKDVFDF


>TTHERM_00694540(gene)
ATGAAGTGTTCAGAACTATGGACGGAAATCATTGTATTTTTTTTAAACACTAGCAACCAT
TATTTATAAAGAGAATAATTTTATTCCACTCTACTTTAAAAAAATTGATTAATGATCACA
ATAAAAAATAAAAAATAGCCCAAGAATGACCCCAATTCTAATATAACAAATCAAGTATGG
AGTTGTAGCTTCAATAATGGTATTAAAATTAAACATTTGCAAAATTCATTCAGAATTTAA
AGTATGTGCAGGATATTTATTCATACTTTATCATATAAATAGATGGCTCTATATTATTAG
CTTGTGTAGGAGATGCTATTCTTGTATACGATTCATTTACTGGCAATTTAGTAAATAAAG
CAATTAGAGGAGGTAATTATAATTTTTTATAATTCATTAAATAGGGATAATTCTAATAAT
TTTTTTAGGAAAAAAGCTTTTCATTAACCATTATAATAATATAATTTATTGCTCTGCTAA
GTTAAAAATTAATGCTAATTATTTTTATGTAAATAAAGGATAAAAGGAATAAATTAATTG
CATCAAGTTCTCAAAAGATGGAAAAAGGTTTGCAACTGCTAGGTAATTAAGACTTACCAA
TAAAATATTCAAAACTACTAAATGGAGCTTGATAAATAGCTATAAATTGCTATATTATGC
AACTAATCCAATAATAAATTATTATAAATTTTTAAATTTTGATTGGATTTTGATATTAAA
ATTTTATAAATTTTTAATGTAAATTTTAGTAATGATAAAACTGTTTGGGTCTGGTCATTC
GATGTAAATAAAAATCCCAAATTAGCACCTGAAGTAAAATATTCTCATACAGATAAGGTT
TTATGTCTTGCTTTTAATCCATTGACGCATCAAGTAATTAATAAATTTTTTCAATTATAA
TTCGAGTATTCAATTTATAATAAAAAATAAAAGATTTTCTCTGGAGGTGCTTAGGACTAT
GCTTTATGGACTCCAGATCAACAAAGTATAGAAAAATCTAAATTTAAAGATAAAATAATA
ACTTGTGCATGGAGTTGGGATGGTTTATATTTAGGTTTTGGTACTATGGGAGGTATTATT
GGAATAAGAAACAGAGCTCTCGAATAGTTAGCAGAAATTTAAAGGTCATTCCCTATATGG
TGTATGGATTGGACGCCAATTACTCCTGACTATTAAAACAGTGTTCTCGTAGTAGGTGTT
TGGGAATAGTCAATAGCTCACTATAATATTTAAGGTCAATAATTAGGTTCGGATAAAAAG
CTTACATATGATCCTATAGATATCAATTTTAGCACTCAAGGAGAATTCCTTTTAGTAAGT
GGAACTAATAACAAATGCACTCTATACACCAGAGAAGGTGGCTTTTTAATAGATGTTGCA
ACAAAAAATGATTGGGTTTGGAATAATAAATTGAAACCTGTAATTAAAGAAGCTGGTAAT
TATTAACTAATTTAAATAAATTCAATAGAGATTAATTTTTGTGTAAAAAATGTGTTTTAA
TTTTTTGTATGATTTAAATTTAACAGGATCTGTTGCTGTTTAAGATTAGTTACACGTTGC
TTTAACTACAAATGATGGCGAAATCAGTATGTTTAAAATTCAATAACTAACAGTGCATGC
ACTTGAAGGTGATAAATATGCTTATAGAGATAATTTAACAGATATTGTTGTTTAGAGCAT
GAGCTCAAATTAAAGAATTCGTTTGAAATGCAAAGAACTAGTTAAGAACATTAGTATATA
TAAAGATAAGCTTGCTGCTCATTTAACAGAAAGAATTTTGATTTATGGAACTTCTTCAGA
AGATAGCTAAATGAAATATAAGTTGCATAAGAGAATAGTTAAAAAAGTTGAAGCTCATAT
CTTAGAAATAGTTTCAAATCACTTGATAGCTTGTGTAAAAAATAAAGTATAATTATATTA
ATTATCAGGAGATTTAGAAAAAGAATGGGTTTTTGACTCAAGAGTTAATTGCATTAAAAT
TATAGGTGGAATGCCTAACAAAGAAGGAGCTTATGTCGGTTTAAAGAACGGTTAAATTTT
CAAAGTAATTTTTTTTTAATGTGTAAAACTTCATTTTATTTAAATAATAAAATAAAGATA
TTTGTTGATAACAGTTTCCCTATTCCTATATTAAACCACAATATTTCTATTAAAAATATT
GATGCTTCTCAAAAAAGAAAAAGATTAGCAGTTGTTGATAAAAATAGCAACCTAACTGTT
TATGATCTTTCAAACAAAGAATAAGTCTTCTAAGAAATGAATATTGTTTCTTGCGCTTTC
AACAATAATTTTGATGACTTGCTTGCTTTTTCGTATTAATTTATTTTAATAAATATTTAA
ATTTCATCGACTCATAATTTTTGATAATAAATAAATGTATAGATCAACTGACACAACATT
