Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_01262850
Standard Name
FAP251 (Flagellar Associated Protein 251)
Aliases
PreTt01683 | 298.m00024
Description
WD-40 protein putative; Calmodulin and spoke-associated complex (CSC) protein; required for stable assembly of radial spoke protein RS3; homolog of the Chlamydomonas CSC protein FAP251
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Cellular Component Biological Process
Domains
( PF02210 ) Laminin G domain
( PF00400 ) WD domain, G-beta repeat
( PF02762 ) CBL proto-oncogene N-terminus, SH2-like domain
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 12%
TetraMine Data
TTHERM_01262850
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Stentor Coeruleus SteCoe_15009 0
Tetrahymena borealis EI9_21053.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (972 aa)
Oxytricha Contig21434.0.g6 9.997093137033517e-262 WD domain, G-beta repeat
DictyBase DDB_G0269104 0.0000009995106777214876 calB on chromosome: 1 position
2981116 to 2981944
WormBase WBGene00000552 0.00003998524687536623 locus:cmd-1 Calmodulin sta
tus:Confirmed UniProt:O16305
protein_id:CCD69969.1
SGD YBR109C 0.0002999184360822198 CMD1 Calmodulin; Ca++ binding
protein that regulates Ca++ in
dependent processes (mitosis,
bud growth, actin organization
, endocytosis, etc.) and Ca++
dependent processes (stress-ac
tivated pathways), targets inc
lude Nuf1p, Myo2p and calcineu
rin
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:25694453 : Urbanska P, Song K, Joachimiak E, Krzemien-Ojak L, Koprowski P, Hennessey T, Jerka-Dziadosz M, Fabczak H, Gaertig J, Nicastro D, Wloga D (2015) The CSC proteins FAP61 and FAP251 build the basal substructures of radial spoke 3 in cilia. Molecular biology of the cell 26(8):1463-75
Sequences
>TTHERM_01262850(coding)ATG TAT TAG TAA GAA GAA TAC GAA GTT AAC AAT GAA GGC TAA GAA GAT GTT AGC AAG ATA AAT GCA TTA AAT TTG AAA TGG ACT TTA GGT TTT AAT TTC TAG CTC ACT GAT GGC GTT CAC AAT TTA ACA AAT GAA AAA AGA AAA GAA ATT TTC TAT CCT GTT GCG CAC ACT GGT GTT ATA TAC GAT TAT GAA AAC AAT ACA TAA AGA TTA TTA TAG GGT CAT TGT AAT AGA ATT ACA GCA ACA GCA TAT TGC AAA TTC TCA GAT ATA ATT GTT ACT GCT GAC TGC GGT CCA GAT TCT ATG TTA GTA GTC TGG GAT GCA TCA ACA GGT ATT CCT AAA AAG ACT ATC TTT GAA CCA CAT CCT AAT GGT TGT TAA GCT TTA GAT ATT TCT CAA GAT GGA CAA TTC ATC GTG ACT CTT TCA AAA GAA GCT AAT ACA GAT ACT GAT GTA TAA TCT CTT TCT TTG TGG GAG TGG AAT AAA GAT GAT GAA CCA TGT TTG ATT ACC AAT GAA TTC GAT AGA AGA ATT AAG GAT TAT TAA TAT TTC GTT AGA TTC AAT TCA GAT GAT AAC ACT GAA TTT GCA ACA ACT GGT AAG ACA AGA ATT GTT TTT TGG AGA AGA GAA GGA GAA TAA AAA GGT TTT AAC TAT TAT TCC CCT