Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00675560

Standard Name

HCF2 (HeteroChromatin Factor 2)

Aliases

PreTt10997 | 101.m00152

Description

HCF2 Tc5 transposase DNA-binding domain protein; Heterochromatin formation protein; associated with DNA rearrangement in macronucleus

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Domains

  • ( PF09091 ) Centromere binding protein B, DNA

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_00675560

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_14280.12.0008536325002377e-42hypothetical protein (694 aa)
WormBaseWBGene000216790.00006000996057121373status:Confirmed UniProt:Q9N
3P2 protein_id:CCD71726.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:SUPR000276
  2. Ref:SUPR000277

Sequences

>TTHERM_00675560(coding)
ATGTATATGAAATCACTAAAAAACAAAATCCATACTAAATACATAGCTAAAAAAAGGCGC
TTTTAAATTTAAAAATTTTATCAGGAATTATTTCTTATCAAAAAGGTGTGTCTGATCACA
AAATAATATCAAACTATTTATCTTGCTACTTAAGATTTTTTAATATTTGATGAAATTTAG
TAAAGGAAAGAATAAAAAGTAGAACTAAATCATTTAATATAGATGCACAGTGAAAAAAAA
GATTTTAAACTTAATTCTGCTGCCACTTCAGATTTATTTTACAATAGACAGTAATTTATT
TAACTCGTTAATGAGCAAATTTAACTTTTGGAGACATCTGTAGATAGTTAGAATCTTAAT
GAGCAGTATAAATTCTTATCTGGTTTCTTAAGAGAGAGTAGTAGCTTAGTTATTTTTTTG
CAGCAACAAATGTAAACTCTTTACAAGTTAAGAATTTATCAATTATCTGCTGTTTCGGTT
GAAAGAAATCAGCTAACTCCACCAAAATATGATTATTTGAGTAATACTGAATGTACATTT
TAAGATTTGTTTAGTAGAAACGAGCAGCTTAAAAGTCAATCTTCCTTTCAAAGGGCTTTT
GATAAATCTGTTTAGTAAAGCGATTCTAATTTTTACATTTACCCGAAGCAACTAGCTGAA
GAAAATAATAGTTAAAACAATAATAAGTATTTTGATTATATGAACAATATTACTCCTCAA
CAATATTAATAAAAGTATTAACTTTACAACAACTCTTCTTTTTTTAATGATAAAAACGAA
GATTTATTTCCTGTAAATCTTAGTGAGTCCTTTAAGAAAATTAAGAACTACTCAGATTTT
TTCGATAACCAAAATAACAAGCAATCTACTAACTTTTCTGAATACTTTGATACTAAGAAT
AGATACAGAATACTTAAGCAATAAAACCTTGAGCTAGATTTCATCAAAGTTAAACAACCA
ACCATCACAGATGAGGCTAAAGAAAATTATGTCAGCTAATTTGGCAATTAAAGTTAGGGC
AAGCAAATAAAAATTGTAAAAAAGAATACCTGTAGTAACAATAATTTGGCTATATTTTCT
TCTCCACAGCAAGCGATGGCTCAAGAAGAAAAGATACAGTCTAAGAACTTCTCGTTTGAA
GACATGGATGTTTATGAAGAAAAAAATACAGATAAAAATTATAACTAAAAGTTTTTAAGA
CAAGAAATTCCCGTTTAAGAGTTTTAACTTTTAAATTTGCCTGGTTCTTCTCCCAAGCAG
CAGAATGGTGGCACTCCTTATAAAACATTTAAAGAAAAGTAGCTCTATTAAAAACCAATA
AATTCTAATTAAACCAAACAAATATAGAAATTCAATTAAAATAATAGCTATCTAGACTAT
