Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_01220340

Standard Name

GCP4 (Gamma-tubulin Complex Protein 4)

Aliases

PreTt17298 | 279.m00023

Description

Spc97/Spc98 family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• microtubule organizing center (IEA) | GO:0005815
• spindle pole (IEA) | GO:0000922

Biological Process

• microtubule cytoskeleton organization (IEA) | GO:0000226

Domains

• ( PF04130 ) Spc97 / Spc98 family

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 16.5%

TetraMine Data

TTHERM_01220340

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_17175.1	9.997093137033517e-262	Spc97/Spc98 family protein (92 6 aa)
Oxytricha	Contig19816.0.g9	2.9991470337942304e-139	Spc97 / Spc98 family
Stentor Coeruleus	SteCoe_8727	2.4426007377405277e-36
DictyBase	DDB_G0285849	0.00000000000020009182674645818	spc97 on chromosome: 4 positio n 3719511 to 3723808

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_01220340(coding)
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>TTHERM_01220340(protein)
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LFQLLLRLDFNGYYREKMEDKYKY

>TTHERM_01220340(gene)
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AATGATAGCTTTGTTTTAGATCCAAAGATAACATTTCTGACTCCTGCTGAAAAGGAGATA
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GCTGTAAGAAAAAGTTGCAGAGATTAAAGACTTTGAAGAACTTAGAAAGATAATTGATCT
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CTTTGATATTGTCGATTGCTGTAGGAGATATTGTAACATCGTAGTAAAGTAAAAATTTTG
ATTAAAAAATATATTCTTTTATTTTTTATCTCATTTAAATTAATTAATACAGATTAGAAT
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ATAAATATAAATACTGA