GGT AAC ATT CCA TCT CTT AAG GTT CTC ACT CAA ACA GTA TTT ATA CCT GAT AAT ACA TAG GTT GTT ACA GGA ACA ACT GAT GGT CAT ATT ATT GTA TGG GAT ATT TCT CTT ATC ATA GAA AAA GTA GAC ACT CCA AAA GAA AGA AGA GCA ATT AAA TTG GTT GAT CTT ATG AAT AAA TCA AAA AAG CCT GAT GGC AAA AAA GGA TCA AAT TCA ATT AAT ATA TTA AAA ATT TAA GAT AAC TAT TTA GTT ATT GGT TCA TCT AAT GGA TCT ATC CGT TTT TAT GAC TTT CAA TAC AGA ATT ATA GCT TGG TTT GAA GAT GCA ATT ATA GGC TCT ATC AGC AAT ATT TCT TTT GCA AAT ACT CCA ATG ATT GAA GAC AAT GAA GAT GAA GAT GGC TTT GAT GAT GAA AGA AAA GAT AAG GGT GAA AAT GAA CCT AAA TTT ATC TGC CCT GAC TTT ATT GTA GTA GAT CTT GAT GCA ACT ATC ACT ATG TTA AAT TAC AAA CTT TTT GAA GAA TTA GAT GAT GAA AAG AAA AAG GGA ACT ACT TTA ATG AAA TCT ATA GTT TCA CCA ATT ATT GCA ATG AGT TGT AGA CCA AAC TCT AAT GTT ATT GGT ATT TGT TGT GAA AAT GGT TAT CTT TAT GAA TGG AAT TTC TAA GAA AAA TCT TCC GTT CTA TCT ATT TTA AGA GTA TTT GAT ACA GAT AAA GAA AAT ATT CCT AAT TGC ATT GAT TAC TCT CCA GAT GGA AAT TGG CTC TCT GTA GCC ACT AAG TCT GGT AAA ATC CAT ATA TTC GAT TGC AAA GAA AAA TAA TGG CAA AAC TCA GTT CTT GAA GTA TCT GAA AAT GAA TAA GGA AAA CCC AAA GTT AAT ATG CAG GTA TTT TCT TCA GAC TCA AAA AAT CTA GCT ACT ATG GAT GCT GAT TAT GCT GTT TCA CTC TTT ACT ATT GAT CAT AGA TAA TTT GAT GTG AAT ATT CCA GAA AAG GAA TGG TAA TTC GTT GGA AAG CAT AGA ATC CAT CAT AGT GAA ATT AAA TCT ATA GCA TTT GGC GAG TCA AAA AAT GAA AAC GAT AAA AAA TAT TAT AGA TTA TTT AGT ATT GGA GCA GAT ATG AAA ATG GTA GAA TAT GAA GTT CTT GAA ATC GAC TAT AGC AAG CAA AAA GAA AAA GGA TAA TAA ATA AAT TAT ATT GAC AGA CTA AAG CTT AAA TCC ATA TAT CCA ATT GAA TAA GAA ACA ATA CCT ACT GCA TGT ATC TGG TAC CCT ATA AAT ATG TAT AAA GAA GAT GTC CTG CTT ACA GTC AAT GAA GAA TTC AAA ATA AAA TTG TGG CAA TTT ATG AAG GAC AAT TTC AAA TTT TGT AAA AAG ACA TGT CTT GGT CCA ATT TAT GGT GGC GCA ATA AAT AAA TTA CTA ATT TTA AAT TAA AAC GAT GCT TAA AAT GAT TAT TAA GAT AAA TAC CTT GCT TAT TCA ACT AAA GAA AAA GTA GTA GGA ATT ATT AAG CTT CCT TTA GAA GGT AAT CCT AAT TAA ACT ATG GGT TTA ATT GCT CAC CCT GAT AAA ATT ACT AGT ATT AGT TGC TCT AAT GAT GGT AAA CAC TTC TTT TCA TCA GGT TCA GAT GAT TAT TGT GTT AAT GTA TGG TCT GTC AAT GTG TAG GCT TTA GAA TAA ATA TTT GCA ACC AAT CCA AAT GAA GAC CCA TAT CCA AAA CTT CTT GAA GGT GGA GAA GAT GGA TAA ACA CAT TAA GAC TTA AAG AAT TTC TTC TAT TAT TCT TAG ATT AGA AGT AAG GAT GAG CAT ACA ACA AAA GCA AGA AAG CTA GAT GGT AAA GTG CCA TTA ATT GCC ATT CCA GAT ATG ATG AGG TCT ATG GGT TAC TAT CCT ACT AAT AAG GAA ATA GAA AAT ATG TAA AAC GAA ATT AGA TTC TCT AAA TAT CTT GAT CCT GGC GAG TAG GTA GAA GAA TTA GAC TTA AAC ATG TTC TTG AAA TTA TTC GTC AAT CAC AGA CCT GTA TAA GGT ATT GGT AAA TCA AAA ATT GCT GAG TCA