GATTTTGACATACAAGAAGGAAGTGTTTTAAAAAATTGTTAAAAATTGAATATTTTAAAT
AATTAGGTTACAAATAATTAAAATGAGAAGAAGTCTTTTAACATGGATAATTCTAAATAA
ATTAATGTATTAGGTACTTTGCAAAAAAATATTTAAGAAAATGGCTAAATTGATTCATCT
CAATTTAAGTAAAATCACTACAAAAATGATATTTCAAATACATAAGAAAGGAATACTTAA
AACAATTTGCTTGGAGGAGCTTAAAACATTTTACAGACAAATAATTAATGCAATTTATTG
AATAATTCTAATTAAAAATTAAATATTTAAAATAGTTAAATATCAAAGATTTCTAATAAT
CAATAAAGTAATAAATAAAACTAATAAAGTAATTTAAGTAGTTAATAAGGTCAAGTTTCT
TACAGTTAATAAAGTTCTCACTTAAATACTTAATAAAGCTCAAATGAAAAATAAAATTCT
AATTTATTTTAAGGAAAAATAAGCTAAAAACCACAACGAAAGAAAAAAGAAAGAGCAAAA
AAAATCTTGAAAGCATACTATCAGCAGAACAGCGATGAATCCTTAAGCAGCAATCCAATT
GATAAGAAGAAAAAAATATCTAAAACCAATAACAAGCTTGCTACCTCAATGAGAAGTAAA
ATATAAGAAAATGATAAAATAAAGACAAAATTAAGTAAAAGAGATTCAAATTATGGTGAT
AGTAATTTAGAAGAATCTCTATTTGAAAATGATACTAGCGAAGAAAGCAGCAATTCTGAC
TTATATTATGATTAAGAAAGTGAAAATGATGATAATGATAGCTTAAAGCAAGAGTCAGAT
AAAAGTTTCGATGAAGATTAGTCTTTTTCATACTCAGATGAAGAGAATTTAGACGACAAA
GGTTTTATAGAAACATAGCAAGCAAATAACTCTAGTAAACTGAATTTGACAACAAAATCA
AAAAGAGGGCATTACAAAAAATATTCTGTGAAACTAAAGAAAAAATTGGTTAATCTACTT
CTGGAAGGAGAATAGCCAAAGGATCTCTCTTAAAAATATAATATTCCTATGAAAAATTTA
TAAAGATGGAAAATTTATGGTGCTGAAAGAAGGGAAGGAGGAGGAAGAAAGATCATGGAT
TTAAATATGGAAGTTATTCTTTTAGAGTATTGTATTGATTATACATTAAGAGGAAGGTGT
AGATGTCCTAGAAAATTAATTATGCAAAAAGCAAGAGATTTTACTAAAGAGGCTAATAAG
TTTAAAGGATCAAAAGGTTGGCTTGATAAATACTCTACTAGAACTGGTCTGTCAAAGATA
ATGTCAGAGTATAAACAATTAAAGATTAGTAATGAGAGAGAAATCTTCAAATATGTTAAA
TGTAAATCAATTGAGCATATTAAATAAAAGATAAAATAGGTAAATCCTCTAAACATATTT
ACAAGTTAGCAATACATTAAATTTTTAGAAGGGCAACTTTCTGTTTATTAGAATTTTTGG
GAAATTGAATTACCTTGCTATAAAAACATTTCTAGTTAATATTGGCAGTATTATGAAAAT
AGAAACACAATTTAACTAATTTAAAATAACATCTTTAGTGATGTTATAACTGAATATAAA
AAATTTAATAAGTGTTCTAAATTAAATGACCTTAACTATTACTTTGGTATTCCATCTGAA
TATTTCTTAAAATGTCTTTGCCTTTAAAATTGCTCTGAGAAAAGCAAGCAACCAAACGAT
TAAACAATACAACATTAAAATTTGAAAGAACAGTCTTAGATAGTTTAAGAAGCAAATTCA
GAATATTTAAAGCAGGATCTCATAAAATAAGTAAAAAAAGAAGCAGTTGAAGAGAGAATG
CAAAGCTCAGCAGTTTTGGTAGATGATAATTAAAATTTTGTTTTTAGTCCTTTGATAATA
AGAAGTAAAAATGTACCAAAATATAACATTAAACAATCTTATGATTTAAAAGATAAACAA
ACTGAGTTAAATAATTTAATTGAAGGATAAAATTAAACTGATCAAAATGACTAAATATTC
AATAAATAAGATAAATAAATTAATCACTTCAGCTAACAAAAATACAAATATGCTCAATTA
ATTAGTGATGACGATAGTTCGATTGAAGAGATTTTCAGGAATTATGAAAATAATATTGAC
TGA