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TATGAAATTAGTTATTTGTTTTGAATGACAATGTTATGAGTACAATTGATGTTTCGATGA
CTTAGACTATGATTAAATACTTAGAAAGAAAAGAATTTTAATCTGCATATGAAATATCTT
TATTAGGAGTAACTGATTAAGATTTCTTATATTTAGGTAATGAAGCATTAATCGCAACAC
AATTTGCTATTGCTAGAAAAGTAAATATTGAAAAATTAAAATGTTGAAAATAATATTAAT
TAATGCTTGATTAAATTTTTAATAAATTAGTGCTACACAAGAATAAAAAAATTAGACTTC
ATCTATCTCCTTGAAAAGGTAAAGAAACAATTAATTAGTTTAGAATCAAAATGAACAAAA
TATTTTTTAATTTTAGGCAGAAAAAGATTTTAAAAAGAATACATTTGTTGAGGGATTCTA
TTAAGGTGAGATATATGCTTTATAAACTAAATTCTATGAAGCAGAAAACGCACTCACTAA
GTCAAATTTAGCTTCTTAAGCAAAAGAAATGTGGATCATTCTTAAGGAATTTGATAAGGC
TATGAGAATTACAGATACTGGTGCTAGTCCTATTAATAGAGGCCAGAATAAAGAAATAAA
TTGTAAATAATTCTTATTTTATTTTAGTTATTAATTTTTTAATTCCAGCTGATGCTTCTA
GAAAGGACCTACTCATTTAGAGGGCAGAATGGGAAGTCAAACAAGGAAATTGGAAAAAGG
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AACATTTTAATTTAATTTATCAGGAAAGCAAAACTTCATCAATACACAAAAGAAGCTTAC
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AAAAAAGATTCTCTGACGCTGCTTTATTTACTTGGATGATAGCTACTGAGCACTTAGGTT
TGATTCGTAATATGAAAGCTCCAACCCCTGAAGATATTGAGAATTTAATGAAATTTTATT
AGTACAGAGATGATGCTGAAATATATTTTGCATACTCCAAAGTTTAATCTTTTGTTGATG
AACCATTCTTACCTTTATCAGGTCATGCTTACATGTTAAATATCTTCAATGCTGCTCGCT
TCGCCATAAACAAACTAGGAAACAGGCAGTTATACGGAGTACAATTTCTTTAAAATTTAT
TAAAAATACTTAAAATCAAAAATTATATTATAGGTCTAACACAGTTATCTCTATTATTCA
TTAGGAAAAGTAAGTAAATAGCTTGAAGGTTACAAGACAGCCCGTATTTGCTATGAAAAA
CTAGCTGTATGTTCAAATTTATTATTATTATTATTACCAAGTTAAACATTATTTTAACAA
AAAGAGCTACAAAATTCCTACTGAATGGAGCGAAGAAATAGAATTAAGTACACTCTTAAT
TAGATCTAAGCCATATAGTGATTAGGAGTCTTTACTTCCTATTTGCAATAGATGCTATAA
TTAAAACCCAGCTCTCACAGAAGGTAACAGATGTTCTTCTTGTATGCACTAATTTTAAAA
CTGCTTCATAAGCTTTGAAAATCTACCTTTGGTTGAGTTTAAATTGGATCCTAAAATCAC
ACATAAGAGATTTATTGAATTAATCAATTCTGATAAATCAAAAACACAACCTAATAAAAA
GAAGAAGAAAGCGTAATTAGATTTTAATAATTACTTGACTTACACTGACAATTCAAAATT
AATTAAATTTTTTTTCAAAATTGGATGGAAATTATTAATTTGAACTGATATTTTGATTAT
TTCATAATAATTTGATTAAATAGAAACGACGGATGGTAAGAATCTCACTAAGGAGATTAA
TAAGTTCTCACCTTTAACAATTCACCTTAAAAAGGAGGAAATGACAGTAAAAGATTTTAG
CATGATTATTTAAAATTTATTATTTAAATCTAAAAAATATTAAGATGAAAGCAGTCCTTT
CTTAGATAAACTTAACGAAGTATTCGAAATTTAATAAACTACTTAAGAATACATACCTGT
TACATTAGATGAAAATATAGTATCATCTCTTAGTATAGATGAGGTAATTTCGTTTAATTT
TTAAAGAAAGATACAACAAATAACTAATGTATCTTCTCTTAAAGGCCCATTACAATTAGC
TAATTTTTTTAATAGGTTTATTGGGTAGACTATACAAAATATTGCTACACAGCAGAAATA
AAATATTACAAGAGTATGTTAACAGACATTCCTCTCAAGAATTGTTAAGAATGTGGAACA
TTCTACATTTTGGTAATTAATATCATTTTTTTTCCATATAATTACACACAAAAAAATTTA
TCAATTAGGATGAATATGAATTTGAAATAAGTAAGACATAAAAATGTCCTTTCTGCAGAT
CAGTTGATGAAAGAGCAGGACCTTAGAAGGATGTTTTTGATTTCTGA