Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00190830
Standard Name
DRH1 (DExD/H box RNA helicase 1)
Aliases
PreTt08734 | 15.m00445 | 3697.m00156
Description
DRH1 DEAD/DEAH-box helicase; P68-like protein- putative
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
Domains
( PF00270 ) DEAD/DEAH box helicase
( TIGR00643 ) ATP-dependent DNA helicase RecG
( TIGR01389 ) ATP-dependent DNA helicase RecQ
( TIGR01587 ) CRISPR-associated helicase Cas3
( PF00271 ) Helicase conserved C-terminal domain
( PF04851 ) type III restriction enzyme, res
( TIGR00614 ) ATP-dependent DNA helicase, RecQ family
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 17.2%
TetraMine Data
TTHERM_00190830
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
( SD01850 ) Macronucleus: Neo3 cassette replaces part of 5’ end of coding ( SD01851 ) Macronucleus: Neo3 cassette replaces part of 5’ end of coding ( SD01944 ) Micronucleus: neo4 Macronucleus: neo4 ( SD01945 ) Micronucleus: Neo4 into 5’ end of coding of DRH1 Macronucleus: Neo4 into 5’ end of coding of DRH1 ( SD02139 ) Micronucleus: Neo4 into 5’ end of coding of DRH1 ( SD02140 ) Micronucleus: Neo4 into 5’ end of coding of DRH1 ( SD02141 ) Micronucleus: Neo4 into 5’ end of coding of DRH1 ( SD02142 ) Micronucleus: Neo4 into 5’ end of coding of DRH1 ( SD02594 ) Macronucleus: Neo3 cassette replaces part of 5’ end of coding ( SD02595 ) Macronucleus: Neo3 cassette replaces part of 5' end of coding ( SD02596 ) Macronucleus: Neo3 cassette replaces part of 5’ end of coding ( SD02597 ) Macronucleus: Neo3 cassette replaces part of 5’ end of coding ( Micronucle ) Micronucleus: neo4 Macronucleus: neo4 ( SD02598 ) Micronucleus: neo4 Macronucleus: neo4 ( SD02599 ) Micronucleus: neo4 at 5’ end of coding, some coding remains Macronucleus: neo4 at 5’ end of coding, some coding remains
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_06214.1 9.997093137033517e-262 P68-like protein (718 aa)
Oxytricha Contig21312.0.g80 6.002069467939404e-154 DEAD/DEAH box helicase
SGD YNL112W 4.000899569014317e-153 DBP2 Essential ATP-dependent R
NA helicase of the DEAD-box pr
otein family, involved in nons
ense-mediated mRNA decay and r
RNA processing
DictyBase DDB_G0293168 9.003323285460187e-148 ddx17 on chromosome: 6 positio
n 2360817 to 2364250
