Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00411600

Standard Name

DRH25 (DExD/H box RNA helicase 25)

Aliases

PreTt21578 | 44.m00245 | 3714.m00091

Description

DExD/H box RNA helicase

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• ATP binding (IEA) | GO:0005524
• helicase activity (IEA) | GO:0004386
• nucleic acid binding (IEA) | GO:0003676

Domains

• ( PF06994 ) Involucrin
• ( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
• ( TIGR01967 ) ATP-dependent helicase HrpA
• ( TIGR01970 ) ATP-dependent helicase HrpB
• ( PF04408 ) Helicase associated domain (HA2)
• ( PF00271 ) Helicase conserved C-terminal domain
• ( PF07717 ) Domain of unknown function (DUF1605)
• ( PF08432 ) Fungal protein of unknown function

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_00411600

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_10352.1	9.997093137033517e-262	hypothetical protein (1639 aa)
WormBase	WBGene00015525	2.0002546692351096e-156	locus:rha-2 Putative ATP-dep endent RNA helicase rha-2 st atus:Partially_confirmed Uni Prot:P34305 protein_id:CCD62 570.1
SGD	YMR128W	1.0001788721085356e-149	ECM16 Essential DEAH-box ATP-d ependent RNA helicase specific to the U3 snoRNP, predominant ly nucleolar in distribution, required for 18S rRNA synthesi s
Oxytricha	Contig20930.0.g43	1.99970314379378e-94	Helicase associated domain (HA 2)
DictyBase	DDB_G0287351	2.9986068920536807e-84	dhx37 on chromosome: 5 positio n 165026 to 169507
Stentor Coeruleus	SteCoe_16833	3.532628572200807e-24

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00411600(coding)
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GATGCTGAAAGAAAAGAAATTTTGCTTGGCTTACAAAAAGGAGTCCAAGATTAAAAATAG
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ATTTCTCAAGCATCTTGTGATTAAAGATAAGGTAGAGCTGGTAGAACTGGTCCTGGTTAT
TGTTATAGACTATTTGCACCATCTGTTTATGCAAATATTTTTGAAAAGTTTTCTGATCCT
GAAATACTTAGTATGCCATTAGAAAGTGTTATTTTACATCTCAAAGCCATTGGCATTTAA
GATGTTATTAAATTCCCTTATCCTACTCCTCCAAGCCTCTTGAATATGAAGAGAGCTTTA
TAAAATCTTGTAAAAATAAAAGCTCTCAGAGATAAAAATATGGACGTCGACCAAGAAATC
GAAGAAACTAACATAAATGAAGATGACAGAATTGATAAAAGTGAAATCACTGAGTTAGGA
AAAATTTTAGCATTCTTACCTATAAATCCAAGGTTTTCAAAAATGCTTCTTTAAGGCAGA
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GTTAAGCCTAATGCCACTCAACAAAAACTATTATAAGAGATAGTCATAAGTTGCTTTATT
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GAATGTTTGGAGACAACAGAAAGAGTGTTTATAAATTCTACATCATTTTTGATAAAAAAT
TAGCCAGATTTTATCGTATATACTGACATCATGGAAACCAAAAAGAAATATATGAACAAT
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AAATTGTAATATGTATATGAGCCTAAGCCATTTTATTCTAAGAAAAAAAATCAATTGGTT
ATTTTAGGTAAATCAACTTTTGGCAAAAGAAAATGGGATCTTCCTACATTTGAGACAACA
TTTTAAGAAGAAAGTATTGAAAAATACTGTTGGTTTGCTAGATGTTTGCTTGAAGGTTAG
GTCTTAGATTTCTTCAAAGCATGCAAGAGCCTCTATTAATTTGATCCTCAGATAATAAAA
TCATCTAATTTATAACCTAAAGTTTAAGCAATCGTTAATAAGCTTAAAAACAATCAAATT
GATAATTCTCAAAAGCTAGTTAAAAAGTGGGAGTCAGATAAATCTTTCTTACTTCCTGAA
GTTGCTTTGTGGATAAAAGATTAATATAAAGCTAATATATAGAAGAAATGGCCTCCTACT
TCTTGA

>TTHERM_00411600(protein)
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LEKERKHKKSLEMKKETDDSKLSEEEEVEDFEPDVEKKQKVEEDDAQNKQKQAQQPSVNI
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TSKRVLEDLSTTDEMRKEKQRLEEEYYKEPEYDDFIEDELLKPILQGQKKVFNTINRSDE
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EEEKNRGIIQHNPMESENLKAQKKTFLHFKILPLFSKLPLQEQEKIFKNKSPNTRLIIAS
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CYRLFAPSVYANIFEKFSDPEILSMPLESVILHLKAIGIQDVIKFPYPTPPSLLNMKRAL
QNLVKIKALRDKNMDVDQEIEETNINEDDRIDKSEITELGKILAFLPINPRFSKMLLQGR
AGGVTTYALILVTALTIEELFCRGDFRIEENPADKLKDDYLKENDELYASDEDSKMNAKD
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S

>TTHERM_00411600(gene)
ATGGGAAAGAAGTTAACAGCATAGTAAAAGCTTTAAAAGCTTTAAGTAAGCTTAATATTA
TTTTGCTTAATATTTCAAGCATGCCTAAATAAATCAGAAATTTCATTTTTATCTTATAAA
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AAGCTTAAAAACAATCAAATTGATAATTCTCAAAAGCTAGTTAAAAAGTGGGAGTCAGAT
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