Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00312230

Standard Name

ELP2 (ELongation Protein 2)

Aliases

PreTt03411 | 30.m00220 | 3810.m01836

Description

ELP2 elongator complex protein; RNA polymerase II elongator complex subunit

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

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Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.5%

TetraMine Data

TTHERM_00312230

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_03238.1	9.997093137033517e-262	hypothetical protein (847 aa)
Oxytricha	Contig19993.0.g37	8.001903776189462e-102	WD domain, G-beta repeat
DictyBase	DDB_G0275651	2.998893725394183e-91	elp2 on chromosome: 2 position 5847867 to 5850695
SGD	YGR200C	3.0005221502158484e-68	ELP2 Subunit of Elongator comp lex, which is required for mod ification of wobble nucleoside s in tRNA; target of Kluyverom yces lactis zymocin
WormBase	WBGene00013738	5.9995872346509964e-61	locus:elpc-2 status:Partiall y_confirmed UniProt:Q9NEW7 protein_id:CAC35846.4
Stentor Coeruleus	SteCoe_11397	2.4426007377405277e-36

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00312230(coding)
ATGAGTCAATTAGAATTAAGCTGCGTTTAAGGAGGTGTTAACCCCCTTTATAAATGTTTT
GCCTTAGGCAAAGCTGTTAAGGAAGCTTGCTTTTATGCTTGCTCCAATAGCATTATTGTG
AACAATATCAATAAGGTTACTAATTATTTTACTTTAAGTGGACATTCAGATCGCGTTAAC
TTTGTAAAAACTATAAATAATTTTTCTGAGCGTTAGCTTATTGTTTCAGGAAGCAGTGAT
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CCTAATCTTGCATATGTCGTAGCTGGTAATATTATGGGTGATGTCTATATTATAAAGATA
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TAAGAATGCACTGCACTTATCCGCCACAATCCTAATAAAGATGAATTTTTGATAGCTTTA
GGAGGTTTAGACTTCACTGTTCATATCTATCACACTGATTTAAAGAAATATACAGCTCCA
GTAGATGGTAAAAATACTATGGAAAGAGGTACTTTGTTTGAATACAAAGTTAGTCTTAAA
GGACATGAAAATGCAATTACTGATTTGTAGGTCTTAAAACAAAAAAAAGACACTCATGAA
GAATGGATTATTGCCAGCTCTTCTAAAGATACTTATGTTCGTTTATGGAGATTTAGTGAG
CTCTTAGAAGATGAGACTATTAAGTAAATTTCTGAATTCTAAAATAAGCAAACTTAAAGA
TTCGTTTTAGGCGATAAGAAGTATTTTATCACTTTAGAAAGTGTTTTGAGCGGACACGGT
GAAGCAGTAGTCTGTCTTGACTGGGGTTTGTACAAAGGAGAAACTGCACTTATCTCTGCA
TCATTTGATTTTAACATTATATTATGGACCAAGGATAAAGACACAGATATTTGGTTAACC
TCATACAGATTAGGTTAGGTAACAGGAAGCAAGTATGCCTTTTTCCAAGCTACCTTTAAT
GCTGATTACACATAGATTTTTTCTTACACATACACAGGTTCATTTTACTTATGGGAATAC
AATTAAGAAAAGGGAATTTGGGATTCTAAACCAACTGTTAGTGGCCACTTCAATTAGGTA
TTTGATTTGGATTGGAGCACTAAAGGAGATTTCTTAGTATCTTGTGGTTTAGATTAAACA
ACAAGAATTATCACTTAATCTTCTTAAACTCAATCCTGGCATGAAATTTCTCGTGCATAA
ATTCACGGTTACGATATCAATAGCATTAAATGCTATCCTGTTTAACTTGAAAATAAAAAT
ATTTGTGACACTCTTATTTGCGGAGCTGACGAAAAAGTTGTTAGATTATTTGAACCTCCT
GCAGCTTTTGTGAATGCAGTTAATCAAATGTCCAACACAGATTTACATTTATACTTCTAA
GACGATAATCAAGAAAAGAAATATTTGGATTAAAAGCAGTTAGAAAAGGGTATCTTTGAA
TACCAAGTTTCCTAAGAAGGTGGTGCTCAAGTTCTCGGTCTTATGATTAAAGCTATTAAA
CTTGAACCAGATTTTGACCCTTCTAAATACGTAGATCCTGAAGATGAAGGTGGTTTGATT
TCAGATAAAATTTAATCTATTGAAGATAAAAAGAAAGAAGAAGAACTTTTTTCTTAGAAG
CACGATTTTACTCAACCTCCTATTGAAGATTACTTGATAAAGCATACCTTATGGCCTGAA
TTGAATAAGTTATATGGACATGGTTATGAATTAAAGTGTGTCAGCTGCAGCAATGATGGC
AAATTAATTGCAAGTTGCTCAAAATCTTAAACAAAAGAAAATGCATGTGTGATTTTCTGG
AATCCTACTAACTATTAAATTTATTCCAAGTTAGAATATCACAATTTCACTATTAACCAG
ATGGAATTCTCACCCAGTGATGAATACTTTGCAACTGTTTCCAAAGATAGATCTTTAGCA
TTATTTAAAAAGAATTATCTTGACGAAGCTAAAAAGGAATTAAACTTCAAAGAACCTTAC
GCTCTATACTATAATGATAAATCCCATACAAGAATTATTTATAGCGCAGCTTTCTCACAT
GATGAGAAATTTATTGCCACAGGTGCAAGAGATAAGAGAATCAAAATTCACTCAATATTA
GATAAAAAGGTTATATTTAATAAAGTATTAAGTAGCACTATTACTGCATTAGCATTTGCT
CCTATATCATATAAAAATGAAAACTCATACCTTATTATTGTTGGCTACGAAGAAGGAGGA
ATGGAATTATATGAATTCGAAAGTAACACTAATCAACTCAATCTGATTGATAAGCCACAC
GAGTTTATCGGACATACAAATACAATCAGTAGGATTAAATTCAGAAAGAATTATAAGCCT
AACATTAACAGCAAAATTCTTCAATTTGCTACTTGTTCACTTGATCACACAGTCCGTGTT
TTCAATTTCAAGATTAATTGA

