Gene Model Identifier
TTHERM_00112490
Standard Name
HARPL1
Aliases
PreTt27063 | 8.m00323 | 3812.m02360
Description
hypothetical protein
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Domains
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Signal Peptide Present?: No
TTHERM_00112490
Fullscreen View
No Data fetched for StockID
(v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_03966.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (1005 aa)
Oxytricha Contig18000.0.g59 3.000619078166531e-39 SNF2 family N-terminal domain
DictyBase DDB_G0281559 6.001696815660978e-24 DDB_G0281559 on chromosome: 3
Stentor Coeruleus SteCoe_15873 0.0000000001026187963170189
WormBase WBGene00015806 0.0000000010002658722841845 Putative SMARCAL1-like protein
SGD YBR245C 0.000006997203421143941 ISW1 Member of the imitation-s
No Data fetched for General Information
Ref:23884606 : Gao S, Xiong J, Zhang C, Berquist BR, Yang R, Zhao M, Molascon AJ, Kwiatkowski SY, Yuan D, Qin Z, Wen J, Kapler GM, Andrews PC, Miao W, Liu Y (2013) Impaired replication elongation in Tetrahymena mutants deficient in histone H3 Lys 27 monomethylation. Genes & development 27(15):1662-79
>TTHERM_00112490(coding)ATG ATT ACA TCT ATT TAA CAG ATT AGT AAC ACA TAA GCT CTG GTA CAA GTC GAA AAC CAA ATA CTA ATT AAA GAT CCT TAT ATA AAG AGA TAT TTG CAA AAT TAA AAT AGA AGC AAA TAT GAG GAG AAA TAC AAT GGA TAT CTA ATA GAT ATC GCA GAG TCT TCA TTC ATG AAA GAT AAG ATT AAT TTT TAG ATT AGC GCC AAA TAA AAG AAA AAG AAA TTA TCA GAT ATC CCA AGA TTT GTG ACA GAA GCT TTT ACA GAC TTT GGG AAT AAG TTA AAA ATT AGA GAC TTA AAA GGC AAC ATT GTT TCA GAG ATC AAT TAT GGA AAT GAA TAA CTT GCA AAT GAT CTT GGA TTA TCT TAG GAA CAT ATC AGT GAT GCT ATT TAA ATG GCT TTT CAG ATG AGA GGA AGA GTT ATC CTT GCT GAT GAC CCA GGA CTG AAT TCA TGC AAA ACA GCA GTC AAT ATT GCA TAT GCT TAT GAT TAT AAA ATA CCT TTT TTA ATA ATT GCT TCT TCT ACT CAG CGT TAG AAA TGG AAA TCA ATA CTA AAA TAA CAA TTT AGC CTG AAA GAT AAA GAC ATA TAA ATT TTA TAT AAC AAT TAA ACT TAA TTT GAT TTC AAA AAG GAT GCA ATA ATA GCT ACA TAT GAT CAA GTT TCT ACT AGA AAA GAG GAA CTT CAA GAT ATA AAA GTT GCT TTA GTA GAT GAG GCT CAT TAC TTG AGA AAT ATA AAG TTT GTA AAT GAG AGA AAT TTA ATG GAG TAT TTA TGC AAA AGA AAA AGA GTT GTC CTT TTG AGT AGT TGC TGT ATT ATA TAA TCA GTT GAA GAT CTA TTT CCT TTG CTA AGA GTT ATT CGT CCT