Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_01435670Standard Name
GLC3 (GLyCogen branching enzyme 3)Aliases
PreTt03614 | 388.m00008Description
GLC3 1-4-alpha-glucan branching enzyme from glycoside hydrolase family GH13 protein putative; Alpha amylase; catalytic domain containing proteinGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- catalytic activity (IEA) | GO:0003824
- cation binding (IEA) | GO:0043169
- hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds (IEA) | GO:0004553
Biological Process
- carbohydrate metabolic process (IEA) | GO:0005975
Domains
- ( TIGR02456 ) trehalose synthase
- ( TIGR02104 ) pullulanase, type I
- ( PF02922 ) Isoamylase N-terminal domain
- ( TIGR02403 ) alpha,alpha-phosphotrehalase
- ( PF00128 ) Alpha amylase, catalytic domain
- ( TIGR01515 ) 1,4-alpha-glucan branching enzyme
- ( PF02806 ) Alpha amylase, C-terminal all-beta domain
- ( TIGR02402 ) malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%
TetraMine Data
TTHERM_01435670
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Stentor Coeruleus SteCoe_31581 0 WormBase WBGene00011409 9.997093137033517e-262 status:Confirmed UniProt:Q22
137 protein_id:CAA84727.1
Tetrahymena borealis EI9_09467.1 9.997093137033517e-262 alpha amylase, catalytic domai
n-containing protein (808 aa)
DictyBase DDB_G0274105 9.997093137033517e-262 glgB on chromosome: 2 position
4089271 to 4091779
Oxytricha Contig22093.0.g31 9.997093137033517e-262 Alpha amylase, C-terminal all-
beta domain
SGD YEL011W 9.997093137033517e-262 GLC3 Glycogen branching enzyme
, involved in glycogen accumul
ation; green fluorescent prote
in (GFP)-fusion protein locali
zes to the cytoplasm in a punc
tate pattern
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_01435670(coding)
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GTGTATATACCATCAAGATGTGCTATGGTTTTAACATCTGTAAGCTAAGCACATAATTAC
TGGAACTAAAAAAAGTTACTTAATGAAGCCAAAAAGCATCACTGA>TTHERM_01435670(protein)
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VYIPSRCAMVLTSVSQAHNYWNQKKLLNEAKKHH>TTHERM_01435670(gene)
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TTTTTGATTTTAGTAATGTCTTTGTCAGTTTTAGTGTAAAATCAACTAATAAATAATGAC
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TTTATCCTGATGCTATTACTATTGCTGAAGATGTTTCTGGCTATCCCACACTTTGCAGAA
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TAAAAAATAATTAATTGAAATTTCTTTTTAAAATTTAATTTGTTTTTTTTAATTAAAAGT
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CCTTAGTCGGAGATAAAACTCTTTCCATGTGGCTTTTTGATGCTGTAAATAAATTTGATT
AATAATAAATATATTTTATTCTTTAAATTAAAATAAAAGTAAATTTATGAAAATATGAGC
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GAAAATATTTCTATTTTCTTAGATAAATTGTTATTTTTTTTCATACTAAAATTGATTTTT
GTAATAAAAAGGGTTATCTTAACTTTATGGGTAACGAATTTGGTCACCCAGAATGGATTG
ATTTCCCCAGATAAGATAATGGCTGGAGCTATCATCATTGTCGTAGAAGATGGGACTTAG
TAGATGACTAACTTCTCAGATTCAGATTCTTTAATGTAAATATTAAAAAAATACTTTATT
TGTTGAATGAAATTTATTTATTAAAAGAATTTCGATAGAGACATGATTCATCTTGAAAGT
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CTGATGAGGTAATTAATTTTCACATTTAAAAAAATATATTTCAATCAATAGCTTTTAATA
ATATATATTTCTATTATTATAATAGCCTCATTACGGTGGTCATGATAGAGTTAGAGCTGG
ACATGAAAAGCCTTTCCCTTATATTTAAGAAAACTTTAATGGTAGACCCTATTGCTTAAA
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CTGGAACTAAAAAAAGTTACTTAATGAAGCCAAAAAGCATCACTGA