CTT AAT ACT TTA ACT AAA AGT TTG AGT GAT TCT GCT AAG GAA ATT GCT GAA TAG GCT AAA GGT TAA TCT GTA TAA CCT AAA ACA TAT AAT ATT GAT GGC ATT GGA GAG ATT TCT TTA TAA GAC TTA AAA AAA ATA TTA ACC ACT GAA GGA GAG CGT ATG ACT AAT GAA GAA TTT GAT GAA TGT CTC AAA ATA TTA TGT GGT GAA AAT GAA GAC TAA ATT CCT CAA TAA ATT AAT GTA AAC AAT TTA TGT GAA GAT ATT TTA GGT TTT GAA GAT TTA GAA GGT GAA GAA AGA GAT GAT AAC ATT GAA GAT TAG TAT GAA GAT GAA GAA AAT GAA GAA TAT GAT TAA GAT TGA >TTHERM_01262850(protein)M Y Q Q E E Y E V N N E G Q E D V S K I N A L N L K W T L G F N F Q L T D G V H N L T N E K R K E I F Y P V A H T G V I Y D Y E N N T Q R L L Q G H C N R I T A T A Y C K F S D I I V T A D C G P D S M L V V W D A S T G I P K K T I F E P H P N G C Q A L D I S Q D G Q F I V T L S K E A N T D T D V Q S L S L W E W N K D D E P C L I T N E F D R R I K D Y Q Y F V R F N S D D N T E F A T T G K T R I V F W R R E G E Q K G F N Y Y S P G N I P S L K V L T Q T V F I P D N T Q V V T G T T D G H I I V W D I S L I I E K V D T P K E R R A I K L V D L M N K S K K P D G K K G S N S I N I L K I Q D N Y L V I G S S N G S I R F Y D F Q Y R I I A W F E D A I I G S I S N I S F A N T P M I E D N E D E D G F D D E R K D K G E N E P K F I C P D F I V V D L D A T I T M L N Y K L F E E L D D E K K K G T T L M K S I V S P I I A M S C R P N S N V I G I C C E N G Y L Y E W N F Q E K S S V L S I L R V F D T D K E N I P N C I D Y S P D G N W L S V A T K S G K I H I F D C K E K Q W Q N S V L E V S E N E Q G K P K V N M Q V F S S D S K N L A T M D A D Y A V S L F T I D H R Q F D V N I P E K E W Q F V G K H R I H H S E I K S I A F G E S K N E N D K K Y Y R L F S I G A D M K M V E Y E V L E I D Y S K Q K E K G Q Q I N Y I D R L K L K S I Y P I E Q E T I P T A C I W Y P I N M Y K E D V L L T V N E E F K I K L W Q F M K D N F K F C K K T C L G P I Y G G A I N K L L I L N Q N D A Q N D Y Q D K Y L A Y S T K E K V V G I I K L P L E G N P N Q T M G L I A H P D K I T S I S C S N D G K H F F S S G S D D Y C V N V W S V N V Q A L E Q I F A T N P N E D P Y P K L L E G G E D G Q T H Q D L K N F F Y Y S Q I R S K D E H T T K A R K L D G K V P L I A I P D M M R S M G Y Y P T N K E I E N M Q N E I R F S K Y L D P G E Q V E E L D L N M F L K L F V N H R P V Q G I G K S K I A E S L N T L T K S L S D S A K E I A E Q A K G Q S V Q P K T Y N I D G I G E I S L Q D L K K I L T T E G E R M T N E E F D E C L K I L C G E N E D Q I P Q Q I N V N N L C E D I L G F E D L E G E E R D D N I E D Q Y E D E E N E E Y D Q D >TTHERM_01262850(gene)ATG TAT TAG TAA GAA GAA TAC GAA GTT AAC AAT GAA GGC TAA GAA GAT GTT AGC AAG ATA AAT GCA TTA GTA ATT TTA AAA TTA AAA TGA AAG GAT AGG GAG TGT AGT TAA TTG