GAC TGC TTC CAT AAT ACT AAA GCT TTC AAA GAC AGA TAT GTT AAC AAT GAA AAT AAT TGG ATA GAA CTT CAT TGT ATG CTA AAT TAA ATA GGA TTT ATT AGA AGA ACA AGA TAA ATG TTC GCA GAT AAC CAT AAT TTT ACT AAT TTT GGA ATT GTT CCT ATA GAA TGT GAT AAA AGT GTT ACA TCA ATT ATA AAT AGC CTC GTT CAT AAT GCA CAT AGA ATT GGA GGA AAC TTT TCA AAA GGT ATC TAT TCA TAA TGC TAT ACT TTA TCA TTA GAT GCA AAG ATC AAG GGT TGC TTG TAA TTC ATA GAT AGA TAA TTA GAA TAA AAA CCT GAT GAT AAA ATA GTA ATT TTT GGA TAT CAT CAG AAA TCT TTC GAG ATG ATT GGT ACC CAT TTA TAA GCA AAA AAT ATT ACT TTC ATA GTT GTT GAT AAA AAA ACT AAT TTT GCT TAA AAA GAA GAG TTA CTA CAT CAA ATA GAT CCA TAA ATT AGC GTT GTT TTG ATG TCT TTC ACA AAT TTA TAA GAT ATT GAG TTA TCC CTA TTT TCT ACA GCT ATT GTC TTG GAA TTT TCT TGG ACT CCA CAT TTA ATA GAT CAA GCT ATT GGT TGT TTA TAT AGC TTA AGT CAA GTG AAT GAA TAA GTA GAT GCT TTT TTA CTT GAA GGT ATA GGG ACA CTT GAC AAA TTA CTA AAA GGG AAA TAC ATC AAG TGG TTA GAT TTG AAA ACT AAA ATT TTA GAT GGG AAA AAA GTA GAT AAT TTA CTA AAT ATT CAA GAT GTA GTG AGT ATT GAT AAT TAA GGT TCA AAT AGA TTA AGA TAG AAT TAA AGC ATA GAT ATA AGC TTC AAT GAA GAT AAT CAT TTG TCA AAC TAA CCT TCA AAA GCA TAC AAT TAG CAG AAA TCT CCT CAA TAG AAA AAA AAG AGA AGT AGA AAA AAT ATT TAA AAA TTT GAA ATA TCT AAG CTA AAT ACT AGT AAA TAA AGA ATA ACA ACT TAG ACA TTA AGC TAG GAT ATA CTA CCA CCT GAA ATA AAG GTA GAT ATT AAT TAG AGC AAA AAA ATC TTT ATG TAG AAA GCC AGA ACT GTT GAA GAT TTA AAA AAG AAT AAT AAT AAC ACC AAG TAT AAA AAT GAA AAA TTT TTT TAA TAA TAA TAA CAT GAT ATG GAG ATA ATT ATA TCT GAG GAT GAT ATT GAA AAT ATA ACA GAT GAA AGA TAA ATC ACA AAT ATG GGT TAA AAG AAT AAT AAT TAT AAT AAT AAA AAT AAT TAT TAC GAA TTG AAT CGC TAG TAA AAC GAA TAA AAA GAT GAA TAG GTA TTT ATG ACA GAC TAT ACT TAA AGC TTT AAT GAA GGA TTT ATT TCT ATT TAT GAA GAT ATT GAG AAT AAT TAA AGT AAA AAT GTA TAC CGT GAT GAA GAA CAA TTC GAC TTT GAC TAT GAA GAG AAT GAA TTC AAT TAA ATA AAA AGA AAA AAG AAC TAT TCA AAT AGA AGT ATG CCT AGT AAT TAC TTA AAA GAT ATA GAG TGC GAT TTA AAT ATC TCT GAA ATA TAA AAC AAT TAA GTC AAT TCA ATA GAT TTT GGC TAT GAT GAG ACA CCT ATA AAC AAA TTT CAG AGC TAA AAG AGC GAA TCT CAT GCT TCT TTA TAT AAA TAG ATT ATT TCT AAA ATA ACT GAT TAC ACA GAA CCA ATA ACA CTT CAA GTG GAA GAT TAC ACA AAT GAC TAA AAG AGT TAA TGT TAA AAA CCT TCA AAA ATT ATT TAA GAG AAA AAA TAA ATG ATT TAA