Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00426160

Standard Name

GCP2 (Gamma-tubulin Complex Protein 2)

Aliases

PreTt14051 | 47.m00246

Description

Spc97/Spc98 family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• spindle pole (IEA) | GO:0000922
• microtubule organizing center (IEA) | GO:0005815

Biological Process

• microtubule cytoskeleton organization (IEA) | GO:0000226

Domains

• ( PF04130 ) Spc97 / Spc98 family
• ( PF07852 ) Protein of unknown function (DUF1642)

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_00426160

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Stentor Coeruleus	SteCoe_12356	0
Tetrahymena borealis	EI9_00181.1	9.997093137033517e-262	Spc97/Spc98 family protein (93 7 aa)
Oxytricha	Contig22101.0.g33	9.997093137033517e-262	Spc97 / Spc98 family
DictyBase	DDB_G0285849	3.0009061039838537e-46	spc97 on chromosome: 4 positio n 3719511 to 3723808
SGD	YHR172W	0.000000000004997916451710233	SPC97 Component of the microtu bule-nucleating Tub4p (gamma-t ubulin) complex; interacts wit h Spc110p at the spindle pole body (SPB) inner plaque and wi th Spc72p at the SPB outer pla que

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00426160(coding)
ATGATTTAAGAAAACGGAACAGGATTGTCTTATTTGACAAAGATTGGTATTAAAAACACT
AGAAACAATAGATATTTGAGCCATCAATATACTTATGATACAGAAAAAAATGAATTAACA
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GAAAATTTAAATACTGTAAGTGCCAATAGTCCAAATATTTCTCCTGACTCTATGTGGAGA
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TAAAATTACATTGCATAGCATTAATAATTTTCTTTTGGAACTGTTTCGCAGGCTCTTTGT
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ACAATATAATCAATAAATTCTTGCTGTCAGACTTTTGCTCAATTTATATAAAATAACATT
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ATAAATTTAATTGCCAGATTAGATTTTGATGGATTCTACAGTAATTAGTGGAGTTTCAAT
TAAGGAGCTATGGAAGGATAAAATTAATTTTTTGAAAATAATAACAATGATAAAAATTAA
TCGTATTAAATGTTTTAGAAAAAGATCTGA

>TTHERM_00426160(protein)
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QNYIAQHQQFSFGTVSQALCAALGLLLREYVVMINQLDQEFQKAELTLQKLWFYIQPSLK
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LVAEKNYKDFFQKYTQKFDSSLKDLMKIINNMITKYDTYLINLIARLDFDGFYSNQWSFN
QGAMEGQNQFFENNNNDKNQSYQMFQKKI

