Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00725930

Standard Name

DRH42 (DExD/H box RNA helicase 42)

Aliases

PreTt21859 | 117.m00111

Description

DExD/H box RNA helicase

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• helicase activity (IEA) | GO:0004386
• nucleic acid binding (IEA) | GO:0003676
• ATP binding (IEA) | GO:0005524

Domains

• ( PF03107 ) DC1 domain
• ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
• ( TIGR01587 ) CRISPR-associated helicase Cas3
• ( PF00271 ) Helicase conserved C-terminal domain
• ( PF03202 ) Putative mycoplasma lipoprotein, C-terminal region
• ( PF04297 ) Putative helix-turn-helix protein, YlxM /

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 14.1%

TetraMine Data

TTHERM_00725930

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_04583.1	9.997093137033517e-262	helicase domain-containing pro tein (738 aa)
Oxytricha	Contig13621.0.g36	2.9999146385131704e-95	Mitochondrial degradasome RNA helicase subunit C terminal
DictyBase	DDB_G0278937	3.0011595823640496e-94	DDB_G0278937 on chromosome: 3 position 1214678 to 1217558
WormBase	WBGene00007444	2.0001503375893664e-79	ATP-dependent RNA helicase SUV 3 homolog, mitochondrial sta tus:Partially_confirmed UniP rot:Q17828 protein_id:CAJ434 33.1
SGD	YPL029W	2.999564368270328e-76	SUV3 ATP-dependent RNA helicas e, component of the mitochondr ial degradosome along with the RNase Dss1p; the degradosome associates with the ribosome a nd mediates RNA turnover; also required during splicing of t he COX1 AI5_beta intron
Stentor Coeruleus	SteCoe_20130	1.368539471173853e-44

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00725930(coding)
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>TTHERM_00725930(protein)
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>TTHERM_00725930(gene)
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