Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00628550

Standard Name

DRH32 (DExD/H box RNA helicase 32)

Aliases

PreTt24681 | 88.m00149 | 3822.m00669

Description

DEAD/DEAH box helicase family protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

TetraMine Data

TTHERM_00628550

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_17274.19.997093137033517e-262DEAD/DEAH box helicase (1397 a
a)
SGDYLR398C7.002698837743091e-168SKI2 Ski complex component and
putative RNA helicase, mediat
es 3-5 RNA degradation by the
cytoplasmic exosome; null muta
nts have superkiller phenotype
of increased viral dsRNAs and
are synthetic lethal with mut
ations in 5-3 mRNA decay
WormBaseWBGene000085021.9995317320402142e-140locus:skih-2 status:Partiall
y_confirmed UniProt:Q19103
protein_id:CAA92767.2
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position 7627913 to 7632171
OxytrichaContig21835.0.g979.998173848842182e-134DSHCT (NUC185) domain
Stentor CoeruleusSteCoe_79172.8946403116483003e-63

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00628550(coding)
ATGATTGAATGCGATTAGTAGCTAATTGAAAAATTTGAATAGATCATTACATTGAATACT
GCAAATAAGCTTAAATAAGTTCATTCTAGCAACATTTTAGGTATTTAGTAAGGAATTTTA
TAATTTGATGTAGAAGATAAAGGTTTAGGATAAGAATTTAGAGTAAATTTAGAGTAGAAA
TCTAATAAGAAGGTTATTTTTAACAATTATCATTATCCTATTCATAATGATACAATTTTT
AGCAACCTCAAAACACTTAGGTAAAAAGAATTAAAATTTACTATTGAAGAAGAAATTAAC
TAACTAGATTATGAAGCGCTTATTGATGGATTTGATAATAAAAATTTAAATAAAGAGTTA
GAAAATTAGTTTACTTTTAAGAGTGTTGATGAATTCAATATTAGCTCCAAGAATCCTTTT
TCTGTTGGATTTTAGTTCAATGAATTAACAAACGAACTGATTGATTTTAATTATGAAATG
ATAAATGTTAACTTTAAAAACTTTTCATCAGAGGGATTTACAGGAAAGATATTTTAGATC
AGCGATAAATCATCTAAAGTTGAAGACGAAGATATTAATTACAAGACTAAAAAATATTTG
CCATACAGCAATAAAGTTTAAATAGAGTAGGATTTCCTAGATCTTGCAAATAATATTGAT
GAATTTTGCAAATAAAATGATAAACATATTATTTTATCAGACAAATAGAATTTAAAGGAG
TTAGAGGCAATCAAAATAAGTGGCGAATAGAAAGTTAAAATGTTTAATAAAGTATATAAA
TAATTAAATATTTTGAAGGTACAAGAAGCAGGTTTATTTGATTTTGAGAAGGCATAGAAA
GAAATCAAAAGTTAATATGAAAGTGAAGTTGAAAAAAAAAAAAAAATCAGTCTTGTCTAT
AAAAGTAAGGAAATTAATGAAATTATTAACTAAGCTAGTCATAAACTAAAAGTTGATCAA
TTTACTAATGAATCTTAAGACAATAAAAAAGCATAAAATTCTCTCTTATAAAGCATAGAC
TAATATCAATGGGCAGAAGAAGATAATTAAGATGTATCTTAATTCCACGATAAATTGCCT
AAAGAAAGAATGGCTATTCAGTACCCTTTCGAGTTGGATAGTTTTTAAAAAAGGTCTATT
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GTTGTTGCAGAATATTCTATTGCCCTTGCAAAAAAACACAAAAGAAAAGCCATATACACT
TCACCTATTAAAGCTTTGTCAAATCAAAAGTATAGAGACTTCAAAAAAAAATTTGGAGAT
GATGTTGGTATTATAACTGGTGACGTCTCTTTAAATCCTACTGCAAGCTATCTAATTGTT
ACTACTGAAGTTCTTCGTAACATGCTTTATAAGGGGCATGACATAGTTAGAGATGTTGCA
TGGGTTATTTTTGATGAAGTGCATTACGTAAATAATTAAGATAGAGGTGGTGTCTGGGAA
