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Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00312230Standard Name
ELP2 (ELongation Protein 2)Aliases
PreTt03411 | 30.m00220 | 3810.m01836Description
RNA polymerase II elongator complex subunitGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
No Data fetched for Domains
Gene Expression Profile
- Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.5%
TetraMine Data
TTHERM_00312230
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_03238.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (847 aa)
Oxytricha Contig19993.0.g37 8.001903776189462e-102 WD domain, G-beta repeat
DictyBase DDB_G0275651 2.998893725394183e-91 elp2 on chromosome: 2 position
5847867 to 5850695
SGD YGR200C 3.0005221502158484e-68 ELP2 Subunit of Elongator comp
lex, which is required for mod
ification of wobble nucleoside
s in tRNA; target of Kluyverom
yces lactis zymocin
WormBase WBGene00013738 5.9995872346509964e-61 locus:elpc-2 status:Partiall
y_confirmed UniProt:Q9NEW7
protein_id:CAC35846.4
Stentor Coeruleus SteCoe_11397 2.4426007377405277e-36
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00312230(coding)
ATGAGTCAATTAGAATTAAGCTGCGTTTAAGGAGGTGTTAACCCCCTTTATAAATGTTTT
GCCTTAGGCAAAGCTGTTAAGGAAGCTTGCTTTTATGCTTGCTCCAATAGCATTATTGTG
AACAATATCAATAAGGTTACTAATTATTTTACTTTAAGTGGACATTCAGATCGCGTTAAC
TTTGTAAAAACTATAAATAATTTTTCTGAGCGTTAGCTTATTGTTTCAGGAAGCAGTGAT
TCCAATTTAATAATTTGGGAAGGTAAACTTTCTAACCTATTTATCAAGGAAAATTGGTCT
ATTAAGCATAAATTTAATCTCAATCACTCTGTTTCATTTGCCACTGTTTTAGAATACTCT
CCTAATCTTGCATATGTCGTAGCTGGTAATATTATGGGTGATGTCTATATTATAAAGATA
AGCGATGAATCTAATCAAAGTTTAATTATGGATAGCATCACATTTGGACATCATTTTACA
TAAGAATGCACTGCACTTATCCGCCACAATCCTAATAAAGATGAATTTTTGATAGCTTTA
GGAGGTTTAGACTTCACTGTTCATATCTATCACACTGATTTAAAGAAATATACAGCTCCA
GTAGATGGTAAAAATACTATGGAAAGAGGTACTTTGTTTGAATACAAAGTTAGTCTTAAA
GGACATGAAAATGCAATTACTGATTTGTAGGTCTTAAAACAAAAAAAAGACACTCATGAA
GAATGGATTATTGCCAGCTCTTCTAAAGATACTTATGTTCGTTTATGGAGATTTAGTGAG
CTCTTAGAAGATGAGACTATTAAGTAAATTTCTGAATTCTAAAATAAGCAAACTTAAAGA
TTCGTTTTAGGCGATAAGAAGTATTTTATCACTTTAGAAAGTGTTTTGAGCGGACACGGT
GAAGCAGTAGTCTGTCTTGACTGGGGTTTGTACAAAGGAGAAACTGCACTTATCTCTGCA
TCATTTGATTTTAACATTATATTATGGACCAAGGATAAAGACACAGATATTTGGTTAACC
TCATACAGATTAGGTTAGGTAACAGGAAGCAAGTATGCCTTTTTCCAAGCTACCTTTAAT
GCTGATTACACATAGATTTTTTCTTACACATACACAGGTTCATTTTACTTATGGGAATAC
AATTAAGAAAAGGGAATTTGGGATTCTAAACCAACTGTTAGTGGCCACTTCAATTAGGTA
TTTGATTTGGATTGGAGCACTAAAGGAGATTTCTTAGTATCTTGTGGTTTAGATTAAACA
ACAAGAATTATCACTTAATCTTCTTAAACTCAATCCTGGCATGAAATTTCTCGTGCATAA
ATTCACGGTTACGATATCAATAGCATTAAATGCTATCCTGTTTAACTTGAAAATAAAAAT
