Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00628550

Standard Name

DRH32 (DExD/H box RNA helicase 32)

Aliases

PreTt24681 | 88.m00149 | 3822.m00669

Description

DEAD/DEAH box helicase family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• nucleic acid binding (IEA) | GO:0003676
• hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides (IEA) | GO:0016818
• ATP-dependent helicase activity (IEA) | GO:0008026
• ATP binding (IEA) | GO:0005524
• helicase activity (IEA) | GO:0004386

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.4%

TetraMine Data

TTHERM_00628550

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_17274.1	9.997093137033517e-262	DEAD/DEAH box helicase (1397 a a)
SGD	YLR398C	7.002698837743091e-168	SKI2 Ski complex component and putative RNA helicase, mediat es 3-5 RNA degradation by the cytoplasmic exosome; null muta nts have superkiller phenotype of increased viral dsRNAs and are synthetic lethal with mut ations in 5-3 mRNA decay
WormBase	WBGene00008502	1.9995317320402142e-140	locus:skih-2 status:Partiall y_confirmed UniProt:Q19103 protein_id:CAA92767.2
DictyBase	DDB_G0277211	1.0004025422005049e-134	DDB_G0277211 on chromosome: 2 position 7627913 to 7632171
Oxytricha	Contig21835.0.g97	9.998173848842182e-134	DSHCT (NUC185) domain
Stentor Coeruleus	SteCoe_7917	2.8946403116483003e-63

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00628550(coding)
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GCAAATAAGCTTAAATAAGTTCATTCTAGCAACATTTTAGGTATTTAGTAAGGAATTTTA
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GAAAATGATTACAAACCTTATCAAATGTAAGTTCAAAAAAAAGATTATATTTATGAACTA
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AAAGCAATATATGAATCTTTTCAAGATGGATATGAAAGATCATTATGTTTCACTTGCAAT
AAAAAAATCGAACACTTTAAGTTAATATCTCAAAAAAATGAACTTTAGATAGAATTTGAT
AATTTAATTAAGGTTTTAGATGAAGATGATTTAGCTTAACATAAAAACTTTTAAGCGAGG
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AGGTTTGCTAAAGAAATTGATAATATTTATGTATCTGAACTCATAGTTTAAGGAATTTTT
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AAAAAATATAATGAATCAGATTATGATCCCTCTGAAGATTATGAAAATCATGGATTTTAG
TACTCACTTAATTTCTTTGATGCCTATACCAAAACTAAGGAAATTCTCAATAAAATAATT
TAACTAGAAATTGATAATGAGATAATAATTGTTGGTAAAATTGAAGAGGCCTTATCTGAA
ATTTTTAGTCCATAATTAATGAAAGTAGCTTATGAATGGGTTCGAGGTAAAGATTTTCTC
CAAGTTTCTTTGTTAACAGATGTTGAAGAAGGAAGTATTATTTTAAGCATGTTGAGACTT
GATAATTTATTGAAGAACATTAAAAATAGTGCTTAGTACATTGGTAATAACTCTCTATCT
CTTAAAATCGAAAGCTGCCAAGAAAAAATGAGAAGAGATATTATCTTTGCCCAAAGTCTT
TATTTAGAAGAAGACAATTAATGA

>TTHERM_00628550(protein)
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SDKSSKVEDEDINYKTKKYLPYSNKVQIEQDFLDLANNIDEFCKQNDKHIILSDKQNLKE
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VEFIKKEKYENYFVVMFAYEFQDKIVQPNFEKLGRSCFFTENDYKPYQMQVQKKDYIYEL
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DNLLKNIKNSAQYIGNNSLSLKIESCQEKMRRDIIFAQSLYLEEDNQ

>TTHERM_00628550(gene)
ATGATTGAATGCGATTAGTAGCTAATTGAAAAATTTGAATAGATCATTACATTGAATACT
GCAAATAAGCTTAAATAAGTTCATTCTAGCAACATTTTAGGTATTTAGTAAGGAATTTTA
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TGCTTAGTACATTGGTAATAACTCTCTATCTCTTAAAATCGAAAGCTGCCAAGAAAAAAT
GAGAAGAGATATTATCTTTGCCCAAAGTCTTTATTTAGAAGAAGACAATTAATGA