Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00628560

Standard Name

DRH30 (DExD/H box RNA helicase 30)

Aliases

PreTt24682 | 88.m00150 | 3822.m00670

Description

DEAD/DEAH box helicase family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides (IEA) | GO:0016818
• ATP-dependent helicase activity (IEA) | GO:0008026
• ATP binding (IEA) | GO:0005524
• helicase activity (IEA) | GO:0004386
• nucleic acid binding (IEA) | GO:0003676

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.7%

TetraMine Data

TTHERM_00628560

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_17274.1	9.997093137033517e-262	DEAD/DEAH box helicase (1397 a a)
SGD	YLR398C	7.999597868332553e-175	SKI2 Ski complex component and putative RNA helicase, mediat es 3-5 RNA degradation by the cytoplasmic exosome; null muta nts have superkiller phenotype of increased viral dsRNAs and are synthetic lethal with mut ations in 5-3 mRNA decay
DictyBase	DDB_G0275633	1.0002534232488231e-144	DDB_G0275633 on chromosome: 2 position 5972320 to 5975825
WormBase	WBGene00008502	5.000301007691871e-141	locus:skih-2 status:Partiall y_confirmed UniProt:Q19103 protein_id:CAA92767.2
Oxytricha	Contig21835.0.g97	2.0001701965494945e-132	DSHCT (NUC185) domain
Stentor Coeruleus	SteCoe_7917	5.301718666092324e-65

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00628560(coding)
ATGACTGAGTGCGATTAATAGCTTGTTGAAGAATTTGAAAAGATCATTTCATTAAATACT
GCAAATAAACTTGAATAAGTTCATTCTAAGAGCATTTTGGGTATTTAGAAAGGAATAATA
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ATTGGCGATAAATCATCGAACGTTGAAGACGAAGATTTAAGTTACAAAACTAAAAAATAC
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TAAGTCGAAACTGAATCAAATTAAAATGATAAAGCAATATATGAATCTATTCAAGATGGA
TATGAAAGATCGTTATGCTTCACTTGCAATAAAAAAATCGAACACTTTAAGTTAATATCT
CAAAAAAATGAACTTTAGACAGAGTTTGATAATTTAATTAAGGTTTTAGATGAAGATGAT
TTAGCTTAACATAAAAACTTTTAAGCGAGATTAAATCTTTTGAAGTAATTAAATTATATT
GATGAAGACAATCTTCCTTAGATAAAGGCAAGGCTTGCTAAAGAAATTGAAAATATTTAT
GTTTCTGAACTTATAGTTTAAGGAATTTTTGATGAACTTGATGAAGCAGAGATAGCTGCT
ATTTTAATAGGATTCGTTACTCAATGCAAGAAAAAAGAAAATGAATCGGATTATGATCCC
TCTAAAGATTATGAAAATCATGGATTTTAGTACTCAATTAATTTCTTTGATGCCTATACC
AAAACTAAGGAAATTCTCCTTTAAGTAATTTAACTAGAAATTGATAATGAGATAATAATT
GTTGGTAAAATTGAAGAGGCCTTATCTGAAATTTTTAGTCCAGAATTAATGAAAGTAGCT
TATGAATGGATTCAAGGAAAAGATTTTCTCCATGTTACTTTATTAACAGATGTCCAAGAA
GGAACTATTATTAGAAGCATGTTGAGACTTGATAATTTGATGAAGAACATTAAAAATAGT
GCTTAATACATTGGTAATAACTCTCTATCGCTTAAAATAGAAAGCTGCTAAGAAAAAATG
AGAAGAGATATAATCTTTGCACAAAGTCTTTATTTAGAAGAAGACAATTAATGA

>TTHERM_00628560(protein)
MTECDQQLVEEFEKIISLNTANKLEQVHSKSILGIQKGIIQFNVEDKGLGQGFIVNLEQK
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LENQFTSKSIDEFNINSKNPFSVGFQFNELTNELVDFNNEMINVNFKNFSSEGYTGKIFQ
IGDKSSNVEDEDLSYKTKKYLPYSNKEQIEQDFLDLAKNIDEFCKQNEKTTETKKNSRSD
KGKNENLMESEANKIIGEQRVKIFNKVQDQLNIQKVQEEDLFDFDKAQKEIKSYYESEVE
KKNKISLVFKGKEVNEIIEQASQRLQIDELVNEPQNNEEDQYSLLSSTNPQKFFKEAKLK
ETEQVEALFQKNQWAVEDNQDVSIFQDKLPKERMAIQYPFELDNFQKRSILRLEEGQNVF
VCAHTSAGKTVVAEYSIALAKKLKRKAIYTSPIKALSNQKYRDFKEKFGDDVGIITGDVS
LNPTASCLIVTTEVLRNMLYKGHDIVRDIAWVIFDEVHYVNNQDRGVVWEETIILLPEYI
GLVMLSATVPNHMDFANWVGRTKQRKIYVQKTLHRPVPLEHSIYYDGKIFIIKSANEGFN
QENYQKINKYIKEQESNKKNIVNAKDKLKQEKKDKEIYKNTNLSQNAKAKQKFIQEKFIK
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TETKYLQEEFAIPSYCQFIDEDYNDYLGLIVEFIKKEKYENYFVVMFAYEIQDKIVQPNF
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YEWIQGKDFLHVTLLTDVQEGTIIRSMLRLDNLMKNIKNSAQYIGNNSLSLKIESCQEKM
RRDIIFAQSLYLEEDNQ

>TTHERM_00628560(gene)
ATGACTGAGTGCGATTAATAGCTTGTTGAAGAATTTGAAAAGATCATTTCATTAAATACT
GCAAATAAACTTGAATAAGTTCATTCTAAGAGCATTTTGGGTATTTAGAAAGGAATAATA
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TCAAAGAAAAATTTGGAGATGATGTTGGTATTATAACTGGTGACGTCTCTTTAAATCCTA
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AGAACATTAAAAATAGTGCTTAATACATTGGTAATAACTCTCTATCGCTTAAAATAGAAA
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