Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00196320

Standard Name

DRH27 (DExD/H box RNA helicase 27 )

Aliases

PreTt06817 | 16.m00473

Description

DExD/H box RNA helicase

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• helicase activity (IEA) | GO:0004386
• nucleic acid binding (IEA) | GO:0003676
• ATP binding (IEA) | GO:0005524

Domains

• ( TIGR01612 ) rhoptry protein
• ( PF04665 ) Poxvirus A32 protein
• ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
• ( PF08225 ) Pseudin antimicrobial peptide
• ( TIGR01967 ) ATP-dependent helicase HrpA
• ( TIGR01970 ) ATP-dependent helicase HrpB
• ( PF04408 ) Helicase associated domain (HA2)
• ( TIGR01587 ) CRISPR-associated helicase Cas3
• ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein
• ( PF00271 ) Helicase conserved C-terminal domain
• ( PF07717 ) Domain of unknown function (DUF1605)
• ( PF00097 ) zinc finger, C3HC4 type (RING
• ( PF08011 ) Protein of unknown function (DUF1703)
• ( PF04851 ) type III restriction enzyme, res

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.9%

TetraMine Data

TTHERM_00196320

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_03805.1	9.997093137033517e-262	helicase domain-containing pro tein (2036 aa)
Oxytricha	Contig13549.0.g40	1.999129405549486e-73	Oligonucleotide/oligosaccharid e-binding (OB)-fold
DictyBase	DDB_G0291183	9.995417076252815e-72	dhx8 on chromosome: 5 position 5107365 to 5110847
SGD	YER013W	6.001182358613152e-70	PRP22 DEAH-box RNA-dependent A TPase/ATP-dependent RNA helica se, associates with lariat int ermediates before the second c atalytic step of splicing; med iates ATP-dependent mRNA relea se from the spliceosome and un winds RNA duplexes
WormBase	WBGene00018967	7.003229617538552e-69	locus:ddx-15 status:Confirme d UniProt:G8JY03 protein_i d:CCD63139.1
Stentor Coeruleus	SteCoe_9095	1.462486227251231e-31

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00196320(coding)
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ACTTACACTGGATCTAGAATTTTAGGATTTACTAACATTTATAACGAGATTAACTTCTCG
ATTCATCGCTTCTCTAAATTTTGCAAATCTGAATTTAAAGAAGGAGATTGCTTATTCTAT
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TTTTTTCAAAAAAATTCATTTGATAAGATGGCTATTTACATTGTTTTTAGAAATTATGAA
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GTATTCCAGCATGATCCTGAGCCTAAATAGCATCAACAGCTAGTAAAAAATTATTGTATA
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TGGTTCGAAGAATAAAATGAAAATGCTAAATAGAAAATTATTTAGAAAATATAGATAGCT
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TTGCAAGATCAAATATAAAATTTAGTAAGATAAAATTTTATTTCAAATTATGATGAAAAA
TAAGACTCTATCATTATTAAAGGAGTTTAATCTTAGCTGTAAAAAGCTCTAAGAATAATT
AATTAAGAATGTAGATTAGTATAATCTACATAATCATGTAAAATTTGCTTCGAAGATAAG
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GTATTATCAAGTGCTATTAATAGCGAATGTGTATGCTGTCCTGACCACAAGGAATCTCTG
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GATAAAATTAATTCCTAAATAGATACATGGAAAAATAAAAAAGTAAACTTATCTAAATTT
ATTAGATGCACATCTATAAACTGCGACTCTTTCTTCGGTAAAAAGTATTACGATAAAAAT
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CAGTGCCCAGGTTGCAATGATATGATATAAAAAAGTATGGGTTGTAACCATATGACTTGT
AAATGTGGTGCTCATTTTTGCTTTTAATGCTTATATTATCCAACTCCATCAAATGCCCAG
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>TTHERM_00196320(protein)
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>TTHERM_00196320(gene)
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