TAA ACA CCT AAT TTT ATA GCC CAA AAA TAA ACT GAC AAC GAT TTG GAT TTT TTG TTG AAA GAA TTA GAA ATA GAA ATA GAT TTT GAA GAA AAG GAC AAA TCA AAC TCA CAA AAA TTG GAC TGC GAC AGT ATA CCA TTT TAA ATA TTG GAC GAA GAC AGC AAT CTA GAA AAA AAC TCT TAA AAA GAT AAC TTA AAT CAT TCT AAT TTA TCT AAC TAG CCA ATT GTT TAT AAG GGA AAA TAA ATA TCA GCA GAA AAA ATT ACA TAG AAA AAA ATA CCT CTT AAA GAC TAA CCA TTC TGT AGG AAA TTA TTT GAT GAT GAA TTT AGC TCT CCA TTT GGA GCT TTT AGC AAA GAA TCT GCT TTA ACA AAA TGC TCT ACT AAC CAT TTT GTG AAT GAT AAT AGC TGT AAG AAA TCT AGT GTT TTC GAT AAG CTA ATA TTA GAT ATT GAT GAA AGC ACT AAA AAA TCT AAT GTT TTT AAC GAT TAA TTG AAC CCT AAA TAA AAT GTA GAC TAA GGT GAT CTA GAA TAT GAT GAT TTA TTT TCA ATA AAC GGA TAA AAT GCT ATA GGA TTT TTT GAA ATA AAT AAA AAA TTG AAT CAT AAT ACA AAT AAT AAC AAG AAT TTA AGC AAA GAA CAA TTT AAA ACT CAA CAA TTA TTT AAA GAT ACT CAA AAA ACA AAT GAC AAA AAT CTA TTT AAT TAG TCC GAT AAA AAT ATA GAA GCC CCT TAA TAA ATG AAA TTT ACT GGA TTA AAG AAA AGG AAA CTT AAC AAT TCT TTC AAG TTA GAT CCA AAG CAA TTA CTA AAA AAG AAA AAA ATA AAA ACA AAT TGA >TTHERM_00112490(protein)M I T S I Q Q I S N T Q A L V Q V E N Q I L I K D P Y I K R Y L Q N Q N R S K Y E E K Y N G Y L I D I A E S S F M K D K I N F Q I S A K Q K K K K L S D I P R F V T E A F T D F G N K L K I R D L K G N I V S E I N Y G N E Q L A N D L G L S Q E H I S D A I Q M A F Q M R G R V I L A D D P G L N S C K T A V N I A Y A Y D Y K I P F L I I A S S T Q R Q K W K S I L K Q Q F S L K D K D I Q I L Y N N Q T Q F D F K K D A I I A T Y D Q V S T R K E E L Q D I K V A L V D E A H Y L R N I K F V N E R N L M E Y L C K R K R V V L L S S C C I I Q S V E D L F P L L R V I R P D C F H N T K A F K D R Y V N N E N N W I E L H C M L N Q I G F I R R T R Q M F A D N H N F T N F G I V P I E C D K S V T S I I N S L V H N A H R I G G N F S K G I Y S Q C Y T L S L D A K I K G C L Q F I D R Q L E Q K P D D K I V I F G Y H Q K S F E M I G T H L Q A K N I T F I V V D K K T N F A Q K E E L L H Q I D P Q I S V V L M S F T N L Q D I E L S L F S T A I V L E F S W T P H L I D Q A I G C L Y S L S Q V N E Q V D A F L L E G I G T L D K L L K G K Y I K W L D L K T K I L D G K K V D N L L N I Q D V V S I D N Q G S N R L R Q N Q S I D I S F N E D N H L S N Q P S K A Y N Q Q K S P Q Q K K K R S R K N I Q K F E I S K L N T S K