Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00024050

Standard Name

ELP1 (ELongation Protein 1)

Aliases

PreTt12018 | 1.m01066

Description

RNA polymerase II elongator complex subunit

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF04762 ) IKI3 family
• ( PF03138 ) Plant protein family
• ( PF00515 ) tetratricopeptide repeat
• ( PF07719 ) tetratricopeptide repeat

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_00024050

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_13868.1	9.997093137033517e-262	hypothetical protein (1315 aa)
Oxytricha	Contig9231.0.g15	2.0001055857497602e-161	IKI3 family
DictyBase	DDB_G0284075	3.000969471571755e-58	elp1 on chromosome: 4 position 1525708 to 1529993
SGD	YLR384C	9.995951036711152e-55	IKI3 Subunit of Elongator comp lex, which is required for mod ification of wobble nucleoside s in tRNA; maintains structura l integrity of Elongator; homo log of human IKAP, mutations i n which cause familial dysauto nomia (FD)
Stentor Coeruleus	SteCoe_1742	2.3802664086944007e-26
WormBase	WBGene00022463	4.999617891954556e-16	locus:elpc-1 status:Partiall y_confirmed UniProt:Q9N595 protein_id:CCD66208.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00024050(coding)
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GAGGCTTTTGATTTCGAAGAATTCTCATACACTCTCTACATTATCACCAAGTCAAAAATT
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TGTGAAAGTGTTGGATGCATCGAAAACGGAATTTTAGGTTTTTCATATTCTCCTAACTAG
GAATAACTTATTGTGGCTACTGGAAATCATACATTAATATCTTTTGATAATAACTTCGAC
GTTTCAAAAGAAGTTCATATTGATGAAGATGCTAATTCATTTAAGGCTCCTTCATCTCCT
TAGCCTGTTTACTTTGCATGGAAGGCAGATGCTAAGTTCTTTGCTTGCAATTTTGCAGTT
GAAGGTGGACGTAAAAGTTTAACCAGAAGCACTGAACTCGAAGTATTTAAGTCAGCTGCT
CAACCTGATCCAGATGGTCAAAATGTAGTATCAGTTTCTGAAGAACCAACTGAGAATTTG
TAAGGACCCATCAGCTGGTAGCCTACTGGTAACTTTATTGCTGGTGTTGATAGAAAGCCT
TCAAAGCAAGATAAATCAAAAACTTTAACTAGAGTTATTTTCTGGGAAAAGAATGGTTTG
AGACATTTGGAGTTTAATTTACCAAATTTAAAGGACTCCTTAAACACTGATTCTAACTTA
ATAGAAGTAATCAACTTATAATATAACAAGGAATCTGAAATATTAGCTGTCCATGTCAAA
GAAGAGGAATCTCAAGAAAGCATTTTGCTCTATCACAGAAGCAATTACAGATGGTACTTA
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ATGTCTAACTTCGAGTTAGCCCTCCCTAATCCAGTCTTAGGATTCTCAGCAGGAAACAAC
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TTGAAGTAAAAGACAATTAAAAACGAAGTCAGTAAATAGAGCAATAGACTCAGATAATTC