WormBase WBGene00010260 2.0000211193600847e-137 locus:ddx-17 status:Confirme
d UniProt:Q9XUW5 protein_i
d:CAB04518.1
Stentor Coeruleus SteCoe_12603 5.96629836401057e-72
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:27793833 : McDaniel SL, Zweifel E, Harris PK, Yao MC, Cole ES, Chalker DL (2016) DRH1, a p68-related RNA helicase gene, is required for chromosome breakage in Tetrahymena. Biology open 5(12):1790-1798
Sequences
>TTHERM_00190830(coding)ATG ATT AAC TTA TTA AAA ATT AGT AGT AAG ACT AAG TTA ATT AGT AGT TTG AGC TCA AGT GCT TCT GCA TTT AAA ATA ATC AAA CAA AAT TCT GAA AAT TTA TAA TTT CAA AAA CTA ATA ACC AAA TAA TTA TAT CAA ATG TCA AGA TAA ATC TAA AGC AAT TCT AAT AAG GGA GAA GGC TCA GAC TAT GAG AGT CAT CAA AGC TCC GAC AAC CAA CAG AAA TAA GGA AAT GGC TAC TTC AAT AAC AGA AAT GTC AAT GGC CAA AAT TAA AAT GGC TAC TAA AGC AAT GGC TAT AAC AAT AGA GGT GGA TAT CAA AAG AGC TAC GGA ACA AAC AAG TAC AAT AAC GGA AAT GGC TAT GGT AAC TCC AAT GGT GGC TAC TTC AAT AAC AAC AAT AAA CCA AAT GGA TAC TTC AAT GCC AAT AAA AAG TTT GGA AAT GAA GAG CAA AAA ACT AAC GTA GAT AAT CAA AAA CCT TAC GGA TAC AAC TAA TAA AAT AAC AAC TAG TCT AAT AAG GAC TTG AAT AAC AGC GGC TAC AGT GAT GAA AAT CAC TTA GGT GAA AAT TTA CAC GAT ATT GAC TAC ACA AAG GTC GAG CTC AAG CCT TTC TAA AAG GTT TTC TAC TAA GTT GGT AAA TCA ATA CAT ACT GAT GAA GAA ATT GCT ACC TAC TAA AGA GAG AAG GGT ATT ATA ATC CGT TCA AAG CAC AAA GAG GTT CCC TAA CCT TTC ATA AAA TGG AAC GAA ACC AAA TTC CCC AAA TAT ATT ATG TCC GTA ATA GAA GAC AGC AAA TTC TCT GAA CCT ATG CCC ATC TAA GCT CAG TCT TTC CCT ATT GTG TTG AGT GGT CAT GAC TTG ATA GGT ATT GCT TAA ACT GGT TCA GGA AAA ACT CTT TCT TTC ATG CTT CCT GCT CTT GTT CAT ATT AAT GCC CAA GAT CCC GTA AAG CCA GGC GAA GGC CCT ATT GCA TTA GTT TTG GCT CCA ACC AGA GAA TTG GCA AAC TAA ATA TAA GAA CAA TGC TTC AAA TTT GGC AGC AAA TGC AAA ATT AGC AGT GTT TGT GTT TAT GGT GGT GCC CCT AAG ATT TAC CAA GAA AAG GAA CTC CGT AAT GGC TGC GAT ATT GTC ATT GCT ACT CCT GGT AGA CTC ATT GAT TTC TTG GAA AGT AAT GTT ATC GAC TTG AAG AGA GTA ACT TAT CTT GTT CTC GAT GAA GCC GAT AGA ATG CTT GAT ATG GGT TTT GAA CCT TCC ATC AGA AAA ATC GTT GGC TAA ATC AGA CCT GAT AGA TAA ACT CTT ATG TTC TCT GCT ACT TGG CCT TAA ACT GTT AGA AGA CTT GCC CTT GAT TTT TGT CAT GGA GAT CCT ATT CAC ATT CAA ATT GGT GAT ATG GAA AAC AAC GTC AAC AAT GAT ATC GAT CAA TAA GTT GAA ATC ATT GAT AAA AGC CAA AAA TAC GAT AGA GTT AAA