>TTHERM_00675560(protein)
MYMKSLKNKIHTKYIAKKRRFQIQKFYQELFLIKKVCLITKQYQTIYLATQDFLIFDEIQ
QRKEQKVELNHLIQMHSEKKDFKLNSAATSDLFYNRQQFIQLVNEQIQLLETSVDSQNLN
EQYKFLSGFLRESSSLVIFLQQQMQTLYKLRIYQLSAVSVERNQLTPPKYDYLSNTECTF
QDLFSRNEQLKSQSSFQRAFDKSVQQSDSNFYIYPKQLAEENNSQNNNKYFDYMNNITPQ
QYQQKYQLYNNSSFFNDKNEDLFPVNLSESFKKIKNYSDFFDNQNNKQSTNFSEYFDTKN
RYRILKQQNLELDFIKVKQPTITDEAKENYVSQFGNQSQGKQIKIVKKNTCSNNNLAIFS
SPQQAMAQEEKIQSKNFSFEDMDVYEEKNTDKNYNQKFLRQEIPVQEFQLLNLPGSSPKQ
QNGGTPYKTFKEKQLYQKPINSNQTKQIQKFNQNNSYLDYDFDIQEGSVLKNCQKLNILN
NQVTNNQNEKKSFNMDNSKQINVLGTLQKNIQENGQIDSSQFKQNHYKNDISNTQERNTQ
NNLLGGAQNILQTNNQCNLLNNSNQKLNIQNSQISKISNNQQSNKQNQQSNLSSQQGQVS
YSQQSSHLNTQQSSNEKQNSNLFQGKISQKPQRKKKERAKKILKAYYQQNSDESLSSNPI
DKKKKISKTNNKLATSMRSKIQENDKIKTKLSKRDSNYGDSNLEESLFENDTSEESSNSD
LYYDQESENDDNDSLKQESDKSFDEDQSFSYSDEENLDDKGFIETQQANNSSKLNLTTKS
KRGHYKKYSVKLKKKLVNLLLEGEQPKDLSQKYNIPMKNLQRWKIYGAERREGGGRKIMD
LNMEVILLEYCIDYTLRGRCRCPRKLIMQKARDFTKEANKFKGSKGWLDKYSTRTGLSKI
MSEYKQLKISNEREIFKYVKCKSIEHIKQKIKQVNPLNIFTSQQYIKFLEGQLSVYQNFW
EIELPCYKNISSQYWQYYENRNTIQLIQNNIFSDVITEYKKFNKCSKLNDLNYYFGIPSE
YFLKCLCLQNCSEKSKQPNDQTIQHQNLKEQSQIVQEANSEYLKQDLIKQVKKEAVEERM
QSSAVLVDDNQNFVFSPLIIRSKNVPKYNIKQSYDLKDKQTELNNLIEGQNQTDQNDQIF
NKQDKQINHFSQQKYKYAQLISDDDSSIEEIFRNYENNID