Q R I T T Q T L S Q D I L P P E I K V D I N Q S K K I F M Q K A R T V E D L K K N N N N T K Y K N E K F F Q Q Q Q H D M E I I I S E D D I E N I T D E R Q I T N M G Q K N N N Y N N K N N Y Y E L N R Q Q N E Q K D E Q V F M T D Y T Q S F N E G F I S I Y E D I E N N Q S K N V Y R D E E Q F D F D Y E E N E F N Q I K R K K N Y S N R S M P S N Y L K D I E C D L N I S E I Q N N Q V N S I D F G Y D E T P I N K F Q S Q K S E S H A S L Y K Q I I S K I T D Y T E P I T L Q V E D Y T N D Q K S Q C Q K P S K I I Q E K K Q M I Q Q T P N F I A Q K Q T D N D L D F L L K E L E I E I D F E E K D K S N S Q K L D C D S I P F Q I L D E D S N L E K N S Q K D N L N H S N L S N Q P I V Y K G K Q I S A E K I T Q K K I P L K D Q P F C R K L F D D E F S S P F G A F S K E S A L T K C S T N H F V N D N S C K K S S V F D K L I L D I D E S T K K S N V F N D Q L N P K Q N V D Q G D L E Y D D L F S I N G Q N A I G F F E I N K K L N H N T N N N K N L S K E Q F K T Q Q L F K D T Q K T N D K N L F N Q S D K N I E A P Q Q M K F T G L K K R K L N N S F K L D P K Q L L K K K K I K T N >TTHERM_00112490(gene)ATG ATT ACA TCT ATT TAA CAG ATT AGT AAC ACA TAA GCT CTG GTA CAA GTC GAA AAC CAA ATA CTA ATT AAA GAT CCT TAT ATA AAG AGA TAT TTG CAA GTA ACT TTA CTC ATT TTA ACA TAA AAA AAA GTA AGT TAA ATT TAT TTT TAA GAA TTA AAA TAG AAG CAA ATA TGA GGA GAA ATA CAA TGG ATA TCT AAT AGA TAT CGC AGA GTC TTC ATT CAT GAA AGA TAA GGT ACT TAA TTT TGG ATT TCA AAT CGA AGC TAA ACG GAT TTT TTA AAT TTC GAA AGA TTA ATT TTT AGA TTA GCG CCA AAT AAA AGA AAA AGA AAT TAT CAG ATA TCC CAA GAT TTG TGA CAG AAG CTT TTA CAG ACT TTG GGA ATA AGT TAA AAA TTA GAG ACT TAA AAG GCA ACA TTG TTT CAG AGA TCA ATT ATG GAA ATG AAT AAG TAT AAT GTT ATA TTT GAT TTT TCT ATT TCA AGA TTA TTA ATT AAA TTT TAA TTT AAA AAA TAT TTT AAA ATA AAT TAA AAT TAA TAG CTT GCA AAT GAT CTT GGA TTA TCT TAG GAA CAT ATC AGT GAT GCT ATT TAA ATG GCT TTT CAG ATG AGA GGA AGA GTT ATC CTT GCT GAT GAC CCA GGA CTG AAT TCA TGC AAA ACA GCA GTC AAT ATT GCA TAT GCT TAT GAT TAT AAA ATA CCT TTT TTA ATA ATT GCT TCT TCT ACT CAG GTT TTA TTG TTA TTT TAT GCT TAT TTT ATT AAT TTT TAA AAA TAT TTA ACT TAG CGT TAG AAA TGG AAA TCA ATA CTA AAA TAA CAA TTT AGC CTG AAA GAT AAA GAC ATA TAA ATT TTA TAT AAC AAT TAA ACT TAA TTT GAT TTC AAA AAG GAT GCA ATA ATA GCT ACG TAA GTT TTT ATT AAC ATT TTA ATT AAA ATA TGT TTA ATT AGT