GAA ATT CTT AGC ACA ATG ACA AGA TCT GAT AAG ACC ATT ATC TTT ACT TAA ACA AAG AAA GAT TGT GAT GAT CTT AGC AAA GCT CTC TAA ACT GAC AAT ATA AGA AAC ATC TGT ATC CAT GGT GAT AAA TCC CAA AGA GAT AGA GAT AAA GTT ATG GAC CTC TTC AAA ACT GGT AGA GTC AAC ACT TTA ATT GCA ACC GAT GTT GCA TCT AGA GGT CTT GAT GTC AAG GAC ATT AAA TTA GTT ATT AAC TAT GAT TTC CCT AAG CAA ATC GAA GAC TAC GTA CAT AGA GTC GGT AGA ACT GGA AGA GCA GGT GCT TAA GGT AAA GCT ATT TCA TTC CTT GAT CAA TAT GAA GAC AAG AAG ATT TCT AAG GAA TTA GTT GAT GTC TTG AAG TAA AAT AAT TAA GAA ATT AGT CAA GAT CTT CTT GAA CTC TCT GAA GCA AAC TAC AAG GGT AAT TAC AGT AAT AAC TAT AAT AAG AAC AGA AGT AGC AAG CCT TAC AGT GGT GGA TAC AAT AAT AAC AGA AAC TAT TAT GGA AAT AAT AAC GAA ATG GGT TTC AGA AAC AGC AAT AAT GGA TTC TCT AAC AAT GGC TAC CAA AAT GGT AAC AGC AAC GGA GGT TAT AGA AGC CAA TAG AAC AAT AAT GGG TTC CAA AAT AAT AAC TAT AAC CGT GAC TTC CCT AAG AGA TAG GAA GAT GGC AAC GGT GGT TCT GAA CAA CCT AAG AAA TTC GGT TTC TTC AAC CCA AAG AAA GAC AAC TGA >TTHERM_00190830(protein)M I N L L K I S S K T K L I S S L S S S A S A F K I I K Q N S E N L Q F Q K L I T K Q L Y Q M S R Q I Q S N S N K G E G S D Y E S H Q S S D N Q Q K Q G N G Y F N N R N V N G Q N Q N G Y Q S N G Y N N R G G Y Q K S Y G T N K Y N N G N G Y G N S N G G Y F N N N N K P N G Y F N A N K K F G N E E Q K T N V D N Q K P Y G Y N Q Q N N N Q S N K D L N N S G Y S D E N H L G E N L H D I D Y T K V E L K P F Q K V F Y Q V G K S I H T D E E I A T Y Q R E K G I I I R S K H K E V P Q P F I K W N E T K F P K Y I M S V I E D S K F S E P M P I Q A Q S F P I V L S G H D L I G I A Q T G S G K T L S F M L P A L V H I N A Q D P V K P G E G P I A L V L A P T R E L A N Q I Q E Q C F K F G S K C K I S S V C V Y G G A P K I Y Q E K E L R N G C D I V I A T P G R L I D F L E S N V I D L K R V T Y L V L D E A D R M L D M G F E P S I R K I V G Q I R P D R Q T L M F S A T W P Q T V R R L A L D F C H G D P I H I Q I G D M E N N V N N D I D Q Q V E I I D K S Q K Y D R V K E I L S T M T R S D K T I I F T Q T K K D C D D L S K A L Q T D N I R N I C I H G D K S Q R D R D K V M D L F K T G R V N T L I A T D V A S R G L D V K D I K L V I N Y D F P K Q I E D Y V H R V G R T G R A G A Q G K A I S F L D Q Y E D K K I S K E L V D V L K Q N N Q E I S Q D L L E L S E A N Y K G N Y S N N Y N K N R S S K P Y S G G Y N N N R N