Gene Model Identifier
TTHERM_00729230
Standard Name
IBD1
Aliases
PreTt07324 | 118.m00152 | 3739.m00074
Description
Bromodomain containing protein. Member of the SWI/SNF, SAGA, SWR complexes and a putative HMT complex during vegetative growth. Member of the SAGA and SWR complex during conjugation at 5 hours.
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Signal Peptide Present?: No
TTHERM_00729230
Fullscreen View
No Data fetched for StockID
(v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_17985.1 3.998941839720987e-159 bromodomain containing protein
Oxytricha Contig18584.0.g108 6.000354955737408e-39 Bromodomain
DictyBase DDB_G0270170 0.0000000000000030004923591262316 DDB_G0270170 on chromosome: 1
Stentor Coeruleus SteCoe_26039 0.00000000000003442477108469977
SGD YGR252W 0.0000000000008001317446409227 GCN5 Acetyltransferase, modifi
WormBase WBGene00017423 0.000000000006001570085597868 status:Confirmed UniProt:O76
No Data fetched for General Information
Ref:29523178 : Saettone A, Garg J, Lambert JP, Nabeel-Shah S, Ponce M, Burtch A, Thuppu Mudalige C, Gingras AC, Pearlman RE, Fillingham J (2018) The bromodomain-containing protein Ibd1 links multiple chromatin-related protein complexes to highly expressed genes in Tetrahymena thermophila. Epigenetics & chromatin 11(1):10
>TTHERM_00729230(coding)ATG TCA GGT TTT AAG TCT TCT CTT AAA TTA AAC TAG CAT ACT AAT ATA GGA AAA GAA GAA CTC AAA AAG CTA AAT CAA ATG CTA AGT TAG CTC TTG CAA AAC AAT GAT TCA ATT GAA TTT AGA TAA GCA GTT GAT TGG AAA GCT TTG GGT TTG ATG GAC TAT CCA AAT ATT ATT AAA TAC CCC ATG GAT TTA GGC ACA TGT AAA GAA AAG TTA AAG AAT AAT GAA TAC AAC TTC GTC GAA GAT TGC CTT GAT GAT ATA TAA ATA GTT TGG GAT AAC TGT AAA AAT TAT AAT GCT GAA GGA TCT TGG ATT TAT AAA TTA GCA GAA AAG TTG GAA AAG CAC TTT AAA AAT ATG ATT AAG AAT TAT CTC CCT TCC ATA TAA TTT ATG AAT GCT GTA GTC AAA AAG GAA AAG CTC TCC TAG ATG AAG ATT AAT CAA GAT GAG AAT AGT TCA TCT CAA AAT GGA GAC TAA CCA ACT CCA GCT AAT AAT ACA ACT AAT GGA AAC AAA AAT AAT GAT GCA AAT AAT GGT ACA AGC TAG AAT TAA AAT TAA ATA TAT CAA GAA GAA GAA GCC AGT GAA TCT ATA ACA TCT TAA GAT AAA ATA TTA TTC TCC TAG AAA ATA AAG ATG CTA CCC ACT GAA TAG CTC GGT ATG ATA GTA CTT ATG ATT TAG AAT AGT GCT TCT TAA GCA TTT AAA GAT ATT GAT AAA GAA AAA TGT TAG ATT CTA GTA GAC TAA ATA GAT CCA GAA ACA TTT AAG AAA ATT AAT CAG TAA ATC GAT TTA TGG AAT GTT AGT ACT GAA ACT ACT ACA AAG AGA GTG AAG ATT TGA >TTHERM_00729230(protein)M S G F K S S L K L N Q H T N I G K E E L K K L N Q M L S Q L L Q N N D S I E F R Q A V D W K A L G L M D Y P N I I K Y P M D L G T C K E K L K N N E Y N F V E D C L D D I Q I V W D N C K N Y N A E G S W I Y K L A E K L E K H F K N M I K N Y L P S I Q F M N A V V K K E K L S Q M K I N Q D E N S S S Q N G D Q P T P A N N T T N G N K N N D A N N G T S Q N Q N Q I Y Q E E E A S E S I T S Q D K I L F S Q K I K M L P T E Q L G M I V L M I Q N S A S Q A F K D I D K E K C Q I L V D Q I D P E T F K K I N Q Q I D L W N V S T E T T T K R V K I >TTHERM_00729230(gene)ATG TCA GGT TTT AAG TCT TCT CTT AAA TTA AAC TAG