Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01435670

Standard Name

GLC3 (GLyCogen branching enzyme 3)

Aliases

PreTt03614 | 388.m00008

Description

Alpha amylase; catalytic domain containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• catalytic activity (IEA) | GO:0003824
• cation binding (IEA) | GO:0043169
• hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds (IEA) | GO:0004553

Biological Process

• carbohydrate metabolic process (IEA) | GO:0005975

Domains

• ( TIGR02456 ) trehalose synthase
• ( TIGR02104 ) pullulanase, type I
• ( PF02922 ) Isoamylase N-terminal domain
• ( TIGR02403 ) alpha,alpha-phosphotrehalase
• ( PF00128 ) Alpha amylase, catalytic domain
• ( TIGR01515 ) 1,4-alpha-glucan branching enzyme
• ( PF02806 ) Alpha amylase, C-terminal all-beta domain
• ( TIGR02402 ) malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_01435670

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Stentor Coeruleus	SteCoe_31581	0
WormBase	WBGene00011409	9.997093137033517e-262	status:Confirmed UniProt:Q22 137 protein_id:CAA84727.1
Tetrahymena borealis	EI9_09467.1	9.997093137033517e-262	alpha amylase, catalytic domai n-containing protein (808 aa)
DictyBase	DDB_G0274105	9.997093137033517e-262	glgB on chromosome: 2 position 4089271 to 4091779
Oxytricha	Contig22093.0.g31	9.997093137033517e-262	Alpha amylase, C-terminal all- beta domain
SGD	YEL011W	9.997093137033517e-262	GLC3 Glycogen branching enzyme , involved in glycogen accumul ation; green fluorescent prote in (GFP)-fusion protein locali zes to the cytoplasm in a punc tate pattern

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_01435670(coding)
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GTGTATATACCATCAAGATGTGCTATGGTTTTAACATCTGTAAGCTAAGCACATAATTAC
TGGAACTAAAAAAAGTTACTTAATGAAGCCAAAAAGCATCACTGA

>TTHERM_01435670(protein)
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>TTHERM_01435670(gene)
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TAAAAAATAATTAATTGAAATTTCTTTTTAAAATTTAATTTGTTTTTTTTAATTAAAAGT
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ATTTCCCCAGATAAGATAATGGCTGGAGCTATCATCATTGTCGTAGAAGATGGGACTTAG
TAGATGACTAACTTCTCAGATTCAGATTCTTTAATGTAAATATTAAAAAAATACTTTATT
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CTGATGAGGTAATTAATTTTCACATTTAAAAAAATATATTTCAATCAATAGCTTTTAATA
ATATATATTTCTATTATTATAATAGCCTCATTACGGTGGTCATGATAGAGTTAGAGCTGG
ACATGAAAAGCCTTTCCCTTATATTTAAGAAAACTTTAATGGTAGACCCTATTGCTTAAA
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CTGGAACTAAAAAAAGTTACTTAATGAAGCCAAAAAGCATCACTGA