GGT TAA AAA TTT GAA AAA TAT AAT ATT AAA GTT GTA ATC AAG CTC CAT TAA TAA ATT AGA TAT CTC GCT CTC TAT TTT AAT ACC CTA CTA AAT TGA AAT GCA TTA ACA AAT AAT AAT TTC TCT TAT ATA AAA AGA ATT TGA AAT GGA CTT TAG GTT TTA ATT TCT AGC TCA CTG ATG GCG TTC ACA ATT TAA CAA ATG AAA AAA GAA AAG TAA TTT TGT TAA TCA GAT TTG AAA TAT AAT TAA ATA AGT TTA TAA TAA CTA ACT ACA CAC GAA TTA AAA ATT CAT AAT ATG AAT AAA GGA AAT TTT CTA TCC TGT TGC GCA CAC TGG TGT TAT ATA CGA TTA TGA AAA CAA TAC ATA AAG ATT ATT ATA GGG TCA TTG TAA TAG AAT TAC AGC AAC AGC ATA TTG CAA ATT CTC AGA TAT AAT TGT TAC TGC TGA CTG GTG AAT ATT TAT TTA TAA AAT TAA ATT TTA ATT TGA TAT GCT GTT AAG CCT TAA ACA TAA ATT AAT TTA AAT CAT CTA TAA AAA GCG GTC CAG ATT CTA TGT TAG TAG TCT GGG ATG CAT CAA CAG GTA TTC CTA AAA AGA CTA TCT TTG AAC CAC ATC CTA ATG GTT GTT AAG CTT TAG ATG TAA TAA TTT TTA TTA AAA TTA ATT ATA TAA AAT ATA ATT AAA ATT CAG TTT TAT TTA ATA TAT TGT TTG TAC TAA TAA AAT TAT AAT TAG ATT TCT CAA GAT GGA CAA TTC ATC GTG ACT CTT TCA AAA GAA GCT AAT ACA GAT ACT GAT GTA TAA TCT CTT TCT TTG TGG GAG TGG AAT AAA GAT GGT AAA AAA TAG AAA TAT TTG TTT GTT TTA CTC ATT ATG TAA ATG TTT CCT TTA AAT ATT AAT AGA TGA ACC ATG TTT GAT TAC CAA TGA ATT CGA TAG AAG AAT TAA GGA TTA TTA ATA TTT CGT TAG ATT CAA TTC AGA TGA TAA CAC TGA ATT TGC AAC AAC TGG TAA GAC AAG AAT TGT TTT TTG GAG AAG AGA AGG AGA ATA AAA AGG TTT TAA CTA TTA TTC CCC TGG TAA CAT TCC ATC TCT TAA GGT TCT CAC TCA AAC AGT ATT TAT ACC TGA TAA TAC ATA GGT AAA TAT GAA ATA TTA TTA AAA GTC TTC ATT ACA TTT TTG TTT ATA TTT AAA GGT TGT TAC AGG AAC AAC TGA TGG TCA TAT TAT TGT ATG GGA TAT TTC TCT TAT CAT AGA AAA AGT AGA CAC TCC AAA AGA AAG AAG AGC AAT TAA ATT GGT TGA TCT TAT GAA TAA ATC AAA AAA GCC TGA TGG CAA AAA AGG ATC AAA TTC AAT TAA TAT ATT AAA AAT TTA AGA TAA CTA TTT AGT TAT TGG TTC ATC TAA TGG ATC TAT CCG TTT TTA TGA CTT TCA ATA CAG AAT TAT AGC TTG GTT TGA AGA TGC AAT TAT AGG CTC TAT CAG CAA TAT TTC TTT TGC AAA TAC TCC AAT GAT TGA AGA CAA TGA AGA TGA AGA TGG CTT TGA TGA TGA AAG AAA AGT ATG TTT TTA TCT TAT TTA ATT GTT CAT TTC ATC ATT AAT TAA TAA TAA AAA AAG GAT AAG GGT GAA AAT GAA CCT AAA TTT ATC TGC CCT GAC TTT ATT GTA GTA GAT CTT GAT GCA ACT ATC ACT ATG TTA AAT TAC AAA CTT TTT GAA GAA TTA GAT GAT GAA AAG AAA AAG GGA ACT ACT TTA ATG AAA TCT ATA GTT TCA CCA ATT ATT GCA ATG AGT TGT AGA CCA AAC TCT AAT GTT ATT GGT ATT TGT TGT GAA AAT GGT TAT CTT TAT GAA TGG AAT TTC TAA GAA AAA TCT TCC GTT CTA TCT ATT TTA AGA GTA TTT GAT ACA GAT AAA GAA AAT ATT CCT AAT TGC ATT GAT TAC TCT CCA GAT GGA AAT TGG CTC TCT GTA GCC ACT AAG TCT GGT AAA ATC CAT ATA TTC GAT TGC AAA GAA AAA TAA TGG CAA AAC TCA GTT CTT GAA GTA TCT GAA AAT GAA TAA GGT GAT TAA