>TTHERM_00312230(protein)
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FVKTINNFSERQLIVSGSSDSNLIIWEGKLSNLFIKENWSIKHKFNLNHSVSFATVLEYS
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GGLDFTVHIYHTDLKKYTAPVDGKNTMERGTLFEYKVSLKGHENAITDLQVLKQKKDTHE
EWIIASSSKDTYVRLWRFSELLEDETIKQISEFQNKQTQRFVLGDKKYFITLESVLSGHG
EAVVCLDWGLYKGETALISASFDFNIILWTKDKDTDIWLTSYRLGQVTGSKYAFFQATFN
ADYTQIFSYTYTGSFYLWEYNQEKGIWDSKPTVSGHFNQVFDLDWSTKGDFLVSCGLDQT
TRIITQSSQTQSWHEISRAQIHGYDINSIKCYPVQLENKNICDTLICGADEKVVRLFEPP
AAFVNAVNQMSNTDLHLYFQDDNQEKKYLDQKQLEKGIFEYQVSQEGGAQVLGLMIKAIK
LEPDFDPSKYVDPEDEGGLISDKIQSIEDKKKEEELFSQKHDFTQPPIEDYLIKHTLWPE
LNKLYGHGYELKCVSCSNDGKLIASCSKSQTKENACVIFWNPTNYQIYSKLEYHNFTINQ
MEFSPSDEYFATVSKDRSLALFKKNYLDEAKKELNFKEPYALYYNDKSHTRIIYSAAFSH
DEKFIATGARDKRIKIHSILDKKVIFNKVLSSTITALAFAPISYKNENSYLIIVGYEEGG
MELYEFESNTNQLNLIDKPHEFIGHTNTISRIKFRKNYKPNINSKILQFATCSLDHTVRV
FNFKIN