ATTTGTGACACTCTTATTTGCGGAGCTGACGAAAAAGTTGTTAGATTATTTGAACCTCCT
GCAGCTTTTGTGAATGCAGTTAATCAAATGTCCAACACAGATTTACATTTATACTTCTAA
GACGATAATCAAGAAAAGAAATATTTGGATTAAAAGCAGTTAGAAAAGGGTATCTTTGAA
TACCAAGTTTCCTAAGAAGGTGGTGCTCAAGTTCTCGGTCTTATGATTAAAGCTATTAAA
CTTGAACCAGATTTTGACCCTTCTAAATACGTAGATCCTGAAGATGAAGGTGGTTTGATT
TCAGATAAAATTTAATCTATTGAAGATAAAAAGAAAGAAGAAGAACTTTTTTCTTAGAAG
CACGATTTTACTCAACCTCCTATTGAAGATTACTTGATAAAGCATACCTTATGGCCTGAA
TTGAATAAGTTATATGGACATGGTTATGAATTAAAGTGTGTCAGCTGCAGCAATGATGGC
AAATTAATTGCAAGTTGCTCAAAATCTTAAACAAAAGAAAATGCATGTGTGATTTTCTGG
AATCCTACTAACTATTAAATTTATTCCAAGTTAGAATATCACAATTTCACTATTAACCAG
ATGGAATTCTCACCCAGTGATGAATACTTTGCAACTGTTTCCAAAGATAGATCTTTAGCA
TTATTTAAAAAGAATTATCTTGACGAAGCTAAAAAGGAATTAAACTTCAAAGAACCTTAC
GCTCTATACTATAATGATAAATCCCATACAAGAATTATTTATAGCGCAGCTTTCTCACAT
GATGAGAAATTTATTGCCACAGGTGCAAGAGATAAGAGAATCAAAATTCACTCAATATTA
GATAAAAAGGTTATATTTAATAAAGTATTAAGTAGCACTATTACTGCATTAGCATTTGCT
CCTATATCATATAAAAATGAAAACTCATACCTTATTATTGTTGGCTACGAAGAAGGAGGA
ATGGAATTATATGAATTCGAAAGTAACACTAATCAACTCAATCTGATTGATAAGCCACAC
GAGTTTATCGGACATACAAATACAATCAGTAGGATTAAATTCAGAAAGAATTATAAGCCT
AACATTAACAGCAAAATTCTTCAATTTGCTACTTGTTCACTTGATCACACAGTCCGTGTT
TTCAATTTCAAGATTAATTGA>TTHERM_00312230(protein)
MSQLELSCVQGGVNPLYKCFALGKAVKEACFYACSNSIIVNNINKVTNYFTLSGHSDRVN
FVKTINNFSERQLIVSGSSDSNLIIWEGKLSNLFIKENWSIKHKFNLNHSVSFATVLEYS
PNLAYVVAGNIMGDVYIIKISDESNQSLIMDSITFGHHFTQECTALIRHNPNKDEFLIAL
GGLDFTVHIYHTDLKKYTAPVDGKNTMERGTLFEYKVSLKGHENAITDLQVLKQKKDTHE
EWIIASSSKDTYVRLWRFSELLEDETIKQISEFQNKQTQRFVLGDKKYFITLESVLSGHG
EAVVCLDWGLYKGETALISASFDFNIILWTKDKDTDIWLTSYRLGQVTGSKYAFFQATFN
ADYTQIFSYTYTGSFYLWEYNQEKGIWDSKPTVSGHFNQVFDLDWSTKGDFLVSCGLDQT
TRIITQSSQTQSWHEISRAQIHGYDINSIKCYPVQLENKNICDTLICGADEKVVRLFEPP
AAFVNAVNQMSNTDLHLYFQDDNQEKKYLDQKQLEKGIFEYQVSQEGGAQVLGLMIKAIK
LEPDFDPSKYVDPEDEGGLISDKIQSIEDKKKEEELFSQKHDFTQPPIEDYLIKHTLWPE
LNKLYGHGYELKCVSCSNDGKLIASCSKSQTKENACVIFWNPTNYQIYSKLEYHNFTINQ
MEFSPSDEYFATVSKDRSLALFKKNYLDEAKKELNFKEPYALYYNDKSHTRIIYSAAFSH
DEKFIATGARDKRIKIHSILDKKVIFNKVLSSTITALAFAPISYKNENSYLIIVGYEEGG
MELYEFESNTNQLNLIDKPHEFIGHTNTISRIKFRKNYKPNINSKILQFATCSLDHTVRV
FNFKIN>TTHERM_00312230(gene)
ATGAGTCAATTAGAATTAAGCTGCGTTTAAGGAGGTGTTAACCCCCTTTATAAATGTTTT
GCCTTAGGCAAAGCTGTTAAGGAAGCTTGCTTTTATGCTTGCTCCAATAGCATTATTGTG
AACAATATCAATAAGGTTACTAATTATTTTACTTTAAGTGGACATTCAGATCGCGTTAAC
TTTGTAAAAACTATAAATAATTTTTCTGAGCGTTAGCTTATTGTTTCAGGAAGCAGTGAT
TCCAATTTAATAATTTGGGAAGGTAAACTTTCTAACCTATTTATCAAGGAAAATTGGTCT
ATTAAGCATAAATTTAATCTCAATCACTCTGTTTCATTTGCCACTGTTTTAGAATACTCT
CCTAATCTTGCATATGTCGTAGCTGGTAATATTATGGGTGATGTCTATATTATAAAGATA