GAAACAATCATTTTACTACCGGAATACATCGGATTAGTTATGTTAAGTGCAACAGTACAT
AACTATATGGATTTTGCTAATTGGGTTGGAAAAACAAAGCAAAGAAAAATTTATGTTGAA
AAAACTTTGCACAGACCAGTTCCTTTGGAGCATTCTATTTATTATGATGGAAAGATATTT
ATTATTAAATCAGATAATGAAGGTTTTAACCAAGAAAACTATGAAAAGATAAATAAGTAT
ATTAAAGAACAAGAAAGCAATAAGAAAAAGATTGTTAATGCCAAAGATAAATTAAAACAA
GAGAAAAAAGATAAAGAAATTTATAAAAATACAAATCTTTCATAAAATGCCAAAGCAAAA
TAAAAGTTCATCTAAGAAATATTTATTAAATAAAGTAAAAAGACAAATTTAAGTGGTGGA
AACGGACCACTTACAGAGGCTCAATAAGTCAAAAATGTATTAAAATATTGCCAAAAGAAC
GAGCTTTTACCTTGTGTGGTATTTGCTTTCAGTAAAAATATTATTAAGTAGCTCTCAGAA
AGTTTAGGAAATCTCAACTTGATTAGCCATGAAGAATCAAAATAAATTGAAGAATTCTTT
AACAAAGCTTCATAAAAACTGAAATCTAAAGATTTAGAAGTTCATTAAATTAGAACTTTG
AAAGATTTGATGATGAGAGGTATTGCTGTCCATCATAGCGGTGTCATTCCTTTTATAAAA
GAAATAGTAGAAATTCTGTTTTCTAAAGGTCTTATCAAAGTTTTGTTTGCTACTGAAACT
TTTGCTATAGGTATCAATATGCCCACTAAGACAGTCATTTTCTATAGTTTGAAAAAATTT
GATAGTTCTCAATATAGAATTTTAAACTCTTCTGAGTACACTTAAATGAGTGGCAGAGCT
GGTCGTAGAGGTTTAGATTTGAAAGGAAATGTTATTATTTTAGTGACTGAGCCAAAAAGA
CTTCCAAGTAAAATGGAACTAACCTAAATACTTGATCACAAGGGAGAAATGCTATCTTCT
AAGTTTAAAATAACTTATGAGCTAATTATGAAGCTACTTTCTTCAAGAGAACTTGATGTA
ACAGAGATGATGAAAAAAAGTTATAGTGAAAATGATAAATATTCTTAATTGCCTTTAAAT
TTGAAGAGAATTCAAGAGATTTAGAAAGGATTAAAGGATATTTAGCAAATAGTATGCCCA
ATAAAACCTTTAACAATGCCTACTCTTCCAATAGAAGATTTTTACTAAATCACTTAGTAA
ATGCAATAGGCAAACAAAGCATATTGGTCTACCGAAACAAAATATCTCTAAGAGGAGTTT
GCAATTCCAAGCTATTGCCAATTTATTGATGAAGACTATAATGATTATTTAGGTTTAATA
GTCGAATTTATTAAGAAGGAAAAATATGAAAATTATTTTGTTGTGATGTTTGCCTACGAA
TTTTAAGACAAAATTGTATAGCCTAACTTTGAAAAGCTTGGAAGATCATGCTTTTTTACA
GAAAATGATTACAAACCTTATCAAATGTAAGTTCAAAAAAAAGATTATATTTATGAACTA
ATTGAATTACCAGCTAGAATGATTTCTAAGATATTTGATGTTGGTTTCGATGCTAAAAAG
ACTGGTTTAAGGAATAAAGATTATTTAAAAAATTGTGTAATTAATTTGATTTACAAGATG
AAAAATACTTATTAAGACTACAGAATGATTAGAAATGGCAAAGACCTAAAATATATAAAG
AATAAACAAGAATTCTTAAAGGATTACAAATAAGTCGAAACTGAATCAAATTAAAATGAT
AAAGCAATATATGAATCTTTTCAAGATGGATATGAAAGATCATTATGTTTCACTTGCAAT
AAAAAAATCGAACACTTTAAGTTAATATCTCAAAAAAATGAACTTTAGATAGAATTTGAT
AATTTAATTAAGGTTTTAGATGAAGATGATTTAGCTTAACATAAAAACTTTTAAGCGAGG
CTAAATCTTTTGAAATAATTAAATTATTTTGATGAAGATGATCTTCCTTAGCTAAAGACA
AGGTTTGCTAAAGAAATTGATAATATTTATGTATCTGAACTCATAGTTTAAGGAATTTTT
GATGAACTTGATGAAGCAGAGGTAGTTGCTATTTTAATAGGATTCGTTACTCAATACAAT
AAAAAATATAATGAATCAGATTATGATCCCTCTGAAGATTATGAAAATCATGGATTTTAG
TACTCACTTAATTTCTTTGATGCCTATACCAAAACTAAGGAAATTCTCAATAAAATAATT
TAACTAGAAATTGATAATGAGATAATAATTGTTGGTAAAATTGAAGAGGCCTTATCTGAA
ATTTTTAGTCCATAATTAATGAAAGTAGCTTATGAATGGGTTCGAGGTAAAGATTTTCTC
CAAGTTTCTTTGTTAACAGATGTTGAAGAAGGAAGTATTATTTTAAGCATGTTGAGACTT
GATAATTTATTGAAGAACATTAAAAATAGTGCTTAGTACATTGGTAATAACTCTCTATCT
CTTAAAATCGAAAGCTGCCAAGAAAAAATGAGAAGAGATATTATCTTTGCCCAAAGTCTT
TATTTAGAAGAAGACAATTAATGA