>TTHERM_00312230(gene)
ATGAGTCAATTAGAATTAAGCTGCGTTTAAGGAGGTGTTAACCCCCTTTATAAATGTTTT
GCCTTAGGCAAAGCTGTTAAGGAAGCTTGCTTTTATGCTTGCTCCAATAGCATTATTGTG
AACAATATCAATAAGGTTACTAATTATTTTACTTTAAGTGGACATTCAGATCGCGTTAAC
TTTGTAAAAACTATAAATAATTTTTCTGAGCGTTAGCTTATTGTTTCAGGAAGCAGTGAT
TCCAATTTAATAATTTGGGAAGGTAAACTTTCTAACCTATTTATCAAGGAAAATTGGTCT
ATTAAGCATAAATTTAATCTCAATCACTCTGTTTCATTTGCCACTGTTTTAGAATACTCT
CCTAATCTTGCATATGTCGTAGCTGGTAATATTATGGGTGATGTCTATATTATAAAGATA
AGCGATGAATCTAATCAAAGTTTAATTATGGATAGCATCACATTTGGACATCATTTTACA
TAAGAATGCACTGCACTTATCCGCCACAATCCTAATAAAGATGAATTTTTGATAGCTTTA
GGAGGTTTAGACTTCACTGTTCATATCTATCACACTGATTTAAAGAAATATACAGCTCCA
GTAGATGGTAAAAATACTATGGAAAGAGGTACTTTGTTTGAATACAAAGTTAGTCTTAAA
GGACATGAAAATGCAATTACTGATTTGTAGGTCTTAAAACAAAAAAAAGACACTCATGAA
GAATGGATTATTGCCAGCTCTTCTAAAGATACTTATGTTCGTTTATGGAGATTTAGTGAG
CTCTTAGAAGATGAGACTATTAAGTAAATTTCTGAATTCTAAAATAAGCAAACTTAAAGA
TTCGTTTTAGGCGATAAGAAGTATTTTATCACTTTAGAAAGTGTTTTGAGCGGACACGGT
GAAGCAGTAGTCTGTCTTGACTGGGGTTTGTACAAAGGAGAAACTGCACTTATCTCTGCA
TCATTTGATTTTAACATTATATTATGGACCAAGGATAAAGACACAGGTAATAAAATAATT
CATCAATAAATAACCTTTTTATCATAAAAACAATGAATACATTTTATCCACACTATAATT
TTTATTTTAATTAAATTATTGAAAAATAAAATAGAATAATTATATATTTTTTCTATTTAT
AGATATTTGGTTAACCTCATACAGATTAGGTTAGGTAACAGGAAGCAAGTATGCCTTTTT
CCAAGCTACCTTTAATGCTGATTACACATAGATTTTTTCTTACACATACACAGGTTCATT
TTACTTATGGGAATACAATTAAGAAAAGGGAATTTGGGATTCTAAACCAACTGTTAGTGG
CCACTTCAATTAGGTATTTGATTTGGATTGGAGCACTAAAGGAGATTTCTTAGTATCTTG
TGGTTTAGATTAAACAACAAGAATTATCACTTAATCTTCTTAAACTCAATCCTGGCATGA
AATTTCTCGTGCATAAGTAAGTTTATTAAAATTGTAAAATAAATTAATCTAATAAATAAC
CCTTATTTAAAAGATTCACGGTTACGATATCAATAGCATTAAATGCTATCCTGTTTAACT
TGAAAATAAAAATATTTGTGACACTCTTATTTGCGGAGCTGACGAAAAAGTTGTTAGATT
ATTTGAACCTCCTGCAGCTTTTGTGAATGCAGTTAATCAAATGTCCAACACAGATTTACA
TTTATACTTCTAAGACGATAATCAAGAAAAGAAATATTTGGATTAAAAGCAGTTAGAAAA
GGGTATCTTTGAATACCAAGTTTCCTAAGAAGGTAAATTATTAATTCATTTTCATTTATT
TTTATATTTGAATAAAATTTTTTTAATCATTGATATGATTTTATCATTCACAAATTATTT
AAATTAATTTTACTTTTTAAATCTTATTTTAGGTGGTGCTCAAGTTCTCGGTCTTATGAT
TAAAGCTATTAAACTTGAACCAGATTTTGACCCTTCTAAATACGTAGATCCTGAAGATGA
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TTTTTCTTAGAAGGTAAAAAATAATTTTTTTAATAAAAAAAATATTAATAATTGAAATAA
TAATTATAATTAATAAATTATAGCACGATTTTACTCAACCTCCTATTGAAGATTACTTGA
TAAAGCATACCTTATGGCCTGAATTGAATAAGTTATATGGACATGGTTATGAATTAAAGT
GTGTCAGCTGCAGCAATGATGGCAAATTAATTGCAAGTTGCTCAAAATCTTAAACAAAAG
AAAATGCATGTGTGATTTTCTGGAATCCTACTAACTATTAAATTTATTCCAAGTTAGAAT
ATCACAATTTCACTATTAACCAGATGGAATTCTCACCCAGTGATGAATACTTTGCAACTG
TTTCCAAAGATAGATCTTTAGCATTATTTAAAAAGAATTATCTTGACGAAGCTAAAAAGG
AATTAAACTTCAAAGAACCTTACGCTCTATACTATAATGATAAATCCCATACAAGAATTA
TTTATAGCGCAGCTTTCTCACATGATGAGAAATTTATTGCCACAGGTGCAAGAGATAAGA
GAATCAAAATTCACTCAATATTAGATAAAAAGGTTATATTTAATAAAGTATTAAGTAGCA
CTATTACTGCATTAGCATTTGCTCCTATATCATATAAAAATGAAAACTCATACCTTATTA
TTGTTGGCTACGAAGAAGGAGGAATGGAATTATATGAATTCGAAAGTAACACTAATCAAC
TCAATCTGATTGATAAGCCACACGAGTTTATCGGACATACAAATACAATCAGTAGGATTA
AATTCAGAAAGAATTATAAGCCTAACATTAACAGCAAAATTCTTCAATTTGCTACTTGTT
CACTTGATCACACAGTCCGTGTTTTCAATTTCAAGATTAATTGA