>TTHERM_00675560(gene)
ATGTATATGAAATCACTAAAAAACAAAATCCATACTAAATACATAGCTAAAAAAAGGCGC
TTTTAAATTTAAAAATTTTATCAGGAATTATTTCTTATCAAAAAGGTGTGTCTGATCACA
AAATAATATCAAACTATTTATCTTGCTACTTAAGATTTTTTAATATTTGATGAAATTTAG
TAAAGGAAAGAATAAAAAGTAGAACTAAATCATTTAATATAGATGCACAGTGAAAAAAAA
GATTTTAAACTTAATTCTGCTGCCACTTCAGATTTATTTTACAATAGACAGTAATTTATT
TAACTCGTTAATGAGCAAATTTAACTTTTGGAGACATCTGTAGATAGTTAGAATCTTAAT
GAGCAGTATAAATTCTTATCTGGTTTCTTAAGAGAGAGTATTATATTGAATGGATTTTAT
CATAATTTCATTATTTTTTATTAAAGGTAGTAGCTTAGTTATTTTTTTGCAGCAACAAAT
GTAAACTCTTTACAAGTTAAGAATTTATCAATTATCTGCTGTTTCGGTTGAAAGAAATCA
GCTAACTCCACCAAAATATGATTATTTGAGTAGTAAAAGAATTTATTTCATTTTATAAAA
ATAATAATAATATACAAAAAGATAAATCATAATATTTTAATTTGAAAATATAAATAGATA
CTGAATGTACATTTTAAGATTTGTTTAGTAGAAACGAGCAGCTTAAAAGTCAATCTTCCT
TTCAAAGGGCTTTTGATAAATCTGTTTAGTAAAGCGATTCTAATTTTTACATTTACCCGA
AGCAACTAGCTGAAGAAAATAATAGTTAAAACAATAATAAGTATTTTGATTATATGAACA
ATATTACTCCTCAACAATATTAATAAAAGTATTAACTTTACAACAACTCTTCTTTTTTTA
ATGATAAAAACGAAGATTTATTTCCTGTAAATCTTAGTGAGTCCTTTAAGAAAATTAAGA
ACTACTCAGATTTTTTCGATAACCAAAATAACAAGCAATCTACTAACTTTTCTGAATACT
TTGATACTAAGAATAGATACAGAATACTTAAGCAATAAAACCTTGAGCTAGATTTCATCA
AAGTTAAACAACCAACCATCACAGATGAGGCTAAAGAAAATTATGTCAGCTAATTTGGCA
ATTAAAGTTAGGGCAAGCAAATAAAAATTGTAAAAAAGAATACCTGTAGTAACAATAATT
TGGCTATATTTTCTTCTCCACAGCAAGCGATGGCTCAAGAAGAAAAGATACAGTCTAAGA
ACTTCTCGTTTGAAGACATGGATGTTTATGAAGAAAAAAATACAGATAAAAATTATAACT
AAAAGTTTTTAAGACAAGAAATTCCCGTTTAAGAGTTTTAACTTTTAAATTTGCCTGGTT
CTTCTCCCAAGCAGCAGAATGGTGGCACTCCTTATAAAACATTTAAAGAAAAGTAGCTCT
ATTAAAAACCAATAAATTCTAATTAAACCAAACAAATATAGAAATTCAATTAAAATAATA
GCTATCTAGACTATGATTTTGACATACAAGAAGGAAGTGTTTTAAAAAATTGTTAAAAAT
TGAATATTTTAAATAATTAGGTTACAAATAATTAAAATGAGAAGAAGTCTTTTAACATGG
ATAATTCTAAATAAATTAATGTATTAGGTACTTTGCAAAAAAATATTTAAGAAAATGGCT
AAATTGATTCATCTCAATTTAAGTAAAATCACTACAAAAATGATATTTCAAATACATAAG
AAAGGAATACTTAAAACAATTTGCTTGGAGGAGCTTAAAACATTTTACAGACAAATAATT
AATGCAATTTATTGAATAATTCTAATTAAAAATTAAATATTTAAAATAGTTAAATATCAA
AGATTTCTAATAATCAATAAAGTAATAAATAAAACTAATAAAGTAATTTAAGTAGTTAAT
AAGGTCAAGTTTCTTACAGTTAATAAAGTTCTCACTTAAATACTTAATAAAGCTCAAATG
AAAAATAAAATTCTAATTTATTTTAAGGAAAAATAAGCTAAAAACCACAACGAAAGAAAA
AAGAAAGAGCAAAAAAAATCTTGAAAGCATACTATCAGCAGAACAGCGATGAATCCTTAA