Y Y G N N N E M G F R N S N N G F S N N G Y Q N G N S N G G Y R S Q Q N N N G F Q N N N Y N R D F P K R Q E D G N G G S E Q P K K F G F F N P K K D N >TTHERM_00190830(gene)ATG ATT AAC TTA TTA AAA ATT AGT AGT AAG ACT AAG TTA ATT AGT AGT TTG AGC TCA AGT GCT TCT GCA TTT AAA ATA ATC AAA CAA AAT TCT GAA AAT TTA TAA TTT CAA AAA CTA ATA ACC AAA TAA TTA TAT CAA ATG TCA AGA TAA ATC TAA AGC AAT TCT AAT AAG GGA GAA GGC TCA GAC TAT GAG AGT CAT CAA AGC TCC GAC AAC CAA CAG TAA GCA TTT CAG TAT TTT CTT TCA TAG CAA CTT ACA TCC ATA GCT TAA AAT TTC ATA TTA TGT CTA AGC TAC TCC AAA GGA AAA CTA ACT CTT TTT TAC TAA GCA AGC TAT GAA ATC TTC ATG ATT TTA AAA ATC TAA AAA ATA AGG AGA TAT GAA AAA AAA ATC AAG AAT ACA TTC TCT AAA ATA GTT TTT ATC ACA ATA AAT TCC AAT GAT TTC ATC TAT AAT TTA GAA TTA ACA ACA GAA AAT CTA TCT AAT TTA AGC AGT TGG ATG AAG AGT TTT TTG TTT GGA GCA GAT ATT TTG CTT TTT ATT TTC TGA CAA AAC CAT TCA TTA ACA CAA TAT TAT AAA TTA TAA AGG AAA TAA GGA AAT GGC TAC TTC AAT AAC AGA AAT GTC AAT GGC CAA AAT TAA AAT GGC TAC TAA AGC AAT GGC TAT AAC AAT AGA GGT GGA TAT CAA AAG AGC TAC GGA ACA AAC AAG TAC AAT AAC GGA AAT GGC TAT GGT AAC TCC AAT GGT GGC TAC TTC AAT AAC AAC AAT AAA CCA AAT GGA TAC TTC AAT GCC AAT AAA AAG TTT GGA AAT GAA GAG CAA AAA ACT AAC GTA GAT AAT CAA AAA CCT TAC GGA TAC AAC TAA TAA AAT AAC AAC TAG TCT AAT AAG GAC TTG AAT AAC AGC GGC TAC AGT GAT GAA AAT CAC TTA GGT GAA AAT TTA CAC GAT ATT GAC TAC ACA AAG GTC GAG CTC AAG CCT TTC TAA AAG GTT TTC TAC TAA GTT GGT AAA TCA ATA CAT ACT GAT GAA GAA ATT GCT ACC TAC TAA AGA GAG AAG GGT ATT ATA ATC CGT TCA AAG CAC AAA GAG GTT CCC TAA CCT TTC ATA AAA TGG AAC GAA ACC AAA TTC CCC AAA TAT ATT ATG TCC GTA ATA GAA GAC AGC AAA TTC TCT GAA CCT ATG CCC ATC TAA GCT CAG TGT AAA TAT TTT TAT AAA TTG AAT TTC TTT CTC TAT GAC ATT AGT TTG ATA GAC ACT TGA AAA TTT TTG TCA AGA TGT TAC AAA CAA GAA ATA GAA GAA AAA GTA TAA AAT GTA TGA ATG TTC CTT CAT ACG TAC TAC GAT AAT TAA ATG AAT CAA AAT TTG ATT TAA ATT GCA ATG AAA TTA AAT CAT TCA AAC AAA CTA CGC TCA TAA GTG ATT AAA TAA ATG AGT ATT TTA TCT TTG ATT TTA TTA ATT AGT CAC TAA ATT TAT CTA TGA CTC ACT TAA TCA ATC AAT CAA TCG CTT AGA GAA AAT TTT TTA TCT CCC ACC TTT AAA TAA ATA AAT AAT TAG CGT GTT AGA TAA AAA TTG ATT TCA AAC ACA AAT AAA TCA TAT TTC CAA TAT TTA ATT TTT CCT CTG AAA ATT AAT AAT TTT GCA TTC TCT TTA TTT TCA AAT TAA TTA TTT