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AAATTTATAGTAGAAATAGTACTAGATAGCAACATGAATGTTATAAACACTTTCGAGAAG
AGCATTAAGAACTCTCTTACTGCTACTTGTGTATCAGGTTATTTGTATACCTAAACAACT
AAAGGAGGTCAAAAATCAGACGATAATGATGATGAAGAAGAGGAATATGGATTTTAAGAT
AAATCTAGTGGAAATTACTTGTTCATTTAAAACTCCAAAGGCACCGTCTTCAAGTATTTC
TTAAATGATGACTCTAAAATTGAAAAACACTCCACTTTTGAAATTCCTGCTTCTAAAATC
CAAGCCACTGTTTTGAATGGAATGGAATATCTCTTTGGTCTTTCTCATAACTACAGATTT
ATGCTTGGCTCTAAAATTATTTCTTCACAAGCTACTTCATTTGCTCTTTATGATTCATTT
GTTTTGTTTACTTAAAATACTCTCGGTATGTACTAATGCATGTATGTCTACGATTTGAGT
GATCCTAAGAATCCTTTAGCTGGTCTTTCTGATTCAGTTGTTCTTCCTTCTCCAGAAAGC
AAGAGCTTGAATGTTAGAAACATTGAAAGAGGTAGCATCATTGTTTCTGTTGCAAATGAC
AAACTTGTATTTTAATTACCTAGAGGAAATTTAGAAACTATAAATCATAGAATTATTTTC
TTAAGAAAAGTTAAAAAGTTAATCGATTAAGATTAATATAACACTGCCTTCGAGTTATGT
AGAACTAATAAGCTCGATATTAATGTTATCTTTGATATCAACCCCAAAAAGTTTATTGAA
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CATATTAGAAAGGAGCCCAGCGAACTTGAATTTGTTCTTAACACTATTAAATAAATGAAA
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AAAAGATTTGAACATAAAAGGCTTGTTACTGCTAGAAGCTTACTTGAATATGTTTGCTGG
TTAGCTGATGCTGAAAAAATATACGAAGTATCTTTAGGTACTTATGATTTAGATTTAGTT
GCTATGGCTGCTCAATTCACTCAAAAAGATCCTAAGGAATACGTTCCTTACTTAGAAAAA
TTGAAAGCTATGACTGATTTAGTTGAAAGAAAGTATGTTATTAACATGGATTTAAAGAAA
TACGATCGTGCTGTGGTTGTTCTTTCTTAGGGCAATGCTGATTAAAAGAAAAGAGCTATT
AGCTTAATCAAGCAACATAACCTTTTCAATGTTGGTCTCAAGACTTTTAAGTCTGAACCA
TAGATTATTCGTGAAGTTAAAGTTTATATGGGTGAATATTTGGCTTCTAAAAAAGAATTC
TAGCAAGCACTTCTTGCCTTTGAATCAGTTCATGCATTTGAAGAAGCCTTGTCTGTTTGC
AAGAAATCAGGTGAAGTCAAGAGAGCTCTCTATTATGCTAACAAACTCAAAAAAAATGAA
GAAGAAAAGCAAACTATTCTTAAAGAAATTCTTCACGAACTCCTCCTTAACGAAAACCAT
TCTTAGGCTGGTAAGGTTTACCACTAGTTAGGAGACAATAAGACTGCTTTAGAGCATTTT
GTTAAGGGTTCAGATTGGGCTGCTTGCACAAAAACTCTTCTTAAAATGGAAGAAGATCAT
GATGTCATCAAAGCAGAAATCATTGTACCAGGATTAGAACTTGCTTCAAATCTTAAGGCT
AACCTTTTAAGACAATACAGATAAACTTTCAGTAGTAAATATGCTAGACTTAAAGTTGTT
TAATAGGAAAAGAAAATGAGACCTCAATTATTGGGAGAATTAGGTGCAGGACAGTTTAGT
AATCAAGAAGCTGATATGATTTCAGACATATCTGAATCAACTCAAAAGACTACTACCACA
CATACTTCATATACATTCTCTATTACAACTGGTATGAGAAAGAAGAAGGACAAAAAACCT
AAGAATCTCCTCAAGAGAAATATCAAAGAAGGCTCTCCCATAGAAGAAGAGTACATAGTT
GATTTCTTAACTGAAATGCAAGGCTAAATGGGAATCTTCACCGATTGCAAGAATTTAATA
CAATATTTAATTTATTACGACTTGATTGATGCTGCCGAAGAGCTAAACAAAGAAATGAAG
CTATACGAAGAAGAAATTAACATAAAAGTAAAGTCTCTCAAACAATCTCTTTTCGAAGAA
CAAAATCCTCAATTAGCAGAATTGTATCCTAACATTAAACAATTCGATAACAAAGTTAGT
AAAGCCTTTGATGTCTTCTTAAATAACTTTGATCACGTTTTAGTTTGA