TGA TAT TTA AAT AAA AGA TAT GAT CAA GTT TCT ACT AGA AAA GAG GAA CTT CAA GAT ATA AAA GTT GCT TTA GTA GAT GAG GCT CAT TAC TTG AGA AAT ATA AAG TTT GTA AAT GAG AGA AAT TTA ATG GAG TAT TTA TGC AAA AGA AAA AGA GTT GTC CTT TTG AGT AGT TGC TGT ATT ATA TAA TCA GTT GAA GAT CTA TTT CCT TTG CTA AGA GTT ATT CGT CCT GAC TGC TTC CAT AAT ACT AAA GCT TTC AAA GAC AGA TAT GTT AAC AAT GAA AAT AAT TGG ATA GAA CTT CAT TGT ATG CTA AAT TAA ATA GGA TTT ATT AGA AGA ACA AGA TAA ATG TTC GCA GAT AAC CAT AAT TTT ACT AAT TTT GGA ATT GTT CCT ATA GAA TGT GAT AAA AGT GTT ACA TCA ATT ATA AAT AGC CTC GTT CAT AAT GCA CAT AGA ATT GGA GGG TAA TTA ATG CAA ATT TAT TTT TTT TAA CTA AAA TTG CTT AAA TTT AAG TTA AAT ATT TGG TTT ATA CTT GAG ATA AAA GAG AAA ATT ATT AAG TAA TAC ACC TTA TTC TTT CAA ACA TCA TAA CTT TTA ATT CAA AAA ATG AAA GAG TTT CCT AGT TAA TTG AAA AAA TCC ATA TTT TTG GCT TAC CTC GTA AAT CAA AAT ACT AAG TTT ATC GAT ACA ATA CGA TAT ATT AGT TAC ATC TGA TAA CTA TCC ACT AAA ACA TAC TAT AAA ATC AAA ATG ATA GAA ATT TTA TTT TTA TAT AAT GAG ATA AAA TTT AAT AAT AAT CAG TAT AAA AAT TAG GAT ATA TTG ATT AAT AAA ATA AAT TTT ATA TTT AAA AAA ATT TAA TAA TTA TTT TAT TAA AAT TTA ATA GAA ACT TTT CAA AAG GTA TCT ATT CAT AAT GCT ATA CTT TAT CAT TAG ATG CAA AGA TCA AGG GTT GCT TGT AAT TCA TAG ATA GAT AAT TAG AAT AAA AAC CTG ATG ATA AAA TAG TAA TTT TTG GAT ATC ATC AGA AAT CTT TCG AGA TGA TTG GTA CCC ATT TAT AAG CAA AAA ATA TTA CTT TCA TAG TTG TTG ATA AAA AAA CTA ATT TTG CTT AAA AAG AAG AGT TAC TAC ATC AAA TAG ATC CAT AAA TTA GCG TTG TTT TGA TGT CTT TCA CAA ATT TAT AAG ATA TTG AGT TAT CCC TAT TTT CTA CAG CTA TTG TCT TGG AAG TAA GTT TAA TAA ATA TTT GTT ATT TTA TTT AGT ATT AAA AAT TTG ATT AGT TTT CTT GGA CTC CAC ATT TAA TAG ATC AAG CTA TTG GTT GTT TAT ATA GCT TAA GTC AAG TGA ATG AAT AAG TAG ATG CTT TTT TAC TTG AAG GTA TAG GGA CAC TTG ACA AAT TAC TAA AAG GGA AAT ACA TCA AGT GGT TAG ATT TGA AAA CTA AAA TTT TAG ATG GGA AAA AAG TAG ATA ATT TAC TAA ATA TTC AAG ATG TAG TGA GTA TTG ATA ATT AAG GTT CAA ATA GAT TAA GAT AGA ATT AAA GCA TAG ATA TAA GCT TCA ATG AAG ATA ATC ATT TGT CAA ACT AAC CTT CAA AAG CAT ACA ATT AGC AGA AAT CTC CTC AAT AGA AAA AAA AGA GAA GTA GAA AAA ATA TTT AAA AAT TTG AAA TAT CTA AGC TAA ATA CTA GTA AAT AAA GAA TAA CAA CTT AGA CAT TAA GCT AGG ATA TAC TAC CAC CTG AAA TAA AGG TAG ATA TTA ATT AGA GCA AAA AAA TCT TTA TGT AGA