>TTHERM_00426160(gene)
ATGATTTAAGAAAACGGAACAGGATTGTCTTATTTGACAAAGGTAGTTATATTATAGAAT
AGTCTTAAGCACAGTTCATACATACTAAATATAAAATGTTTATAAATAATAAATAGATTG
GTATTAAAAACACTAGAAACAATAGATATTTGAGCCATCAATATACTTATGATACAGAAA
AAAATGAATTAACAGGCAATTCGGTTTAAATGAGCGCAATTCATCCTTTTTTAAAATAAT
AAACACAAGTTTAAGAAACTGATTCCATTGAAGAATTCATAATTTATAATTCCTAAAATT
AGGTATTTATCTTGATTGCCGTTTCTTTATTTTTAAAACAGCATTTATTCTATCTCAAAT
CTTACTCATCTCAATTAAATATGATAGGATTATCCAGGGTTTATTTTGTTTGGTTCCTAA
GTGCATATAAAGAATAGGTAATATATCATTTATTACAATACAGTTAATAACATTAAATGC
GTGATAGACCTAAATATTTGACAAATGTTCTTTTTAACATAAATTAGTTAAGGGTATTAT
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TAAAACGGGATAACTTTTAAGTCAGCAAAATGGACTTTAGTTGATGCAAATAATCAACAA
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TTAATATGTGAAAATTTAAATACTGTAAGTGCCAATAGTCCAAATATTTCTCCTGACTCT
ATGTGGAGAATTTGTAAGAGTCATATACCTTTCATGCCAACATGGACAGAGCCTACTGAT
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CTTAACAAAACATGTAACATTATCAAATATAATAACTAAATTTATCATATAAATTGTTTT
ATTACTATTATTTTAGAAGAGAAAAAAAATCTAGGAGCAATGAGTCCCTAATTACAAGAG
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TTTAATTTTAATTTAATAGGAAATTATATCAAGAAAAAGGCAGATTAGTACAGAAAACCC
TATATTTATTGCATCGAACCATACTTAGAAACTTCAACATGTGAAAGTTCTTTGAAATAA
TTAGTTAATAAAATTCTTGAAATTTGCTTACAGTATGATAAAATATAAAATTACATTGCA
TAGCATTAATAATTTTCTTTTGGAACTGTTTCGCAGGCTCTTTGTGCTGCATTAGGACTT
CTCCTTAGAGAGTATGTTGTAATGATTAACTAACTCGATTAAGAGTTCCAGAAAGCAGAG
CTTACTTTGCAAAAATTATGGTTTTACATACAGCCATCTCTTAAAGTTATGGAAGCATTA
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AAATATAGAAAAATATTAATAAAAATAGCTAGAGTTAATTATTTAAAAGAATCAATAAAT
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TTAAATGTAAATTGCAATTCAATCTTAAGCAAGCATAATATGATTCATGCAATATTTAAA
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AAAAAAACATTTTCTGATAATTATTTAAAATAAATTCAGTTTAGTTGAATAAAATAAATA
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AGTAATTGGTATACTCTAAAGATAACTTTATCAAATTTAATTATAAAGCTAAAGAAAAAA
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TTTTTATTCAATTAAAAAACTAATAAGGGAGGAGAATTATTGAGTAAATTGTATGATTTG
CTTAAAAATACTAGTGACAAATAGATAGTTGATATATATTATTATGTTTTGTAGAAATCT
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CTTTATTTGTGGAAGGAAATGGTTTTTAAGACAGGTAAATATCTCAGTGTGTTGAGTGAG
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TTTTAAATGATTAAAATCAAGAGAAGTTCAAAATTCATACTCCAGCTCTTACTTTGAAAG
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GAAAAACTCTTACAAAATACTAACTGATTTTCCGTCATTTATTTAACTGCAAATATATTG
AAAGATAGCTGAGTAATGCATGGCTTGTTCAATAATCCATGAAAGAATTAAATGTATAAA
GAATATTTTTGAAAGGTTATGCTCTAACTCAAAGAATGATCCATTATGTAAAAAATTTCA
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AATCAGTTTAATAATTCGAAGACATCATACAACACCACGATTAATTCTTAGATGAATGCT
TAAAGGAATGCGTTTTGCTCGATACTTCCCTTATAAACACAATATAATCAATAAATTCTT
GCTGTCAGACTTTTGCTCAATTTATATAAAATAACATTTCAATCATTAAAAAGCCAGAAG
TAATTTTTTTTTATAAACAAATTTTATTTATTTTTTACCTAAAACTAAAAGAAAAGTCTT
AAAAAAATTAATTTTTGAAAAATTCTAAACTTAAAAAATAAATTGTATTAATGTAATTTC
TAAAATATAAAAAAAGAGCCAAAATACAGCTCATCTTTTAAATTAAGATGAAAAGAAAAC
ACCTTTGCAGTAAAGAAAGGAATAAGTTGAAGTAATTAATTAATTGATAAAAAGTTTTAG
CTATATTTAAAAAATAAAATTAGGAATAAAGAAAGCATGCTAGAATTCTTGTTGCAGAAA
AAAATTACAAAGATTTCTTTTAAAAATACACTTAAAAATTTGACTCGAGTTTGAAAGACC
TTATGAAAATAATTAACAATATGTAAATTTAAACGTTTAAAAGTATTATTTTTAAAAATA
ATAAATTTATATTAGGATTACAAAATATGACACCTACTTAATAAATTTAATTGCCAGATT
AGATTTTGATGGATTCTACAGTAATTAGTGGAGTTTCAATTAAGGAGCTATGGAAGGATA
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AAAGATCTGA