AGCGATGAATCTAATCAAAGTTTAATTATGGATAGCATCACATTTGGACATCATTTTACA
TAAGAATGCACTGCACTTATCCGCCACAATCCTAATAAAGATGAATTTTTGATAGCTTTA
GGAGGTTTAGACTTCACTGTTCATATCTATCACACTGATTTAAAGAAATATACAGCTCCA
GTAGATGGTAAAAATACTATGGAAAGAGGTACTTTGTTTGAATACAAAGTTAGTCTTAAA
GGACATGAAAATGCAATTACTGATTTGTAGGTCTTAAAACAAAAAAAAGACACTCATGAA
GAATGGATTATTGCCAGCTCTTCTAAAGATACTTATGTTCGTTTATGGAGATTTAGTGAG
CTCTTAGAAGATGAGACTATTAAGTAAATTTCTGAATTCTAAAATAAGCAAACTTAAAGA
TTCGTTTTAGGCGATAAGAAGTATTTTATCACTTTAGAAAGTGTTTTGAGCGGACACGGT
GAAGCAGTAGTCTGTCTTGACTGGGGTTTGTACAAAGGAGAAACTGCACTTATCTCTGCA
TCATTTGATTTTAACATTATATTATGGACCAAGGATAAAGACACAGGTAATAAAATAATT
CATCAATAAATAACCTTTTTATCATAAAAACAATGAATACATTTTATCCACACTATAATT
TTTATTTTAATTAAATTATTGAAAAATAAAATAGAATAATTATATATTTTTTCTATTTAT
AGATATTTGGTTAACCTCATACAGATTAGGTTAGGTAACAGGAAGCAAGTATGCCTTTTT
CCAAGCTACCTTTAATGCTGATTACACATAGATTTTTTCTTACACATACACAGGTTCATT
TTACTTATGGGAATACAATTAAGAAAAGGGAATTTGGGATTCTAAACCAACTGTTAGTGG
CCACTTCAATTAGGTATTTGATTTGGATTGGAGCACTAAAGGAGATTTCTTAGTATCTTG
TGGTTTAGATTAAACAACAAGAATTATCACTTAATCTTCTTAAACTCAATCCTGGCATGA
AATTTCTCGTGCATAAGTAAGTTTATTAAAATTGTAAAATAAATTAATCTAATAAATAAC
CCTTATTTAAAAGATTCACGGTTACGATATCAATAGCATTAAATGCTATCCTGTTTAACT
TGAAAATAAAAATATTTGTGACACTCTTATTTGCGGAGCTGACGAAAAAGTTGTTAGATT
ATTTGAACCTCCTGCAGCTTTTGTGAATGCAGTTAATCAAATGTCCAACACAGATTTACA
TTTATACTTCTAAGACGATAATCAAGAAAAGAAATATTTGGATTAAAAGCAGTTAGAAAA
GGGTATCTTTGAATACCAAGTTTCCTAAGAAGGTAAATTATTAATTCATTTTCATTTATT
TTTATATTTGAATAAAATTTTTTTAATCATTGATATGATTTTATCATTCACAAATTATTT
AAATTAATTTTACTTTTTAAATCTTATTTTAGGTGGTGCTCAAGTTCTCGGTCTTATGAT
TAAAGCTATTAAACTTGAACCAGATTTTGACCCTTCTAAATACGTAGATCCTGAAGATGA
AGGTGGTTTGATTTCAGATAAAATTTAATCTATTGAAGATAAAAAGAAAGAAGAAGAACT
TTTTTCTTAGAAGGTAAAAAATAATTTTTTTAATAAAAAAAATATTAATAATTGAAATAA
TAATTATAATTAATAAATTATAGCACGATTTTACTCAACCTCCTATTGAAGATTACTTGA
TAAAGCATACCTTATGGCCTGAATTGAATAAGTTATATGGACATGGTTATGAATTAAAGT
GTGTCAGCTGCAGCAATGATGGCAAATTAATTGCAAGTTGCTCAAAATCTTAAACAAAAG
AAAATGCATGTGTGATTTTCTGGAATCCTACTAACTATTAAATTTATTCCAAGTTAGAAT
ATCACAATTTCACTATTAACCAGATGGAATTCTCACCCAGTGATGAATACTTTGCAACTG
TTTCCAAAGATAGATCTTTAGCATTATTTAAAAAGAATTATCTTGACGAAGCTAAAAAGG
AATTAAACTTCAAAGAACCTTACGCTCTATACTATAATGATAAATCCCATACAAGAATTA
TTTATAGCGCAGCTTTCTCACATGATGAGAAATTTATTGCCACAGGTGCAAGAGATAAGA
GAATCAAAATTCACTCAATATTAGATAAAAAGGTTATATTTAATAAAGTATTAAGTAGCA
CTATTACTGCATTAGCATTTGCTCCTATATCATATAAAAATGAAAACTCATACCTTATTA
TTGTTGGCTACGAAGAAGGAGGAATGGAATTATATGAATTCGAAAGTAACACTAATCAAC
TCAATCTGATTGATAAGCCACACGAGTTTATCGGACATACAAATACAATCAGTAGGATTA
AATTCAGAAAGAATTATAAGCCTAACATTAACAGCAAAATTCTTCAATTTGCTACTTGTT
CACTTGATCACACAGTCCGTGTTTTCAATTTCAAGATTAATTGA