TAA ATA TTA TTT TTT TTT TCA AGT AAA GCA AAT TTA AAA GAA AAT TTA AAA AAT ATT TAG GAA AAC CCA AAG TTA ATA TGC AGG TAT TTT CTT CAG ACT CAA AAA ATC TAG CTA CTA TGG ATG CTG ATT ATG CTG TTT CAC TCT TTA CTA TTG ATC ATA GAT AAT TTG ATG TGA ATA TTC CAG AAA AGG AAT GGT AAT TCG TTG GAA AGC ATA GAA TCC ATC ATA GTG AAA TTA AAT CTA TAG CAT TTG GCG AGT CAA AAA ATG AAA ACG ATA AAA AAT ATT ATA GAT TAT TTA GTA TTG GAG CAG ATA TGA AAA TGG TAG AAT ATG AAG TTC TTG AAA TCG ACT ATA GCA AGC AAA AAG AAA AAG GAT AAT AAA TAA ATT ATA TTG ACA GAC TAA AGC TTA AAT CCA TAT ATC CAG TAA TTA ATT GAT TAC AAT CAT AAA GAA TTA TCA TAT ACT TAT TTA TTT ATA TTT TAT TTA TTA AAG ATT GAA TAA GAA ACA ATA CCT ACT GCA TGT ATC TGG TAC CCT ATA AAT ATG TAT AAA GAA GAT GTC CTG CTT ACA GTC AAT GAA GAA TTC AAA ATA AAA TTG TGG CAA TTT ATG AAG GAC AAT TTC AAA TGT ATT TTA AAT AAT ATA AAA ATT ATT TTA TTT AAA AAA AAA AAC AAA TTC TTA AAA ATT AGT TTG TAA AAA GAC ATG TCT TGG TCC AAT TTA TGG TGG CGC AAT AAA TAA ATT ACT AAT TTT AAA TTA AAA CGA TGC TTA AAA TGA TTA TTA AGA TAA ATA CCT TGC TTA TTC AAC TAA AGA AAA AGT AGT AGG AAT TAT TAA GCT TCC TTT AGA AGG TAA TTT AGA TAT TTA TCA ATT ATT TAT TGA TTT TTT ATT TTT AAT TAA TCA AAG GTA ATC CTA ATT AAA CTA TGG GTT TAA TTG CTC ACC CTG ATA AAA TTA CTA GTA TTA GTT GCT CTA ATG ATG GTA AAC ACT TCT TTT CAT CAG GTT CAG ATG ATT ATT GTG TTA ATG TAT GGT CTG TCA ATG TGT AGG CTT TAG AAT AAA TAT TTG CAA GTA CAA TTA GTT GAT TAA AAA AAT TTT GTT ATT TTA TTA TTG CTA ATA AAA ATA GCC AAT CCA AAT GAA GAC CCA TAT CCA AAA CTT CTT GAA GGT GGA GAA GAT GGA TAA ACA CAT TAA GAC TTA AAG AAT TTC TTC TAT TAT TCT TAG ATT AGA AGT AAG GAT GAG CAT ACA ACA AAA GCA AGA AAG CTA GAT GGT AAA GTG CCA TTA ATT GCC ATT CCA GAT ATG ATG AGG TCT ATG GGT TAC TAT CCT ACT AAT AAG GAA ATA GAA AAT ATG TAA AAC GAA ATT AGA TTC TCT AAA TAT CTT GAT CCT GGC GAG TAG GTA GAA GAA TTA GAC TTA AAC ATG TTC TTG AAG TGA GCA CTT TTA AAT ATT TAT TTA ATT AAA ATT TAA TAA TTT TAT TTA TTT ATT TAC TTA CTT AAT ATT TTA TTA AAA AAG ATT ATT CGT CAA TCA CAG ACC TGT ATA AGG TAT TGG TAA ATC AAA AAT TGC TGA GTC ACT TAA TAC TTT AAC TAA AAG TTT GAG TGA TTC TGC TAA GGA AAT TGC TGA ATA GGC TAA AGG TTA ATC TGT ATA ACC TAA AAC ATA TAA TAT TGA TGG CAT TGG AGA GAT TTC TTT ATA AGA CTT AAA AAA AAT ATT AAC CAC TGA AGG AGA GCG TAT GAC TAA TGA AGA ATT TGA TGG TAA TTT ATA ATA TTT TAA ATG AAA TAT TAA ATA AAA TTA AAA ATA GAA TGT CTC AAA ATA TTA TGT GGT GAA AAT GAA GAC TAA ATT CCT CAA TAA ATT AAT GTA AAC AAT TTA TGT GAA GAT ATT TTA GGT AAG GAG CAA TTC ATT TTC ATT TAA ATT TTT TTT TAA CTA AAA TTT ATT GAT AAA TAG GTT TTG AAG ATT TAG AAG GTG AAG AAA GAG ATG ATA ACA TTG AAG ATT AGT ATG AAG ATG AAG AAA ATG AAG AAT ATG ATT AAG ATT GA