TAA TAT TGA TAC CAT TTT TTA GAT TTA GCA TAA ATA AAT TTA TTT TAT AGC AAT TCA ATG CTT AAA GAG AGC GAA ATT AGT TCA AAT GCA GCT TAT TAA CTT TTT AAT ATA ATG ACC ATC ATT ATT GAT TTT TAT TTT TAA AAA TAG GCA TAC TAA TAT AGG AAA AGA AGA ACT CAA AAA GCT AAA TCA AAT GCT AAG TTA GCT CTT GCA AAA CAA TGA TTC AAT TGA ATT TAG ATA AGC AGT TGA TTG GAA AGG TAA TTT TGA ATT AAT TTT AGA GAT TTG GCA AAT TTA ACT CTA TTA TTT TGA GAT ATT TCA AAT AAT CGA TTT AAA TAG ATC AAT TAA ATT TTG CAT ACA TAA ATT ATT TTG TGA GTA CTA ATC AAA ATT GAT AAT AAA ATA AGC TTT GGG TTT GAT GGA CTA TCC AAA TAT TAT TAA ATA CCC CAT GGA TTT AGG CAC ATG TAA AGA AAA GTT AAA GAA TAA TGA ATA CAA CTT CGT CGA AGA TTG CCT TGA TGA TAT ATA AAT AGT TTG GGA TAA CTG TAA AAA TTA TAA TGC TGA AGG ATC TGT AAT TAA TTA AAT TTC AAT TAT TTA ATA TTC TTT TAA AAA GAG TTT TTT TTA ATT CAA AGA TAT TTT CTA ATA TTT TTA AAG AAA ACA AAA ATA ATA TAA TCA AAT TAA ATC AAA TCA ATT ACA ATT ATA CAA CCA AAA ACA AAC CCC TTT TAT CTA TTT ATT TAT AAT AGC TGT TCT GAA ATT ATT ATT TTT ATT TTA AAT AAA AAT ATT ATT AAC TGA TAA TAA AAA TTT TTT AAA TTT AAG ATA TTT TTG ATT TTT TAT AAA GCT AAT ATT TCG CAG TAA CAA AAT AAA TGG ATT TAA ATA TTT TAT ATA TAT TTA TAT CAA GCT TTA AAA ATA AAA TAA ATT AAT CAA TGC TAA TTT TCA AGT ACC AAT AAA AAA TGA ATA ACT AAA AAA TAA ATT TTA TAA TTT TAA ATG TAG GTT TAT ATA AAA AAA TAA AAT CAA AAG CAA AGT ATA AAT CTA TTA GCA AAC AAT TTT TAA AAA CAT GAT TAT TTG ATT AAT GAG AAG ATT TTC ACA AGA TTT AAT TTA CAA AAT AAA TAT ATT TAA AAT AAT ATT AAA ATG AAT TTA TTT TTC ATT TTT TTC AAA TAA TTT TTG AAT GTA TTT TGG TTT TAT GTA AAA ATA AAA TTA TTA TGA TCA AAA CCA TAC TGG TTT TAG TAA AAG AAG TTG AAA AAA TTT TTC TGT TTT TTA TTT TTA AAA ATT GTT TTT TTT TCT TTA AAA ACT TGA AGA AAA ATA TTT AAA ATT ATT TAA TAT CTC CTT GTT AAT TAA TAA ATA TTT ATA ATA ATT TTT AAA ATA GTG GAT TTA TAA ATT AGC AGA AAA GTT GGA AAA GCA CTT TAA AAA TAT GAT TAA GAA TTA TCT CCC TTC CAT ATA ATT TAT GAA TGC TGT AGT CAG TAA AAA ATT AGT TTT TTG ATA ATG ATT TAT AGC TTT TAA CTT GAA TTT TGT GAT TAA AAT TTT TTT CAT TAA ATA GAA AAG GAA AAG CTC TCC TAG ATG AAG ATT AAT CAA GAT GAG AAG TAT CTT ATT CAT TTA TTA TTT AAG AAT TAA TGA ATA ATT TAT TTT ATA ATT AAT TAT ATA AGT AGT TCA TCT CAA AAT GGA GAC TAA CCA ACT CCA GCT AAT AAT ACA ACT AAT GGA AAC AAA AAT AAT GAT GCA AAT AAT GGT ACA AGC TAG AAT TAA AAT TAA ATA TAT CAA GAA GAA GAA GCC AGT GAA TCT ATA ACA TCT TAA GAT AAA ATA TTA TTC TCC TAG AAA ATA AAG ATG CTA CCC ACT GAA TAG CTC GGT ATG ATA GTA CTT ATG ATT TAG AAT AGT GCT TCT TAA GCA TTT AAA GAT ATT GAT AAA GAA AAA TGT TAG ATT CTA GTA GAC TAA ATA GAT CCA GAA ACA TTT AAG AAA ATT AAT CAG TAA ATT ATT ATA ATT TGA TAT TAA TTA TTA GCT GAT TTT ATA GAA AAA ATA TAA TTT AAA TTT TAT ACT ATT TTG AAA ATA TAA GTT TTT ATT AAT TTA ATT ATT ATA ACT AGG TAA ATC GAT TTA TGG AAT GTT AGT ACT GAA ACT ACT ACA AAG AGA GTG AAG ATT TGA
Login
Recent Activity
Recent Papers
Identifiers and Description
Gene Ontology Annotations 
Domains
Gene Expression Profile
Signal Peptide
Homologs (v.2006 protein sequences)
General Information 
Associated Literature 
Sequences