>TTHERM_00628550(protein)
MIECDQQLIEKFEQIITLNTANKLKQVHSSNILGIQQGILQFDVEDKGLGQEFRVNLEQK
SNKKVIFNNYHYPIHNDTIFSNLKTLRQKELKFTIEEEINQLDYEALIDGFDNKNLNKEL
ENQFTFKSVDEFNISSKNPFSVGFQFNELTNELIDFNYEMINVNFKNFSSEGFTGKIFQI
SDKSSKVEDEDINYKTKKYLPYSNKVQIEQDFLDLANNIDEFCKQNDKHIILSDKQNLKE
LEAIKISGEQKVKMFNKVYKQLNILKVQEAGLFDFEKAQKEIKSQYESEVEKKKKISLVY
KSKEINEIINQASHKLKVDQFTNESQDNKKAQNSLLQSIDQYQWAEEDNQDVSQFHDKLP
KERMAIQYPFELDSFQKRSILRLEEGQNVFVCAHTSAGKTVVAEYSIALAKKHKRKAIYT
SPIKALSNQKYRDFKKKFGDDVGIITGDVSLNPTASYLIVTTEVLRNMLYKGHDIVRDVA
WVIFDEVHYVNNQDRGGVWEETIILLPEYIGLVMLSATVHNYMDFANWVGKTKQRKIYVE
KTLHRPVPLEHSIYYDGKIFIIKSDNEGFNQENYEKINKYIKEQESNKKKIVNAKDKLKQ
EKKDKEIYKNTNLSQNAKAKQKFIQEIFIKQSKKTNLSGGNGPLTEAQQVKNVLKYCQKN
ELLPCVVFAFSKNIIKQLSESLGNLNLISHEESKQIEEFFNKASQKLKSKDLEVHQIRTL
KDLMMRGIAVHHSGVIPFIKEIVEILFSKGLIKVLFATETFAIGINMPTKTVIFYSLKKF
DSSQYRILNSSEYTQMSGRAGRRGLDLKGNVIILVTEPKRLPSKMELTQILDHKGEMLSS
KFKITYELIMKLLSSRELDVTEMMKKSYSENDKYSQLPLNLKRIQEIQKGLKDIQQIVCP
IKPLTMPTLPIEDFYQITQQMQQANKAYWSTETKYLQEEFAIPSYCQFIDEDYNDYLGLI
VEFIKKEKYENYFVVMFAYEFQDKIVQPNFEKLGRSCFFTENDYKPYQMQVQKKDYIYEL
IELPARMISKIFDVGFDAKKTGLRNKDYLKNCVINLIYKMKNTYQDYRMIRNGKDLKYIK
NKQEFLKDYKQVETESNQNDKAIYESFQDGYERSLCFTCNKKIEHFKLISQKNELQIEFD
NLIKVLDEDDLAQHKNFQARLNLLKQLNYFDEDDLPQLKTRFAKEIDNIYVSELIVQGIF
DELDEAEVVAILIGFVTQYNKKYNESDYDPSEDYENHGFQYSLNFFDAYTKTKEILNKII
QLEIDNEIIIVGKIEEALSEIFSPQLMKVAYEWVRGKDFLQVSLLTDVEEGSIILSMLRL
DNLLKNIKNSAQYIGNNSLSLKIESCQEKMRRDIIFAQSLYLEEDNQ