GCAGCAATCCAATTGATAAGAAGAAAAAAATATCTAAAAGTAAAATATCAAATTAATTTT
TTTTTAGTTGATTTAAGTTAATTTTTATTTATTTTAAATATTCAGCCAATAACAAGCTTG
CTACCTCAATGAGAAGTAAAATATAAGAAAATGATAAAATAAAGACAAAATTAAGTAAAA
GAGATTCAAATTATGGTGATAGTAATTTAGAAGAATCTCTATTTGAAAATGATACTAGCG
AAGAAAGCAGCAATTCTGACTTATATTATGATTAAGAAAGTGAAAATGATGATAATGATA
GCTTAAAGCAAGAGTCAGATAAAAGTTTCGATGAAGATTAGTCTTTTTCATACTCAGATG
AAGAGAATTTAGACGACAAAGGTTTTATAGAAACATAGCAAGCAAATAACTCTAGTAAAC
TGAATTTGACAACAAAATCAAAAAGAGGGCATTACAAAAAATATTCTGTGAAACTAAAGA
AAAAATTGGTTAATCTAGTAAAAAATTAAACTAAATTATTAATACTTAAAAACTTATTAT
TTATAAATTATAAAGCTTCTGGAAGGAGAATAGCCAAAGGATCTCTCTTAAAAATATAAT
ATTCCTATGAAAAATTTATAAAGATGGAAAATTTATGGTGCTGAAAGAAGGGAAGGAGGA
GGAAGAAAGATCATGGATTTAAATATGGAAGTTATTCTTTTAGAGTATTGTATTGATTAT
ACATTAAGAGGAAGGTGTAGATGTCCTAGAAAATTAATTATGCAAAAAGTAATCAATTCT
ATTTATTTTATTATTTTTTTAAGTTTTCTGATATTAAAAGATATTTATTTACATCTTAAA
ATTATATTAATTTTAATAAATTTGTTTAAATTACTCTAATCTATTTGTTTTTTTTTCATT
AACGAACGAGAAAATGGTAAAAATTAAATATAAACACAAAAAAAATAACCTAAAAATAAT
TACAACATATTTTAATATTTCCAAAAATAAAAAATTATTTATTATTGATTAAAATTTTAA
TAAACTAATGCTTAATTTTAGAATATTTAGTTTTAGGATTTTATTTTATATTGTCTAAGC
AATTACAGTTGATATAAATTAATTGCTATTTTAATATTTTAAAATATTTAAATTAAAAGG
CAAGAGATTTTACTAAAGAGGCTAATAAGTTTAAAGGATCAAAAGGTTGGCTTGATAAAT
ACTCTACTAGAACTGGTCTGTCAAAGATAATGTCAGAGTATAAACAATTAAAGATTAGTA
ATGAGAGAGAAATCTTCAAATATGTTAAATGTAAATCAATTGAGCATATTAAATAAAAGA
TAAAATAGGTAAATCCTCTAAACATATTTACAAGTTAGCAATACATTAAATTTTTAGAAG
GGCAACTTTCTGTTTATTAGAATTTTTGGGAAATTGAATTACCTTGCTATAAAAACATTT
CTAGTTAATATTGGCAGTATTATGAAAATAGAAACACAATTTAACTAATTTAAAATAACA
TCTTTAGTGATGTTATAACTGAATATAAAAAATTTAATAAGTGTTCTAAATTAAATGACC
TTAACTATTACTTTGGTATTCCATCTGAATATTTCTTAAAATGTCTTTGCCTTTAAAATT
GCTCTGAGAAAAGCAAGCAACCAAACGATTAAACAATACAACATTAAAATTTGAAAGAAC
GTAAACACATTCAATATATCTACAAAATCACTTTAAAAAAATTTTTTTATTTATTTATAA
AGAGTCTTAGATAGTTTAAGAAGCAAATTCAGAATATTTAAAGCAGGATCTCATAAAATA
AGTAAAAAAAGAAGCAGTTGAAGAGAGAATGCAAAGCTCAGCAGTTTTGGTAGATGATAA
TTAAAATTTTGTTTTTAGTCCTTTGATAATAAGAAGTAAAAATGTACCAAAATATAACAT
TAAACAATCTTATGATTTAAAAGATAAACAAACTGAGTTAAATAATTTAATTGAAGGATA
AAATTAAACTGATCAAAATGACTAAATATTCAATAAATAAGATAAATAAATTAATCACTT
CAGCTAACAAAAATACAAATATGCTCAATTAATTAGTGATGACGATAGTTCGATTGAAGA
GATTTTCAGGAATTATGAAAATAATATTGACTGA