>TTHERM_00024050(protein)
MRNILLSDYYKFNIEELADIEAFDFEEFSYTLYIITKSKILYAIKIESLESHEIIFKADL
SNDICDVEKVLGIKYILELESVIIIQQSGEIMKFSISDKSCESVGCIENGILGFSYSPNQ
EQLIVATGNHTLISFDNNFDVSKEVHIDEDANSFKAPSSPQPVYFAWKADAKFFACNFAV
EGGRKSLTRSTELEVFKSAAQPDPDGQNVVSVSEEPTENLQGPISWQPTGNFIAGVDRKP
SKQDKSKTLTRVIFWEKNGLRHLEFNLPNLKDSLNTDSNLIEVINLQYNKESEILAVHVK
EEESQESILLYHRSNYRWYLKKVVQCLDGIKINGLIWCLQNSKRLVIVYEQNFIEVLDLS
LVHSQNIHDTAHENNLSLIPSVDNNKILTTVFKRTIMPPPMSNFELALPNPVLGFSAGNN
YICAACENSFEIFTVDNNLGLKQKTIKNEVSKQSNRLRQFLMVPYEDKYSIFFVHNKGES
KFIVEIVLDSNMNVINTFEKSIKNSLTATCVSGYLYTQTTKGGQKSDDNDDEEEEYGFQD
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ELKNYHTTHLSKKVNTFCDSIIKALEATKNEKYLYSQFTAHIRKEPSELEFVLNTIKQMK
DEEAEHIPENYPPHLNPANNKRFEHKRLVTARSLLEYVCWLADAEKIYEVSLGTYDLDLV
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LYEEEINIKVKSLKQSLFEEQNPQLAELYPNIKQFDNKVSKAFDVFLNNFDHVLV

>TTHERM_00024050(gene)
ATGAGAAACATTTTATTATCTGATTATTACAAGTAAAAAATATTTATTAAAATAATAAGA
TATTCTTTGTGTATAAAACAAGTATATTTCATTTCTTTTTCTCATTAAATCAGGTTTAAT
ATTGAAGAATTAGCCGATATTGAGGCTTTTGATTTCGAAGAATTCTCATACACTCTCTAC
ATTATCACCAAGTCAAAAATTTTGTATGCAATCAAGATTGAGAGCTTAGAGAGTCACGAA
GTAATTTAATTAAATGATTGGAATATGTGTTAAAACACACAAGCTATTTTTATTCCAAAT
ATAAACTTATTGGCTTGTTTTAGCTAAATTTACAATAATTCAAAATAGATCATTTTTAAA
GCTGATTTGAGCAATGATATCTGCGATGTAGAAAAGGTTTTGGGAATCAAGTATATTTTA
GAATTAGAAAGTGTCATTATCATTTAACAAAGTGGAGAAATTATGAAATTCAGCATTTCT
GATAAATCTTGTGAAAGTGTTGGATGCATCGAAAACGGAATTTTAGGTTTTTCATATTCT
CCTAACTAGGAATAACTTATTGTGGCTACTGGAAATCATACATTAATATCTTTTGATAAT
AACTTCGACGTTTCAAAAGAAGTTCATATTGATGAAGATGCTAATTCATTTAAGGCTCCT
TCATCTCCTTAGCCTGTTTACTTTGCATGGAAGGCAGATGCTAAGGTAAAAAATGAACAT
TCTATTATTAAACAAATAAAAAGCTAAGATATATATTATTTAATTATGTTTAATGTGCAA
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GAACTCGAAGTATTTAAGTCAGCTGCTCAACCTGATCCAGATGGTCAAAATGTAGTATCA
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GTTTATGAATAAAACTTTATTGAAGTTCTCGACTTATCTCTTGTCCATTCTTAAAACATT
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TAATATAAACAAAAATATAACTAATTATTAAAATAAAATACTAAAGAGTAATTCTCATTC
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TAATTAAAAATCACATGAACTAAATTGAAATGATATTTCTGATTAACCTCCGTAGTAAGT
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GACTCTAAAATTGAAAAACACTCCACTTTTGAAATTCCTGCTTCTAAAATCCAAGCCACT
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TCTTTCTTAGGGCAATGCTGATTAAAAGAAAAGAGCTATTAGCTTAATCAAGCAACATAA
CCTTTTCAATGTTGGTCTCAAGACTTTTAAGTCTGAACCATAGATTATTCGTGAAGTTAA
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TAAAGAAATTCTTCACGAACTCCTCCTTAACGAAAACCATTCTTAGGCTGGTAAGGTTTA
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