>TTHERM_00628550(gene)
ATGATTGAATGCGATTAGTAGCTAATTGAAAAATTTGAATAGATCATTACATTGAATACT
GCAAATAAGCTTAAATAAGTTCATTCTAGCAACATTTTAGGTATTTAGTAAGGAATTTTA
TAATTTGATGTAGAAGATAAAGGTTTAGGATAAGAATTTAGAGTAAATTTAGAGTAGAAA
TCTAATAAGAAGGTTATTTTTAACAATTATCATTATCCTATTCATAATGATACAATTTTT
AGCAACCTCAAAACACTTAGGGTAAGATTATGAAGATATTTTATTTACTTTACATTTTTT
TGTTAATAATTTAGTAAAAAGAATTAAAATTTACTATTGAAGAAGAAATTAACTAACTAG
ATTATGAAGCGCTTATTGATGGATTTGATAATAAAAATTTAAATAAAGAGTTAGAAAATT
AGTTTACTTTTAAGAGTGTTGATGAATTCAATATTAGCTCCAAGAATCCTTTTTCTGTTG
GATTTTAGTTCAATGAATTAACAAACGAACTGATTGATTTTAATTATGAAATGATAAATG
TTAACTTTAAAAACTTTTCATCAGAGGGATTTACAGGAAAGATATTTTAGATCAGCGATA
AATCATCTAAAGTTGAAGACGAAGATATTAATTACAAGACTAAAAAATATTTGCCATACA
GCAATAAAGTTTAAATAGAGTAGGATTTCCTAGATCTTGCAAATAATATTGATGAATTTT
GCAAATAAAATGATAAACATATTATTTTATCAGACAAATAGAATTTAAAGGAGTTAGAGG
CAATCAAAATAAGTGGCGAATAGAAAGTTAAAATGTTTAATAAAGTATATAAATAATTAA
ATATTTTGAAGGTACAAGAAGCAGGTTTATTTGATTTTGAGAAGGCATAGAAAGAAATCA
AAAGTTAATATGAAAGTGAAGTTGAAAAAAAAAAAAAAATCAGTCTTGTCTATAAAAGTA
AGGAAATTAATGAAATTATTAACTAAGCTAGTCATAAACTAAAAGTTGATCAATTTACTA
ATGAATCTTAAGACAATAAAAAAGCATAAAATTCTCTCTTATAAAGCATAGACTAATATC
AATGGGCAGAAGAAGATAATTAAGATGTATCTTAATTCCACGATAAATTGCCTAAAGAAA
GAATGGCTATTCAGTACCCTTTCGAGTTGGATAGTTTTTAAAAAAGGTCTATTTTGAGAT
TAGAAGAAGGTCAAAATGTCTTTGTTTGTGCTCACACTTCTGCAGGTAAAACAGTTGTTG
CAGAATATTCTATTGCCCTTGCAAAAAAACACAAAAGAAAAGCCATATACACTTCACCTA
TTAAAGCTTTGTCAAATCAAAAGTATAGAGACTTCAAAAAAAAATTTGGAGATGATGTTG
GTATTATAACTGGTGACGTCTCTTTAAATCCTACTGCAAGCTATCTAATTGTTACTACTG
AAGTTCTTCGTAACATGCTTTATAAGGGGCATGACATAGTTAGAGATGTTGCATGGTAAT
TAATAAAAAAATTGATTATTAATTCATTTGACCAAATTTCTTTGATTTTGATATAAATTT