AAG CCA GAA CTG TTG AAG ATT TAA AAA AGA ATA ATA ATA ACA CCA AGT ATA AAA ATG AAA AAT TTT TTT AAT AAT AAT AAC ATG ATA TGG AGA TAA TTA TAT CTG AGG ATG ATA TTG AAA ATA TAA CAG ATG AAA GAT AAA TCA CAA ATA TGG GTT AAA AGA ATA ATA ATT ATA ATA ATA AAA ATA ATT ATT ACG AAT TGA ATC GCT AGT AAA ACG AAT AAA AAG ATG AAT AGG TAT TTA TGA CAG ACT ATA CTT AAA GCT TTA ATG AAG GAT TTA TTT CTA TTT ATG AAG ATA TTG AGA ATA ATT AAA GTA AAA ATG TAT ACC GTG ATG AAG AAC AAT TCG ACT TTG ACT ATG AAG AGA ATG AAT TCA ATT AAA TAA AAA GAA AAA AGA ACT ATT CAA ATA GAA GTA TGC CTA GTA ATT ACT TAA AAG ATA TAG AGT GCG ATT TAA ATA TCT CTG AAA TAT AAA ACA ATT AAG TCA ATT CAA TAG ATT TTG GCT ATG ATG AGA CAC CTA TAA ACA AAT TTC AGA GCT AAA AGA GCG AAT CTC ATG CTT CTT TAT ATA AAT AGA TTA TTT CTA AAA TAA CTG ATT ACA CAG AAC CAA TAA CAC TTC AAG TGG AAG ATT ACA CAA ATG ACT AAA AGA GTT AAT GTT AAA AAC CTT CAA AAA TTA TTT AAG AGA AAA AAT AAA TGA TTT AAT AAA CAC CTA ATT TTA TAG CCC AAA AAT AAA CTG ACA ACG ATT TGG ATT TTT TGT TGA AAG AAT TAG AAA TAG AAA TAG ATT TTG AAG AAA AGG ACA AAT CAA ACT CAC AAA AAT TGG ACT GTA ATT AGC TAT AAC CGT TTT AAC AAT ATT TAT TTT CTT TTT CAC ATT ATT TAT AAA ATA GGC GAC AGT ATA CCA TTT TAA ATA TTG GAC GAA GAC AGC AAT CTA GAA AAA AAC TCT TAA AAA GAT AAC TTA AAT CAT TCT AAT TTA TCT AAC TAG CCA ATT GTT TAT AAG GGA AAA TAA ATA TCA GCA GAA AAA ATT ACA TAG AAA AAA ATA CCT CTT AAA GAC TAA CCA TTC TGT AGG AAA TTA TTT GAT GAT GAA TTT AGC TCT CCA TTT GGA GCT TTT AGC AAA GAA TCT GCT TTA ACA AAA TGC TCT ACT AAC CAT TTT GTG AAT GAT AAT AGC TGT AAG AAA TCT AGT GTT TTC GAT AAG CTA ATA TTA GAT ATT GAT GAA AGC ACT AAA AAA TCT AAT GTT TTT AAC GAT TAA TTG AAC CCT AAA TAA AAT GTA GAC TAA GGT GAT CTA GAA TAT GAT GAT TTA TTT TCA ATA AAC GGA TAA AAT GCT ATA GGA TTT TTT GAA ATA AAT AAA AAA TTG AAT CAT AAT ACA AAT AAT AAC AAG AAT TTA AGC AAA GAA CAA TTT AAA ACT CAA CAA TTA TTT AAA GAT ACT CAA AAA ACA AAT GAC AAA AAT CTA TTT AAT TAG TCC GAT AAA AAT ATA GAA GCC CCT TAA TAA ATG AAA TTT ACT GGA TTA AAG AAA AGG AAA CTT AAC AAT TCT TTC AAG TTA GAT CCA AAG CAA TTA CTA AAA AAG AAA AAA ATA AAA ACA AAT TGA
Login
Recent Activity
Recent Papers
Identifiers and Description
Gene Ontology Annotations 
Domains
Gene Expression Profile
Signal Peptide
Homologs (v.2006 protein sequences)
General Information 
Associated Literature 
Sequences