TAT ATG CAT TAA TTA TGA AAC TAA GAA AAT TGA ATA TGT AGC TAA ATT TTC TTT TTC CCA ACT ACA AAT TAA TTA ATT AAT TAA TTA AAT TTT AAA ACC CAT TTT ATA CAT CCC ATT TTT TTG ACA GAT TTA AAT ATT TTT GAT ACT AAA ATT AGT ATT TTA ATA TAT TTG TTT ATT CAT TCA TAA ATT AAT TAA TAA TCA CTC TAT AAT ATA GCT TTC CCT ATT GTG TTG AGT GGT CAT GAC TTG ATA GGT ATT GCT TAA ACT GGT TCA GGA AAA ACT CTT TCT TTC ATG CTT CCT GCT CTT GTT CAT ATT AAT GCC CAA GAT CCC GTA AAG CCA GGC GAA GGC CCT ATT GCA TTA GTT TTG GCT CCA ACC AGA GAA TTG GCA AAC TAA ATA TAA GAA CAA TGC TTC AAA TTT GGC AGC AAA TGC AAA ATT AGC AGT GTT TGT GTT TAT GGT GGT GCC CCT AAG ATT TAC CAA GAA AAG GAA CTC CGT AAT GGC TGC GAT ATT GTC ATT GCT ACT CCT GGT AGA CTC ATT GAT TTC TTG GAA AGT AAT GTT ATC GAC TTG AAG AGA GTA ACT TAT CTT GTT CTC GAT GAA GCC GAT AGA ATG CTT GAT ATG GGT TTT GAA CCT TCC ATC AGA AAA ATC GTT GGC TAA ATC AGA CCT GAT AGA TAA ACT CTT ATG TTC TCT GCT ACT TGG CCT TAA ACT GTT AGA AGA CTT GCC CTT GAT TTT TGT CAT GGA GAT CCT ATT CAC ATT CAA ATT GGT GAT ATG GAA AAC AAC GTC AAC AAT GAT ATC GAT CAA TAA GTT GAA ATC ATT GAT AAA AGC CAA AAA TAC GAT AGG TAA ATA ATA ATT ATT ACT TAA ATT TGA CAC ATT ATA ATA TCT AAT TTA TCA TAA AGA GTT AAA GAA ATT CTT AGC ACA ATG ACA AGA TCT GAT AAG ACC ATT ATC TTT ACT TAA ACA AAG AAA GAT TGT GAT GAT CTT AGC AAA GCT CTC TAA ACT GAC AAT ATA AGA AAC ATC TGT ATC CAT GGT GAT AAA TCC CAA AGA GAT AGA GAT AAA GTT ATG GAC CTC TTC AAA ACT GGT AGA GTC AAC ACT TTA ATT GCA ACC GAT GTT GCA TCT AGA GGT CTT GAT GTC AAG GAC ATT AAA TTA GTT ATT AAC TAT GAT TTC CCT AAG CAA ATC GAA GAC TAC GTA CAT AGA GTC GGT AGA ACT GGA AGA GCA GGT GCT TAA GGT AAA GCT ATT TCA TTC CTT GAT CAA TAT GAA GAC AAG AAG ATT TCT AAG GAA TTA GTT GAT GTC TTG AAG TAA AAT AAT TAA GAA ATT AGT CAA GAT CTT CTT GAA CTC TCT GAA GCA AGT AAT TAA TAA CTT TAA TTA ATT TTC ACC ATC ATT TAT ATT TAT TTT CAC AAT TGA AAA GTT AAA TAT TTA TTT ATT CAT ATA TTT TCC TCT AAA AAA AAA GAC TAC AAG GGT AAT TAC AGT AAT AAC TAT AAT AAG AAC AGA AGT AGC AAG CCT TAC AGT GGT GGA TAC AAT AAT AAC AGA AAC TAT TAT GGA AAT AAT AAC GAA ATG GGT TTC AGA AAC AGC AAT AAT GGA TTC TCT AAC AAT GGC TAC CAA AAT GGT AAC AGC AAC GGA GGT TAT AGA AGC CAA TAG AAC AAT AAT GGG TTC CAA AAT AAT AAC TAT AAC CGT GAC TTC CCT AAG AGA TAG GAA GAT GGC AAC GGT GGT TCT GAA CAA CCT AAG AAA TTC GGT TTC TTC AAC CCA AAG AAA GAC AAC TGA