TAATATTTTTGTTGAAAATTTCTCTCTTTTAAATCTCTTTTAAAGGATGCATTTAAATTA
TTTGAAATAGGGTTATTTTTGATGAAGTGCATTACGTAAATAATTAAGATAGAGGTGGTG
TCTGGGAAGAAACAATCATTTTACTACCGGAATACATCGGATTAGTTATGTTAAGTGCAA
CAGTACATAACTATATGGATTTTGCTAATTGGGTTGGAAAAACAAAGCAAAGAAAAATTT
ATGTTGAAAAAACTTTGCACAGACCAGTTCCTTTGGAGCATTCTATTTATTATGATGGAA
AGATATTTATTATTAAATCAGATAATGAAGGTTTTAACCAAGAAAACTATGAAAAGATAA
ATAAGTATATTAAAGAACAAGAAAGCAATAAGAAAAAGATTGTTAATGCCAAAGATAAAT
TAAAACAAGAGAAAAAAGATAAAGAAATTTATAAAAATACAAATCTTTCATAAAATGCCA
AAGCAAAATAAAAGTTCATCTAAGAAATATTTATTAAATAAAGTAAAAAGACAAATTTAA
GTGGTGGAAACGGACCACTTACAGAGGCTCAATAAGTCAAAAATGTATTAAAATATTGCC
AAAAGAACGAGCTTTTACCTTGTGTGGTATTTGCTTTCAGTAAAAATATTATTAAGTAGC
TCTCAGAAAGTTTAGGAAATCTCAACTTGATTAGCCATGAAGAATCAGTAATTATATTAC
ATTTTCTTCAATTTTATTTTTAATATTTTTTGTTTGACCTAAAAGACACTTTATGAGCAT
TTTAATCAAAAATAAATCAATATTATCATAAATTCCCAAATTTAAATTTCAGTTTTTATT
TTAATTTTTTAGATTTTCTAAACCTTTTTTAAGAAAGCTTAAATTTATTCTTACAATTTT
GCTTTTTGCATTAAATATTTATTTAAAAATATTACTTCTTATATTAATATTATTAAAATA
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ATAAATAATAGAAATAAATTGAAGAATTCTTTAACAAAGCTTCATAAAAACTGAAATCTA
AAGATTTAGAAGTTCATTAAATTAGAACTTTGAAAGATTTGATGATGAGAGGTATTGCTG
TCCATCATAGCGGTGTCATTCCTTTTATAAAAGAAATAGTAGAAATTCTGTTTTCTAAAG
GTCTTATCAAAGTTTTGTTTGCTACTGAAACTTTTGCTATAGGTATCAATATGCCCACTA
AGACAGGTAAGAATTATTTTAAAAAAATTAAATATATCATTTTTAAAATATGATAGTCAT
TTTCTATAGTTTGAAAAAATTTGATAGTTCTCAATATAGAATTTTAAACTCTTCTGAGTA
CACTTAAATGAGTGGCAGAGCTGGTCGTAGAGGTTTAGATTTGAAAGGAAATGTTATTAT
TTTAGTGACTGAGCCAAAAAGACTTCCAAGTAAAATGGAACTAACCTAAATACTTGATCA
CAAGGTGGAATAGATAGTTTTGAAAAAAAATCCTTTTTTTATGTTATTTTTTTATATATA
AATAAATAGGGAGAAATGCTATCTTCTAAGTTTAAAATAACTTATGAGCTAATTATGAAG
CTACTTTCTTCAAGAGAACTTGATGTAACAGAGATGATGAAAAAAAGTTATAGTGAAAAT
GATAAATATTCTTAATTGCCTTTAAATTTGAAGAGAATTCAAGAGATTTAGAAAGGATTA
AAGGATATTTAGCAAATAGTATGCCCAATAAAACCTTTAACAATGCCTACTCTTCCAATA
GAAGATTTTTACTAAATCACTTAGTAAATGCAATAGGCAAACAAAGCATATTGGTCTACC
GAAACAAAATATCTCTAAGAGGAGTTTGCAATTCCAAGCTATTGCCAATTTATTGATGAA
GACTATAATGATTATTTAGGTTTAATAGTCGAATTTATTAAGAAGGAAAAATATGAAAAT
TATTTTGTTGTGATGTTTGCCTACGAATTTTAAGACAAAATTGTATAGCCTAACTTTGAA
AAGCTTGGAAGATCATGCTTTTTTACAGAAAATGATTACAAACCTTATCAAATGTAAGTT
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TGTGTAATTAATTTGATTTACAAGATGAAAAATACTTATTAAGACTACAGAATGATTAGA
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AACAAGAATTCTTAAAGGATTACAAATAAGTCGAAACTGAATCAAATTAAAATGATAAAG
CAATATATGAATCTTTTCAAGATGGATATGAAAGATCATTATGTTTCACTTGCAATAAAA
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TAATTAAGGTTTTAGATGAAGATGATTTAGCTTAACATAAAAACTTTTAAGCGTATTTTA
TAAAAAAAATAAATTTCTTCTATTGAAATATTAATTTAAAATTATAGGAGGCTAAATCTT
TTGAAATAATTAAATTATTTTGATGAAGATGATCTTCCTTAGCTAAAGACAAGGTTTGCT
AAAGAAATTGATAATATTTATGTATCTGAACTCATAGTTTAAGGAATTTTTGATGAACTT
GATGAAGCAGAGGTAGTTGCTATTTTAATAGGATTCGTTACTCAATACAATAAAAAATAT
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AATTTCTTTGATGCCTATACCAAAACTAAGGAAATTCTCAATAAAATAATTTAACTAGAA
ATTGATAATGAGGTAATTAGATTATTTTAATTTCAAAAAATATAAATTTATTTATGAGTT
TAACTAATCATGAATAAATTCTAAACTAAAATTCTTATACTTATAAACTTAGATAATAAT
TGTTGGTAAAATTGAAGAGGCCTTATCTGAAATTTTTAGTCCATAATTAATGAAAGTAGC
TTATGAATGGGTTCGAGGTAAAGATTTTCTCCAAGTTTCTTTGTTAACAGATGTTGAAGA
AGGAAGTATTATTTTAAGCATGTTGAGACTTGATAATTTATTGAAGAACATTAAAAATAG
TGCTTAGTACATTGGTAATAACTCTCTATCTCTTAAAATCGAAAGCTGCCAAGAAAAAAT
GAGAAGAGATATTATCTTTGCCCAAAGTCTTTATTTAGAAGAAGACAATTAATGA